This study was designed to determine whether or not Vibrio vulnificus metalloprotease VvpE can promote iron uptake via the proteolytic cleavage of human hemoglobin. We found that V. vulnificus utilized hemoglobin as an iron source more efficiently via the vulnibactin-mediated iron-uptake system than via the HupA-mediated iron-uptake system and, of the proteases produced by V. vulnificus, VvpE was found to be the only protease capable of destroying hemoglobin. However, VvpE expression, on both the transcriptional and protein levels, was suppressed in iron-limited media. However, vvpE transcription, but not extracellular VvpE production, was reactivated by the addition of hemoglobin or inorganic iron into iron-limited media. Moreover, vvpE transcription began only in the late growth phase when V. vulnificus had already consumed most of the iron for growth. In addition, neither vvpE mutation nor in trans vvpE complementation affected the ability of V. vulnificus to acquire iron or to grow in iron-limited media or in cirrhotic ascites containing hemoglobin. Hemoglobin added into iron-limited media was not destroyed, but gradually formed an insoluble aggregate during culture; this aggregation of hemoglobin occurred regardless of vvpE mutation or complementation. These results indicate that VvpE is not required for efficient iron uptake from hemoglobin. On the contrary, hemoglobin or iron is required for efficient vvpE transcription. In addition, a discrepancy exists between vvpE transcription and extracellular VvpE production in iron-limited media containing inorganic iron or hemoglobin, which suggests that additional unknown posttranscriptional events may be involved in the extracellular production of VvpE.
Differential display 방법으로 NaCl에 의하여 발현이 증가되는 cDNA들을 분리하였으며 그중 하나가 식물유래의 outer envelope membrane protein과 높은 유사성을 보였으므로 이를 ShOEP로 명명하였다. ShOEP는 1293 bp 길이에 359개의 아미노산으로 구성된 open reading frame을 포함하고 있으며, 이로부터 추정되는 분자량은 8.9 kDa이었다. ShOEP 단백질은 애기장대의 OEP와는 40.6%, 시금치와는 38%의 유사성을 나타내었다. Northern 분석결과, ShOEP 유전자는 NaCl의 농도가 증가함에 따라 발현량이 급격히 증가하는 것으로 나타났다. 염생식물인 퉁퉁마디의 OEP는 PEG에 의하여 발현이 증가하는 반면 비염생식물인 애기장대의 OEP는 큰 차이를 보이지 않았다. 효모 complementation 실험결과 ShOEP는 NaCl에 특이적이었으며 식물의 염분스트레스 내성 기작에 직접적으로 관여하고 있음을 알 수 있었다.
대장균 염색체의 acetyl CoA carboxylase (fabE)영역 (염색체 지도상 72분 영역)의 유전자를 가진 결함형질도입 파아지를 분리했다 이 형질도입 파아지로부터 20 Md의 염색체 유래의 DNA를 분리하여 제한효소 지도를 작성했으며 이 영역에는 제한효소 Eco RI의 절단부위는 없었다. 형질도입 파아지 DNA의 제한효소 분해산물들은 pACYC 184 플라스미드 벡터에 재클로닝하여 fab E의 온도감수성 변이를 회복할 수 있는 수 종류의 플라스미드를 분리했다. 이들 플라스미드를 분석하여 fab E 유전자는 7, 4Md Bel II 단편상의 Hind III의 절단부위를 가진 3.4 Md Ban HI-Sal I 단편내에 존재함을 밝혔다.
이 글은 1997년도에 개봉된 <신세기 에반게리온 극장판: The End of Evangelion>에 나타난 구원관 연구를 주목적으로 한다. 구원을 이야기 할 때에는 지금 상황에 대한 부정적 인식을 전제로 한다. 역사 종교들이라 할 수 있는 그리스도교, 불교, 이슬람 등도 예외는 아니다. 그들 역시 인간의 원죄를 이야기 하고, 또 인간의 어두움(無明)을 지적한다. 그러한 원죄와 무명이 인간을 보다 더 완벽한 경지로 가지 못하도록 한다고 본 것이다. <에바>의 구원관도 그런 구조적 특징을 공유한다. <에바>에서 구원을 요청하는 그룹은 크게 3가지로 나눌 수 있다. <젤레>와 겐도, 그리고 신지 등은 각자의 희망에 따라 구원을 요청하고 실현하려 애쓴다. 하지만 이들 역시 인류 전체를, 혹은 개인을 결핍의 존재라고 보고 있다는 점에서 보편적인 구원관을 유지하고 있다고 할 수 있다. 또한 구원의 완성을 '지금', 그리고 '이곳'에 두고 있다는 점에서 현세적 특징이 강하다고 할 수 있다. 그리고 이 점에서 <에바>의 구원관은 기존 종교들과 공유하는 바가 적지 않음을 이 글을 통해 살펴볼 수 있었다.
