• 제목/요약/키워드: biophysical characteristics

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Polyphasic Assignment of a Highly Proteolytic Bacterium Isolated from a Spider to Serratia proteamaculans

  • Kwak, Jang-Yul;Lee, Dong-Hun;Park, Youn-Dong;Kim, Seung-Bum;Maeng, Jin-Soo;Oh, Hyun-Woo;Park, Ho-Yong;Bae, Kyung-Sook
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권10호
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    • pp.1537-1543
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    • 2006
  • A bacterial strain named HY-3 that produces a highly active extracellular protease was isolated from the digestive tract of a spider, Nephila clavata. The bacterium was a Gram-negative, oxidase-negative, catalase-positive, nonhalophilic, nitrate-reducing, facultative anaerobe. Transmission and scanning electron microscopies demonstrated that the isolate was non-spare-forming, straight, rod-shaped, and motile by peritrichous flagella. The G+C content of the DNA was 57.0 mol%. The isoprenoid quinone type was ubiquinone with 8 isoprene units (Q-8). The morphological and biochemical characteristics including the predominant fatty acid and phospholipids profiles placed the isolate HY-3 in the family Enterobacteriaceae. Further biochemical characterization and phylogenetic studies including determination of an almost complete 16S ribosomal DNA sequence suggested that the bacterium was closely related to the genus Serratia. DNA-DNA hybridization analysis revealed that this extracellular protease-producing strain belongs to Serratia proteamaculans, which is also known far its association with insects.

Analysis of BRD Components Over Major Land Types of Korea

  • Kim, Sang-Il;Han, Kyung-Soo;Park, Soo-Jea;Pi, Kyoung-Jin;Kim, In-Hwan;Lee, Min-Ji;Lee, Sun-Gu;Chun, Young-Sik
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.653-664
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    • 2010
  • The land surface reflectance is a key parameter influencing the climate near the surface. Therefore, it must be determined with sufficient accuracy for climate change research. In particular, the characteristics of the bidirectional reflectance distribution function (BRDF) when using earth observation system (EOS) are important for normalizing the reflected solar radiation from the earth's surface. Also, wide swath satellites like SPOT/VGT (VEGETATION) permit sufficient angular sampling, but high resolution satellites are impossible to obtain sufficient angular sampling over a pixel during short period because of their narrow swath scanning. This gives a difficulty to BRDF model based reflectance normalization of high resolution satellites. The principal objective of the study is to add BRDF modeling of high resolution satellites and to supply insufficient angular sampling through identifying BRDF components from SPOT/VGT. This study is performed as the preliminary data for apply to high-resolution satellite. The study provides surface parameters by eliminating BRD effect when calculated biophysical index of plant by BRDF model. We use semi-empirical BRDF model to identify the BRD components. This study uses SPOT/VGT satellite data acquired in the S1 (daily) data. Modeled reflectance values show a good agreement with measured reflectance values from SPOT satellite. This study analyzes BRD effect components by using the NDVI(Normalized Difference Vegetation Index) and the angle components such as solar zenith angle, satellite zenith angle and relative azimuth angle. Geometric scattering kernel mainly depends on the azimuth angle variation and volumetric scattering kernel is less dependent on the azimuth angle variation. Also, forest from land cover shows the wider distribution of value than cropland, overall tendency is similar. Forest shows relatively larger value of geometric term ($K_1{\cdot}f_1$) than cropland, When performed comparison between cropland and forest. Angle and NDVI value are closely related.

Mechanical and Biological Characteristics of Reinforced 3D Printing Filament Composites with Agricultural By-product

