• Molecules and Cells
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• 제42권1호
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• pp.67-78
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• 2019

Methylation of HBV cccDNA has been detected in vivo and in vitro; however, the mechanism and its effects on HBV replication remain unclear. HBx derived from a 1.2-mer HBV replicon upregulated protein levels and enzyme activities of DNA methyltransferase 1 (DNMT1), 3a, and 3b, resulting in methylation of the negative regulatory region (NRE) in cccDNA, while none of these effects were observed with an HBx-null mutant. The HBx-positive HBV cccDNA expressed higher levels of HBc and produced about 4-fold higher levels of HBV particles than those from the HBx-null counterpart. For these effects, HBx interrupted the action of NRE binding protein via methylation of the C-1619 within NRE, resulting in activation of the core promoter. Treatment with 5-Aza-2′dC or DNMT1 knock-down drastically impaired the ability of HBx to activate the core promoter and stimulate HBV replication in 1.2-mer HBV replicon and in vitro infection systems, indicating the positive role of HBx-mediated cccDNA methylation in HBV replication.

• 미생물학회지
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• 제24권2호
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• pp.106-112
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• 1986

자연계에서 분리한 Pseudomonas에서 크기가 매우 큰 plasmid (약 180 megadaltons:를 분리하였다. 이 plasmid는 기존의 plasmid 검출방법보다 더 온화한 조건에서 분리되었다. Alkalin., sodium dodecyl sulfate (pH 12. 45)를 사용하여 chromosomal DNA를 변성시킨 뒤 $55^{\circ}C$로 열처리 하여 covalently closed circular DNA 의 손실을 최대한으로 방지하였고, polyethylene glycol을 최종농도 10%로 첨가하여 plasmid DNA를 선택적으로 농축하였다. 한편, 이 plasmid는 mitomycin C를 처리하여 얻은 cured sitrains에서는 나타나지 않아 salicylate를 분해하는 새로운 plasmid로 확인되었다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제25권1호
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• pp.47-53
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• 2009

Sequence analysis of the Chlorella virus SS-2 revealed one putative nuclease gene that is 807 bp long and encodes a 31kDa protein. Multiple sequence alignment analysis reveals the presence of highly conserved PD-(D/E)XK residues in the encoded protein. The gene cloned into an expression vector was expressed as a His-tagged fusion protein in chaperone containing pKJE7 cells. The recombinant protein was purified using a His-Trap chelating HP column and used for functional analysis. Exonuclease activity of the SS-2 nuclease was detected when the DNA substrates, such as linear ssDNA, PCR amplicon, linear dsDNA with 5'-overhang ends, 3'-overhang ends, or blunt ends were used. Covalently closed circular DNA was also degraded by the SS-2 recombinant protein, suggesting that the SS-2 nuclease has an endonuclease activity. Stable activity of SS-2 nuclease was observed between $10^{\circ}C$ and $50^{\circ}C$. The optimum pH concentrations for the SS-2 nuclease were pH 6.0-8.5. Divalent ions inhibited the SS-2 nuclease activity.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제3권2호
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• pp.154-158
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• 1995

We isolated Streptomyces spry. from Korean soil, which showed high cytotoxicity against tumor cell lines, L1210 and P388Dl. Among 30 strains, three strains (DKM 104, DKM 128, DKM 409) were appeared to possess plasmid. Strain DKM 104 and DKM 128 had two CCC(Covalently Closed Circular) form plasmid, about 20 Kb in size and about 1 Kb compared with λ Hind III DNA size marker. And strain DKM 409 had three plasmids, among which two plasmic were CCC form about 20 Kb and about 20 Kb compared with same size marker. To find out whether plasmid involved in production of antitumor agent or not, we performed to curing experiment. Comparing cytotoxicity between culture filtrate of plasmid-containing strains and cured strains, we knew that only the cytotoxic activity of the strain DKM 128 was involved in plasmid.

