• 제목/요약/키워드: conformation

검색결과 970건 처리시간 0.027초

황촉규근(黃蜀葵根) 점액(粘液)에 관한 연구(硏究) -[제오보(第五報)] 초기점도변화(初期粘度變化)의 동역학적고찰(動力學的考察)- (Studies on the Mucilage of the Root of Abelmoschus manihot, MEDIC -[Part V] Kinetics of initial viscosity-)

  • 온두현;임제빈;손주환
    • Applied Biological Chemistry
    • /
    • 제22권1호
    • /
    • pp.42-50
    • /
    • 1979
  • 본(本) 연구(硏究)에서 얻은 결과(結果)를 종합(綜合)하면 다음과 같다. 1. 황촉규근(黃蜀葵根) 점액(粘液)의 온도변화(溫度變化)에 따른 회전점도(回轉粘度)의 회복(回復)은 $5^{\circ}{\sim}30^{\circ}C$ 범위(範圍)에서는 조(組) 81%, $5{\sim}95^{\circ}C$ 범위(範圍)에서는 조(組) 53% 회복(回復)된다. 2. 황촉규근(黃蜀葵根) 점액(粘液)의 점도변화(粘度變化)는 $5{\sim}50^{\circ}C$범위(範圍)에서 Andrade equation이 잘 적용(適用)되며 여러가지 방법(方法)으로 전처리(前處理)한 황촉규근(黃蜀葵根) 점액(粘液)의 점도변화(粘度變化)에 대한 activation energy $12{\sim}14$ Kcal/mole, activation entropy는 $12{\sim}15e.u.$ 범위(範圍)이다. 3. Autoclave처리(處理) 또는 formalin 처리(處理)한 황촉규근점액(黃蜀葵根粘液)의 activation energy는 다른것보다 큰 값이 계산(計算)되었고, 또 질소기류내(窒素氣流內)에서의 activation energy 값이 큰 값으로 계산(計算)되었는 결과(結果)로 점도(粘度)의 변화(變化)에 생물학적(生物學的) 요인(要因)이 크게 관여(關與)할 것으로 추측(推測)된다. 4. 단시간내(短時間內)의 점도변화(粘度變化)에 대한 도도(渡度) 의존성(依存性)은 비교적(比較的) 작고 $5^{\circ}{\sim}50^{\circ}C$, 72시간내(時間內)에서는 점도변화(粘度變化)에 관여(關與)할 분자구조(分子構造)의 전환(轉換)에 대한 도도의존성(渡度依存性)도 작다. 따라서 이 범위내(範圍內)에서의 점도변화(粘度變化)의 주요인(主要因)은 점질물(粘質物)의 분선현상(分鮮現象)과 conformation의 전환(轉換)이라 추측(推測)된다.

  • PDF

유비퀴틴 단백질의 부분적으로 폴딩된 구조에 대한 분광학적 분석 (Spectroscopic Analysis of Partially Folded State of Ubiquitin)

  • 박순호
    • Applied Biological Chemistry
    • /
    • 제46권4호
    • /
    • pp.305-310
    • /
    • 2003
  • Hydrophobic core가 변이된 유비퀴틴 단백질이 pH 2 용액에서 보이는 구조적인 특성을 여러 분광학적 방법으로 측정하였다. 낮은 pH값을 갖는 용액에서 이 변이 유비퀴틴의 intrinsic tryptophan fluorescence emission spectrum은 unfolded 상태보다 약간 blue shift되어 있고 또한 그 intensity도 상당히 낮게 나타났다. 이는 이 용액 조건에서 이 변이 유비퀴틴의 삼차구조가 약간 남아 있는 것을 의미한다. 같은 용액에서 이 변이 유비쥐틴의 far-UV circular dichroic spectrum은 native 상태나 unfolded 상태의 spectrum과 현저히 달랐으며 220 nm 에서의 molar ellipticity 값을 통하여 볼 때 pH 2인 용액에서 상당량의 이차구조를 지니고 있었다. 또한 같은 용액에서 이 변이 유비퀴틴은 hydrophobic dye인 8-anilinonaphthalene-1-sulfonic acid(ANS)외 fluorescence emission intensity를 증가시키고 fluorescence emission maximum이 짧은 파장에서 나타나게 하였다(blue shift). 이러한 현상은 pH 2 용액에서 이 변이 유비퀴틴의 hydrophobic core가 느슨하여져서 hydrophobic dye인 ANS가 결합할 수 있는 구조를 띠고 있음을 나타낸다. 이러한 분광학적인 관찰은 이 변이 유비귀틴이 pH 2인 용액에서 상당량의 이차구조를 지니고 있지만 hydrophobic core는 느슨하게 형성된 molten globule과 같은 형태를 지니고 있음을 나타낸다. 이 변이 유비퀴틴의 molten 히obule 형태는 단백질 폴딩 반응의 경로를 연구할 수 있는 좋은 모델이 될 수 있을 것으로 생각된다.

