• 제목/요약/키워드: de novo protein synthesis

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세균 게놈 유래성 PyrR Orthologue의 기능 분석 (Characterization and Functional Study of PyrR Orthologues from Genome Sequences of Bacteria)

  • 김사열;조현수;설경조;박승환
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.103-110
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    • 2003
  • 그람 양성세균에서 PyrR단백질에 의하여 피리미딘의 생합성이 조절된다는 발견을 바탕으로 하여, Synechocystis sp.PCC6803과 Haemophilus influenzae의 PyrR orthologue 유전자를 Bacillus subtilis에서 형질전환 시켜 피리미딘 생합성의 조절 유무를 조사하였다. Synechocystis sp.PCC6803과 H. influenzae의 PyrR orthologue유전자를 pUC19과 T-vector에 클로닝 한후 pKH1, pKH2, pHPSK1, pHPSK2으로 각각 명명하였다. 이것을 다시 Escherichia. coli와 B. subtiius용 shuttle vector인 pHPS9에 클로닝 하여 pKH3, pKH4, pHPSK3, pHPSK4로 각각 명명하였다. B. subtilis DB104Δ PyrR에 pKH3, pKH4, pHPSK3, pHPSK4을 형질전환후 ATCase 활성을 측정결과 pHPSK3을 가진 균주만 피리미딘에 의한 조절작용이 일어난다는 사실을 통하여, H. influenzae의 PyrR orthologue 유전자의 선도 부분에 조절에 관여하는 미지의 부분이 있음을 예측할 수 있었다. 서로 다른 유래의 PyrR orthologue단백질을 정제하기 위하여 pET14b에 클로닝후 pKH5, pHPSK5으로 각각 명명하였다. SDS-PAGE로 분석한 결과 각각 약 18 kDa과 21 kDa의 분자량을 나타내었다. 정제된 PyrR orthologue 단백질의 UPRTase 활성을 측정한 결과 H. infuenzae의 PyrR orthologue 단백질은 UPRTase 활성을 나타내었으며 다양한 pH에서 측정한 결과 pH 5에서 가장 높은 활성을 나타내었다. 반면에, Synechocystis sp. PCC6803의 PyrR orhologue 단백질은 UPRTase 활성을 나타내지 않았다. 여러 가지 균주의 PyrR 아미노산 서열을 비교한 계통수 분석은 PyrR 단백질의 조절기작과 어느 정도 연관됨을 시사해 주었다.

DNA복제 및 회복에 미치는 수종항암 항생제의 영향에 관한 연구 (Effects of Anti-Neoplastic Antibiotics on DNA Replication and Repair)

  • Park, Sang-Dai;Rie, Myung-Chull;Lee, Chun-Bok
    • 한국동물학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.19-28
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    • 1983
  • 본 연구는 알킬화제이며 항암항생제인 Mitomycin C(MMC)와 Bleomycin(BLM)이 DNA 복제 및 회복에 미치는 영향을 규명하고, 아울러 MMC에 의한 "유발상해회복"이 포유동물세포에 유발되는지 밝히고자 수행하였다. 이를 위해 자기방사법에 의한 비주기 DNA 합성율과 알카리 유출법에 의한 DNA단사절단율을 측정하였다. CHO세포에 MMC를 제 1차 $(MMC_1)$ 처리한 후 5시간 뒤에 제 2차 $(MMC_2)$로 처리하여 얻은 결과는 다음과 같았다. 1. BLM은 비주기 DNA합성을 매우 적게 유발시켰으며, BLM $5\\mug/ml$의 농도에서 부터 비주기 DNA합성율은 증가를 보이지 않았다. BLM은 처리후 1.5시간까지 DNA합성억제를 보였으며, 1.5시간후 DNA합성율이 증가되었으나, 대조군의 60% 수준까지 회복되었을 뿐이다. 2. MMC에 의해 유발된 비주기 DNA합성은 농도에 따라 비례하였으며, 배양후 시간의 간격에 따라 비례하여 감소하였다. 제 1,2차 MMC를 처리한 세포의 비주기 DNA합성은 제 1차만 처리한 세포의 비주기 DNA합성보다 많았다. 3. 알카리 유출법 결과는 MMC에 의하여 유발된 DNA 단백질 연결로 인한 DNA 단사절단율이 농도에 비례함을 나타내었다. DNA 단백질 연결로 인한 DNA 단사절단율은 배양후의 시간에 비례해서 감소되었다. 이러한 결과는 MMC와 BLM 모두가 DNA 상해제임과 MMC에 의한 DNA 상해 부위의 복제율이 어떠한 유발기작에 의하여 촉진됨을 시사한다.촉진됨을 시사한다.

