• 제목/요약/키워드: biological information processing

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인간의 시각특성에 의거한 디지털 흉부 x-선 영상의 처리 기법 (A New Image Processing Method for Digital Chest Radiographs based on Human Visual System)

  • 김종효;박광석;민병구;임정기;한만청;이충웅
    • 대한의용생체공학회:학술대회논문집
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    • 대한의용생체공학회 1990년도 추계학술대회
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    • pp.42-47
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    • 1990
  • In this paper, a new adaptive image processing method based on human visual system has been presented. The basic idea behind the proposed method is to improve the efficiency of the information transfer channel regionally by manipulating the displayed image in order to compensate the regional inefficiency of the information transfer channel. The proposed method consists of two parts; the first part reallocates pixel values corresponding to high X-ray attenuation to that of more intense X-ray exposure by multiplying the pixel values with the local adaptive multiplcation factor, and the second part adjusts the pixel values of dark area of displayed image such as overexposed lung area to be more bright. The processed image with the proposed method shows significantly increased visibility of mediastinal and subdiaphramatic area, and also the lung area of over exposed case without any artifact.

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Treatment Planning in Smart Medical: A Sustainable Strategy

  • Hao, Fei;Park, Doo-Soon;Woo, Sang Yeon;Min, Se Dong;Park, Sewon
    • Journal of Information Processing Systems
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    • 제12권4호
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    • pp.711-723
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    • 2016
  • With the rapid development of both ubiquitous computing and the mobile internet, big data technology is gradually penetrating into various applications, such as smart traffic, smart city, and smart medical. In particular, smart medical, which is one core part of a smart city, is changing the medical structure. Specifically, it is improving treatment planning for various diseases. Since multiple treatment plans generated from smart medical have their own unique treatment costs, pollution effects, side-effects for patients, and so on, determining a sustainable strategy for treatment planning is becoming very critical in smart medical. From the sustainable point of view, this paper first presents a three-dimensional evaluation model for representing the raw medical data and then proposes a sustainable strategy for treatment planning based on the representation model. Finally, a case study on treatment planning for the group of "computer autism" patients is then presented for demonstrating the feasibility and usability of the proposed strategy.

miRNA 와 mRNA 통합 분석을 위한 웹 기반 시스템 개발 (Development of web-based system for miRNA and mRNA integrated analysis)

  • 김다연;고윤희
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2022년도 추계학술발표대회
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    • pp.690-692
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    • 2022
  • 기존의 질병 관련 연구들은 대부분 유의미하게 변화되는 유전자들을 찾아내고(Differentially Expressed Genes, DEGs), 이들이 연관된 생물학적 패스웨이(biological pathway)를 찾아내는 방향으로 이루어졌다. 더불어 miRNA(microRNA)가 많은 mRNA 의 발현을 조절하며, 실제 면역, 대사 및 세포 사멸을 포함한 여러 필수 생리학적 및 질병에 매우 중요한 역할을 한다고 밝혀지며, 바이오 마커로써의 miRNA 를 찾아내고자 하는 연구가 활발히 진행되기 시작하였다. 하지만 mRNA 나 miRNA 의 독립적인 연구만으로는 명확한 질병과의 연관성이나 기능을 이해하기에는 어려움이 있다. 따라서 본 연구에서는 질병 상태에서 유의미하게 변화되는 miRNA 와 이러한 miRNA 에 의해 조절되는 mRNA 를 함께 고려하여 분석함으로써, 실제 질병의 발병 원인이 되는 생물학적 패스웨이나 메커니즘을 밝히고자 하였다. 또한, miRNA 와 mRNA 의 연관성을 찾기 위해, PPI(protein-protein interaction) 네트워크에 기반을 둔 RWR(Random Walk with Restart Algorithm)를 적용하여, 직접적 연관성뿐 아니라, 유전자 간의 숨겨진 간접적인 패스웨이를 고려하여 분석하기 위한 웹 기반 시스템을 개발하였다. 이 시스템은 mRNA-miRNA 를 함께 고려한 통합 분석을 통해 숨겨진 질병의 메커니즘을 이해하고 치료 방법을 찾아내는 데 크게 공헌할 것이다.

