• Journal of the korean society of oceanography
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• 제34권4호
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• pp.236-240
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• 1999

A preliminary study was carried out to find characteristics of microbial trophic relations in hypoxic waters of Lake Shihwa in May and August 1996. Abundances of bacteria, viruses, and heterotrophic nanoflagellates (HNF) and HNF grazing on bacteria were measured. Dissolved O$_2$ (DO) saturation ranged from 13 to 34% in the bottom waters, and % of DO saturation strongly correlated with salinity. Ratios of HNF-to-bacteria abundance (42-118${\times}$10$^{-5}$) and biomass (0.06-0.25), and ratios of virus-to-bacteria abundance (110-297) in the hypoxic water were similar to those found in the surface layer, indicating similar structures of microbial abundances and trophic functions in hypoxicand surface waters during the study period. In the hypoxic water, an energy flow from organic matter to bacteria to HNF might operate as equally as in oxic surface layer.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제13권1호
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• pp.35-47
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• 1971

최근 외국에서 Virus성 연화병을 발견하였으며 본병으로 인한 피해는 다를 연화병보다 매우 심하였음을 밝혔다. 그러나 우리나라에서는 거의 발병여부조차 밝혀지지 못하고 있는 것이다. 그리므로 본 연구에서 Virus성 연화병이 발생하는가를 생물학적검정과 전자현미경 관찰로 구명하였고 가잠을 어떠한 불량조건으로 사육하였을 때에 유발현상이 나타나는가를 조사하였다. 그러고 연화병의 Virus와 연화병 잠체에 분리한 Bacillus spp의 세균과의 기동작용 및 Virus의 잠좌내감염방지에 대하여 실험을 하였다. 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1) 우리나라에서 Virus성 연화병이 발생하였으며 그 병원체인 Virus 입자는 구형이고 직경이 26~30m$\mu$이었음을 동정하였다. 2) 누에를 식상불족으로 인한 영양장해를 입히게 하거나 3~4 영기의 고온다습환경에서 사육하면 광의의 유발현상이 뚜렷이 나타냈음을 인정하였다. 3) Virus 또는 세균을 단독접종한 경우보다 혼합접종한 경우는 잠복기간이 짧고 발병율이 높은 결과를 얻어 Virus에 세균과의 기동작용이 이루워졌음을 인정하였다. 4) Virus의 잠좌내감염방지에는 소석회를 사용함이 효과적방법이 였음을 인정하였다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제27권2호
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• pp.95-103
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• 2024

Purpose: Diarrhea is one of the leading causes of mortality in children living in developing countries. The etiology of acute diarrhea in each healthcare center varies depending on place, time, and population. This study aimed to identify pathogen patterns in human immunodeficiency virus (HIV)-infected and non-HIV children suffering from acute diarrhea, using multiplex real time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), in an Indonesian tertiary hospital. Methods: This cross-sectional study was conducted at Dr. Cipto Mangunkusumo National Hospital from March 2019 to April 2020. Results: The study showed that multiplex RT-PCR results were positive in 58.9% of the specimens, with more positive results in HIV-infected children than in non-HIV-infected children (70% vs. 54.7%). Altogether 72 enteropathogens were detected from all specimens. Enteropathogens in non-HIV children with acute diarrhea consisted of bacteria (70.6%) and viruses (29.4%) with a predominance of enteroaggregative Escherichia coli (25.4%), followed by Campylobacter spp. (11.8%), enteropathogenic E. coli (9.8%), Norovirus GII (7.8%), and Clostridium difficile (7.8%). Enteropathogens in HIV-infected children consisted of viruses (57.1%), bacteria (28.6%), and parasites (14.3%) comprising Norovirus GII (24%), Cryptosporidium spp. (14.3%), Campylobacter spp. (14.3%), Norovirus GI (14.3%), and Astrovirus (14.3%). Cryptosporidium spp. was the only parasite found in this study and was found only in HIV-infected children. In non-HIV children with acute diarrhea, most pathogens were invasive bacteria, while in HIV-infected children, more viral and parasite infections occurred, primarily caused by opportunistic pathogens. Conclusion: The pattern of enteropathogens can help clinicians determine further examinations and appropriate empirical antimicrobial therapy for the patient.

