• 생명과학회지
• /
• 제6권4호
• /
• pp.234-240
• /
• 1996

PKR인산화효소의 억제인자로서 밝혀진 이중선RNA결합단백질 (RBF)의 RNA결합특이성을 정기영도에 의한 RNA 이동변화실험과 여과막결합도실험에 의해 측정하였다. RBF는 바이러스RNA나 stem/loop구조를 지니는 합성 RNA들에 대한 다양한 친화력을 지니는 것으로 나타났으며 충분한 GC가 포함된 11염기쌍으로 이루어진 RNA stem helix RBF가 결합하기 위한 최소한의 RNA구조로 제시되고 있다. 자연적 RNA구조에 대한 RBF의 결합은 poly(I) : poly(C)의 첨가에 의해 반전되었으며 E. coli 5S RNA경우는 효과를 거의 나타내지 않았다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제35권8호
• /
• pp.2317-2325
• /
• 2014

P-glycoprotein (P-gp) is a member of the ATP-Binding Cassette transporter superfamily and mediates transmembrane efflux of many drugs. Since it is involved in multi-drug resistance activity in various cancer cells, the development of P-gp inhibitor is one of the major concerns in anticancer therapy. Human P-gp protein has at least two "functional" drug binding sites that are called "H" site and "R" site, hence it has multi-binding-specificities. Though the amino acid residues that constitute in drug binding pockets have been proposed by previous experimental evidences, the shapes and the binding poses are not revealed clearly yet. In this study, human P-gp structure was built by homology modeling with available crystal structure of mouse P-gp as a template and docking simulations were performed with inhibitors such as verapamil, hoechst33342, and rhodamine123 to construct the interaction between human P-gp and its inhibitors. The docking simulations were performed 500 times for each inhibitor, and then the interaction frequency of the amino acids at the binding poses was analyzed. With the analysis results, we proposed highly contributing residues that constitute binding pockets of the human P-gp for the inhibitors. Using the highly contributing residues, we proposed the locations and the shapes of verapamil binding site and "R" site, and suggested the possible position of "H" site.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
• /
• 제20권3호
• /
• pp.229-235
• /
• 2005

태양광선,특히 자외선 B에 대한 환경적 노출은 편평세포암과 기저세포암을 포함하는 흑색선종 이외의 피부암과 크게 관련된다고 알려져 있다. 염기 류신 지퍼계 전사조절인자인 CChAT/enhancer binding protein-alpha는 표피 각질형성세포에서 다량으로 발현되었고, 각질형성세포의 증식을 억제하며 피부암 발생을 억제하는 유전자로서의 역할이 암시된 바 있다. 최근 자외선 B가 각질형성세포에서 p53에 의한 CCAAT/enhanrer binding protein-alpha의 발현을 강력하게 유도한다는 것이 보고되었다. 이러한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha 단백질 발현의 유도는 세포 성장 억제 세포고사와 함께 일어났다. 이 연구는 glycogen synthase kinase-3 길항제가 자외선 B에 의한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha 유도를 억제하며 변이 kinase-불활성 GSK의 강제 발현은 자외선 B가 CCAAT/enhancer binding protein-alpha전사조절부위 활성의 증가를 억제한다는 것을 보여주었다. 즉 자외선 B에 의한 CCAAT/enhancer binding protein-alpha의 유도가 p53과 활성 glycogen synthase kinase-3에 의한 것이라는 것을 증명하였다.

• 한국유체기계학회 논문집
• /
• 제10권5호
• /
• pp.20-26
• /
• 2007

Some gate valves are susceptible to pressure locking and thermal binding which prevent the safety function. The safety related gate valves susceptible to pressure locking and thermal binding shall be identified and taken preventive actions to ensure the safety function. The identification of the gate valves susceptible to pressure locking and thermal binding needs the evaluation of system design, valve and piping arrangement, test requirements, and operating conditions. Application of preventive methods should consider the system safety function, applicability, effectiveness, interface with system design, and cost. The selection procedure of valves susceptible to pressure locking and thermal binding can be effectively used in industry including nuclear power plants. In order to prevent the pressure locking, the hole can be drilled through the one disc of upstream side or down stream and the external equalizing line can be installed from bonnet to downstream or upstream. The double disc parallel seat valve type can be used instead of flexible wedge gate valve to prevent the thermal binding. The identification of gate valves susceptible to pressure locking and thermal binding, and preventive actions will meet the regulatory requirements and enhance the availability and safety of plants.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제20권3호
• /
• pp.257-262
• /
• 1992

Streptomyces virginiae가 생산하는 virginimycin 생산 유도인자(virginiae butanolide C,VB-C) 결합 단백질의 ligand(VB-C)와의 결합활성에 미치는 일반적인 성질을 검토한 결과, 본 VB-C 결합단백질은 막성분을 제외한 세포질에 90% 이상 존재하며, 최적 pH는 7.0인 것으로 입증되었다. KCL 존재하 약 15%의 결합활성이 증대되었으며,$Mo^{6+}$ 이온 존재시 60%의 결합활성 저하를 보였다.