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Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) 처리로 유도되는 THP-1 세포의 초기 부착에 관한 다양한 인자의 효과 (Effect of Various Factors on Early THP-1 Cell Adhesion Induced Phorbol 12-Myristate 13-Acetate (PMA))

  • 조용삼;신지현;최태생
    • 생명과학회지
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    • 제18권7호
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    • pp.952-957
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    • 2008
  • 본 실험에서는 THP-1 세포의 PMA에 의하여 유도되는 초기 세포부착에 관한 메카니즘을 이해하기 위하여 다양한 요인(혈청, 신규 단백질의 합성, 세포 골격 저해제, 단백질 인신화 저해제)들의 효과를 조사하였다. 또한 본 실험에서는 이들 세포부착의 정도를 일반적으로 세포증식 분석에 사용되고 있는 SRB염색법을 도입하여 세포부착 분석에 간편한 방법의 조건을 확립하였다. PMA에 의한 초기 세포부착에는 배양액중의 혈청의 유무는 영향이 없었으나, 신규 단백질의 합성이 요구되는 것을 확인하였다. 또한 이들 초기 세포부착에 PMA처리에 의한 PKC의 활성화는 필수적이나, 그 하류 활성화 인자로 잘 알려진 MAP-kinase (erk1/2)의 인산화는 필요치 않음을 알 수 있었다. 흥미롭게도 액틴 중합 저해제인 cytochalasin D의 PMA와 공 처리는 오히려 세포부착을 PMA 단독 처리시 보다 증가시켰다. 또한 본 실험에서 사용된 SRB 염색법을 통한 세포부착 분석법은 최근 암 등 다양한 질환의 신약 표적 분자로 주목을 받고 있는 PKC 저해제의 초기 세포 기반 분석에 매우 유용하리라고 생각된다.

실크단백질의 식이 공급이 아토피 피부염 동물 모델 NC/Nga Mice 피부의 세라마이드 함량 및 관련인자 발현에 미치는 영향 (Dietary Effect of Silk Protein on Ceramide Synthesis and the Expression of Ceramide Metabolic Enzymes in the Epidermis of NC/Nga Mice)

  • 박경호;최영심;김현애;이광길;여주홍;정도현;김성한;조윤희
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제36권5호
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    • pp.554-562
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    • 2007
  • 본 연구에서는 아토피 피부염 동물 모델인 NC/Nga mice에 실크단백질 sericin과 fibroin을 식이 공급 후 피부의 세라마이드 함량 및 관련인자 발현 변화를 정상대조군인 BALB/c mice 및 아토피 피부염 대조군과 비교 분석하였다. 세라마이드 함량은 아토피 대조군인 CA군이 정상대조군 C군보다 현저히 낮았으나, 정제된 건조 분말을 별다른 처리 없이 그대로 실크단백질 sericin을 식이공급한 S군은 정상대조군인 C군 이상의 수준으로 높였으며, 실크단백질 fibroin(F군)은 세라마이드 함량을 정상대조군 수준이상으로 올려주지는 못하였다. 세라마이드 합성효소인 SPT의 mRNA 및 protein 발현은 아토피 대조군인 CA군은 정상대조군인 C군보다 높았으나, 실크단백질 공급군인 S군 및 F군은 모두 정상대조군 C군보다 현저히 낮았다. 반면, 세라마이드 분해효소인 ceramidase의 mRNA 및 protein 발현은 아토피 대조군인 CA군은 정상대조군인 C군보다 높았으나, 실크단백질을 식이섭취한 S군 및 F군에서는 정상대조군인 C군과 유사한 수준으로 CA군에 비해서는 유의적으로 낮았다. 결론적으로 실크단백질 sericin의 10주간 식이섭취는 아토피 피부염 동물모델 NC/Nga mice 표피의 세라마이드 함량을 정상대조군 수준 이상으로 증가시켰으며, 궁극적으로 표피의 장벽기능을 정상대조군의 수준으로 변화시켰다. 이는 serine이 다량 함유되어있는 실크단백질 sericin을 공급에 의해 증가되었는데, serine은 그 자체로서 보습기능을 하여 표피의 장벽기능을 보완하였기 때문에 SPT에 의한 생합성은 불필요하였으며 또한, ceramidase에 의한 세라마이드 분해를 정상수준이하로 억제하여 세라마이드의 생성보다는 분해억제에 의한 것으로 여겨진다.