Li, Feng-Ying;Ren, Xiao-Bin;Xie, Xin-You;Zhang, Jun
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제14권12호
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pp.7203-7206
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2013
Recent studies suggested that the ovarian cancers with negative excision repair cross-complementation group 1 enzyme (ERCC1) expression have a better response to platinum-based chemotherapy than those with positive ERCC1 expression. The objective of this study was to evaluate whether ERCC1 expression is associated with response to platinum-based chemotherapy in ovarian cancers. MEDLINE, PubMed, Web of Science and CNKI databases were used for searching studies relating to ERCC1 protein expression and response to platinum-based chemotherapy in ovarian cancers. Statistical analysis was based on the method for a fixed effects meta-analysis. Pooled odds ratios (ORs) with 95% confidence intervals for ERCC1 protein expression and response to platinum-based chemotherapy were generated. Publication bias was investigated with Begg's test. Five studies involving 306 patients with ovarian cancer were included. Compared to patients with positive ERCC1 expression, those with negative ERCC1 expression had a better response to platinum-based chemotherapy. The pooled OR was 5.264 (95% CI: 2.928-9.464, P < 0.001) and publication bias was not found (P = 0.904). The result was similar in both in Asians and Caucasians (P < 0.001 and P = 0.028, respectively). ERCC1 protein expression status is significantly associated with response to platinum-based chemotherapy in ovarian cancers.
진핵세포 유전자의 기초대사발현의 조절계를 밝히기 위한 일환으로, 효모의 histidine생합성계 효소의 구조유전자 HIS5를 이용하였다. HIS5 유전자는 충분한 아미노산 조건하에서는 발현이 억제되어 비교적 높은 기초발현만을 하나, 어떤 아미노산이 결핍되면 탈억제되어 높은 발현량을 보이며 탈억제는 cis의 작용인자인 promoter상의 5'-TGACTC-3' 및 trans 작용인자 GCN4와 GCD17 GCN2등이 관여한다. trans 작용인자들에 의한 HIS5 유전자의 발현량의 변화를 간단하게 측정하기 위하여, HIS5 promoter와 repressible acid phoshates(APase)의 구조유전자중 promoter를 제거한 DNA단편을 연결시켜 HIS5-PHO5 융합유전자를 이용하였다. gcn2 및 gcn4 변이주의 APase 활성은 야생주와 비교하여 3내지 4배 낮았으며, gcn2변이주와 gcn2 gcn4 이중변이주의 APase 활성은 유사하였다.
Streptomyces coelicolor를 화학적 방법으로 돌연변이시킨 결과, 유전적 교잡방법에 의해 bldA와 유사한 위치인 10시 방향으로 위치가 결정되는 변이주들을 찾아내었다. 이들의 자세한 위치를 점검한 결과 cysA를 중심으로 반시계 방향으로 떨어져 있는 group고가 시계방향으로 떨어져 있는 두가지로 나뉘었다. 반시계 방향으로 떨어져 있는 변이주들을 bldA와 유사한 변이주라고 생각되어 이를 확인하기 위해 정상적인 bldA 유전자가 cloning 되어 있는 phage를 이용하여 기능적인 complementation 여부를 확인하여 보았다. Complementation이 되는 것으로 미루어 보아 이 변이주들이 bldA의 allele일 가능성이 매우 높으나 이들 중 몇몇 변이주들은 기존의 bldA와 무척 다른 양상을 보였다. 즉, 고영양 배지인 $R_2$YE배지에서 왕성하게 spore를 생산하며 wild type이 생산하는 이상의 색소 생산을 보인 점이다. 이때까지 발견된 bldA 변이주들은 배지 조성에 따라 약간의 aerial mucelium을 형성하는 것이 보고되었으나 이렇게 조건에 따라서는 완전히 bld phenotype을 잃는 변이주는 보고되지 않았다. 이 색소 생산이 실지로 항생물질 유전자의 발현에 의한 것이라는 것을 xylE fusion을 이용했을 때 유전자의 전사가 일어나는 것이 확인됨으로써 증명되었다. 또 이들 bldA 유사 변이주들은 actII-ORF4가 높음 copy수로 들어있는 pasmid에 의해 act 유전자를 발현하는 것도 관찰되었다.