• 정보처리학회논문지C
• /
• 제10C권6호
• /
• pp.755-762
• /
• 2003

MIPv6에서는 경로 최적화를 위하여, 새로운 서브넷으로 이동한 MN(Mobile Node) 은 CN(Correspondent Node) 에게 자신의 HoA(Home Address) 와 새로운 CoA(Care-of Address)와의 바인딩을 통고하는 바인딩 갱신 패킷을 전송해야 한다. 하지만, 안전하지 않은 바인딩 갱신은 오히려 침입자로 하여금 다양한 공격을 가능하게 한다. 이에 따라 안전한 바인딩 갱신을 ?∏? 여러 프로토콜들이 제안되었다. 본 연구에서는 기존 프로토콜들을 비교하기 위해 공격에 대한 취약성을 포함한 보안 특성, 프로토콜의 관리 특성, 패킷 교환 횟수와 암호화 연산 시간의 성능 특성에 대한 비교 기준을 제시하였다. 또한, 제시된 기준에 따라 대표적인 4가지 바인딩 갱신 프로토콜들을 비교 분석하고, 안전한 바인딩 갱신을 위한 개선안을 제시하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제9권5호
• /
• pp.619-623
• /
• 1999

The C-terminal starch-binding domain of Bacillus cereus $\beta$-amylase expressed in Escherichia coli was purified and crystallized using the vapor diffusion method. The crystals obtained belong to a space group of $P3_2$ 21 with cell dimensions, a=b=60.20${\AA},\; c=64.92{\AA},\; and \; \gamma = 120^{\circ}$ The structure was determined by the molecular replacement method and refined at 1.95 ${\AA}$, with R-factors of 0.181. The final model of the starch-binding domain comprised 99 amino acid residues and 108 water molecules. The starch-binding domain had a secondary structure of two 4-stranded antiparallel p-sheets similar to domain E of cyclodextrin glucanotransferase and the C-terminal starch-binding domain of glucoamylase. A comparison of the structures of these starch-binding domains revealed that the separated starch-binding domain of Bacillus cereus $\beta-Amylase$had only one starch-binding site (site 1) in contrast to two sites (site 1 and site 2) reported in the domains of cyclodextrin glucanotransferase and glucoamylase.

• Reproductive and Developmental Biology
• /
• 제33권3호
• /
• pp.119-123
• /
• 2009

The two dimensional quantitative structure-activity relationships (2D-QSARs) models concerning the binding affinity constants ($p[Od.]_{50}$) between 2-cyclohexyltetrahydropyrane and 2-cyclohexyltetrahydrofurane analogues as substrates, and bovine odorant binding protein (bOBP) as receptor were derived by multiple regression analyses method and discussed. The statistical quality of the optimized 2D-QSAR model (5) was good (r=0.907). From the model, the binding affinity constants ($p[Od.]_{50}$) were dependent upon the optimal value ($(TL)_{opt.}$=2.737) of total lipole (TL) of substrate molecules. Based on these findings, the high active compounds predicted by optimized 2D-QSAR model (5) were 2-(dimethylcyclohexyl)tetrahydropyrane molecule and their isomer molecules. The binding affinity constants regarding bOBP of the tetrahydrofuryl-2-yl family compounds were dependent upon the hydrophobicity (logP) of whole substrate molecules. In any case of porcine odorant-binding proteins (pOBP), the constants were dependent upon the hydrophobicity (${\pi}x={\log}P_X-{\log}P_H$) of substituents (R) in substrate molecules. Also, from the optimal values of hydrophobic constant, the hydrophobicity for bOBP influenced ca. twice time bigger (bOBP>pOBP) than that for pOBP.

• 한국자기공명학회논문지
• /
• 제10권2호
• /
• pp.175-187
• /
• 2006

Binding interactions between a positively charged porphyrin derivative TMAP(meso-tetra(p-trimethylanilinium-4-yl)porphyrin) and triple helical $(dT)_{12}{\cdot}(dA)_{12}{\cdot}(dT)_{12}$, as well as double helical $(dA)_{12}{\cdot}(dT)_{12}$ have been studied with NMR, UV and CD spectroscopy to obtain the detailed information about the binding mode and binding site. UV melting studies showed both DNA duplex and triple helix represented very similar UV absorption patterns upon binding TMAP, but the presence of third strand of triple helical $(dT)_{12}{\cdot}(dA)_{12}{\cdot}(dT)_{12}$, inhibited improvement in thermal stability in terms of melting temperature, $T_m$. In addition, the TMAP molecule is thought to bind to the major groove, according to CD and NMR data. But absence of the clear isosbestic point in UV absorption spectra represented that binding of TMAP to DNA duplex as well as DNA triplex did not show a single binding mode, rather complex binding modes.

• 생물환경조절학회지
• /
• 제19권2호
• /
• pp.117-121
• /
• 2010

단감 '부유'를 대상으로 과실 비대 및 착색 증진에 위한 결박 처리 시 가지 종류에 따른 효과를 비교하고자 결과모지, 부주지 및 주지에 철사를 이용하여 결박 처리하였다. 철사 제거 직후 6주 동안 과실 직경과 과피색 a값은 무처리에 비해 결과모지 및 주지 결박처리에서 더 많이 증가하였지만 부주지 결박처리에서는 효과를 나타내지 않았다. 결박 처리 8주 후 수확된 과실을 처리하지 않은 과실과 비교하면, 과중은 모든 결박처리에서 더 무거웠는데 특히, 주지 결박처리에서는 월등히 무거웠다. 과고는 주지 결박처리에서만 더 높았고, 과경은 결과모지 및 주지 결박처리에서 더 길었다. 과실 당도는 결과모지 및 부주지 결박처리에서 다소 높거나 비슷하였으나, 주지 결박처리에서는 낮게 나타났다. 과피색 a값은 결과모지 및 주지 결박처리에서 유의하게 높았지만, 이와 반대로 과피색 b값은 낮게 나타남으로써 Chroma값은 결과모지 및 부주지 결박처리에서 높게 나타났다. 과피 내 라이코펜 및 베타카로틴 함량은 부주지 및 주지 결박처리에서 유의하게 높게 나타났지만, 결과모지 결박처리에서는 차이를 나타내지 않았다. 총 엽록소 함량은 모든 결박 처리에서 낮게 나타났다.