New cellulase genes, named as CelV2 and CelN1, respectively, were isolated from Erwinia carotovora ATCC15713 and expressed in E. coli. The CelV2 and CelN1 gene were PCR amplified with degenerated primers and PCR products were sequenced and expressed in E. coli. Two new cellulase genes showed 97% homologies with previously reported Erwinia cellulase genes. The recombinant cellulase were purified with Ni-NTA column chromatography and its enzymatic properties were characterized. The optimum temperature of two enzymes were about $50^{\circ}C$ degree and optimum pH were around pH7.0. The newly isolated celluase genes could be used for enhancing substrate range of alcohol-producing bacteria such as Zymomonas mobilis.
Clostridium thermocellum의 cellulase 유전자를 pBR322를 이용하여 Escherichia coli에 cloning하였다. 삽입된 Hind III 분해 DNA 단편의 크기는 약 1. 8kb였으며 이미 알려진 C. themocellum의 cellulase gene과는 다른 제한효소 분해위치를 가진 새로운 cellulase gene으로서 E, coli에서 CMCase와 FPase 활성을 나타내었다. 이 유전자는 생육의 전시기를 통해 표현되었고 고온성 cellulase의 구조적, 기능적 특성이 그대로 유지되었을 뿐만 아니라 상당량이 세포밖으로 분비되었다.
Carboxymethylcellulose (CM-cellulose)와 Beechwood xylan을 각각 기질로 사용하여 trypan blue를 첨가하여 제작한 Agar-LB 배지 상에서 명확한 활성환을 형성하는 균주를 cellulase와 xylanase 생산 균주로 단리하였다. 단리한 균주 유래의 16S rRNA 유전자 및 API 50 kit를 분석한 결과 Bacillus subtilis와 약 99.5%의 높은 상동성을 보였기에 본 균주를 Bacillus subtilis로 동정하여 B. subtilis NC1로 명명하였다. B. subtilis NC1 유래 cellulase와 xylanase는 CM-cellulose와 Beechwood xylan에 대하여 각각 높은 효소 활성을 보였으며, 두 효소 모두 pH 5.0과 $50^{\circ}C$의 조건하에서 가장 높은 효소 활성을 보였다. B. subtilis NC1 균주 유래 cellulase와 xylanase 유전자를 cloning하기 위하여 shot-gun cloning 방법을 이용하여 B. subtilis NC1 염색체 DNA로부터 효소 유전자를 cloning하여 유전자 배열을 규명한 결과 cellulase 유전자는 아미노산 499개를 암호화하는 1,500 bp의 open reading frame (ORF)으로 이루어져 있었으며, 아미노산 배열로부터 추정되는 분자량은 55,251 Da 이었다. 그리고, xylanase에 대한 유전자는 아미노산 422개를 암호화하는 1,269 bp의 ORF로 이루어져 있었으며 유전자 유래 아미노산 배열로부터 추정되는 단백질 분자량은 47,423 Da 이었다. 두 효소의 아미노산 배열을 이용하여 상동성을 검토한 결과 cellulase는 glycoside hydrolase family (GH) 5에 속하는 cellulase와 xylanase는 GH30에 속하는 xylanase와 높은 상동성을 나타내었다.
The bifunctional Xylanase-Cellulase hybrid protein was constructed by gene fusion. Two genes corresponding to endoxylanase gene (xylS) and endocellulase gene (celA) were amplified by PCR from Bacillus licleniformis NBL420. It was then linked through splicing by overlap extension (SOE) by PCR method. The two resulting fused hybrids, xyl/cel and cel/xyl, which differ by its orientation, were confirmed by its nucleotide sequencings. One of two fusion genes, xyl/cel was successfully expressed into pET22b(+) vector (pxyl/cel) with bifunctional xylanase-cellulase activity. On the contrary, the other cel/xyl fusion protein showed only cellulase activity with much decreased xylanase activity. Enzymatic properties of Xyl/Cel fusion protein were investigated regarding optimum pH, optimum temp, thermostability, and pH stability. It was revealed that Xyl/Cel fusion protein retained the bifunctional xylanase-cellulase activities eventhough two enzymes were connected with each other directly. These informations could be useful for construction of other hybrid proteins as well as increased range of substrate utilization.
