• Title/Summary/Keyword: base pairing

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MicroRNA Analysis during Cultured Odontoblast Differentiation

  • Park, Min-Gyeong;Lee, Myoung-Hwa;Yu, Sun-Kyoung;Park, Eu-Teum;Kim, Seog;Lee, Seul-Ah;Moon, Yeon-Hee;Kim, Heung-Joong;Kim, Chun-Sung;Kim, Do-Kyung
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제37권3호
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    • pp.146-152
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    • 2012
  • MicroRNAs (miRNAs, miRs) are about 21-25 nucleotides in length and regulate mRNA translation by base pairing to partially complementary sites, predominantly in the 3'-untranslated region (3'-UTR) of the target mRNA. In this study, the expression profile of miRNAs was compared and analyzed for the establishment of miRNA-related odontoblast differentiation using MDPC-23 cells derived from mouse dental papilla cells. To determine the expression profile of miRNAs during the differentiation of MDPC-23 cells, we employed miRNA microarray analysis, quantitative real-time PCR (qRT-PCR) and Alizaline red-S staining. In the miRNA microarray analysis, 11 miRNAs were found to be up- or down-regulated more than 3-fold between day 0 (control) and day 5 of MDPC-23 cell differentiation among the 1,769 miRNAs examined. In qRT-PCR analysis, the expression levels of two of these molecules, miR-194 and miR-126, were increased and decreased in the control MDPC-23 cells compared with the MDPC-23 cells at day 5 of differentiation, respectively. Importantly, the overexpression of miR-194 significantly accelerated mineralization compared with the control cultures during the differentiation of MDPC-23 cells. These results suggest that the miR-194 augments MDPC-23 cell differentiation, and potently accelerates the mineralization process. Moreover, these in vitro results show that different miRNAs are deregulated during the differentiation of MDPC-23 cells, suggesting the involvement of these genes in the differentiation and mineralization of odontoblasts.

패스워드 기반 인증된 3자 키 교환 프로토콜 (Password-Based Authenticated Tripartite Key Exchange Protocol)

  • 이상곤;이훈재;박종욱;윤장홍
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제8권4호
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    • pp.525-535
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    • 2005
  • A. Joux의 프로토콜을 기반으로 패스워드 기반 인증된 3자 키 교환 프로토콜을 제안하였다. 공유 패스워드를 이용한 대칭 키 암호를 사용하여 A. Joux의 프로토콜이 갖는 인증과 man-in-the-middle attack 문제를 해결하였다. 또한 패스워드를 사용한 대칭 키 암호의 취약점인 오프라인 사전공격에 대한 대책도 제시하였다. 제안된 프로토콜은 인증서 기반 인증과 ID 기반 인증에서 요구되는 신뢰 기관이 필요 없으므로 ad hoc 네트워크와 같이 네트워크 인프라 구축이 어려운 환경에서 유용하게 사용될 수 있다. 제안된 프로토콜은 기존에 발표된 패스워드 인증된 키 교환 프로토콜보다 통신적인 면에서 더 효율적이며 트리기반 그룹 키 프로토콜에 적용될 경우 계산상의 약점을 보상받을 수 있다.

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Long non-coding RNA: its evolutionary relics and biological implications in mammals: a review

  • Dhanoa, Jasdeep Kaur;Sethi, Ram Saran;Verma, Ramneek;Arora, Jaspreet Singh;Mukhopadhyay, Chandra Sekhar
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제60권10호
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    • pp.25.1-25.10
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    • 2018
  • The central dogma of gene expression propounds that DNA is transcribed to mRNA and finally gets translated into protein. Only 2-3% of the genomic DNA is transcribed to protein-coding mRNA. Interestingly, only a further minuscule part of genomic DNA encodes for long non-coding RNAs (lncRNAs) which are characteristically more than 200 nucleotides long and can be transcribed from both protein-coding (e.g. H19 and TUG1) as well as non-coding DNA by RNA polymerase II. The lncRNAs do not have open reading frames (with some exceptions), 3`-untranslated regions (3'-UTRs) and necessarily these RNAs lack any translation-termination regions, however, these can be spliced, capped and polyadenylated as mRNA molecules. The flexibility of lncRNAs confers them specific 3D-conformations that eventually enable the lncRNAs to interact with proteins, DNA or other RNA molecules via base pairing or by forming networks. The lncRNAs play a major role in gene regulation, cell differentiation, cancer cell invasion and metastasis and chromatin remodeling. Deregulation of lncRNA is also responsible for numerous diseases in mammals. Various studies have revealed their significance as biomarkers for prognosis and diagnosis of cancer. The aim of this review is to overview the salient features, evolution, biogenesis and biological importance of these molecules in the mammalian system.