Biological Function of Single Chain Glycoprotein Hormone Mutants

  • Min, Kwan-Sik;Chang, Yoo-Min;Chang, Sun-Hwa;Lee, Hyen-Gi;Lee, Yun-Gun;Chang, Won-Kyong;Cheong, Il-Cheong
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국동물번식학회 2001년도 춘계학술발표대회
    • /
    • pp.54-54
    • /
    • 2001
  • Human chorionic gonadotropin (hCG) is a member of the glycoprotein hormone family which includes FSH, hCG, TSH. These hormone family is characterized by a heterodimeric structure composed a common $\alpha$-subunit noncovalently linked to a hormone specific $\beta$-subunit. The correct conformation of the heterodimer is also important for efficient secretion, hormone-specific post-translational modifications, receptor binding and signal transduciton. To determine $\alpha$ and $\beta$-subunits can be synthesized as a single polypeptide chain (tethered-hCG) and also display biological activity, the tethered-hCG molecule by fusing the carboxyl terminus of the hCG $\beta$-subunit to the amino terminus of the $\alpha$-subunit was constructed and transfected into chinese hamster ovary (CHO-K1) cells. We also constructed C-terminal deletion mutants (D9l, D89, D88, D87, D86, D84, D83) of single chain hCG to determine the biological function (secretion, LH-activity, receptor binding, cAMP production) of these mutants. Between six and eight stably transfected pools of cells expressing wild type and mutant hCGs were selected for neomycin resistant. The hCGs secreted by the stably transfected cells into serum-free media were collected and quantified by radioimmunoassay, as described in protocol (DPC(hCG IRMA). LH activity was in terms of testosterone production and aromatase activity in primary cultured rat Leydig cells. The tethered-wthCG was efficiently secreted and showed similar LH-like activity to the dimeric hCG. The D83hCG mutant was not detected in this assay. It is suggest that hCG C-terminal part is very important for hCG secretion. Now, we checking the LH-like activity of these mutant hCGs. These data indicate that the constructs of tethered molecule will be useful in the study of mutants that affect subunit association and/or secretion.

  • PDF

Neuropeptide $\gamma$의 구조 및 생리활성 (Conformation and Biological Activity of the Neuropeptide $\gamma$)

  • 구희정;서정길;김은희;허민도;정준기;박장수;강신원;박남규
    • 한국수산과학회지
    • /
    • 제30권2호
    • /
    • pp.244-251
    • /
    • 1997
  • 생리활성을 지닌 신경펩타이드의 구조와 활성간의 관계를 규명하기 위하여 고상법으로 합성한 세 종류의 neuropeptide $\gamma$(mammalian-, trout- 그리고 goldfish-neu-ropeptide $\gamma$)를 사용하여 연구하였다. Circular dichroism spectra에 의하면 mammalian-, trout-와 goldfish-neurope-ptide $\gamma$는 완충액 조건하에서 모두 random한 구조를 나타내었다. 중성 및 산성 지질 존재 하에서, mammalian과 trout-neuropeptide $\gamma$는 여전히 random한 구조를 취했다. 그러나, goldfish-neuropeptide $\gamma$는 중성 및 산성지질하에서 부분적으로 $\alpha-helix$ 구조를 나타내었다. 장관 수축활성 에 있어서는 carp 장관, guinea-pig 회장 그리고 rat 십이지장에 대하여 비교하였다. Carp에 대해서는 goldfish-neuropeptide $\gamma\;\simeq$ trout-neuropeptide $\gamma\;>$ mammalian- neuropeptide $\gamma$ 순으로 활성이 나타났다. 그러나, guinea-pig 회장과 rat 십이지장에 대해서 mammalian-neuropeptide $\gamma$는 어류 유래성 neuropeptide g들 보다 높은 수축활성을 나타내었다. 이러한 결과들은 neuropeptide $\gamma$들이 종-특이적인 활성을 나타낸다는 것을 제시한다.

