• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제11권2호
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• pp.251-258
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• 2001

In Gram(+) bacteria and organelles in higher eukarotes, $Gln-tRNA^{Gln}$ utilized for protein biosynthesis is formed by a tRNA-dependent amino acid transformation using mischarged $Gln-tRNA^{Gln}$ as the intermediate. In this study, the gatCAB gene encoding $Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase (Glu-AdT) of Staphylococcus aureus was cloned and its nucleotide sequence wa determined. The S. aureus gatCAB gene was organized in an operon structure consisting of three open reading frames (gatC, gatA, and gatB), similar to that of Bacillus subtilis. The gene sequences for the A and B subunits of$Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase showed significant homology (77 and 87% homology with amino acid sequence) with the gatA and gatB genes of B. subtilis, yet the C subunit (gatC) showed a relatively lowe homology with the B. subtilis gatC gene and other orthologues. The cloned S. aureus <$Gln-tRNA^{Gln}$ amidotransferase gene was highly expressed in Escherichia coli, and the resulting crude enzyme could convert misacylated <$Gln-tRNA^{Gln}$ into $Gln-tRNA^{Gln}$ in vitro.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권6호
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• pp.881-884
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• 1999

The gene encoding the RNA-dependent RNA polymerase of the hepatitis C virus was cloned and expressed with a C-terminal hexahistidine tag. The protein was purified from Escherichia coli to near homogeneity and characterized in vitro. When the 21 amino acids from the C-terminus of the protein were deleted, an inclusion body was not formed and a better purification yield was achieved. However, the activity of the purified enzyme decreased compared to that of the full length protein. The purified enzyme did exhibit ribonucleotide-incorporation activity on an in vitro transcribed RNA containing the 3' end of the HCV genome. It also possessed ribonucleotide incorporation activity, to a lesser extent, on in vitro transcribed foreign RNA templates when RNA or DNA primers were present. The activity was higher with DNA primers than with RNA primers. Accordingly, this assay system will facilitate the screening of inhibitors for hepatitis C virus replication.

• 식물병연구
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• 제10권4호
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• pp.241-247
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• 2004

Cucumber mosaic virus(CMV)-Paf 계통에 포함된 satellite RNA(Paf-satRNA)는 CMV의 병징을 완화시키는 약독병징 관련 유전자로 작용하였다(Choi 등, 2001). 이 연구는 Paf-satRNA의 약독병징 관련 유전자의 도메인을 확인하기 위하여, 고추에서 chlorosis 병징을 발현하는 PepY-satRNA와 키메라 satRNA를 구축하여 분석하였다. 두 종의 satRNA의 염기서열을 비교한 결과, 분자크기가 큰 PepY-satRNA에서 10염기의 삽입이 발견되기는 하였지만, 양 말단영역의 염기는 비교적 안정된 conserved sequence를 보였다. 그러나 이들 satRNA의 중간영역에 존재하는 염기서열, 즉 5' 말단의 81번째 염기로부터 113번째, 그리고 183번째 염기부터 265번째 염기까지의 영역에서는 많은 변화를 나타냈다. 약독병징과 관련된 도메인을 확인하기 위하여 구축한 각 satRNA 및 키메라 satRNA의 cDNA로부터 transcript RNA를 전사시키고, 전사된 각 satRNA transcript를 CMV-Fny의 게놈RNA1, RNA2 및 RNA3의 transcript와 혼합한 후 N. benthamiana에 접종하였다. 그 결과 RT-PCR에 의해서 모든 satRNA-cDNA로부터 전사된 transcript의 감염성이 확인되었으며, Paf-satRNA 및 키메라 Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 N. benthamiana에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였다. 이와는 대조적으로 PepY-satRNA 및 키메라 PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이들 각 키메라 satRNA에 감염된 N. benthamiana를 접종원으로 고추에 접종한 결과, Paf-satRNA와 혼합한 CMV-Fny를 접종한 고추에서는 무병징에 가까운 약한 모자이크 증상이 발현되었고, PepY-satRNA를 접종한 고추는 뚜렷한 chlorosis의 모자이크 증상이 발현되었다. 한편 이들 두 종 satRNA의 키메라, Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 고추에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였고, PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 chlorosis의 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이와 같은 결과를 종합해 보았을 때, N. benthamiana에서와 마찬가지로 Paf-satRNA의 약독병징과 관련된 유전자의 도메인은 HpaI-NarI 영역에 존재한다는 것을 나타냈다.