• 한국어병학회지
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• 제23권1호
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• pp.27-35
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• 2010

2006~2008년 (3년간) 남해안 거제, 통영지역의 해상가두리양식장에서 사육된 조피볼락 579 마리에 대한 병원체 감염률을 조사한 결과, 병원체 검출률은 46.0~92.0%로 연중 보균하고 있는 것으로 나타났으며, 수온상승기인 5월에 평균 58.1%로 낮았고, 수온하강기인 10월에 평균 81.5%로 높았다. 병원체 감염은 수온상승기인 5월과 고수온기인 8월에 기생충 단독감염이 대부분이었으나, 수온하강기인 10~11월에는 기생충 단독감염 뿐만 아니라 세균 단독, 세균과 기생충 혼합, 바이러스 단독 감염되고 있는 것으로 조사되었다. 조피볼락의 질병은 기생충성 질병 중에 Microcotyle sp.와 Caligus sp., 세균성 질병에 Vibrio sp.와 Streptococcus sp., 바이러스성 질병에 RSIV와 VNNV가 우점종으로 나타났다. 2006년도에는 바이러스가 검출되지 않았으나, 2007년도에 VNNV, VHSV 및 RSIV가 검출된 것은 2006년에 비해 여름철 수온이 $1.5\sim2.0^{\circ}C$ 높았기 때문으로 추정 되었다. 크기별 병원체 검출률은 11~15 cm에서 50.0~87.1%로 가장 높았으며, 30 cm 이상에서 감소되는 경향이었다. 기생충은 50.0~79.6%로 총 병원체 검출률과 비슷한 경향이었으며, 세균은 1.6~23.8%로 10 cm 이하와 26 cm 이상에서 높았으며, 바이러스는 0~1.5%로 25 cm 이하의 그룹에서 높은 것으로 나타났다.

• 미생물학회지
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• 제45권4호
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• pp.346-353
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• 2009

이식을 위해 사용하는 사람 양막은 기증자로부터 수혜자에게 바이러스, 세균, 진균과 같은 감염성 위해인자를 전파할 위험이 있다. 따라서 적절한 소독 및 멸균 공정을 통해 이식용 양막 내재 또는 혼입 가능한 감염성 위해인자를 완벽하게 불활화하여야 한다. 본 연구에서는 인체조직은행에서 사용하고 있는 소독 공정과 멸균 공정의 바이러스 및 세균, 진균 불활화 효과를 검증하기 위해 국제적 가이드에 따라 5종의 바이러스[human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), bovine herpes virus (BHV), bovine viral diarrhoea virus (BVDV), hepatitis A virus (HAV), porcine parvovirus (PPV)]와 2종의 세균(Escherichia coli, Bacillus subtilis), 1종의 진균(Candida albicans)을 생물학적 지표로 사용하였다. 양막에 각 생물학적 지표를 첨가한 후 70% 에탄올 소독 공정, 감마선 조사 공정, 산화에틸렌 가스 멸균 공정을 실시한 다음 각 바이러스, 세균, 진균을 회수하여 정량한 후 불활화 정도를 비교하였다. 70% 에탄올 처리 공정에서 HIV-1, BHV, BVDV 같은 외피 바이러스는 처리 시간 2.5분 안에 불활화되었지만, HAV와 PPV 같은 비-외피 바이러스는 에탄올에 매우 큰 저항성을 나타내었다. 감마선 2.5 kGy 조사에 의해 HIV-1, BHV, BVDV는 검출한계 이하로 완벽하게 불활화되었다. HAV와 PPV는 각각 5 kGy와 25 kGy 조사에 의해 검출한계 이하로 불활화되었다. 산화에틸렌 가스 처리에 의해 본 연구에 사용한 모든 바이러스가 검출한계 이하로 불활화되었다. 70% 에탄올 처리 공정에서 E. coli와 C. albicans는 모두 5분 안에 완벽하게 사멸하였다. 하지만 B. subtilis는 큰 저항성을 나타내었다. 감마선 조사 공정과 산화에틸렌 가스 멸균 공정에서 E. coli, B. subtilis, C. albicans 모두 완벽하게 불활화되었다.

• 한국군사과학기술학회지
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• 제22권4호
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• pp.575-580
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• 2019

In biological warfare, it is important to identify biological agents for proper treatment. We focused on developing a real-time RT-PCR kit that can detect multiple species of biological agents. AccuPower(R) Biothreat Real-Time RT-PCR Kit(v3.0) could detect Bacillus anthracis, Yersinia pestis, Vibrio cholerae, Francisella tularensis, Salmonella typhi, Rickettsia prowazekii, Variola virus, Hantaan virus, Yellow fever virus, Brucella spp., Shigella dysenteriae in a single reaction. The results showed that the kit was verified to be able to detect at least 0.005 ng of nucleotide and 10,000 CFU/ml of bacteria. Therefore, the kit is expected to be used as a rapid and sensitive detection kit for 11 species of biological agents within 2 hours.