  • PDF

제초성 3-Phenyl-5-(3,7-dichloro-8-quinolinyl)-1,2,4-oxadiazole 유도체들의 정량적인 구조와 생장 저해 활성과의 관계 (Quantitative structure-activity relationships for the growth inhibition activity of the herbicidal 3-phenyl-5-(3,7-dichloro-8-quinolinyl)-1,2,4-oxadiazole derivatives)

  • 성낙도;이상호;김형래;송종환
    • 농약과학회지
    • /
    • 제6권4호
    • /
    • pp.279-286
    • /
    • 2002
  • Quinclorac계의 새로운 제초성 화합물을 탐색하기 위하여 기질 화합물로 3-phenyl-5-(3,7-dichloro-8-quinolinyl)-1,2,4-oxadiazole 유도체들을 합성하고 정량적인 구조와 벼(Or-yza sativa L.) 및 논피(Echinochloa crus-galli)에 대한 생장 저해활성($pI_{50}$)과의 관계(QSAR)를 분석하였다. 그 결과, 기질물질은 평면성 화합물로서 벼보다는 논피에 대하여 비교적 높은(논피>벼) 생장 저해활성을 나타내었으며 벼는 전자적 성질(줄기: ${\sigma}_{opt.}=0.49$ 및 뿌리 $R_{opt.}=-0.15$)에 그리고 논피는 줄기와 뿌리, 두 부위 모두 소수성(${\pi}_{opt.}=0.37{\sim}2.40$)에 의존적이었다. QSAR 모델로부터 논피에 대한 선택성 조건은 ortho-치환된 전자 밀게로서 소수성(${\pi}$)이 2.40인 치환체가 phenyl 고리상에 도입되는 경우이었다. 그리고 고활성 분자로서 예측된 2-tolyl 또는 3-tolyl 치환체(${\Delta}pI_{50}=1.26$) 등은 선택성 징후가 엿보이는 화합물이었다.

고추 역병균에 대한 3-phenylisoxazole과 3-phenyl-2,5-dihydroisoxazol-5-one 유도체들의 살균 활성에 관한 비교 분자장 분석 (CoMFA) (Comparative molecular field analyses (CoMFA) on the antifungal activity against phytophthora blight fungus of 3-phenylisoxazole and 3-phenyl-2,5-dihydroisoxazol-5-one derivatives)

  • 성낙도;이희철
    • 농약과학회지
    • /
    • 제6권2호
    • /
    • pp.72-79
    • /
    • 2002
  • 일련의 3-phenyl-2,5-dihydroisoxazol-5-one(A)과 3-phenylisoxazole(B)유도체 중, 치환-phenyl기가 변화함에 따라 metalaxyl 살균제에 대하여 감수성(SPC:95C C7105)이나 저항성(RPC: 95CC7303)을 나타내는 고추역병균(Phytophthora capsici)의 살균활성 에 관한 비교 분자장 분석(CoMFA) 결과를 검토하였다. 살균활성은 (A)가 (B)보다 큰 경향이었으며 활성을 나타내는 가장 안정한 기질 분자의 형태는 평면성에 가까운 구조이었다. 두 균주를 대상으로 살균 활성에 미치는 CoMFA 장을 계산한 바, 상대적인 기여도는 공히, 정전기장이 가장 우세하였고 소수성장 및 입체장은 비슷한 정도로 기여하였다. 또한, CoMFA 모델은 좋은 상관성과 높은 예측성($q^2>0.570$$r^2>0.968$)을 나타내었다. 등고도 분석으로부터 RPC에 대한 살균활성의 선택성 요소는 benzoyl-기의 ortho, meta(C14 및 C15) 위치에는 부피가 큰 치환체를 그리고 meta, para(C15 및 C16) 위치부근에는 음하전을 생성하는 전자끌게가 도입되어야 할 것으로 판단된다.