• 미생물학회지
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• 제23권2호
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• pp.122-128
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• 1985

Bacillus thuringiensis serovar israelensis 4Q1 contains 8 different covalently closed-circular (CCC) plasmids of molecular weight 204, 267, 109, 103, 16, 7.6, 6.4, and 5.0kb. The three smallest plasmids, designated pBti6, and pBti8 may prove to be useful as cloning vectors because of thier size and ease of isolation. The three plasmids were incubated separately with 9 different restriction enzymes and 7 of the enzymes tested cleaved one or more of the plasmids. Plasmid pBti6 has a single site for Bg1 II, Pst I and Pvu II, two sites for Bc1 I and Eco RI, and five sites for Hind III. Plasmid pBti7 has a single site for Bam HI and Pst I, two sites for Hind III, and three sites for PvuII. Plasmic pBti8 has a single site for Bam HI, BelI and Hind III, two sites for Eco RI, and three sites for Bgl II and Pvu II. Composite restriction enzyme maps for pBti6, pBti7 and pBti8 were constructed. The sites of restriction enzyme cleavage were determined by single, double and partial digests of the plasmid DNA. All the restriction sites were aligned relative to the single Bgl II(pBti6), Pst I(pBti7) or Hind III(pBti8) site, respectively.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• 제5권
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• pp.52-58
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• 1987

효모(酵母)와 대장균(大腸菌)의 셔틀 벡터인 YIp5, YRp7, YEp13플라스미드를 S. cerevisiae DBY747을 수용세포(受容細胞)로 하여 원형질체 방법(方法)에 의해 형질전환(形質轉換)시킨 결과(結果), YIp5플라스미드는 형질전환체가 나타나지 않았으며, YEp13플라스미드는 DNA $10{\mu}g$ 당(當) $1.2{\times}10^3$, YRp7은 $1.0{\times}10^2$ 개(個)의 형질전환체를 얻었다. YIp5플라스미드와 YEp13플라스미드, 그리고 YIp5플라스미드와 YRp7플라스미드를 환상(環狀)플라스미드 상태(狀態)로 동시형질전환(同時形質轉換) 시켰을 때 각각 DNA $10{\mu}g$ 당(當) 210 및 95개(個)의 형질전환체를 얻었으며, 동일(同一) 부위(部位) 또는 다른 부위(部位)를 절단(切斷)한 선상(線狀)플라스크를 앞서와 같이 동시형질전환(同時形質轉換)시켰을때, 서로 비슷하게 DNA $10{\mu}g$당(當) 15~85개(個)의 형질전환체를 얻을 수 있었다. 이러한 결과(結果)에서 볼때 수용세포(受容細胞)를 S. cerevisiae DBY747로한 동시형질전환(同時形質轉換)에서 환상(環狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)이 선상(線狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)보다 빈도(頻度)가 높으며 선상(線狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)에서 미단(未端) 부위(部位)의 상이(相異)함이 큰 영향을 주지 않는 것으로 나타났다. 형질전환체의 안정성(安定性)에 있어서는 YIp5플라스미드와 YEp13플라스미드간(間)의 형질전환체가 YIp5플라스미드와 YRp7플라스미드간(間) 형질전환체에 비(比)해 안정(安定)하게 나타났는데, 이는 stringent control을 받는 ARS유전자(遺傳子)를 가진 YRp7플라스미드보다 $2{\mu}m$ DNA 복제(複製) 기점(起點)을 가진 YEp13플라스미드의 복제수(copy number)가 많기 때문인 것으로 생각된다.

• 한국동물위생학회지
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• 제29권3호
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• pp.277-285
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• 2006

Plasmids are covalently closed circular molecules of DNA that are stably inherited and replicate somewhat independently of the bacterial chromosome. Genes carried on plasmids can mediate a wide variety of important functions, including antibiotics (R plasmids) and heavy metals resistance, toxins production, cell penetration, iron chelation, complement resistance, and metabolic characteristics such as sucrose and lactose fermentation. Fifty strains of lactobacilli were isolated from 26 staters and 29 fermented milk products. They were classified 27 strains as Lactobacillus paracasei subsp paracasei, 11 stains as Lactococcus lactis subsp cremoris, 6 strains as L delbrueckii subsp lactis, 4 strains as L acidophius, and 2 strains as L delbrueckii subsp bulgaricus. All of these strains were examined for drug resistance and transferability of R plasmids. All of the isolates were sensitive to Am, C, CF, E, NB, P, T, and Te. But resistant to SXT 94% (47 strains), K 66% (33 strains), S 56% (28 strains), ENR 50% (25 strains), NOR 38% (19 strains) CIP 38% (19 strains), GM 16% (8 strains), and N 14% (7 strains), in order. And 32 different resistant patterns were found. The most frequently encountered patterns were CIP-ENR-K-NOR-S-SXT (5 strains). In vitro R plasmids transfer experiment, 57 antibiotic resistant strains which were not transfer to the recipient 2 Escherichia coli strains by conjugation, These results indicate that Lactobacillus in internal trade market' stater recognize R factor but transmissible R plasmid is not existed.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제25권1호
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• pp.1-18
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• 2008