  • Kim, Hye-Been;Seo, Yu-Ri;Chang, Kyeong-Je;Park, Sang-Bae;Seonwoo, Hoon;Kim, Jin-Woo;Kim, Jangho;Lim, Ki-Taek
    • 산업식품공학
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    • 제21권3호
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    • pp.233-241
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    • 2017
  • Scaffolds of cell substrates are biophysical platforms for cell attachment, proliferation, and differentiation. They ultimately play a leading-edge role in the regeneration of tissues. Recent studies have shown the potential of bioactive scaffolds (i.e., osteo-inductive) through 3D printing. In this study, rice bran-derived biocomposite was fabricated for fused deposition modeling (FDM)-based 3D printing as a potential bone-graft analogue. Rice bran by-product was blended with poly caprolactone (PCL), a synthetic commercial biodegradable polymer. An extruder with extrusion process molding was adopted to manufacture the newly blended "green material." Processing conditions affected the performance of these blends. Bio-filament composite was characterized using field emission scanning electron microscopy (FE-SEM) and energy dispersive X-ray spectroscopy (EDX). Mechanical characterization of bio-filament composite was carried out to determine stress-strain and compressive strength. Biological behaviors of bio-filament composites were also investigated by assessing cell cytotoxicity and water contact angle. EDX results of bio-filament composites indicated the presence of organic compounds. These bio-filament composites were found to have higher tensile strength than conventional PCL filament. They exhibited positive response in cytotoxicity. Biological analysis revealed better compatibility of r-PCL with rice bran. Such rice bran blended bio-filament composite was found to have higher elongation and strength compared to control PCL.

심뇌혈관질환 예방을 위한 생활습관 개선 프로그램에 관한 문헌분석 연구 (The Literature Review on Life style Intervention Program for the Prevention of Cardiovascular Disease)

  • 양혜경
    • 문화기술의 융합
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    • 제8권1호
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    • pp.157-166
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    • 2022
  • 본 연구는 심뇌혈관질환 예방을 위한 생활습관 중재 프로그램의 특성을 파악하기 위하여 프로그램 중재 연구논문을 분석한 문헌분석 연구이다. 연구대상 논문은 Pubmed 등 전자 데이터베이스를 통해 "심뇌혈관질환", "중재" 등의 검색어를 적용하여 최종 18편의 논문이 선정되었다. 대상 문헌에서의 프로그램 참여 대상자 선정기준은 주로 신체생리학적 기준이 이용되었고, 신체활동과 식습관 생활습관 영역을 중재한 프로그램이 많았다. 중재유형은 교육이 가장 많이 이용되었고, 여러 중재를 병합하여 적용하는 연구가 많은 것으로 나타났다. 중재기간은 평균 22주 이상의 장기개입이 많았고, 중재효과를 측정하는 효과지표는 신체생리학적 지표가 가장 많이 활용되었다. 본 연구를 통해 여러 생활습관의 상호관련성을 고려한 중재 프로그램의 개발과 건강한 생활습관을 유지하기 위한 환경 및 사회적 지원이 필요함을 제언한다.

양식넙치에서 분리한 Yersinia sp.의 일부 특성과 병원성에 관한 연구 (Studies on characteristics and pathogenicity of Yersinia sp. Isolated from cultured olive flounder, Paralichthys olivaceus)

  • 이근광;김영길;이재창
    • 한국어병학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.153-164
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    • 1997
  • 양식넙치에 분리한 Yersisnia sp. 의 일부 특성과 병원성을 조사하였다. 넙치의 입주변 및 체표에 궤양을 유발한 원인균의 생화학적 생물물리학적 특성을 조사한 결과 이들 균은 Yersisnia sp. (KF-1)로 동정 되었다. 이들 분리균주의 발육 최적 pH는 9.0이었고, 최적 NaCl농도는 1% 이었다. Yersinia sp. (KF-1)의 전체세포를 SDS-PAGE로 분석한 결과 세포를 구성하고 있는 단백질의 분자량은 14.0-100.6kd로써 총 28개의 peptide 밴드로 구성되어 있으며, 32.8kd의 분자량을 갖는 밴드가 주밴드로 생각된다. 병원성 시험에서 KF-1을 $1.0{\times}10^7$cfu/fish 감염시킨 시험구에서 감염 60시간후에 10마리중 9마리가 폐사되었으며, $1.0{\times}10^7$cfu/fish를 감염시킨 시험구에서는 감염 60시간후에 5마리가 폐사되어 $LD_{50}$$1.0{\times}10^7$cfu/fish로 추정되었다. 항생제 감수성 시험에서 KF-1은 chloramphenicol, gentamycin, kanamycin, neomycin, streptomycin, pefloxacin에 감수성을 나타냈고, erythromycin에는 중등도였으며, ampicllin, cephalothin, sulfamethoxazole/trimethoprim, tetracycline, vancomycin에는 저항성을 나타냈다.