Three Non-Aspartate Amino Acid Mutations in the ComA Response Regulator Receiver Motif Severely Decrease Surfactin Production, Competence Development, and Spore Formation in Bacillus subtilis

  • Wang, Xiaoyu;Luo, Chuping;Liu, Youzhou;Nie, Yafeng;Liu, Yongfeng;Zhang, Rongsheng;Chen, Zhiyi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제20권2호
    • /
    • pp.301-310
    • /
    • 2010
  • Bacillus subtilis strains produce a broad spectrum of bioactive peptides. The lipopeptide surfactin belongs to one well-known class, which includes amphiphilic membrane-active biosurfactants and peptide antibiotics. Both the srfA promoter and the ComP-ComA signal transduction system are an important part of the factor that results in the production of surfactin. Bs-M49, obtained by means of low-energy ion implantation in wild-type Bs-916, produced significantly lower levels of surfactin, and had no obvious effects against R. solani. Occasionally, we found strain Bs-M49 decreased spore formation and the development of competence. Blast comparison of the sequences from Bs-916 and M49 indicate that there is no difference in the srfA operon promoter PsrfA, but there are differences in the coding sequence of the comA gene. These differences result in three missense mutations within the M49 ComA protein. RT-PCR analyses results showed that the expression levels of selected genes involved in competence and sporulation in both the wild-type Bs-916 and mutant M49 strains were significantly different. When we integrated the comA ORF into the chromosome of M49 at the amyE locus, M49 restored hemolytic activity and antifungal activity. Then, HPLC analyses results also showed the comA-complemented strain had a similar ability to produce surf actin with wild-type strain Bs-916. These data suggested that the mutation of three key amino acids in ComA greatly affected the biological activity of Bacillus subtilis. ComA protein 3D structure prediction and motif search prediction indicated that ComA has two obvious motifs common to response regulator proteins, which are the N-terminal response regulator receiver motif and the C-terminal helix-turn-helix motif. The three residues in the ComA N-terminal portion may be involved in phosphorylation activation mechanism. These structural prediction results implicate that three mutated residues in the ComA protein may play an important role in the formation of a salt-bridge to the phosphoryl group keeping active conformation to subsequent regulation of the expression of downstream genes.

계태아 발생시 TGF-$\beta$3가 구개판 내측돌기상피의 상피간엽변환 및 상피성장인자수용체 발현에 미치는 영향 (Effects of TGF-$\beta$3 on Epithelial-mesenchymal transformation and Epidermal growth factor receptor expression in palatogenesis of chicken embryo)

  • 양병은;이종호
    • 대한구순구개열학회지
    • /
    • 제4권1호
    • /
    • pp.13-26
    • /
    • 2001
  • Cleft lip and/or palate is the congenital orofacial malformation most commonly occurred in humans, The disease is multifactorial and is probably caused by genetic and/or environmental factors, So, there are many problems in research concerning etiology and in treatment of the disease, Even the most practiced and sophisticated methods of surgical repair are necessarily followed by scar contraction and fibrosis, which result in skeletal defects, dental abnormalities, cosmetic disfigurement, and speech impairment, As a result, Fetal surgery can be considered but practiced rarely when the deformity is not fatal to life, And treatment of cleft palate is performed in the form of medicine projection into uterus in animal experiments, Many studies show that growth factor and its receptor emerge from the developing palate; and the epidermal growth factor receptors have a important role in craniofacial development and in palatal fusion, The palatal morphogenesis of the avine is different from the mammal's; it takes the form of physiologic cleft palate, Recently, cleft palate fusion experiment was performed when the avine were in the period of palate formation through the exogenous TGF-β3 addition, and it showed that the exogenous TGF-β3 makes fusion of divided palate through certain process when cleft palate is occurred in palatal formation, In this study, I had the conformation of the fusion of cleft palate through the addition of TGF-β in case of chicken embryo, and observed the effect of TGF-β in EGF receptor distribution, And the following is the results of this study, 1. In case of the TGF-βl and β3 addition group, there was the decrease of EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor) immunoreactivity in mesenchymal cells beneath the medial edge epithelium and also in epithelial mesenchymal interface which is between medial edge epithelium and nasal septum in 72 hours, 2, The immunoreactivity of the control group resembles that of normal chicken embryo palate in development, 3. In the view through fluorescence confocal microscopy, there was confluence in TGF-β3 addition group, This shows that the confluence induced by exogenous TGF-β3 is related to EGFR expression in palate of chicken embryo, which is a physiologic cleft palate model.