CMCase, a member of cellulose decomposing enzymes, hydrolyze cellulose up to cellobiose. Cellobiase splits cellobiose to glucose units. Therefore, a linkage of the twogenes coding for CMCase and cellobiase on the same plasmid is needed to produce a cellulase complex which can produce glucose from cellulose. A genetic operon in which the two structural genes are under the control of a single promoter would be ideal for this purpose. The present report is on the linking of the two cellulase genes in one plasmid as a preliminary step of the operon construction.
Kim, Sang Hoon;Oh, Ju Kyoung;Kim, Yong Ho;Kang, Dae-Kyung
Journal of Animal Science and Technology
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제62권5호
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pp.761-763
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2020
Here we report the complete genome sequence of Bacillus amyloliquefaciens ATC6, which produces acidic cellulase, isolated from pig feces. The genome is 4,062,817 bp in length and has a guanine-cytosine (GC) content of 46.27%. Among the predicted 3,913 protein-coding genes, two glucanase genes, which are involved in lichenan and cellulose degradation, were found. This genome analysis helps clarify the mechanism involved in cellulose biodegradation and support its application for efficient use of livestock feeds.
Ribonucleic acid interference (RNAi) inhibits the expression of target genes in a sequence-specific manner, and shows potential for gene knockdown in filamentous fungi, in which the locus-specific gene knockout occurs in low frequency. In this study, the function of the repressor of cellulase expression I (ACEI) was verified in Trichoderma koningii (T. koningii) YC01 through RNAi, and ace1-silenced strains with improved cellulase productivity were obtained. An expression cassette that transcribed the interfering double-stranded RNA (dsRNA) of ace1 was constructed and transformed into T. koningii, and the transformants, in which the expression of ace1 was successfully silenced, were selected. As a result of the ace1 gene silencing, the expression levels of the main cellulase and xylanase genes were elevated, and the enhanced production of total proteins, cellulase, and xylanase was observed in the cultivation. In addition, the down-regulation of ace1 resulted in an increasing expression of xyr1, but no clear variation in the expression of cre1, which suggested that ACEI acted as a repressor of the xyr1 transcription, but was not involved in the regulation of the cre1 expression. The results of this work indicate that ace1 is a valid target gene for enhancing enzyme production in T. koningii, and RNAi is an appropriate tool for improving the properties of industrial fungi.
두 개의 cellulase 유전자 xynB1, bglA2과 groEL1 유전자 염기서열에 기초하여 국내에서 분리한 34균주의 Sorangium cellulosum 균주들을 계통 분석한 결과, 점액세균 중 가장 많은 생리활성물질이 발견된 종인 S. cellulosum 내에는 최소한 5그룹의 소그룹이 존재함을 보였다. 이 분석은 또한 S. cellulosum 균주들의 다양성을 보여주어 분석한 34균주 중 30균주가 서로 다른 균주인 것으로 나타났다.
십자화과 작물에 발생하는 검은썩음병(Black rot or Black vein of crucifer)의 병원성 세균인 Xanthomonas campestris pv. crucifer)의 병원성 세균인 Xanthomonas campestris pv. campestris를 분리, 동정하고 병원성을 검정하였다. 이 X. c. pv. campestris 는 3가지 종의 Chinese cabbage에 병원성을 나타내었고, 병원성과 관련된 특성을 결정하기 위하여 Tn5 mutagenesis를 실시 cellulase negative mutant를 선발하여 병원성 검정하였다. 선발된 cellulase negative mutant를 배추에 분무 접종하여 광학 현미경과 전자현미경으로 관찰한 결과 cellulase negative mutant는 wild type와 함께 기공표면과 기공하부조직에서 정착하였지만 그 밀도는 낮았다. 반면 접종 24시간 이후 wild type은 기공표면과 기공하부조직이 lysis되기 시작하여 48시간 이후에는 병원성의 진전으로 보다 많이 lysis되었다. 6일 후, wild type은 cellulase활성에 의해 식물체 조직에서 높은 증식력을 보이며 조직을 lysis 시키고 또한 조직 깊숙이 침입, 정착하는 것을 관찰하였다. 이 결과로 X. c. pv.c campestris의 cellulase는 병원성에 관여하는 중요한 요인으로 생각된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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