• 대한소아치과학회지
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• 제31권2호
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• pp.304-313
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• 2004

천연의 당알콜계 감미료인 자일리톨을 사용하여 자당으로부터 글루캔을 합성하는 효소인 glucosyltransferase(GTF)의 mRNA 발현에 미치는 영향을 Fluorescent in situ hybridization(FISH)과 유식세포측정기를 이용하여 분석하여 다음의 결과를 얻었다. 1. FISH분석결과 1% 자당이 함유된 BHI 배지에 1%, 5%, 10% 자일리톨을 첨가하였을 때 gtfB, gtfC 및 gtfD mRNA 발현이 농도 의존적으로 억제되었고, gtfB 보다는 gtfC 및 gtfD의 발현이 더 크게 억제되었다. 2. 유식세포측정기로 분석한 결과 자당의 농도가 0.1%, 0.5%, 1%로 증가함에 따라 gtfB, gtfC 및 gtfD mRNA 발현이 증가하였다. 3. 유식세포측정기로 분석한 결과 자당이 1%함유되었을 때 1%, 5%, 10% 자일리톨을 첨가한 경우 gtfB, gtfC 및 gtfD mRNA발현이 유사하게 억제되었으며, 10% 자일리 톨을 첨가한 경우 gtfB, gtfC 및 gtfD mRNA발현이 가장 크게 억제되었다. 이상의 결과를 종합하면 자일리톨은 자당첨가에 의한 Streptococcus mutars의 gtf mRNA 발현을 억제하여 항우식효과에 기여하는 것으로 생각된다.

• 대한소아치과학회지
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• 제34권2호
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• pp.299-308
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• 2007

Streptococcus mutans Ingbritt의 비수용성 글루칸을 합성하는 효소인 glucosyltransferase B 및 C의 mRNA 발현에 대한 각 당의 영향을 fluorescent in situ hybridization(FISH) 방법으로 관찰하여 다음의 결과를 얻었다. 1. 1% 설탕이 함유된 BHI 배지에서 S. mutans Ingbritt를 접종하여 배양할 때 배양 9시간 째 gtfB 및 gtfC유전자의 mRNA가 발현이 급격히 증가하였다. 2 BHI 액체배지에 설탕을 첨가한 경우 gtfB및 gtfC유전자의 mRNA가 발현되었으며, 10% 설탕을 첨가한 경우 1%와 5%보다 gtfB 및 gtfC 유전자의 발현이 감소되었다. 3. 1% 설탕이 첨가된 BHI 액체 배지에 당을 첨가한 경우 포도당은 10% 첨가하였을 때 gtfB 및 gtfC 유전자의 mRNA 발현이 감소하였고, 과당의 경우 1% 첨가한 경우 감소하여 5% 와 10%에서는 gtfB및 gtfC 유전자가 거의 발현되지 않았다. 4. 자일리톨의 경우 1%부터 gtfB및 gtfC유전자 mRNA 발현이 대조군보다 감소하였고, 5%와 10%에서는 두 유전자 모두 발현이 현저하게 감소하였다. 5. 유당의 경우 두 유전자의 발현에 거의 영향을 미치지 않는 것으로 관찰되었고, 솔비톨의 경우 각 농도에서 두 유전자의 발현이 대조군보다 감소하였다. 결론적으로 비수용성 글루칸 합성하는 gtfB및 gtfC 유전자의 mRNA 발현이 포도당, 과당 자일리톨 첨가에 의해 감소함을 알 수 있었다.

• 대한화학회지
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• 제39권9호
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• pp.734-740
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• 1995

Xanthomonas palargonii 5S rRNA의 일차구조 및 이차구조를 결정하고 에틸니트로소 우레아, Pb2+, 황산 이메틸 , 피로탄산 이에틸 들의 화학 탐침과 몇 가지 효소 탐침을 사용하여 고차원 구조를 분석하였다. 에틸니트로소 우레아는 삼차 상호작용에 관련되는 포스포디에스테르 결합을 조사하는데 사용되었다. Mg2+이 있을 때 에틸니트로소 우레아에 의한 변형에 대해서 저항성이 있는 자리는 불안정한 d 나선의 Nucleotides G72, A73, G75, A78, G98, G100, A101 들, c고리의 C36, C37, C39, C41들, 그리고 C 줄기의 A29, G33 들이다.이러한 결과와 Pb2+에 의한 가수분해 반응과 화학 탐침과 효소 탐침을 사용하여 얻은 결과들을 종합해 봄으로써 5S 의 b-C 구역과 d 나선 구역은 5S rRNA의 삼차 상호작용에서 돌쩌귀의 구실을 할 것으로 추정할 수 있었다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제5권1호
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• pp.19-25
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• 2001

