• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권4호
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• pp.825-833
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• 2017

Strain IMCC26207 was isolated from the surface layer of Lake Soyang in Korea by the dilutionto-extinction culturing method, using a liquid medium prepared with filtered and autoclaved lake water. The strain could neither be maintained in a synthetic medium other than natural freshwater medium nor grown on solid agar plates. Phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences indicated that strain IMCC26207 formed a distinct lineage in the order Acidimicrobiales of the phylum Actinobacteria. The closest relative among the previously identified bacterial taxa was "Candidatus Microthrix parvicella" with 16S rRNA gene sequence similarity of 91.7%. Here, the draft genome sequence of strain IMCC26207, a freshwater actinobacterium, is reported with the description of the genome properties and annotation summary. The draft genome consisted of 10 contigs with a total size of 3,316,799 bp and an average G+C content of 57.3%. The IMCC26207 genome was predicted to contain 2,975 protein-coding genes and 51 non-coding RNA genes, including 45 tRNA genes. Approximately 76.8% of the protein coding genes could be assigned with a specific function. Annotation of the IMCC26207 genome showed several traits of adaptation to living in oligotrophic freshwater environments, such as phosphorus-limited condition. Comparative genomic analysis revealed that the genome of strain IMCC26207 was distinct from that of "Candidatus Microthrix" strains; therefore, we propose the name "Candidatus Limnosphaera aquatica" for this bacterium.

• 미생물학회지
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• 제53권4호
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• pp.347-350
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• 2017

그람 음성이며 막대모양의 Sphingobacteriaceae bacterium SH-48은 삼척 소한천에서 분리하였다. SH-48에 대한 유전체 분석을 실시하였으며, G + C 비율이 38.4%인 5,650,162 bp 크기의 염기서열을 얻었다. 유전체 특징은 카로티노이드 생합성 유전자인 crt 유전자 클러스터를 보유하고 있어 균주의 잠재적 중요성을 보여준다. 이러한 유전체 정보는 카로티노이드 생합성 경로에 대한 새로운 정보를 제공한다.

• 미생물학회지
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• 제53권4호
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• pp.320-322
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• 2017

그람 음성이며 긴 막대 모양의 betaproteobacteria에 속하는 GR16-43을 한강 발원지 검룡소에서 분리하였다. GR16-43 균주에 대한 유전체분석을 실시하였으며, G + C 비율이 67.12%인 4,806,848 bp 크기의 염기서열을 얻었다. 유전체 특징은 황산화와 관련된 다량의 유전자를 보유하고 있어 균주의 잠재적 중요성을 보여준다. 이러한 결과는 GR16-43 균주가 빈영양 담수 환경에서의 적응 연구를 위한 유전체 정보를 제공한다.