마늘유(diallyl disulfide)와 비타민 A(retinol acetate)가 카드뮴 투여 랫드에 미치는영향 (Effect of Garlic Oil (diallyl disulfide)/ Vitamin A( retinol acetate on Heat Shock Protein Induction in Cadmium Treated Rats.)

  • 김판기
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.171-187
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    • 1998
  • Garlic occupies a special position among the many foods of vegetable origin because it is the sole food for Koreans during the their lives. And vitamin A has been ingested by forms of food or additives. Cadmium has been described as one of the most dangerous trace elements in the food and environment of man and livestocks. Since the de novo synthesis of stress proteins can be detected early after exposure to some agents, analysis of cadmium-induced changes in gene expression , ie. alterations in patterns of protein synthesis, may be useful to develop as biomarkers of exposure and damage for food hygiene. He acute and chronic combine effects of cadmium (Cd, CdCl2 20mg/kg), garlic oil(Dds: diallyl disulfide 50mg/kg, 3 times a week) and vitamin A(Ra: retinol acetate 50,000 IU/kg, 3 times a week) on Wistar male rats were evaluated concerning cadmium contents, tissues enzyme activity, HSP expression histopathological and electron microscopical examinations. The results of the study are as follows ; 1. Less cadmium was absorbed through the digestive tracts, but the ratio of contents in tissue were not changed by the simultaneous adminstration of diallyl disufide or retinol acetate. 2. ALT(alanine aminotransferase) , AST(aspartate aminotransferase), glucose, BUN (blood urea nitrogen), creatinine, the key indices of the clinical changes in hepatic and renal function were significantly hanged by the cadmium treatment after 1 week in liver, after 4 weeks in kidney. 3. Histopathological changes in cadmium treated rats were appeared at 8 weeks age treatment in kidneys. Homogenous eosinophilic material was accumulated in cortical and collecting tubular lumens at 16 weeks. Degenerated or necrotized tubular cells were observed in cortex and medulla. Degenerated seminiferous tubules and homogeneous eosinophilic material was seen in interstitial tissue of rat treated with cadmium for 16 weeks. Calcium deposits were seen in degenerated seminiferous tubules and the tubules showed severe calcification of rat treated with cadmium for 16 weeks. Electron microscope changes in kidney were observed in rats treated with CdCl2 20 mg/kg. Proximal convoluted tubule cells showed selling of cytoplasm and narrow lumen. Capillary endothelial cells showed cytoplasmic vacuoles and swelling. Degenerated epithelial cells were accumulated in tubular lumen of kidney. 4. Enhanced synthesis of 70 KDa relateve molecular mass proteins were detected in 2 hours after cadmium, exposure, with maximum activity occurring at 8~48 hours. Induction of HSP 70 was evident at proximal tubules and glomeruli in kidney. Testicular cells produced enough HSP to be detected normally. From the above results, it could be concluded that HSP70 induction by the cadmium treatment was a rapid reaction to indicated the exposure of xenobiotics, and retinol acetate reduced the cadmium induced nephrotoxicity.