We have studied the effects of excitatory amino acids on the expression of the c-fos and c-jun mRNA in rat C6 glioma cells. The glutamate, $N-methyl-_D-aspartate$ (NMDA), and kainic acid (KA) increased c-fos mRNA level in a concentration-dependent manner. However, they did not affect c-jun mRNA level. In addition, forskolin and phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) increased c-fos mRNA level. Furthermore, PMA increased c-jun mRNA level whereas forskolin downregulated c-jun mRNA level. The glutamate, NMDA and KA, at a concentration of 0.25 mM, did not affect the basal c-fos and c-jun mRNA levels, and also did not affect forskolin- and PMA-induced responses. Furthermore, both forskolin and PMA itself increased the phosphorylation of ERK (extracellular signal regulated kinase) and CREB (cyclicAMP responsible element binding protein) proteins. The KA, NMDA, and glutamate did not affect forskolin- induced increase of ERK and CREB phosphorylation. The KA decreased PMA-induced increase of phosphorylation of ERK and CREB proteins, whereas glutamate and NMDA did not affect the phosphorylation of ERK and CREB proteins induced by PMA. These findings suggest that, in C6 glioma cells, c-fos mRNA induction induced by EAAs is not mediated by phosphorylation of ERK and CREB proteins.

• Molecules and Cells
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• 제42권5호
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• pp.379-385
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• 2019

Non-coding RNAs (ncRNAs) comprise various RNA species, including small ncRNAs and long ncRNAs (lncRNAs). ncRNAs regulate various cellular processes, including transcription and translation of target messenger RNAs. Recent studies also indicate that ncRNAs affect organismal aging and conversely aging influences ncRNA levels. In this review, we discuss our current understanding of the roles of ncRNAs in aging and longevity, focusing on recent advances using the roundworm Caenorhabditis elegans. Expression of various ncRNAs, including microRNA (miRNA), tRNA-derived small RNA (tsRNA), ribosomal RNA (rRNA), PIWI-interacting RNA (piRNA), circular RNA (circRNA), and lncRNA, is altered during aging in C. elegans. Genetic modulation of specific ncRNAs affects longevity and aging rates by modulating established aging-regulating protein factors. Because many aging-regulating mechanisms in C. elegans are evolutionarily conserved, these studies will provide key information regarding how ncRNAs modulate aging and lifespan in complex organisms, including mammals.

• Molecules and Cells
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• 제46권11호
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• pp.664-671
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• 2023

The proper maintenance of mRNA quality that is regulated by diverse surveillance pathways is essential for cellular homeostasis and is highly conserved among eukaryotes. Here, we review findings regarding the role of mRNA quality control in the aging and longevity of Caenorhabditis elegans, an outstanding model for aging research. We discuss the recently discovered functions of the proper regulation of nonsense-mediated mRNA decay, ribosome-associated quality control, and mRNA splicing in the aging of C. elegans. We describe how mRNA quality control contributes to longevity conferred by various regimens, including inhibition of insulin/insulin-like growth factor 1 (IGF-1) signaling, dietary restriction, and reduced mechanistic target of rapamycin signaling. This review provides valuable information regarding the relationship between the mRNA quality control and aging in C. elegans, which may lead to insights into healthy longevity in complex organisms, including humans.

• 대한약리학회지
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• 제32권3호
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• pp.347-355
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• 1996

흰쥐 뇌하수체 전엽배양세포에서 PKC나 cAMP에 의한 LH 분비와 $LH{\beta}$subunit mRNA 증가과정에서 세포외 $Ca^{++}$의 역할을 검증하기 위하여 phorbol ester와 forskolin에 의해 촉진된 LH 분비와 $LH{\beta}$ subunit mRNA 수준에 미치는 EGTA와 verapamil의 영향을 조사하였다. Forskolin에 의해 촉진된 LH 분비와 $LH{\beta}$ subunit mRNA 수준은 $Ca^{++}$ chelator인 EGTA나 $Ca^{++}$ 채널차단제인 verapamil의 처리로 세포외부로부터 $Ca^{++}$의 이동을 억제시켰을때 모두 감소하였다. PMA에 의해 유도된 LH 분비는 EGTA와 verapamil 처리에 의해 영향을 받지 않았으나 PMA에 의해 촉진된 $LH{\beta}$ subunit mRNA는 억제되었다. 따라서 본 연구에 의하면 PKC 활성화나 세포내 cAMP 농도 증가는 $LH{\beta}$ subunit mRNA 수준을 증가시키며 이러한 과정은 세포외 $Ca^{++}$ 의존적인 것으로 생각된다. 그러나 PKC 활성화나 cAMP 증가에 의한 세포외 $Ca^{++}$의 역할이 서로 다른 양상을 보인다. PKC 활성화에 의한 LH 분비는 세포외 $Ca^{++}$에 비의존적이나 cAMP에 의해 촉진된 LH 분비는 세포외 $Ca^{++}$ 유입의 영향을 받는 것으로 사료된다.