• 제목/요약/키워드: contamination detection

검색결과 444건 처리시간 0.026초

인천지역 유통 생약 중 Ochratoxin A 오염실태 조사 (A Survey on Ochratoxin a Contamination of Commercial Medicinal Herbs in Incheon)

  • 임수선;주광식;최은정;이수연;임윤선;엄선아;조남규;이성모
    • 생약학회지
    • /
    • 제48권1호
    • /
    • pp.56-62
    • /
    • 2017
  • The aim of this study was to screen the contamination by ochratoxin A of mycotoxins in various medicinal herbs. We conducted a survey of ochratoxin A in medicinal herb on the retail market in Incheon in 2016. 116 medicinal herb samples were evaluated for the ochratoxin A contamination. They were analyzed for ochratoxin A using immunoaffinity column and high-performance liquid chromatography(HPLC)-fluorescence detection and the positive samples were confirmed using HPLC-tandem mass spectrometry. Ochratoxin A was detected in 4 medicinal herb samples; the concentrations of ochratoxin A were containing between 20.11 and $372.90{\mu}g/kg$. This study shows that in general, this kind of commodity may be contaminated by mycotoxins. Also this contamination is not limited to only aflatoxin of mycotoxins.

Microbial contamination including Vibrio cholerae in fishery auction markets in West Sea, South Korea

  • Choi, Yukyung;Lee, Yewon;Lee, Soomin;Kim, Sejeong;Lee, Jeeyeon;Ha, Jimyeong;Oh, Hyemin;Shin, Il-Shik;Yoon, Yohan
    • Fisheries and Aquatic Sciences
    • /
    • 제22권11호
    • /
    • pp.26.1-26.7
    • /
    • 2019
  • Background: The monitoring of pathogens of fishery auction markets is important to obtain safe fishery products regarding hygiene and sanitation. In this study, aerobic, coliform, Escherichia coli, and Vibrio cholerae were monitored in the fishery products and environmental samples obtained from fishery auction markets. Methods: The fishery products (flounder, octopus, skate, rock cod, sea bass, snail, monkfish, flatfish, comb pen shell, corb shell, conger eel, hairtail, croaker, and pilchard) were placed in filter bags, and the environmental samples (samples from the water tanks at the fishery auction markets, seawater from the fishery distribution vehicles, ice from wooden or plastic boxes, and surface samples from wooden and plastic boxes used for fish storage) were collected. Aerobic bacteria, E. coli, and coliform in the samples were enumerated on aerobic count plates and E. coli/coliform count plates, respectively. For V. cholerae O1 and V. cholerae non-O1 quantification, most probable number (MPN)-PCR analysis was performed. Results: Aerobic and coliform bacteria were detected in most samples, but E. coli was not detected. Wooden boxes were contaminated with high levels of aerobic and coliform bacteria in all seasons (spring, summer, and fall). During fall, V. cholerae non-O1 were detected in snails, hairtails, croakers, flatfishes, pilchards, plastic boxes, and water samples. Conclusions: These results indicate an increased prevalence of V. cholerae contamination in fishery products in fall, including food contact samples, which can be vehicles for cross-contamination.

False-Positive Mycobacterium tuberculosis Detection: Ways to Prevent Cross-Contamination

  • Asgharzadeh, Mohammad;Ozma, Mahdi Asghari;Rashedi, Jalil;Poor, Behroz Mahdavi;Agharzadeh, Vahid;Vegari, Ali;Shokouhi, Behrooz;Ganbarov, Khudaverdi;Ghalehlou, Nima Najafi;Leylabadlo, Hamed Ebrahmzadeh;Kafil, Hossein Samadi
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
    • /
    • 제83권3호
    • /
    • pp.211-217
    • /
    • 2020
  • The gold standard method for diagnosis of tuberculosis is the isolation of Mycobacterium tuberculosis through culture, but there is a probability of cross-contamination in simultaneous cultures of samples causing false-positives. This can result in delayed treatment of the underlying disease and drug side effects. In this paper, we reviewed studies on false-positive cultures of M. tuberculosis. Rate of occurrence, effective factors, and extent of false-positives were analyzed. Ways to identify and reduce the false-positives and management of them are critical for all laboratories. In most cases, false-positive is occurring in cases with only one positive culture but negative direct smear. The three most crucial factors in this regard are inappropriate technician function, contamination of reagents, and aerosol production. Thus, to reduce false-positives, good laboratory practice, as well as use of whole-genome sequencing or genotyping of all positive culture samples with a robust, extra pure method and rapid response, are essential for minimizing the rate of false-positives. Indeed, molecular approaches and epidemiological surveillance can provide a valuable tool besides culture to identify possible false positives.