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청예 사료작물과 볏짚을 이용한 완전배합발효사료의 제조와 영양적가치 (The Nutritive Values and Manufacture of Total Mixed Fermentation Feeds using Green Forage Crops and RiCE-straw)

  • 이현준;조광근;김원호;김현섭;김준식;강승하;우정희;이홍구;최윤재
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권1호
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    • pp.75-86
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    • 2002
  • 반추동물에서 적당한 조사료의 공급은 젖소의 정상적인 반추 기능을 위해서 반드시 필요하다. 본 연구는 사료 작물 종류별, 볏집 및 곡류의 가공 상태를 달리하여 제조한 TMFF에 대하여 일반 성분, RFV 및 면양의 반추위 성상 변화를 조사하기 위하여 실시하였다. 청예 작물인 옥수수, 목초, 호밀, 유채, 알팔파와 귀리를 주구로 하고 곡류 가공 수준을 무가공 (대조구), 거칠게 분쇄 (7~14mm mesh 이상), 일반 분쇄 (7mm 이하)를 세구로 하여 조제한 각각의 TMFF에 대한 일반 성분을 조사하였다. 또한 Fistula가 부착된 면양 8두를 이용한 반추위 성상과 기호성에 미치는 영향을 조사하였다. 유채 TMFF는 상대적 사료가 (RFV)와 일당 사료 섭취량, A/P 비율에 있어서 다른 처리구보다 높은 경향을 나타내었다. 옥수수 TMFF를 급여한 면양의 반추위 VFA 함량은 90.9 mmol%로서 다른 처리구 보다 높았으며, 또한 사료의 pH도 3.82로서 가장 낮은 경향을 보였다. 그러나 TMFF에 있어서 휘발성 지방산 각각에 대한 차이는 찾을 수 없었다. 결론적으로 곡류 가공 방법에 따른 효과는 나타나지 않았지만 상대적 사료가와 기호성, 건물 손실율만을 고려하여 우수성을 판단할 때 유채, 옥수수, 알팔파, 목초, 귀리, 호밀 TMFF의 순서로 나타났다.

울폐산림의 엽면적지수 추정을 위한 적색경계 밴드의 효과 (Effect of Red-edge Band to Estimate Leaf Area Index in Close Canopy Forest)

  • 이화선;이규성
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제33권5_1호
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    • pp.571-585
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    • 2017
  • 적색경계밴드(red-edge band)가 식물의 생물리적 특성과 밀접한 관계를 가지고 있다고 알려지고 있으며, 이에 따라 최근 적색경계밴드를 포함한 위성영상센서가 증가하고 있다. 본 연구는 향후 농림업중형위성에 적색경계밴드 탑재를 계획하고 있는 점을 감안하여, 적색경계밴드와 관련된 연구 현황과 활용 가치를 분석하고자 한다. 수관울폐도가 높은 우리나라 산림의 엽면적지수(Leaf Area Index, LAI) 추정에 있어서 적색경계밴드의 효과를 분석하였고, 더 나아가 LAI 추정을 위한 최적의 파장폭과 파장영역을 도출하고자 하였다. LAI가 5 이상인 갈참나무와 리기다소나무를 대상으로 4월부터 10월까지 시계열 분광반사 측정자료를 이용하여 LAI와의 상관관계를 분석하였다. 분광반사측정자료에서 5개의 파장폭(10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm)과 71개의 중심파장(680 nm부터 750 nm까지 1 nm 간격)을 달리하여 모두 355개의 적색경계밴드를 모의 생성했다. 적색경계밴드를 기반으로 하는 두 개의 분광지수 NDRE(normalized difference red-edge index)와 CIRE(chlorophyll index red-edge)를 산출하여 LAI와 상관관계를 분석하였다. 적색경계밴드 기반의 분광지수인 NDRE 및 CIRE는 수관울폐도가 높은 갈참나무와 리기다소나무의 LAI와 높은 상관관계를 얻을 수 있었다. 이는 수관울폐도가 높은 국내 산림에서 일반적으로 사용되는 NDVI가 LAI와의 상관관계가 낮게 나타났던 한계를 해결할 수 있는 가능성을 보여주었다. 10 nm부터 50 nm까지 적색경계밴드의 파장폭 효과는 산림의 LAI와 관계에서 큰 차이를 보이지 않았다. LAI와 최대 상관관계를 보이는 적색경계밴드의 중심파장은 갈참나무에서는 720 nm 부근, 그리고 리기다소나무에서는 710 nm 주변으로 나타났다. 우리나라 농작물 및 산림의 식생정보 획득과 모니터링을 위한 최적의 적색경계밴드의 파장폭과 파장영역을 결정하기 위해서는 다른 생물리적인자(엽록소, 질소, 수분함량, 생체량 등)와의 관계도 충분히 고려하여야 한다.