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Transcriptome-based identification of water-deficit stress responsive genes in the tea plant, Camellia sinensis

  • Tony, Maritim;Samson, Kamunya;Charles, Mwendia;Paul, Mireji;Richard, Muoki;Mark, Wamalwa;Stomeo, Francesca;Sarah, Schaack;Martina, Kyalo;Francis, Wachira
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권3호
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    • pp.302-310
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    • 2016
  • A study aimed at identifying putative drought responsive genes that confer tolerance to water stress deficit in tea plants was conducted in a 'rain-out shelter' using potted plants. Eighteen months old drought tolerant and susceptible tea cultivars were each separately exposed to water stress or control conditions of 18 or 34% soil moisture content, respectively, for three months. After the treatment period, leaves were harvested from each treatment for isolation of RNA and cDNA synthesis. The cDNA libraries were sequenced on Roche 454 high-throughput pyrosequencing platform to produce 232,853 reads. After quality control, the reads were assembled into 460 long transcripts (contigs). The annotated contigs showed similarity with proteins in the Arabidopsis thaliana proteome. Heat shock proteins (HSP70), superoxide dismutase (SOD), catalase (cat), peroxidase (PoX), calmodulinelike protein (Cam7) and galactinol synthase (Gols4) droughtrelated genes were shown to be regulated differently in tea plants exposed to water stress. HSP70 and SOD were highly expressed in the drought tolerant cultivar relative to the susceptible cultivar under drought conditions. The genes and pathways identified suggest efficient regulation leading to active adaptation as a basal defense response against water stress deficit by tea. The knowledge generated can be further utilized to better understand molecular mechanisms underlying stress tolerance in tea.

F9 기형암종세포에서 Ursolic acid의 apoptosis 유도기작 (Induction of Apoptosis by Ursolic Acid in F9 Teratocarcinoma Cells)

  • 강창모;백진현;김규원
    • 생명과학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.51-59
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    • 1998
  • Ursolic acid(UA)의 apoptosis 유도능을 F9 생쥐 기형암종세포를 대상으로 조사하였다. UA는 피부암화의 억제, tumor의 분화유도, tumor promotion의 억제 등의 항암 효과를 나타내는 pentacyclic triterpene acid로 물질로 알려져 있다. UA를 F9세포에 처리하였을 때 농도비례로 성장억제를 나타냈다. 또한 apoptosis과정에서 관찰되는 전형적인 DNA 분절을 관찰할 수 있었고, 전자현미경을 이용한 세포의 미세구조를 관찰한 결과, 역시 apoptosis과정에서 관찰되는 전형적인 형태인 염색질 응축, 핵의 분절들을 관찰할 수 있어, UA에 의한 항암 효과는 apoptosis에 의한 것임을 시사한다. UA에 의한 apoptosis는 단백질 합성저해제인 cycloheximide에 의해 저해됨을 관찰할 수 있었다. UA를 F4쎄포에 처리한 후 oncogene의 발현양상을 조사한 결과, c-myc과 laminin B1은 apoptosis과정동안 점점 감소하고 c-jun은 증가함을 관찰할 수 있었다. 이상의 결과로서 UA에 의한 F9 세포의 apoptosis에는 새로운 단백질의 합성이 요구되며, c-myc 및 laminin의 발현 감소와 c-jumd의 발현 증가가 관여하고 있음을 시사한다.

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인체거대세포바이러스에 의한 인체 단핵구세포의 세포주기 저해 (Cell Cycle Arrest in Human Monocyte Cell Line by Human Cytomegalovirus)

  • 장소영;김미숙;이찬희
    • 미생물학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.299-304
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    • 2008
  • 마이엘로이드 계열의 단핵세포는 인체세포거대바이러스(human cytomegalovirus, HCMV)의 잠복 부위로 알려져 있다. 다양한 세포에서 HCMV에 의한 세포주기의 촉진 또는 억제에 관한 연구는 많이 있었지만, 단핵세포에서의 연구는 거의 없는 상태이다. 이에 본 연구에서는 단핵세포에 HCMV가 감염되면 세포주기에 어떤 변화가 나타나는지 알아보고자 하였다. Propidium iodide를 이용한 유세포 분석을 통한 세포주기 분석에서 HCMV에 감염된 THP-1 세포에서는 G0-G1기가 증가하고, 그만큼 S가 감소함을 보았다. 반면 HL-60 세포에서는G0-G1기와 S기의 상대적인 비율에 큰 변화가 없었다. BrdU 유입 실험에서 THP-1세포의 DNA 합성이 HCMV 감염에 의해 억제됨을 알 수 있었다. 세포주기의 G1기에서 S기로의 전환을 억제하는 p21 단백질은HCMV에 감염된 THP-1 세포에서는 발현이 유도되었지만 HL-60 세포에서는 거의 발현이 되지 않았다. 따라서 HCMV는 promocyte THP-1 세포에서 p21 단백질의 유도에 의해 세포주기를 G0-G1기에서 억류함에 따라 세포중식을 억제하는 것으로 생각된다.