  • PDF

결핵균 katG 유전자내 463 Codon 돌연변이와 Isoniazid내성 관계 (The Relationship between Isoniazid Resistance and 463 CodonMutation of katG Gne in Mycobacterium Tuberculosis)

  • 박영길;심명섭;조상현;배길한;김상재
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
    • /
    • 제43권1호
    • /
    • pp.8-13
    • /
    • 1996
  • 연구배경: 결핵균 katG유전자내 463 codon의 돌연변이는 INH 내성과 관련이 있을 것으로 보고되고 있어서 INH 감수성 균주를 대상으로 katG 유전자내 463 codon의 돌연변이 발생빈도를 관찰하여 INH 내성과의 관련성을 밝히고자 하였다. 방법: INH 감수성 균주(MIC${\geq}\;0.2{\mu}g/ml$) 28주를 선정하여 DNA를 추출하여 katG 유전자내 463 codon을 포함하는 지역을 PCR로 증폭 합성하였다. PCR산물을 제한효소인 Msp I으로 처리하여 절단 여부를 관찰하였고 그리고 SSCP로 표준균주와 차이를 관찰하였다. 결과: INH 감수성 균주 28주 중에서 7주(25%)만이 제한효소 Msp I에 의해 절단 되었다. 절단되지 않은 21주(75%)는 SSCP에서도 표준균주와 다른 양상을 나타내었다. 제한 효소로 절단되지 않은 균주의 katG 유전자를 염기서열 분석한 결과 463 codon Arg(CGG)이 Leu(CTG)으로 치환 되어있었다. 결론: INH내성에 영향을 줄 것으로 추정 되고있던 katG 유전자 463 codon 돌연변이는 INH 내성과 무관한 것으로 판명되었다.

  • PDF

한국인에서의 TNF-α 유전자 다형성과 HLA/TNF-α 일배체형의 분포 (Polymorphisms in the TNF-α Gene and Extended HLA and TNF-α Haplotypes in Koreans)

  • 박윤준;박혜진;박명희
    • IMMUNE NETWORK
    • /
    • 제2권4호
    • /
    • pp.242-247
    • /
    • 2002
  • Background: Tumor necrosis factor-alpha (TNF-$\alpha$) is known to play an important role in various conditions such as inflammation, autoimmunity, apoptosis, insulin resistance and sleep induction. Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been known to affect the transcriptional activities of TNF-$\alpha$: -1,031T/C, -863C/A, -857C/T, -308G/A and -238G/A. Methods: We have investigated 5 SNPs of the promoter region of TNF-$\alpha$ gene, the distribution of 5-locus TNF-$\alpha$ haplotypes, and their haplotypic associations with previously typed HLA-A, -B and -DRB1 loci in 107 healthy unrelated Koreans. TNF-$\alpha$ SNPs were typed using PCR-single-strand conformation polymorphism (SSCP) and PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) methods. Results: The allele frequencies of -1,031C, -863A, -857T, -308A, and-238A, which are known as the high-producer-type, were 19.3%, 15.9%, 14.0%, 5.9%, and 2.9%, respectively. The frequency of -308A allele, known to be associated with autoimmune diseases, was 5.9% in Koreans which was lower than Caucasians (14~17%) and somewhat higher than Japanese (1.7%). Five most common TNF-$\alpha$ haplotypes (-1,031/-863/-857/-308/-238) comprised over 95% of total haplotypes: TCCGG (58.4%), CACGG (14.8%), TCTGG (13.7%), TCCAG (5.3%), and CCCGA (3.1%). Strong positive associations (P<0.001) were observed between TCCGG and B62; between CACGG and B51, $DRB1^*0901$; between TCTGG and B35, B54, B59, $DRB1^*1201$; and between TCCAG and A33, B58, $DRB1^*0301$, $DRB1^*1302$. Five most common extended haplotypes (>3%) comprised around 16% of total haplotypes: A33-B58-TCCAG-$DRB1^*1302$, A24-B52-TCCGG-$DRB1^*1502$, A33-B44-TCCGG-$DRB1^*1302$, A24-B7-TCCGG-$DRB1^*0101$, and A11-B62-TCCGG-$DRB1^*0406$. The distribution of extended HLA and TNF-$\alpha$ haplotypes showed that most of HLA haplotypes were almost exclusively associated with particular TNF-$\alpha$ haplotypes. Conclusion: The results obtained in this study would be useful as basic data for anthropologic studies and disease association studies in Koreans.