SIC 에러가 협동 NOMA 시스템에 미치는 영향 (Effect of SIC Errors to Cooperative NOMA systems)

  • 김남수
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제17권5호
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    • pp.35-42
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    • 2017
  • NOMA (Non-orthogonal multiple access) 시스템은 5세대 이동통신 시스템에서 요구하는 스펙트럼 효율과 시스템 성능을 만족시키는 유력한 다중화 기술이다. NOMA 시스템은 전력 도메인에서 여러 사용자를 동시에 전송하는데, 타 사용자들로 부터의 간섭을 제거하기 위하여 수신기에 SIC (Successive interference cancellation)를 채택하고 있다. 그러나 현실적으로 무선 페이딩 채널의 특성상 완벽한 SIC가 불가능하므로, SIC 에러가 NOMA 시스템에 미치는 영향에 대한 연구는 매우 필요하다. 본 논문에서는 SIC 에러가 존재할 때 협동 NOMA 시스템을 대상으로 하여 시스템의 오수신율을 해석적으로 유도하였고, 오수신율을 최소화하기 위한 최적의 전력할당을 구하였다. 또한 송신전력이 고정되었을 경우 SIC 에러에 따른 기지국과 릴레이 사이의 거리도 검토하였다. 유도한 결과는 Monte Carlo 시뮬레이션 결과와 비교하여 정확히 일치함을 확인하였다.

전이중 무선 셀룰라 네트워크에서 셀 용량 최대화를 위한 사용자 스케쥴링 방식 (User Scheduling Algorithm for Cell Capacity Maximization in Full Duplexing Wireless Cellular Networks)

  • 최현호
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제18권11호
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    • pp.2613-2620
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    • 2014
  • 본 논문에서는 전이중(full duplexing) 모드로 동작하는 기지국과 시분할 이중(TDD: Time Division Duplexing) 모 드로 동작하는 사용자들이 통신하는 전이중 무선 셀룰라 네트워크를 고려한다. 전이중 모드 사용시 상향링크 사용자 는 하향링크 사용자에게 간섭을 유발하므로 시스템 성능을 극대화하기 위해서는 같은 무선 자원을 동시에 사용하는 상 하향링크 사용자 쌍을 어떻게 결정하는 지가 매우 중요하다. 본 논문은 셀 용량을 최대화하기 위한 최적화 문제 를 제시하고 낮은 복잡도를 갖는 차선의 사용자 스케쥴링 알고리즘을 제안한다. 제안하는 스케쥴링 방식은 더 좋은 신호 품질을 갖는 하향링크 사용자가 자신에게 간섭을 덜 미치게 하는 상향링크 사용자를 먼저 선택할 수 있도록 우 선권을 갖는 방식으로 동작한다. 시뮬레이션 결과 제안 사용자 스케쥴링 방식을 사용하는 전이중 시스템은 최적 성 능을 달성하면서 기존 TDD 시스템의 셀 용량을 현저히 개선한다.

Mechanisms for Hfq-Independent Activation of rpoS by DsrA, a Small RNA, in Escherichia coli

  • Kim, Wonkyong;Choi, Jee Soo;Kim, Daun;Shin, Doohang;Suk, Shinae;Lee, Younghoon
    • Molecules and Cells
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    • 제42권5호
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    • pp.426-439
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    • 2019
  • Many small RNAs (sRNAs) regulate gene expression by base pairing to their target messenger RNAs (mRNAs) with the help of Hfq in Escherichia coli. The sRNA DsrA activates translation of the rpoS mRNA in an Hfq-dependent manner, but this activation ability was found to partially bypass Hfq when DsrA is overproduced. The precise mechanism by which DsrA bypasses Hfq is unknown. In this study, we constructed strains lacking all three rpoS-activating sRNAs (i.e., ArcZ, DsrA, and RprA) in $hfq^+$ and $Hfq^-$ backgrounds, and then artificially regulated the cellular DsrA concentration in these strains by controlling its ectopic expression. We then examined how the expression level of rpoS was altered by a change in the concentration of DsrA. We found that the translation and stability of the rpoS mRNA are both enhanced by physiological concentrations of DsrA regardless of Hfq, but that depletion of Hfq causes a rapid degradation of DsrA and thereby decreases rpoS mRNA stability. These results suggest that the observed Hfq dependency of DsrA-mediated rpoS activation mainly results from the destabilization of DsrA in the absence of Hfq, and that DsrA itself contributes to the translational activation and stability of the rpoS mRNA in an Hfq-independent manner.