Park, S.M.;Song, S.J.;Uhm, S.J.;Cho, S.G.;Park, S.P.;Lim, J.H.;Lee, H.T.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제17권12호
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pp.1641-1646
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2004
The objective of this study was to generate transgenic mice expressing human resistin gene by using the tetraploidembryonic stem (ES) cell complementation method. Human resistin gene was amplified from human fetal liver cDNA library by PCR, cloned into $pCR^{(R)}$ 2.1 $TOPO^{(R)}$ vector and constructed in pCMV-Tag4C vector. Mammalian expression plasmid containing human resistin was transfected into D3-GL ES cells by Lipofectamine 2,000, and then after 10-12 days of transfection, the human resistin-expressing cells were selected with G418. In order to produce tetraploid embryos, blastomeres of diploid embryos at the two-cell stage were fused with two times of electric pulse using 60 V 30 $\mu$sec (fusion rate: 2,114/2,256, 93.5%) and cultured up to the blastocyst stage (development rate: 1,862/2,114, 94.6%). The selected 15-20 ES cells were injected into tetraploid blastocysts, and then transferred into the uteri of E 2.5 d pseudopregnant recipient mice. To investigate the gestation progress, two E 19.5 mused fetuses were recovered by Cesarean section of which one fetus was confirmed to contain human resistin gene by genomic DNA-PCR. Therefore, our findings demonstrate that tetraploid-ES mouse technology can be considered as a useful tool to produce transgenic mice for the rapid analysis of gene function in vivo.
Objective: We aimed to analyze the association between excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 1 (XRCC1) and ovarian cancer risk. Methods: We performed a hospital-based case-control study with 155 cases and 313 controls in China. All Chinese cases with newly diagnosed primary ovarian cancer between May 2005 to May 2010 in our hospital were invited to participate within 2 months of diagnosis. Controls were randomly selected from people who requested general health examinations in the same hospital during the same period. SNPs in EXCC1, ERCC1 C8092A and ERCC1 T19007C, were analyzed by PCR-RFLP method. Results: We observed a non-significantly increased risk of ovarian cancer among individuals with ERCC1 8092TT compared with those with the 8092CC genotype (adjusted OR=1.55, 95% CI%=0.74-2.97). Moreover, 19007TT genotype carriers also showed a non-significant increased risk of ovarian cancer over those with the 19007CC genotype (adjusted OR=1.78, 95% CI%=0.91-3.64). Conclusion: Our firstly investigation of links between polymorphisms in the ERCC1 gene and the risk of ovarian cancer in Chinese population demonstrated no significant association. Further large sample studies in Chinese populations are needed.
Complementation cloning of the argC, E, B, D, F, and G genes in Corynebacterium glutamicum was done by transforming the genomic DNA library into the corresponding arginine auxotrophs fo Escherichia coli. Recombinant plasmids containing 6.7 kb and 4.8kb fragments complementing the E. coli argB mutant were also able to complement the E. coli argC, E, A, D, and F mutants, indicating the clustered organization of the arginine biosynthetic genes within the cloned DNA fragments. The insert DNA fragments in the recombinant plasmids, named pRB1 AND pRB2, were physically mapped with several restriction enzymes. By further subcloning the entire DNA fragment containing the functions and by complementation analysis, we located the arg genes in the order of ACEBDF on the restriction map. We also determined the DNA nucleotide sequence of the fragment and report here the sequence of the argB gene. When compared to that with the mutant strain, higher enzyme activity of N-acetylglutamate kinase was detected in the extract of the mutant carrying the plasmid containing the putative argB gene, indicating that the plasmid contains a functional argB gene. Deduced amino acid sequence of the argB gene shows 45%, 38%, and 25% identity to that from Bacillus strearothermophilus, Bacillus substilus, and E. coli respectively. Our long term goal is genetically engineering C. glutamicum which produces more arginine than a wild type strain does.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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