• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제23권8호
• /
• pp.993-999
• /
• 2010

Serum lysozyme gene is one of the important genes influencing the immune system as its product can cause lysis of bacterial cell wall by cleaving the peptidoglycan layer. The present investigation on the serum lysozyme gene of Indian riverine buffalo was undertaken with the objectives to identify and characterize single nucleotide polymorphic patterns by PCR-SSCP method as well as to study the effect of different genotypes on serum lysozyme activity and somatic cell count. A total of 280 animals comprising four different famous bubaline breeds (Murrah, Mehsana, Surti and Bhadawari), spread over six different farms across the country were used for this study. A 276 bp (partial intron 2, complete exon 3 and partial intron 3) fragment of lysozyme gene was screened for polymorphism using the SSCP technique. Four genotypes namely AA, AB, BC and AC were observed, out of which BC genotype was found to be the most frequent. Among these three alleles, C allele (0.38) was most prevalent in these populations. Various SSCP allelic variants were cloned for sequencing and sequences were submitted to NCBI Genbank. From the alignment of the nucleotide sequences of various allelic variants, it was found that there were differences in 12 positions among the alleles, out of which maximum variation (at 8 places) was found in the intronic region. The allele A was closer to allele-C than allele-B. Allele B was phylogenetically equidistant from both of the other alleles. Mean lysozyme activity determined in serum samples of different animals of Murrah buffalo was $27.35{\pm}2.42\;{\mu}g$ per ml of serum, whereas the mean somatic cell count was $1.25{\pm}0.13{\times}10^5$ cells per ml of milk. The SSCP pattern-wise effects of various genotypes on lysozyme activity and SCC were analyzed. Although the mean values were apparently different in various genotypes, these differences were statistically non-significant. It can be concluded that the riverine buffaloes are sufficiently polymorphic with respect to serum lysozyme gene. The absence of AA genotype in Bhadawari breed of buffalo can be considered as a marker for breed characterization. The difference of four nucleotides in exon-3 indicates high selection pressure on the gene.

• 대한의생명과학회지
• /
• 제6권3호
• /
• pp.201-208
• /
• 2000

Vancomycin은 세포벽의 합성을 억제하여 세균에 대한 항균효과를 나타내는 glycopeptide 계 항생물질로서 그람양성세균으로 인한 감염치료에 광범위하게 사용되며, 특히 methicillin 내성 포도상구균의 선택적 치료제로 쓰이고 있다. 그러나 최근 임상검체에서도 중등도의 내성을 가지는 포도상구균 (Mu50: MIC 8 $\mu\textrm{g}$/ml)이 나타나기 시작하였고 여러 가지 여건상 국내에서도 내성균주가 분리될 가능성이 높다고 사료되어 임상검체 중 methcillin 내성 포도상구균을 대상으로 vancomycin 감수성 및 내성빈도 조사를 실시하고 이에 따른 내성기전을 알아보고자 하였다. 본 실험 결과 107주 (株)의 methicillin 내성균주 중 23.3%가 vancomycin에 대하여 내성을 보였으며 vancomycin 내성을 나타내는 표준균주인 Mu50과 Mu3의 중간 정도의 내성빈도를 보였다. 중합효소 연쇄반응을 통해 장구균의 vancomycin 내성에 관여하는 vanA, vanB, vanC1, vanC2, vanH 특이 유전자는 증폭되지 않았다. SDS-PAGE를 실시하여 81 kDa, 58 kDa, 33 kDa, 28 kDa 등의 주요 단백 분획을 확인하였고, Mu50에서 45 kDa의 특징적인 단백 분획을 관찰하였다. LDH enzyme assay에서는 한 개의 검체가 Mu50과 함께 높은 LDH 활성을 보였다.

• 미생물학회지
• /
• 제52권3호
• /
• pp.319-326
• /
• 2016

병원성 미생물들에 대해 항균활성을 보이는 $W5-1^T$ 균주가 한국의 발효식품인 김치에서 분리되었다. 이 분리주는 그람염색변이성, 절대호기성, 간균, 내생포자형성과 주모성의 편모를 가지고 운동성을 나타내었다. 균주는 $15-40^{\circ}C$, pH 6.0-10.0, 0-4% NaCl 조건에서 생육하였다. 균주는 esculin과 xylan을 가수분해하였고, $\small{D}$-mannose을 동화하였으나 $\small{D}$-mannitol은 동화하지 못하였다. $W5-1^T$ 균주는 Listeria monocytogens, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Salmonella typhi에 항균활성을 보였다. $W5-1^T$ 균주의 DNA의 G+C 함량은 52.6 mol%였다. 주요 호흡성 퀴논은 menaquinone-7 (MK-7)였고, 주요 세포성 지방산은 $C_{16:0}$, antieiso-$C_{15:0}$, $C_{18:0}$, and $C_{12:0}$였다. 균주는 세포벽 펩티도클리칸으로 meso-diaminopimelic acid을 함유하였다. 16S rRNA 유전자서열 분석에 근거하여 $W5-1^T$ 균주는 Paenibacillaceae 과로 분류되었으며 Paenibacillus pinihumi $S23^T$(98.4% similarity), P. tarimensis $SA-7-6^T$(96.4%) 균주와 높은 연관성을 보였다. 분리주와 P. pinihumi $S23^T$는 8.5%의 DNA-DNA 관련성을 보임으로 $W5-1^T$ 균주가 Paenibacillus 속의 한 종임을 보여주었다. 이러한 다각적 연구의 증거로 볼 때 $W5-1^T$ 균주는 Paenibacillus 속의 신종으로 사료되어 Paenibacillus kimchicus로 명명을 제안하며, 표준균주는 $W5-1^T$(=KACC $15046^T$=LMG $25970^T$)이다.