• 제목/요약/키워드: data heterogeneity

검색결과 599건 처리시간 0.027초

암의 이질성 분류를 위한 하이브리드 학습 기반 세포 형태 프로파일링 기법 (Hybrid Learning-Based Cell Morphology Profiling Framework for Classifying Cancer Heterogeneity)

  • 민찬홍;정현태;양세정;신현정
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
    • /
    • 제42권5호
    • /
    • pp.232-240
    • /
    • 2021
  • Heterogeneity in cancer is the major obstacle for precision medicine and has become a critical issue in the field of a cancer diagnosis. Many attempts were made to disentangle the complexity by molecular classification. However, multi-dimensional information from dynamic responses of cancer poses fundamental limitations on biomolecular marker-based conventional approaches. Cell morphology, which reflects the physiological state of the cell, can be used to track the temporal behavior of cancer cells conveniently. Here, we first present a hybrid learning-based platform that extracts cell morphology in a time-dependent manner using a deep convolutional neural network to incorporate multivariate data. Feature selection from more than 200 morphological features is conducted, which filters out less significant variables to enhance interpretation. Our platform then performs unsupervised clustering to unveil dynamic behavior patterns hidden from a high-dimensional dataset. As a result, we visualize morphology state-space by two-dimensional embedding as well as representative morphology clusters and trajectories. This cell morphology profiling strategy by hybrid learning enables simplification of the heterogeneous population of cancer.

Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer

  • Junaid, Muhammad;Lee, Aejin;Kim, Jaehyung;Park, Tae Jun;Lim, Su Bin
    • Molecules and Cells
    • /
    • 제45권9호
    • /
    • pp.610-619
    • /
    • 2022
  • Cellular senescence plays a paradoxical role in tumorigenesis through the expression of diverse senescence-associated (SA) secretory phenotypes (SASPs). The heterogeneity of SA gene expression in cancer cells not only promotes cancer stemness but also protects these cells from chemotherapy. Despite the potential correlation between cancer and SA biomarkers, many transcriptional changes across distinct cell populations remain largely unknown. During the past decade, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies have emerged as powerful experimental and analytical tools to dissect such diverse senescence-derived transcriptional changes. Here, we review the recent sequencing efforts that successfully characterized scRNA-seq data obtained from diverse cancer cells and elucidated the role of senescent cells in tumor malignancy. We further highlight the functional implications of SA genes expressed specifically in cancer and stromal cell populations in the tumor microenvironment. Translational research leveraging scRNA-seq profiling of SA genes will facilitate the identification of novel expression patterns underlying cancer susceptibility, providing new therapeutic opportunities in the era of precision medicine.

외부 연구개발 네트워크가 중소 벤처기업의 수입 대체에 미치는 영향: 기업부설 연구소의 조절 효과 (The Effect of the Exterior R&D Network on the Import Substitution of Small and Medium Venture Firms: The Moderating Impact of Corporate R&D Center)

  • 허용석
    • 디지털융복합연구
    • /
    • 제15권11호
    • /
    • pp.199-207
    • /
    • 2017
  • 기술 진보 및 융합과 함께 매우 빠르게 변화하는 사업 환경은 기업의 성공에 있어서 연구개발(R&D)의 역할을 더욱 더 중요하게 하고 만들고 있다. 본 연구는 기업 수준의 683개 중소 벤처기업 데이터를 대상으로 최소 자승 회귀분석을 실시하여 다음과 같은 4가지 주요 사항을 새롭게 조명한다. 첫째, 중소 벤처기업의 외부 R&D 협력 네트워크의 다양성은 기술 개발로 인한 수입 대체에 정(+)의 영향을 준다. 둘째, 기업 부설 연구소의 존재는 중소 벤처기업의 외부 R&D 협력 네트워크의 다양성이 기술 개발로 인한 수입 대체에 주는 양(+)의 영향을 조절한다. 셋째, 중소 벤처기업의 외부 R&D 정보 네트워크의 다양성은 기술 개발로 인한 수입 대체에 정(+)의 영향을 미친다. 넷째, 기업 부설 연구소의 존재는 중소 벤처기업의 외부 R&D 정보 네트워크의 다양성이 기술 개발로 인한 수입 대체에 주는 양(+)의 영향을 조절한다.

