Kim, Tae-Ho;Hong, Jung Min;Park, Eui Kyun;Kim, Shin-Yoon
Molecules and Cells
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v.24
no.3
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pp.388-393
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2007
Osteonecrosis of the femoral head (ONFH) is a multifactorial disease to which certain individuals are more at risk. Altered lipid metabolism is one of the major risk factors for osteonecrosis, especially corticosteroid therapy and alcoholism. Peroxisome Proliferator-Activated Receptor-${\gamma}$ ($PPAR{\gamma}$) plays a crucial role in differentiation of mesenchymal cells to adipocytes, lipid homeostasis, and bone metabolism. To investigate the possible association between $PPAR{\gamma}$ gene variants and susceptibility to ONFH, we genotyped three common polymorphisms (-796A > G, +34C > G[Pro12Ala], and +82466C > T[His477His]) in 448 ONFH patients and 336 control subjects. Genotypes, allele frequencies, and haplotypes of the polymorphisms in the complete set of patients as well as in subgroups by sex or etiology were not significantly different from those in the control group. This suggests that the examined polymorphisms and haplotypes of the $PPAR{\gamma}$ gene are unlikely to be associated with susceptibility to ONFH.
In order to know the prevalence of S. hyicus subsp hyicus in pigs, attempts were made to isolate the organism from 549 healthy adult pigs, 277 healthy suckling piglets and 17 piglets with exudative epidermitis from April 1988 to January 1989 in Chinju, Korea. Also determined was antibiotic susceptibility of the isolates. Isolation rates of S. hyicus subsp. hyicus from adult pigs and suekling piglets were 27.0% and 53.1%, respectively. The organism was isolated predominantly from abdomen (10.9%) of adult pigs and external ear (31.6%) of suckling piglets. Isolation rates of the organism from piglets of different age group were in order of prevalence of 1(82.1%), 3(74.0%), 2(54.7%), 4(52.9%), 5(15.2%) and 6(5.7%) post-natal weeks. All of 489 isolates were sensitive to gentamicin, kanamycin and cephalexin but 23.7~79.6% of the strains were resistant to erythromycin, penicillin G and tetracycline. The 49.2% of these resistant strains exhibited multiple drug resistance. The drug resistant patterns most frequently encountered were PG TC EM(10.7%) in triple pattern, PG TC(23.0%) in double pattern and TC(44.4%) in single pattern.
Objective: Genetic variation is considered to strongly impact on detoxification of carcinogens and therefore is related to cancer risk. However, findings for the null genotypes of GSTT1 and GSTM1 have not always been consistent. Therefore the present meta-analysis was conducted. Methods: We accessed the reported study at different research areas and used various databases, including PubMed and Wanfang Med Onlion from 1990 to May 1st 2013. We calculated the odds ratio (OR), 95% confidence interval (CI) and P value for oral cancer by using Review Manager 5.1 and STATE 12. Results: We found that there was no increased oral cancer risk among subjects carrying GSTM1 and GSTT1 null genotype (OR=1.35, 95%CI=0.68-2.68, P=0.39) and (OR=1.41, 95%CI=0.72-2.77, P=0.31) in the Chinese population. In contrast, in studies in India a significant correlation between GSTM1 null genotype and oral cancer was observed (OR=1.59, 95%CI=1.20-2.11, P=0.001), but not in GSTT1 (OR=1.21, 95% CI=0.84-1.74, P=0.31). Conclusion: We discovered that GSTM1 deletion polymorphism had a significant effect on the susceptibility of oral cancer in the Indian population.
Background: Variation in metabolic genes is regarded as an important factor in processes leading to cancer. However, the effect of GSTT1 null genotype is divergent in the form of lung cancer. Methods: Studies were conducted at different research databases from 1990 to 2013 and the total odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) were calculated for lung cancer. Review Manager 5.2 and STATE 12 are employed. Results: Total OR value is calculated from 17 articles with 2,118 cases and 2,915 controls. We discovered no significant increase in lung cancer risk among subjects carrying GSTT1 null genotype [OR = 1.15; 95% CI 0.97-1.36] in this meta-analysis. Conclusion: The GSTT1 deletion polymorphism does not have a significant effect on the susceptibility to lung cancer overall in China.
The aim of this study was to identify bacteria isolated from the oral cavities and to determine their antimicrobial susceptibility against eight antibiotics. The bacterial strains were obtained from the Korean Collection for Oral Microbiology (KCOM). The bacteria were identified by comparing 16S rDNA sequences at the species level. The data showed that 77 bacterial strains were predominantly identified as streptococci (49.4%) and staphylococci (14.3%). Minimum inhibitory concentrations (MIC) were determined using a broth dilution assay to test the sensitivity of the bacterial strains. The MIC values of the oral bacterial strains against antibiotics were different. Streptococci were sensitive to clindamycin, cefuroxime axetil, and vancomycin, and they were resistant to tetracycline. Staphylococci also were sensitive to clindamycin, cefuroxime axetil, and vancomycin, and they were resistant to penicillin antibiotics. Gramnegative bacterial strains were sensitive to tetracycline and were resistant to clindamycin. These results suggest that the antimicrobial susceptibility test is necessary in deciding the prescription for antibiotics, to prevent the misuse or abuse of antibiotics.