• KSBB Journal
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• 제26권1호
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• pp.62-68
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• 2011

To isolate Lactic acid bacteria for animals, we have screened from Kim-chi, swine intestine, swine feces, and dairy products by random selection and anti-viral, antipathogenic bacteria test. Among them, CLP-1 shown that inhibitory effect against rotavirus, porcine epidemic diarrhea (PED) virus, Salmonella sp, and E.coli. By examining biological property, API-ZYM and identified Lactobacillus plantarum by 16S rDNAgene sequence. CLP-1 determined resistance to low pH and bile salt. Futhermore, the cell body of CLP-1 adhered to the intestinal epithelium tissue of swine and Caco-2 cell. CLP-1 was examined on cell immune system modulating activity in vitro. The whole cell and cell culture supernatant was increasing of interferon-${\beta}$ activity. And then, CLP-1 increased prevention effect by Salmonella enteritidis infection in SPF chickens. And we determined similar result in pigs.

• 식물병연구
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• 제17권1호
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• pp.44-51
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• 2011

우리나라에서 주로 재배되는 가지과작물의 종자 전염 병원균 중에서 세균성 병원균 Xanthomonns campestris pv. vesicatoria(Xcv), Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)와 바이러스 병원균 Pepper mild mottle virus (PMMoV) and Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV)를 종자로부터 동시검출하기 위한 One-step Multiplex RT-PCR을 개발하였다. 각각의 병원균을 특이적으로 증폭시키는 병원균 검출용 프라이머 15세트를 primer-blast 프로그램을 이용하여 제작하였고 각각의 병원균을 특이적으로 검출할 수 있는 5세트의 프라이머 세트(Cmm-F/R, Ecc-F/R, Xcv-F/R, PMMoV-F/R, TMGMVF/R)를 선발하였다. 이들 프라이머 세트는 프라이머간의 또는 병원균 cDNA간의 간섭없이 타겟 병원균만을 검출하였다. 가지과 작물 중에서 유통 중인 고추종자 20품종과 토마토종자 10품종에 대한 종자 감염 병원균 검출을 위한 PCR을 수행한 결과, 2개 품종의 토마토종자에서 Ecc가 검출되었고 4개 품종의 고추종자에서도 Ecc가 검출되었다. 특히 고추 종자에선 Ecc가 검출된 4개 품종 외에 1개 품종에서 PMMoV, TMGMV가 동시 검출되었다. 이로 인해 개발된 One-step multiplex RT-PCR은 서로 간섭 현상 없이 병원균을 효율적으로 검출할 수 있음을 보여 주었다.

• 한국수의병리학회:학술대회논문집
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• 한국수의병리학회 2003년도 추계학술대회초록집
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• pp.32-32
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• 2003

Intestinal infections are common in growing pigs and can be caused by multiple pathogens, environmental and management factors [1]. Among the most important viruses in swine enteritis are porcine epidemic diarrhea virus (PEDV), transmissible gastroenteritis virus (TGEV), porcine enteric calicivirus (PECV), porcine group A rotavirus (PRV gp A) and bacteria are Escherichia coli and Salmonella spp. and protozoa is Isospora suis [1]. The DNA chip system can serve as a powerful tool that can be utilized for simultaneous detection of specific pathogenic bacteria strains and viruses [2,3]. The combination of PCR and DNA chip technology will provide a novel method for the detection of porcine enteric pathogens thus revolutionize the diagnosis and management of the disease. The aim of this study is to develop DNA chip system for the rapid and reliable detection of five major porcine enteric pathogens based on oligonucleotide DNA chip hybridization. (omitted)

• 한국동물위생학회지
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• 제36권1호
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• pp.37-44
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• 2013

The ecologically and economically important honeybee species are susceptible to infections by various pathogens. This study was investigated to detect infectious pathogens in honeybee colonies reared in eastern Gyeongbuk province by PCR in 2010~2011. A total of 11 infectious pathogens, including 6 viruses, 2 bacteria, 2 fungi, and 1 parasite, were investigated in honeybee colonies suffering from symptoms of sudden collapse, depopulation, or paralysis. The infectious pathogens and infection rates among 24 honeybee colonies detected were as follows: sacbrood virus (66.7%), deformed wing virus (4.2%), black queen cell virus (12.5%), Kashmir bee virus (29.2%), American foulbrood (41.7%), European foulbrood (12.5%), stonebrood (45.8%), chalkbrood (4.2%), and Nosema (33.3%), respectively. Since the coinfection rates of multiple pathogens were detected high in honeybee colonies reared in eastern Gyeongbuk province, large-scale investigation and appropriate control programs need to be established in this region.