소유래 성분 원재료 사용 생물의약품과 의료기기 제조 공정에서 bovine adenovirus type 1 정량 검출을 위한 TaqMan probe real-time PCR (TaqMan probe real-time PCR for quantitative detection of bovine adenovirus type 1 during the manufacture of biologics and medical devices using bovine-derived raw materials)

  • 고운영;노나경;김인섭
    • 미생물학회지
    • /
    • 제51권3호
    • /
    • pp.199-208
    • /
    • 2015
  • 소의 혈액, 세포, 조직, 기관 등이 생물의약품, 조직공학제제, 세포치료제, 의료기기의 원재료로 널리 사용되고 있다. 소유래 성분 원재료에 다양한 바이러스가 오염된 사례가 있기 때문에 소유래 물질을 원재료로 사용한 제제의 바이러스 안전성 검증이 필수적으로 요구된다. Bovine adenovirus type 1(BAdV-1)은 소에게 가장 흔하게 감염되는 바이러스 중의 하나이다. 소유래 물질을 원재료로 하는 생물의약품, 조직공학제제, 세포치료제, 의료기기 등에서 BAdV-1 안전성을 확보하기 위해, 세포주, 원재료, 제조공정, 완제품에서 BAdV-1을 정량적으로 검출하고, 제조공정에서 BAdV-1 제거 검증을 위한 시험법으로 활용이 가능한 TaqMan probe real-time PCR 시험법을 확립하였다. 세포배양법에 의한 감염역가와 비교한 결과, real-time PCR 검출한계는 $7.44{\times}10^1\;TCID_{50}/ml$이었다. 확립 된 시험법의 신뢰성(reliability)을 보증하기 위해 시험법 검증을 실시한 결과, 특이성(specificity)과 재현성(reproducibility), 완건성(robustness)이 우수함을 확인하였다. 확립된 real-time PCR을 생물의약품 제조공정 검증에 적용할 수 있는지 확인한 결과, 인위적으로 BAdV-1을 오염시킨 Chinese Hamster Ovary(CHO) 세포주에서 BAdV-1를 정량적으로 검출할 수 있었다. 확립된 시험법을 항체의약품 생산용 CHO 마스터 세포주와 소유래 type 1 collagen에서 BAdV-1 검출 시험에 산업적으로 적용하였다. 위와 같은 결과에서 확립된 BAdV-1 real-time PCR 시험법은 감염역가 시험법과 같은 생물학적 시험법을 대신할 수 있는 신속하고, 특이성과 민감성이 우수한 시험법임을 확인하였다.

석산개발에 따른 주변 환경오염 및 석분토 처리를 위한 연구 (Environmental Contamination and Best Management of Stone-dust from Quarry Mine)

  • 이평구;염승준;강민주
    • 자원환경지질
    • /
    • 제43권4호
    • /
    • pp.315-332
    • /
    • 2010
  • 이번 연구에서는 석산 내부(광산) 및 외부(주변 환경)에서 채취한 모든 물 시료와 응집제를 함유한 석분토에 대해서 중금속, 시안, 독성 유기화합물 및 유기인의 총함량을 분석하였다. 그리고 EDTA 용출실험법 및 산농도 변화에 따른 용출실험법 등을 이용하여 석분토를 장기간 석산 내부에 보관할 경우 발생할 수 있는 중금속 원소의 용출특성을 평가하였다. 모든 물 시료와 석분토에서 검출된 $Cr^{6+}$, Hg, CN, TCE/PCE 및 총 인의 농도는 모두 검출한계 이하로, 오염되지 않았음을 확인하였다. 석산 내부 및 외부에서 채취한 물 시료에서는 Pb과 CD이 검출되지 않았고 구리와 아연은 일부 시료에서만, 비소는 일반적으로 검출되었으나 검출된 비소 함량은 모두 먹는 물 수질기준보다 훨씬 낮은 값을 보여주고 있다. EDTA 및 산도변화를 이용한 용출실험 등의 결과에서 Pb, Cr, Cd, Cu 및 Zn의 용출함량은 검출한계 이하 혹은 매우 낮은 함량만이 검출되었으며, 비소는 pH 3의 용출실험에서 검출되었다. 따라서 석산 개발에 따른 수계 오염은 없는 것으로 판단된다.