성인병의 공간적 의존성과 이질성 : 미국의 비만, 당뇨, 고혈압을 사례로 (Spatial Dependency and Heterogeneity of Adult Diseases : In the Cases of Obesity, Diabetes and High Blood Pressure in the U.S.A.)

  • 양병윤;황철수
    • 한국지역지리학회지
    • /
    • 제16권5호
    • /
    • pp.610-622
    • /
    • 2010
  • 미국에서 과체중과 비만은 최근까지 지속적으로 증가하고 있다. 그러나 과체중과 비만을 일으키는 요인에 대한 연구에 비해 이들 현상이 갖는 공간적 분포, 즉 공간의존성과 이질성에 대한 연구는 미미한 실정이다. 이에 본 연구는 과체중과 비만, 그리고 위험요인(고혈압과 당뇨병) 사이의 공간적 분포를 분석하였다. Moran''s I와 Geary''s C 분석 결과, 비만은 공간적으로 무작위 분포를 갖고 있지만, 저체중 정상 과체중은 공간적 유사성을 지니고 있음을 확인할 수 있었다. 또한 일반최소자승법에 의한 선형 회귀분석과 잔차도분석을 통해 고혈압과 당뇨는 비만과 공간적 의존성을 갖는 것으로 파악할 수 있었다.

  • PDF

지표면의 비균질성이 지표층의 난류수송에 미치는 영향 (Influence of Surface Heterogeneity on Turbulent Transfer in the Surface Layer)

  • 홍선옥;이영희;임윤진
    • 대기
    • /
    • 제24권3호
    • /
    • pp.317-329
    • /
    • 2014
  • Eddy covariance data have been analyzed to investigate the influence of surface heterogeneity on turbulent transfer over farmland and industrial sites near Nakdong river, Korea, where both large and small scale heterogeneities co-exist. For this purpose, basic turbulent statistics, quadrant analysis and multi-resolution decomposition have been analyzed during the daytime. Basic turbulent statistics were compared with typical turbulent statistics in the surface layer. Such comparisons were in close agreement for momentum and heat at both sites but not for water vapor at industrial site. The correlation coefficient between water vapor and vertical velocity ($r_{wq}$) is relatively low and skewness of water vapor ($sk_q$) is very low at industrial site, possibly due to limited water source. For heat at both sites and water vapor at farmland, the quadrant analysis show similar behavior to that over homogeneous site but for water vapor at industrial site, the presence of river and limited water source at industrial site seems to influence on water vapor transfer by coherent eddy motion by increasing sweep contribution and decreasing ejection contribution. Multi-resolution decomposition analysis shows that large scale heterogeneity leads to low $r_{Tq}$ at large averaging time regardless of season at both sites and there are seasonal changes of $r_{Tq}$ in mid-averaging times at industrial site, possibly due to seasonal change of trees and grasses near the site.

외부 기술 연구개발 협력 네트워크의 다양성이 중소기업의 고용 증대에 미치는 영향: 수출 증대의 매개 효과 (The Impact of the External Technology R&D Collaboration Network Heterogeneity on the Employment Increase of Small and Medium Companies: The Mediating Effect of Export Growth)