1980년대부터 시행된 HBV 감염의 예방 백신접종으로 HBV 감염율이 감소되고 1997년부터 시작된 핵산유사체인 LMV의 항바이러스치료 효과로 인하여 CHB 환자에서 HBV 증식 억압이 가능하게 되면서 10~20여년 동안 HCC 발생율이 현저히 감소된다는 보고가 증가하고 있으며 21세기 전반기에는 1980년대 부터인 백신접종가능 시기 이후의 출생자들이 성인이 되는 시점이 되면 HBV 감염율 감소로 동반된 HCC 발생율의 현저한 감소를 예측하고 있다. 이미 백신 개발 이 전에 또는 백신접종의 기회를 얻지 못하고 이미 영유아 시기에 감염되어 CHB에 이환된 환자들의 간경변증, HCC 등 만성 합병증을 치료하기 위해서는 적극적인 항바이러스치료가 필요하였으나 1980년대 후반에 유일하게 CHB 치료제로 인정된 인터페론은 치료 적응증이나 그 효과에 있었으나 극소수의 제한된 환자에서 제한된 효과만이 입증되었으며 특히 역학적 차이로 인한 바이러스학적, 개체 면역학적 조건에 따라 전혀 고려되지 않는 경우가 많고 수직감염자가 대다수인 우리나라를 포함한 대부분의 고감역지역에서는 우선 선택되지 않는 약제였으며 장기 효과에 대해서는 이십여년이 지난 시점에도 확실하지 않은 상황에서, 1997년부터 극적인 항바이러스 효과를 나타내는 LMV을 투약할 수 있게 되었다. LMV의 HCC 발생 억제효과를 높이기 위해 개선해야 할 점은 필수적인 장기투약에 의해 발생되는 내성 바이러스의 출현이며 이는 간기능뿐 만아니라 HCC 발생의 위험도 높일 수 있다는 보고도 있다. LMV 이후 처방 허가된 ADV, telbivudine(LdT), ETV, CLV, TDF 등도 장기 투약시 내성바이러스 발생이 가능하나 내성 발생을 줄이기 위해서는 적절한 약의 선택과 새로운 약제의 개발과 동시에 치료 원칙의 정립이 필요하다. 그러나 이러한 문제점이 있음에도 불구하고 항바이러스치료로 CHB의 진행 및 만성 합병증 발생의 빈도가 감소되고 있으며 HCC 발생 역시 감소될 것이며, 그 효과를 더 높이기 위해서는 내성변이종 발생 문제를 해결해야 하며 치료대상, 치료기준, 약제의 선택과 방법 및 면밀한 검사관리가 필요하다. 그러나 무엇보다 중요한 것은 일단 HBV에 감염되면 과거감염이건 현재 감염이건 현재의 핵산유사체 제제로 HBV DNA 증식을 억제하더라도 간조직내 cccDNA와 융합된 HBV DNA를 보유할 수 있으며 그 증거로는 HBsAg이 음성인 HCC 환자의 혈청이나 간조직에서 HBV DNA가 발견되는 빈도가 높다는 증거가 무수히 많고, 상황에 따라서는 간질환의 원인이 된다는 보고가 다수 있으므로 가장 완벽하고 확실한 예방법인 HBV 백신 접종이 무엇보다 필수적이며 전세계 대부분의 HCC 발생을 예방할 수 있다. 또한 현재 제시되고 있는 항바이러스제 치료기준은 혈청 간세포괴사치 상승을 조건으로 제한하는데 혈청 ALT치나 HBeAg 상태에 무관하게 간 조직의 상태나 HBV DNA치의 증가와 비례해서 간경변이나 HCC 발생의 위험이 높아진다는 사실이 중요하다.