Receptor-like proteins (RLPs) are involved in plant development and disease resistance. Only some of the RLPs in tomato (Solanum lycopersicum L.) have been functionally characterized though 176 genes encoding RLPs, which have been identified in the tomato genome. To further understand the role of RLPs in tomato, we performed genome-guided classification and transcriptome analysis of these genes. Phylogenic comparisons revealed that the tomato RLP members could be divided into eight subgroups and that the genes evolved independently compared to similar genes in Arabidopsis. Based on location and physical clustering analyses, we conclude that tomato RLPs likely expanded primarily through tandem duplication events. According to tissue specific RNA-seq data, 71 RLPs were expressed in at least one of the following tissues: root, leaf, bud, flower, or fruit. Several genes had expression patterns that were tissue specific. In addition, tomato RLP expression profiles after infection with different pathogens showed distinguish gene regulations according to disease induction and resistance response as well as infection by bacteria and virus. Notably, Some RLPs were highly and/or unique expressed in susceptible tomato to pathogen, suggesting that the RLP could be involved in disease response, possibly as a host-susceptibility factor. Our study could provide an important clues for further investigations into the function of tomato RLPs involved in developmental and response to pathogens.
Objective: This study aimed to examine the difference in toddlers' accumulated cortisol levels based on childcare experience in toddlerhood and the relationship between temperament and accumulated cortisol levels. Methods: Hair sample were collected for measure accumulated cortisol level in 87 toddlers. The Early Childhood Behavior Questionnaire (ECBQ) was used to measure temperament. Results: First, toddlers in childcare showed higher accumulated cortisol levels than in-home toddlers. Second, toddlers in childcare, exhibited a significant correlation between accumulated cortisol levels and surgency. Third, the accumulated cortisol levels of in-home toddlers exhibited a significant correlation with negative affect. In this research, there was significant range in the accumulated cortisol level according to childcare use, and the factors related to accumulated cortisol levels were different in each context. Conclusion: The results of this research support the "susceptibility to context of HPA axis" and imply a needed discussion about the effect of childcare experiences in toddlerhood.
Kim, Jeong-Dong;Lee, Dae-Weon;Lee, Kyou-Seung;Choi, Chang-Hyun;Kang, Kook-Hee
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.14
no.2
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pp.401-410
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2004
Soil samples from five different areas in Korea were collected during 2001/02 and examined for presence of the genus Clostridium. Direct immuno-fluorescent assay (IFA) examination showed that Clostridium septicum, Cl. novyi and Cl. chauvoei were detected in the soil of specific areas in Korea. Sixteen species of Clostridium were isolated and cultivated from the soil samples. Cl. peifringens was detected in all sampling locations, while the other species were not. The in vitro activity of 14 antibiotic agents was determined against 421 clostridia isolated from the soil contaminated with animal feces in Korea. Trovafloxacin was effective against all isolates of the genus Clostridium except one isolate of Cl. subterminale, two of Cl. tetani, and three of Cl novyi with $MIC_{50}$$8- 16\mu$g$ml^{-1}$. Thirteen species of Clostridium were resistant to vancomycin except for Cl. perfringens, Cl. sporogenes, and Cl. subterminale. Imipenem and trovafloxacin showed high antimicrobial activities (>95%) against all strains in the clostridia investigated. Therefore, antibiotic agents such as imipenem and trovafloxacin are the most suitable agents for polymicrobial infection as broad-spectrum monotherapy.
In total, 131 Escherichia coli isolates from surface seawater of the Gomso Bay, of Korea, were analyzed for their susceptibility to 22 different antimicrobials and for genes associated with antimicrobial resistance and virulence. According to the disk diffusion susceptibility test, the resistance to tetracycline was most prevalent (33.6%), followed by that to ampicillin (22.1%), ticarcillin (22.1%), and trimethoprim (16.8%). More than 46.6% of the isolates were resistant to at least one antimicrobial, and 22.9% were resistant to three or more classes of antimicrobials; these were consequently defined as multidrug resistant. We further found that 29 ampicillin-resistant isolates possessed genes encoding TEM-type (93.1%) and SHV-type (6.9%) ${\beta}$-lactamases. Among the 44 tetracycline-resistant isolates, tetA and tetC were found in 35 (79.5%) and 19 (43.2%), respectively, whereas tetB was detected in only three isolates (6.8%). With regard to virulence genes, merely 0.8% (n = 1) and 2.3% (n = 3) of the isolates were positive for the enteroaggregative E. coli-associated plasmid (pCVD432) gene and the enteropathogenic E. coli-specific attaching and effacing (eae) gene, respectively. Overall, these results not only provide novel insight into the necessity for seawater sanitation in Gomso Bay, but they help reduce the risk of contamination of antimicrobial-resistant bacteria.
The objective of the study is to determine differences between cucurbits in the pathogenicity of Didymella bryoniae isolated from the naturally infected seeds of cucumber and pumpkin. Primary seedling infection of cucumber(Cucumis sativus L.), oriental melon(Cucumis melo var. makuwa Makino), pumpkin(Cucurbita pepo L.) and watermelon (Citrullus vulgaris Shrad.) occurred on the radicle, hypocotyl and cotyledons and symptoms on each crop were very similar. Infection of the radicle generally caused pre-emergence rot, while infection on the hypocotyl and cotyledons provided further inoculum for infection of the first true leaves and the stem. In cross inoculation tests, all isolates of D. bryoniae could infect cucumber, oriental melon, pumpkin and watermelon at different growth stages and there were not much differences in pathogenicity or susceptibility between isolates of the pathogen and crops tested. The susceptibility of cucumber and pumpkin was markedly influenced by prevailing humid conditions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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