DNA 교차 오염 방지 기능을 가진 돼지 인플루엔자바이러스 감별진단용 one-step multiplex RT-PCR 진단법 (One step multiplex RT-PCR preventing DNA carryover contamination for differential diagnosis of swine influenza viruses)

  • 김희정;김은미;신연경;송재영;김성희;이경기;이명헌;김영화;박준철;여상건;박최규
    • 한국동물위생학회지
    • /
    • 제37권4호
    • /
    • pp.263-271
    • /
    • 2014
  • In this study, we developed a cost and time saving one-step multiplex RT-PCR for the simultaneous detection and differentiation of swine influenza viruses (SIV) and 2009 pandemic influenza H1N1 virus (pH1N1). The one-step multiplex RT-PCR using four sets of primer was confirmed to be capable of detection of all SIV subtypes and differential diagnosis of major SIV subtype H1, H3 and pH1N1 on individual or mixed viral culture samples. The sensitivity of the multiplex RT-PCR was determined to be at least $2^{-6}$ $HA/25{\mu}L$ of the presented SIVs, providing sufficient efficacy for a routine SIV monitoring in diagnostic laboratories. In addition, compared with the conventional RT-PCR methods that cannot avoid the carryover DNA contamination, the developed RT-PCR applied with the uracil DNA glycosylase (UNG) system was proven to prevent a false positive reaction by carryover contamination of the pre-amplified DNA. In conclusion, the one-step RT-PCR with UNG system could be applicable to detect and differentiate of SIV from the viral cultures without worry of carryover DNA contamination in clinical laboratories.

방사선 오염분포 영상화를 위한 방사선 센서의 탐지 범위 개선에 관한 연구 (Detection Range Improvement of Radiation Sensor for Radiation Contamination Distribution Imaging)

  • 송근영;황영관;이남호;나준희
    • 한국정보통신학회논문지
    • /
    • 제23권12호
    • /
    • pp.1535-1541
    • /
    • 2019
  • 방사선 사고 지역 및 제염이 필요한 지역에서의 안전하고 신속한 제염작업을 진행하기 위해서는 방사선 오염원에 대한 다양한 정보 획득이 필요하다. 특히 방사선원의 정확한 위치와 분포 정보의 파악은 신속한 후속 조치 및 오염원 제거를 위해 반드시 필요하며, 작업자의 방사선 피폭을 최소화할 수 있다. 방사선원의 위치와 분포 정보를 획득하기 위해서는 방사선 분포 탐지 장치를 사용한다. 방사선 분포 탐지 장치의 경우 일반적으로 탐지 센서 부가 단일 센서로 구성되며, 단일 센서의 물리적 한계로 인해 탐지 범위가 제한되는 문제점이 있다. 본 논문에서는 방사선 오염 분포 영상화 장치에 사용되는 단일 센서의 탐지 감도 제어를 위하여 보정 검출기를 적용하였으며, 이를 통해 제한적이었던 선량률 탐지 범위를 향상하였다. 또한 감마선 조사 시험을 통해 방사선 분포 탐지 범위의 개선을 확인하였다.

생물의약품 제조공정에서 Bovine Parvovirus 정량 검출을 위한 Real-Time PCR (Real-Time PCR for Quantitative Detection of Bovine Parvovirus during Manufacture of Biologics)