  • 허용석
    • 디지털융복합연구
    • /
    • 제16권3호
    • /
    • pp.181-187
    • /
    • 2018
  • 본 연구는 한국 중소기업의 수출 증대와 고용 증대에 양(+)의 영향을 미치는 요인들에 대한 연구 흐름의 깊이를 심화시키기 위해 외부 기술 연구개발 협력 네트워크의 다양성이 중소기업의 수출 증대와 고용 증대에 미치는 영향을 연구 모형화 하였으며, 대한민국의 2,200개의 중소기업으로부터 수집된 데이터를 사용하여 연구 모형을 실증적으로 검증 하였다. 본 연구는 이러한 실증 검증 결과를 통해 다음과 같은 2개의 연구 결과를 조명한다. 첫째, 중소기업의 외부 기술 연구개발 협력 네트워크의 다양성은 기술 개발로 인한 고용 증대에 유의한 양(+)의 영향을 미친다. 둘째, 중소기업의 기술 개발로 인한 수출 증대는 기술 개발로 인한 고용 증대가 외부 기술 연구개발 협력 네트워크의 다양성에 의해 받는 양(+)의 영향을 부분 매개한다.

활성탄을 이용한 원소요오드 및 유기요오드 흡착특성 (Adsorption Characteristics of Elemental Iodine and Methyl Iodide on Base and TEDA Impregnated Carbon)

  • Lee, Hoo-Kun;Park, Geun-Il
    • Nuclear Engineering and Technology
    • /
    • 제28권1호
    • /
    • pp.44-55
    • /
    • 1996
  • 원자력 발전소에서 방사성 요오드를 제거하기 위해 사용되는 원료활성탄과 2%, 5%TEDA(Triethylene-Diamine) 첨착활성탄을 이용하여 원소요오드와 유기요오드인 메틸요오드에 대한 흡착특성을 분석하였다. 여러 흡착 등온식을 선정하여 실험치와 비교함으로서 선정된 흡착 등온식의 적합성 여부를 검증하였다. 흡착평형 실험결과 Dubinin-Astakhov(DA) 등온식이 여러 가지 흡착등온식 가운데 가장 적합한 것으로 나타났다. 흡착표면의 흡착에너지 분포가 불균일(Heterogeneous)하기 때문에 포텐셜 (Potential) 에너지를 근거로 하는 DA등온식이 흡착평형 관계를 보다 정확하게 나타내는 것으로 생각된다. 흡착표면의 불균일성을 확인하기 위해 흡착에너지 분포도를 원료활성탄과 첨착활성탄에 대해 상호 비교하였다 활성탄-요오드 흡착시스템에서 불균일성은 활성탄의 기공구조 분만 아니라 흡착질과 활성탄과의 상호관계에 의해서도 영향을 받게된다 따라서 흡착표면의 불균일성은 활성탄을 첨착함에 따라서 증가하게 되고 원소요오드보다 유기요오드의 경우 불균일성이 더 커지는 것으로 보여진다.

  • PDF

심리학적 관점에서의 남북한 문화이질성: 북한이탈주민의 심리적 적응을 중심으로 (North Korea-South Korea cultural heterogeneity in psychological perspective: Focusing on the North Korean defectors' adaptation)

  • 채정민;이종한
    • 한국심리학회지 : 문화 및 사회문제
    • /
    • 제10권2호
    • /
    • pp.79-101
    • /
    • 2004
  • 본 연구는 남북한 통일 논의에서 중요하게 다루어지는 남북한 문화이질성 논란을 심리학적으로 파악하기 위해 북한이탈주민들 181명을 대상으로 설문지법을 적용하여 실시되었다. 여기에서 북한이탈주민들은 정착 초기에 문화이질감을 상당히 많이 지각하는 것으로 드러났는데, 이 자체가 곧바로 문제는 아니며, 이에 대한 대처의 전략으로서 남한 문화지향성을 얼마나 구사하느냐가가 더 중요하다는 점이 밝혀졌다. 즉, 남한 문화지향성을 중심으로 적절하게 대처하면 자기효능감을 높게 가질 수 있었으며, 이에 따라 심리적 적응 수준도 높았다. 그런데, 이 심리적 적응 수준은 생활만족도와 같은 긍정적 지표에서는 유의미한 차이가 발견되지 않았으나, 우울감과 같은 부정적 지표에서는 유의미한 차이가 발견되었다. 여기서 자기효능감이 낮은 집단이 우울감이 높았고, 우울증상군으로 분류할 수 있는 경우가 해당 집단의 43% 수준에 이르는 정도로 많았다. 따라서 본 연구를 통해 북한이탈주민들의 남북한 문화이질감 극복을 위해 남한문화 적응 지향성을 많이 가지는 것이 중요하다는 점을 확인할 수 있었고, 이질감 그 자체만을 문제시하는 것보다는 이에 대해 대처하는 전략이 중요함을 알 수 있었다.