3차원 생물체 가시화 모델 구축장치 개발 및 성능평가 (Development and Evaluation of System for 3D Visualization Model of Biological Objects)

  • 황헌;최태현;김철수;이수희
    • Journal of Biosystems Engineering
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    • 제26권6호
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    • pp.545-552
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    • 2001
  • Nondestructive methods such as ultrasonic and magnetic resonance imaging systems have many advantages but still much expensive. And they do not give exact color information and may miss some details. If it is allowed to destruct a biological object to obtain interior and exterior informations, 3D image visualization model from a series of sliced sectional images gives more useful information with relatively low cost. In this paper, a PC based automatic 3D visualization system is presented. The system is composed of three modules. The first module is the handling and image acquisition module. The handling module feeds and slices a cylindrical shape paraffin, which holds a biological object inside the paraffin. And the paraffin is kept being solid by cooling while being handled. The image acquisition modulo captures the sectional image of the object merged into the paraffin consecutively. The second one is the system control and interface module, which controls actuators for feeding, slicing, and image capturing. And the last one is the image processing and visualization module, which processes a series of acquired sectional images and generates a 3D volumetric model. To verify the condition for the uniform slicing, normal directional forces of the cutting edge according to the various cutting angles were measured using a strain gauge and the amount of the sliced chips were weighed and analyzed. Once the 3D model was constructed on the computer, user could manipulate it with various transformation methods such as translation, rotation, and scaling including arbitrary sectional view.

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생물학 서열 데이타베이스에서 부분 문자열의 선적도 추정 (Estimation of Substring Selectivity in Biological Sequence Database)

  • 배진욱;이석호
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제30권2호
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    • pp.168-175
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    • 2003
  • 지금까지 문자열 데이타에 대한 선택도 추정은 문자열들의 등장 회수에 대한 정보를 저장하고 있는 '카운트 서픽스 트리'를 생성한 뒤, 이 트리를 이용하여 부분 문자열들의 선택도를 추정하는 방법으로 이루어졌다. 그런데, 문자열 데이타가 생물학 서열처럼 매우 길어질 경우 카운트 서픽스 트리를 생성하는 일은 거의 불가능해진다는 문제점이 발생한다. 이 논문에서는 길이가 q인 부분 문자열들만을 삽입한 '카운트 큐그램 트리'를 제안한다. 카운트 큐그램 트리는 서열 내의 길이가 q 이하인 모든 부분 문자열(큐그램) 들의 정확한 등장 회수를 저장하고 있으며, 문자열의 전체 길이 N에 상관없는 크기로, O(N) 시간에 생성 가능하다. 또한, 이 논문에서는 카운트 큐그램 트리를 이용한 'k번째 최대겹침' 추정 방법을 제시한다. 이 추정 방법은 질의 문자열을 길이 q인 부분 문자열로 나눌 때 부분 문자열들의 겹치는 정도 k를 선택할 수 있도록 한 방법으로 이전 연구에서 제시한 '최대겹침' 방법을 확장하였다. q와 k를 변화시키며 진행한 실험 올 통해 대부분의 경우에 매우 정확하게 선택도를 추정할 수 있음을 확인하였다.

웹 서비스를 이용한 바이오 서열 정보 데이터베이스 및 통합 검색 시스템 개발 (Development of Integrated Retrieval System of the Biology Sequence Database Using Web Service)

  • 이수정;용환승
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제11D권4호
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    • pp.755-764
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    • 2004
  • 최근, 바이오 관련 장비, 기술들이 발전함에 따라, 바이오 관린 데이터나 그것을 제공하는 호스트들이 급속하게 증가하고 있나. 또한, 이러한 데이터들은 개발 커뮤니티들의 수만큼, 분산되고 이질적인 면을 가시고 있어서, 바이오 관련 데이터베이스의 통합과 연동기능의 세공이 중요한 문제가 되고 있다. 그러나, 현재까지 진행되고 있는 많은 통합 연구 시스템의 대부분이 링크기반, 데이터웨어하우징 구축 기반으로 하고 있어서, 데이터 스키마나 데이터의 변경시, 실시간 업데이트와 같은 문제점을 보인다. 이러한 비효율적인 면을 개선시키고자, 플랫폼. 스키마의 변화에 구애 받지 않고 서비스를 가능하게 하는 웹 서비스 기술을 이용한 통합 시스템이 제안되고 있다. 본 논문에서도 이러한 흐름에 맞추어, 웹 서비스를 이용한 바이오 서열 데이터의 데이터베이스와, 통합 검색 시스템을 개발하였다 개발된 시스템은 BSML을 포함한 다양한 포맷의 데이터로 서열정보를 제공하며, 또한 외부 데이터베이스의 검색을 병렬로 처리하여, 검색 성능을 향상시키도록 하였다.