막 단백질인 Proteorhodopsin과 Anabaena Sensory Rhodopsin의 다양한 측정 환경에 따른 광화학/생물리학적 특성 (Photochemical/Biophysical Properties of Proteorhodopsin and Anabaena Sensory Rhodopsin in Various Physical Environments)

  • 최아름;한송이;정영호;정광환
    • 미생물학회지
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    • 제47권1호
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    • pp.22-29
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    • 2011
  • Chromophore로 레티날(vitamin A)을 사용하는 막 단백질인 로돕신은 7개의 막 단백질로 이루어진다. 최근 광화학/생물리학 측정 방법이 다양해지면서, 그에 따른 새로운 특성도 함께 다양하게 보고되고 있다. 하지만, 다양한 측정 환경에 따른 그 광화학/생물리학 특성의 차이점에 대한 비교연구는 없는 상태이다. 첫째, 빛 에너지를 이용하여 수소 이온 펌프 역할 하는 것으로 잘 알려져 있는 roteorhodopsin (PR)은 해양 proteobacteria에서 발견 되었다. 둘째, 한 오페론에서 14 kDa 전달자와 같이 발현되면서 신호 전달 기능을 하는 Anabaena sensory rhodopsin (ASR)이 있다. 이에 본 연구에서는 이 두 미생물 로돕신을 이용하여 다양한 조건에서 그 차이를 살펴보았다. 각 단백질이 막에 끼어 있는 상태(membrane state), polyacrylamide gel에 고정되어 있는 상태, nonionic detergent일종인 DDM (n-dodecyl-${\beta}$-D-maltopyranoside)과, OG (octyl-${\beta}$-D-glucopyranoside)에 녹아 있는 상태, 좀더 자연상태와 유사한 환경을 위해 단백질만 깨끗하게 정제한 다음 다시 Escherichia coli의 지질인 DOPC (1,2-didecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine)에 재조립한 상태, 이렇게 5가지 조건에서 각각의 광화학/생물리학 특징을 흡수스펙트럼(absorption spectrum), 빛-어둠 차이 흡수스펙트럼(light-induced difference spectrum), 포토사이클(photocycle)을 측정하였다. 그 결과 DDM에 녹아 있는 PR과 ASR에서 각 다른 파장에서 M과 O state와 같은 선명한 photointermediate를 가지고, 가장 signal/noise 비율이 좋았다. 본 연구를 통해 막단백질의 다양한 측정 환경에 대한 그 특성의 차이점을 살펴봄으로써 앞으로 다양한 종류의 로돕신 연구에 기초 기반이 될 것으로 사료된다.