  • 이동혁;이정희;김찬경;김태은;배정은;김인섭
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제36권3호
    • /
    • pp.173-181
    • /
    • 2008
  • 소의 혈액, 세포, 조직, 기관 등은 생물의약품과 조직공학제제, 세포치료제의 원료로 널리 사용되고 있다. 소유래 물질을 원료로 사용한 제제의 경우 소유래 원료 물질에 다양한 바이러스가 오염된 사례가 있기 때문에 바이러스 안전성 검증이 필수적이다. BPV는 소에게 가장 흔하게 감염되는 바이러스 중의 하나이다. 소유래 물질을 원료로 하는 생물의약품, 조직공학제제, 세포치료제 등에서 BPV 안전성을 확보하기 위해, 원료물질, 제조공정, 완제품에서 BPV를 정량적으로 검출하고, 제조공정에서 BPV 제거 검증을 위한 시험법으로 활용이 가능한 BPV real-time PCR 시험법을 확립하였다. BPV에 특이적인 primer를 선별하였으며, 형광염료 SYBR Green I을 사용하여 BPV DNA 정량 검출 시험법을 최적화하였다. 세포배양법에 의한 감염역가와 비교한 결과 real-time PCR 민감도는 $1.3{\times}10^{-1}\;TCID_{50}/mL$이었다. 확립된 시험법의 신뢰성(reliability)을 보증하기 위해 시험법 검증을 실시한 결과 특이성(specificity)과 재현성 (reproducibility)이 우수함을 확인하였다. 확립된 real-time PCR을 생물의약품 제조공정 검증에 적용할 수 있는지 확인하기 위하여 인위적으로 BPV를 오염시킨 CHO 세포주와 소유래 콜라겐에서 BPV 검출 시험을 실시하였다. BPV를 감염시킨 CHO 세포에서 세포변병효과를 관찰할 수 없었지만, 세포와 세포배양 상청액에서 BPV를 정량적으로 검출할 수 있었다. 소유래 콜라겐에서도 $1.3{\times}10^0\;TCID_{50}/mL$까지 정량적으로 검출할 수 있었다.

위생매립지 누출검지 및 누출위치 파악을 위한 전극배치시스템 개발 (Development of new electrical leakage detection system for waste landfil)

  • 한상재;신현영;정재현;김수삼
    • 한국지반공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국지반공학회 2008년도 춘계 학술발표회 초청강연 및 논문집
    • /
    • pp.242-250
    • /
    • 2008
  • Lining systems are used for two purpose in landfills : as covers to minimize leachate generation and surface water contamination by providing a barrier from precipitation and other percolating waters, and as containment liners to contain leachate and minimize its downward migration into underlying groundwater. So identifying leaks in landfill liners is an essential part of waste management. There are many leakage detection systems to monitor and seek leakage location, such as two electrode method, electrode grid method, diffusion hoses, capacitance sensors and tracers sensing cables. However, most of them can be applied in the new landfill construction sites because sensors must be installed prior to work. This paper presents a new type of leakage detection system, so called fence type electrode arrangement system, to monitor leakage and to seek leakage location in working landfill as well as new landfill. This system is based on the measurement of an electrical current flowing through leakage point. Series of laboratory tests are performed to investigate an availability of this system and this paper present some of these results.

  • PDF

Rapid Quantification of Salmonella in Seafood Using Real-Time PCR Assay

  • Kumar, Rakesh;Surendran, P.K.;Thampuran, Nirmala
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제20권3호
    • /
    • pp.569-573
    • /
    • 2010
  • A quantitative detection method for Salmonella in seafood was developed using a SYBR Green-based real-time PCR assay. The assay was developed using pure Salmonella DNA at different dilution levels [i.e., 1,000 to 2 genome equivalents (GE)]. The sensitivity of the real-time assay for Salmonella in seeded seafood samples was determined, and the minimum detection level was 20 CFU/g, whereas a detection level of 2 CFU/ml was obtained for pure culture in water with an efficiency of ${\geq}85%$. The real-time assay was evaluated in repeated experiments with seeded seafood samples and the regression coefficient ($R^2$) values were calculated. The performance of the real-time assay was further assessed with naturally contaminated seafood samples, where 4 out of 9 seafood samples tested positive for Salmonella and harbored cells <100 GE/g, which were not detected by direct plating on Salmonella Chromagar media. Thus, the method developed here will be useful for the rapid quantification of Salmonella in seafood, as the assay can be completed within 2-3 h. In addition, with the ability to detect a low number of Salmonella cells in seafood, this proposed method can be used to generate quantitative data on Salmonella in seafood, facilitating the implementation of control measures for Salmonella contamination in seafood at harvest and post-harvest levels.