• 제목/요약/키워드: dex gene

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유전자형에 따른 Streptococcus mutans의 subtyping: Southern blot RFLP와 AP-PCR을 이용한 비교 (EVALUATING TWO METHODS FOR FINGERPRINTING GENOMES FOR STREPTOCOCCUS MUTANS IN CHILDREN : A COMPARISON WITH AP-PCR AND SOUTHERN BLOT RFLP)

  • 정태성;김신
    • 대한소아치과학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.292-303
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    • 1998
  • The arbitrary primer polymerase chain reaction(AP-PCR) and Southern blot restriction fragment length polymorphism(RFLP) were used to genotype the cariogenic pathogen S. mutans in children. Following the morphologic chracteristics of colony on selective medium for S. mutans, total genomic DNA from 155 strains was extracted by conventional methods. Among 155 strains, 143 strains (92.3%) were confirmed S. mutans by PCR with dexA gene and 114 strains were used in this study. Three random sequence 10-base oligonucleotide primers were chosen for AP-PCR. The amplified DNA products were separated electrophoretically in a 2% agarose gel containing ethidium bromide and the banding patterns were compared among different strains. For RFLP analysis, DNA was digested with EcoRI and BamHI, separated on a 0.7 % agarose gel and transferred to a nylon membrane. The membrane was probed with a previously characterised 1.6 kilobases (kb) DNA fragment cloned from gtf B gene of S. mutans. The probe was labeled with isotope[$^{32}P-{\alpha}CTP$], and hybridized fragments were detected with intensifying screen. AP-PCR produced 4-8 DNA bands in the 0.25-10 kb regions and distinguished 9, 10 or 12 genotypes, depending on the specific primer used. Southern blot RFLP analysis revealed 2 hybridization patterns consisting of 1 DNA fragments 450, 500 bp. These results indicate that AP-PCR is more discriminative method for genotyping of S. mutans.

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Verotoxin-2 A 유전자의 효소활성 부위에 대한 위치특이적 변이 및 결손변이유발 (Site-specific and deletional mutagenesis for two regions of Verotoxin-2 A gene encoding enzymatically active domain)

  • 김용환;김상현;차인호;김경숙;이영춘
    • 대한수의학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.541-546
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    • 1997
  • VT2(Verotoxin-2)의 효소활성 영역에 해당되는 두 영역의 아미노산들에 대하여, 첫번째 보존영역의 Glu167을 conservative point mutation 시키고, 두 번째 보존영역의 구성 아미노산 5개 전부를 deletion mutation 시켜, 각 변이주에서 독성의 감소 정도를 wild type과 비교한 결과 다음과 같은 성적을 얻었다. 1. pKSC101을 Eco RI과 Pst I으로 절단하여 940bp insert를 통일 제한효소로 절단한 M 13mp19에 삽입하여 pEP19RF를 구축하였다. 이를 이용하여 dU-SSDNA template를 제조하고, mutagenic primer를 annealing 하여 변이를 도입하였으며, 변이가 도입된 insert를 acceptor plasmid에 삽입시켜 각각 발현 플라스미드 pOEX와 pDEX를 구축하였다. 각각의 mutant 단백질을 발현시키기 위하여 pOEX와 pDEX를 JM109에 형질전환시켜 mutant 재조합 균주인 POMUT109와 DEMUT109를 작성하였다. 2. POMUT109와 DEMUT109를 IPTG 유도 발현시킨 배양상층액을 Vero cell에 대하여 세포독성을 시험한 결과 wild type에 비하여 POMUT109의 배양 여액에서는 2000배, DEMUT109의 배양여액에서는 적어도 3000배 이상의 세포독성을 감소시켰다.

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보골탕이 Monosodium Iodoacetate 유도 골관절염과 Interleukin-1β 유도 연골세포에 미치는 보호 효과 (Protective Effects of Bogol-tang on Monosodium Iodoacetate-induced Osteoarthritis and Interleukin-1β-treated Primary Chondrocytes)

  • 성진욱;이해웅;강경화;김경민;조성우
    • 한방재활의학과학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.101-113
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    • 2019
  • Objectives Bogol-tang has clinically been used to protect joint cartilage and to treat osteoarthritis. Our objective was to study the protective effect of Bogol-tang extract (BGT) in functional impairment, behavioral disorders, cartilage loss and pathological changes in a monoiodoacetate (MIA)-induced murine osteoarthritis (OA) model and interleukin (IL)-$1{\beta}$ -treated primary rat chondrocytes. Methods Mouse knee joints were injected with MIA, a chemical that inhibits glycolysis and causes joint inflammation and matrix loss. MIA-OA induced mice orally administered BGT or acetaminophen (AAP) for 18 days by daily. Primary rat chondrocytes were pretreated with BGT or dexamethasone (DEX) and followed by co-incubation with IL-$1{\beta}$ (10 ng/mL). Results In MIA-OA mice model, BGT led to delayed response on hot plate analysis, and suppressed the cartilage loss and damages in joint tissues. BGT suppressed the elevated levels of inflammatory mediators, nitrite and $PGE_2$, the gene expression of matrix degrading enzymes, and extracellular-signal-regulated kinases 1/2 and c-JunN-terminal kinase phosphorylation in IL-$1{\beta}$-treated primary rat chondrocytes. Conclusions Our results suggest that BGT improve the knee joint function and delay the cartilage damages by anti-nociceptive, anti-inflammatory and ant-catabolic effects, which indicate BGT could be a potential candidate for osteoarthritis treatment.

담배에서 병원균에 반응하는 MAPK 신호전달체계에 의해 매개되는 방어 유전자들의 분리 및 특성화 (Isolation and Characterization of Defense Genes Mediated by a Pathogen-Responsive MAPK Cascade in Tobacco)

  • 장은경;강은영;김영철;조백호;양광열
    • 생명과학회지
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    • 제18권8호
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    • pp.1023-1030
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    • 2008
  • SIPK와 WIPK의 상위 단계 인산화 효소로 알려진 NtMEK2가 DEX 유도성 시스템에 의해 밝혀졌다. 이 NtMEK2 유전자가 지속적으로 활성화된 돌연변이체인 $NtMEK2^{DD}$의 발현은 SIPK와 WIPK를 활성화 시켜 주므로 과민감 반응과 같은 세포 괴사를 야기하는 것으로 나타나 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계가 담배에서 방어 반응을 조절하고 있음을 알 수 있었다. 그러나 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 의해서 조절 되는 하위 기질이나 방어관련 유전자들에 대한 연구는 아직 미비한 상태이다. 그래서 본 연구는 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 매개되는 하위 유전자들을 분리하기 위하여 $NtMEK2^{DD}$ 형질전환 식물체를 이용해 ACP에 기초한 DDRT-PCR을 수행하였다. 그 결과 본 연구를 통해 처음으로 pI2-4, MTS2, SINA, CDM1, HRGP 및 DEG45를 포함해 여섯 개의 DEG들을 선발하였다. 이 유전자들의 발현은 $NtMEK2^{DD}$ 형질전환에서 다시 확인하였으며 특히 pI2-4, CDM1, HRGP의 유전자 발현은 다른 유전자들과 비교해 볼 때 살리실산과 담배모자이크바이러스에 강하게 반응하여 증폭됨을 알 수 있었다. 이러한 결과를 볼 때 NtMEK2-SIPK/WIPK 체계에 의해 조절되는 세 개의 유전자는 병저항성에 관여하고 있음을 제시한다 하겠다.