Characterization of Acetylcholine-induced Currents in Male Rat Pelvic Ganglion Neurons

  • Park, Joong-Hyun;Park, Kyu-Sang;Cha, Seung-Kyu;Lee, Keon-Il;Kim, Min-Jung;Park, Jong-Yeon;Kong, In-Deok;Lee, Joong-Woo
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제8권4호
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    • pp.219-225
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    • 2004
  • The pelvic ganglia provide autonomic innervations to the various urogenital organs, such as the urinary bladder, prostate, and penis. It is well established that both sympathetic and parasympathetic synaptic transmissions in autonomic ganglia are mediated mainly by acetylcholine (ACh). Until now, however, the properties of ACh-induced currents and its receptors in pelvic ganglia have not clearly been elucidated. In the present study, biophysical characteristics and molecular nature of nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs) were studied in sympathetic and parasympathetic major pelvic ganglion (MPG) neurons. MPG neurons isolated from male rat were enzymatically dissociated, and ionic currents were recorded by using the whole cell variant patch clamp technique. Total RNA from MPG neuron was prepared, and RT-PCR analysis was performed with specific primers for subunits of nAChRs. ACh dose-dependently elicited fast inward currents in both sympathetic and parasympathetic MPG neurons $(EC_{50};\;41.4\;{\mu}M\;and\;64.0\;{\mu}M,\;respectively)$. ACh-induced currents showed a strong inward rectification with a reversal potential near 0 mV in current-voltage relationship. Pharmacologically, mecamylamine as a selective antagonist for ${\alpha}3{\beta}4$ nAChR potently inhibited the ACh-induced currents in sympathetic and parasympathetic neurons $(IC_{50};\;0.53\;{\mu}M\;and\;0.22\;{\mu}M,\;respectively)$. Conversely, ${\alpha}-bungarotoxin$, ${\alpha}-methyllycaconitine$, and $dihydro-{\beta}-erythroidine$, which are known as potent and sensitive blockers for ${\alpha}7$ or ${\alpha}4{\beta}2$ nAChRs, below micromolar concentrations showed negligible effect. RT-PCR analysis revealed that ${\alpha}3$ and ${\beta}4$ subunits were predominantly expressed in MPG neurons. We suggest that MPG neurons have nAChRs containing ${\alpha}3$ and ${\beta}4$ subunits, and that their activation induces fast inward currents, possibly mediating the excitatory synaptic transmission in pelvic autonomic ganglia.

Four Voltage-Gated Potassium Currents in Trigeminal Root Ganglion Neurons

  • Choi, Seung Ho;Youn, Chang;Park, Ji-Il;Jeong, Soon-Yeon;Oh, Won-Man;Jung, Ji-Yeon;Kim, Won-Jae
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제38권1호
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    • pp.13-19
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    • 2013
  • Various voltage-gated $K^+$ currents were recently described in dorsal root ganglion (DRG) neurons. However, the characterization and diversity of voltage-gated $K^+$ currents have not been well studied in trigeminal root ganglion (TRG) neurons, which are similar to the DRG neurons in terms of physiological roles and anatomy. This study was aimed to investigate the characteristics and diversity of voltage-gated $K^+$ currents in acutely isolated TRG neurons of rat using whole cell patch clamp techniques. The first type (type I) had a rapid, transient outward current ($I_A$) with the largest current size having a slow inactivation rate and a sustained delayed rectifier outward current ($I_K$) that was small in size having a fast inactivation rate. The $I_A$ currents of this type were mostly blocked by TEA and 4-AP, K channel blockers whereas the $I_K$ current was inhibited by TEA but not by 4-AP. The second type had a large $I_A$ current with a slow inactivation rate and a medium size-sustained delayed $I_K$ current with a slow inactivation rate. In this second type (type II), the sensitivities of the $I_A$ or $I_K$ current by TEA and 4-AP were similar to those of the type I. The third type (type III) had a medium sized $I_A$ current with a fast inactivation rate and a large sustained $I_K$ current with the slow inactivation rate. In type III current, TEA decreased both $I_A$ and $I_K$ but 4-AP only blocked $I_A$ current. The fourth type (type IV) had a smallest $I_A$ with a fast inactivation rate and a large $I_K$ current with a slow inactivation rate. TEA or 4-AP similarly decreased the $I_A$ but the $I_K$ was only blocked by 4-AP. These findings suggest that at least four different voltage-gated $K^+$ currents in biophysical and pharmacological properties exist in the TRG neurons of rats.