ASIC을 이용한 고속의료영상처리보드의 개발을 위한 기초연구 (Researches of the Real-time Medical Imaging Precessing Board using ASIC architecture)

  • 서지현;박홍민;하태환;남상희
    • 대한의용생체공학회:학술대회논문집
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    • 대한의용생체공학회 1998년도 추계학술대회
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    • pp.299-300
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    • 1998
  • Recently the development of medical modality like as MRI, 3D US, DR etc is very active. Therefore it is more required not only the enhancement of quality in medical service but the improvement of medical system based on quantization, minimization, and optimization of high speed. Especially, as the changing into the digital modality system, it gets to start using ASIC(Application Specific Integrated Circuit) to realize one board system. It requires the implementation of hardware debugging and effective speedy algorithm with more speed and accuracy in order to support and replace existing device. If objected image could be linked to high speed process board with special interface and pre-processed using FPGA, it can be used in real time image processing and protocol of HIS(Hospital Information System). This study can support the basic circuit design of medical image board which is able to realize image processing basically using digitalized medical image, and to interface between existing device and image board containing image processing algorithm.

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무선 생체신호 처리를 이용한 상황인식 (Context Awareness Using Wireless Biosignal Processing)

  • 이상복;안병주;이삼열;이준행
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제10권6호
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    • pp.117-126
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    • 2005
  • 본 논문에서는 상황인식(Context Awareness)에 필수적인 정보인 사용자의 활동을 감지하고 인식하기 위한 무선 생체신호처리 시스템과 퍼지추론에 의한 사용자의 눕기, 앉기, 걷기, 뛰기의 상황을 인식하는 방안을 제안한다. 제안된 방법에서는 지속적인 동작관찰과 사용자의 생체운동량 및 운동패턴을 측정하기 위하여 가속도 센서인 ADXL 202JE를 사용하였다. 측정된 데이터를 RF(Radio Frequency)로 상황인식 서버에 전송하여 퍼지추론 방법으로 사용자의 상황인식(눕기, 앉기, 걷기, 뛰기)을 하였다. 실험결과 Longitudinal Accelometer Average Value의 크기데이터 만으로는 사용자가 뛰고 걷는 행동상태 판단에 어려움이 있었으며, 임의의 블록에 대한 L.A.A의 분산은 걷고 뛰는 행동 판단에 유용하게 이용될 수 있음을 확인하였다.

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Development of a Smart Oriental Medical System Using Security Functions

  • Hong, YouSik;Yoon, Eun-Jun;Heo, Nojeong;Kim, Eun-Ju;Bae, Youngchul
    • International Journal of Fuzzy Logic and Intelligent Systems
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    • 제14권4호
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    • pp.268-275
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    • 2014
  • In future, hospitals are expected to automatically issue remote transcriptions. Many general hospitals are planning to encrypt their medical database to secure personal information as mandated by law. The electronic medical record system, picture archiving communication system, and the clinical data warehouse, amongst others, are the preferred targets for which stronger security is planned. In the near future, medical systems can be assumed to be automated and connected to remote locations, such as rural areas, and islands. Connecting patients who are in remote locations to medical complexes that are usually based in larger cities requires not only automatic processing, but also a certain amount of security in terms of medical data that is of a sensitive and critical nature. Unauthorized access to patients' transcription data could result in the data being modified, with possible lethal results. Hence, personal and sensitive data on telemedicine and medical information systems should be encrypted to protect patients from these risks. Login passwords, personal identification information, and biological information should similarly be protected in a systematic way. This paper proposes the use of electronic acupuncture with a built-in multi-pad, which has the advantage of being able to establish a patient's physical condition, while simultaneously treating the patient with acupuncture. This system implements a sensing pad, amplifier, a small signal drive circuit, and a digital signal processing system, while the use of a built-in fuzzy technique and a control algorithm have been proposed for performing analyses.

LAN 과 MODEM을 이용한 ECG 원격 진단 시스템 구현 (Design for the Remote ECG Diagnosis System using LAN and MODEM)

  • 안성혁;이윤
    • 대한의용생체공학회:학술대회논문집
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    • 대한의용생체공학회 1997년도 춘계학술대회
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    • pp.171-175
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    • 1997
  • We have developed a remote diagnosis system using the LAN and MODEM which enables a routine check for a patient remotely. We used $LabVIEW^{TM}$ as the programing development tool and DAQ (Data Aquisition) board from National Instrument for data aquisition. The LAN card and MODEM are used for the transmission of patient's data. A patient data are aquired by DAQ board and signal processing is done by $LabVIEW^{TM}$, which is a graphical prgamming language. Two methods for the data of transmission. One is the Client-Server model using TCP/IP (Transmission Control Protocol / Internet Address) in the LAN (Local Area Network) Another is using MODEM to transmit the measured data from a patient. In this case, the data transmission is accomplished by the FTP (File Transfer Protocol).

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