  • PDF

기술혁신과 FDI (Innovation and FDI: Applying Random Parameters Methods to KIS Data)

  • 김병우
    • 기술혁신학회지
    • /
    • 제13권3호
    • /
    • pp.513-537
    • /
    • 2010
  • "시장규율로서의 FDI" 가설에 따르면 직접투자 자금유입은 국내기업의 혁신활동에 영향을 미치는 시장구조에 변화를 주는 메커니즘으로 작용한다. STEPI의 2008 KIS 데이터에 대한 프로빗 추정결과는 Bertschek(1995)이 분석한 독일기업의 경우와 달리, 한국기업의 제품혁신을 설명하는데 FDI가 설명력이 없는 것으로 나타났다. 이의 근거로 본 연구는 한국 산업의 시장구조가 독일의 경우보다 독점적인데서 기인한다는 추론을 제시하였다. 2005, 2008년 데이터로 구성된 패널데이터 분석의 경우, GLS와 OLS의 행렬가중평균을 추정하는 임의 파라미터 추정법을 적용하였다. 그 결과는 단순 패널프로빗추정 결과와 상당한 차이가 나, 기업간 파라미터에 많은 파라미터 추정치 변화가 있음을 보여준다. 그러나, 패널추정치와 횡단면 추정치간 타 계수의 부호는 달라도 FDI에 대한 결과는 동일한 것으로 나타난다.

  • PDF

Estimation of Genetic Parameters for Milk Production Traits Using a Random Regression Test-day Model in Holstein Cows in Korea

  • Kim, Byeong-Woo;Lee, Deukhwan;Jeon, Jin-Tae;Lee, Jung-Gyu
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
    • /
    • 제22권7호
    • /
    • pp.923-930
    • /
    • 2009
  • This study was conducted to compare three models: two random regression models with and without considering heterogeneity in the residual variances and a lactation model (LM) for evaluating the genetic ability of Holstein cows in Korea. Two datasets were prepared for this study. To apply the test-day random regression model, 94,390 test-day records were prepared from 15,263 cows. The second data set consisted of 14,704 lactation records covering milk production over 305 days. Raw milk yield and composition data were collected from 1998 to 2002 by the National Agricultural Cooperative Federation' dairy cattle improvement center by way of its milk testing program, which is nationally based. The pedigree information for this analysis was collected by the Korean Animal Improvement Association. The random regression models (RRMs) are single-trait animal models that consider each lactation record as an independent trait. Estimates of covariance were assumed to be different ones. In order to consider heterogeneity of residual variance in the analysis, test-days were classified into 29 classes. By considering heterogeneity of residual variance, variation for lactation performance in the early lactation classes was higher than during the middle classes and variance was lower in the late lactation classes than in the other two classes. This may be due to feeding management system and physiological properties of Holstein cows in Korea. Over classes e6 to e26 (covering 61 to 270 DIM), there was little change in residual variance, suggesting that a model with homogeneity of variance be used restricting the data to these days only. Estimates of heritability for milk yield ranged from 0.154 to 0.455, for which the estimates were variable depending on different lactation periods. Most of the heritabilities for milk yield using the RRM were higher than in the lactation model, and the estimate of genetic variance of milk yield was lower in the late lactation period than in the early or middle periods.