블랙 초크베리가 HepG2세포에서 콜레스테롤 대사에 미치는 효과 (Effects of black chokeberry on cholesterol metabolism in HepG2 cells)

  • 이상길;김보경
    • 한국식품과학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.398-402
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    • 2022
  • 본 연구에서는 폴리페놀 함유 블랙 초크베리가 콜레스테롤 대사에 미치는 영향을 HepG2 세포에서 콜레스테롤 대사 관련 유전자 발현을 측정함에 따라 조사하였다. 블랙 초크베리는 콜레스테롤 대사와 관련하여 콜레스테롤 흡수, 생합성, 유출과 관련된 유전자 발현을 조절하는 것으로 나타났다. 이는 블랙 초크베리의 혈중 콜레스테롤 저하 효과가 콜레스테롤 및 담즙 대사 관련 유전자 발현을 조절함에 의한 것으로 사료된다. 추후 블랙 초크베리 내 어떠한 생리활성물질이 콜레스테롤 대사 유전자 발현을 조절하여 이러한 효과를 나타내는 지에 대한 연구가 필요하며, 블랙 초크베리의 콜레스테롤 저하 효과를 동물 및 임상에서 기전 연구를 진행하여 천연 유래 기능성 소재로서의 블랙 초크베리의 중요성을 검증할 필요가 있을 것으로 사료된다.

Proteasome Inhibitor-Induced IκB/NF-κB Activation is Mediated by Nrf2-Dependent Light Chain 3B Induction in Lung Cancer Cells

  • Lee, Kyoung-Hee;Lee, Jungsil;Woo, Jisu;Lee, Chang-Hoon;Yoo, Chul-Gyu
    • Molecules and Cells
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    • 제41권12호
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    • pp.1008-1015
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    • 2018
  • $I{\kappa}B$, a cytoplasmic inhibitor of nuclear factor-${\kappa}B$ ($NF-{\kappa}B$), is reportedly degraded via the proteasome. However, we recently found that long-term incubation with proteasome inhibitors (PIs) such as PS-341 or MG132 induces $I{\kappa}B{\alpha}$ degradation via an alternative pathway, lysosome, which results in $NF-{\kappa}B$ activation and confers resistance to PI-induced lung cancer cell death. To enhance the anti-cancer efficacy of PIs, elucidation of the regulatory mechanism of PI-induced $I{\kappa}B{\alpha}$ degradation is necessary. Here, we demonstrated that PI up-regulates nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (Nrf2) via both de novo protein synthesis and Kelch-like ECH-associated protein 1 (KEAP1) degradation, which is responsible for $I{\kappa}B{\alpha}$ degradation via macroautophagy activation. PIs increased the protein level of light chain 3B (LC3B, macroautophagy marker), but not lysosome-associated membrane protein 2a (Lamp2a, the receptor for chaperone-mediated autophagy) in NCI-H157 and A549 lung cancer cells. Pretreatment with macroautophagy inhibitor or knock-down of LC3B blocked PI-induced $I{\kappa}B{\alpha}$ degradation. PIs up-regulated Nrf2 by increasing its transcription and mediating degradation of KEAP1 (cytoplasmic inhibitor of Nrf2). Overexpression of dominant-negative Nrf2, which lacks an N-terminal transactivating domain, or knock-down of Nrf2 suppressed PI-induced LC3B protein expression and subsequent $I{\kappa}B{\alpha}$ degradation. Thus, blocking of the Nrf2 pathway enhanced PI-induced cell death. These findings suggest that Nrf2-driven induction of LC3B plays an essential role in PI-induced activation of the $I{\kappa}B$/$NF-{\kappa}B$ pathway, which attenuates the anti-tumor efficacy of PIs.