Pasteurella multocida, a Gram-negative facultative anaerobic bacterium, is a causative animal pathogen in porcine atrophic rhinitis and avian fowl cholera. For the development of recombinant subunit vaccine against P. multocida, we cloned and analyzed the gene for outer membrane protein H (ompH) from a native strain of Pasteurella multocida in Korea. The OmpH had significant similarity in both primary and secondary structure with those of other serotypes. The full-length, and three short fragments of ompH were expressed in E. coli and the recombinant OmpH proteins were purified, respectively. The recombinant OmpH proteins were antigenic and detectable with antisera produced by either immunization of commercial vaccine for respiratory disease or formalin-killed cell. Antibodies raised against the full-length OmpH provided strong protection against P. multocida, however, three short fragments of recombinant OmpHs, respectively, showed slightly lower protection in mice challenge. The recombinant OmpH might be a useful vaccine candidate antigen for P. multocida.
The emergence of influenza virus and antigenic drift are potential cause of world-wide pandemic. There are some commercially available drugs in the market to treat influenza. During past decade, however, critical resistances have been raised for biological targets. Because of structural complexity and flexibility of target proteins, applying a computational modeling tool is very beneficial for developing alternative anti-influenza drugs. In this review, we introduced molecular dynamics (MD) simulations approach to reflect full conformational flexibility of proteins during molecular modeling works. Case studies of MD works were summarized for the drug discovery and drug resistance mechanism of anti-influenza pharmaceuticals.
The author reported previously on separation of the outer tegument of the spargana (plerocercoids of Spirometra mansoni) using high concentration of urea solution. To determine which layer of the tegument is separated by this method, an electron microscopic analysis has been processed in this study. It was confirmed that the basement layer of the tegument is separated from the parenchyme of the sparganum. In addition, the antigenicity of the separated outer tegument against the human sparganosis patient sera was evaluated. Numerous antigenic proteins, including 16 and 55 kDa proteins, were noticed in the separated tegument; however, there were no diagnostic 31/36 kDa molecules in this tegument. The molecules reactive with the patient sera in the tegument are to be characterized in future studies.
Lee, Sang-Yeop;Yun, Sung Ho;Bang, Geul;Lee, Chang-Seop;Kim, Seung Il
Mass Spectrometry Letters
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제12권3호
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pp.76-80
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2021
Scrub typhus is an acute febrile disease caused by the pathogenic bacterium Orientia tsutsugamushi, belonging to the Rickettsiaceae family. The shotgun proteomic analysis was performed using the sera of scrub typhus patients to identify the proteins having their origin in O. tsutsugamushi. Three different databases approaches were used for the identification of the proteomes. We identified the RsmD, an RNA methyltransferase as the commonly detected protein from all three approaches. This protein was not detected in the sera of healthy negative controls. We believe that this protein is a potential biomarker of Orientia tsutsugamushi present in the sera of scrub typhus patients.
Kim, Hyo-Joon;Lee, Yang-Min;Hwang, Joon-Sung;Won, Ho-Shik;Kim, Bok-Hwan
BMB Reports
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제32권5호
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pp.461-467
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1999
Recombinant Mycobacterium smegmatis expressing ovalbumin was used to immunize C57BL/6(H-$2^b$) mice, and the humoral immunity against recombinant ovalbumin was analyzed. Antibodies were purified by denatured ovalbumin-conjugated affinity chromatography. The epitopes of the antibodies were screened with a random peptide library displayed on the tip of fUSE5 filamentous phage pIII minor coat proteins. Two peptides, IRLADR and SPGAEV, were selected predominantly by the recognition of purified antibodies using biopanning methods. The composition of the peptide sequence with the primary structure of OVA revealed that the peptide sequence analogizes to INEAGR, part of the $^{323}ISQAVHAAHAEINEAGR^{339}$ sequence previously reported as the antigenic determinant for murine Band also Th cell epitopes (I-$A^d$ binding). Also, the structures of these mimotopes obtained from restrained molecular dynamic computations resulted in the formation of a $\beta$-turn proven to be a secondary structure of the parent peptide within the ovalbumin molecule, enabling us to confirm the structural similarity. This study demonstrates that immunization with recombinant M. smegmatis can generate neutralizing antibodies identical with those induced by the administration of natural antigenic proteins and supports the potential use of mycobacteria as vaccine delivery vehicles.
질편모충 항원 분석의 일환으로 막항원의 분석을 시도하였다 수확 세척된 질편모충 HY-l의 homogenate를 sucrose step-gradient를 이용하여 differential centrifugation하였으며 25%/45%의 sucrose 경계면으로녁터 막분회을 얻었다. 분리된 막분회은 transmission electron microscopy를 통하여 순수 분리되었는지 확인하였고 효소면역 전기영동 이적법(EITB)을 이용하여 항원성을 관찰하였으며 그 결과는 다음과 같았다. 분리된 막분획은 투과전자 현미경상에서 extended sheet나 concentric vesicle의 형태가 거의 균질하게 분포하고 있었으며 막 분획에서 특징적으로 나타나는 trilaminal appearance를 보여 질편모충의 막분획이 순수 분리된 것으로 간주할 수 있었다. 분리된 막분획은 EITB상에 토끼의 항혈청과 반응하였을 때 46, 60, 110, 120, 130 및 150 kfDa에서 항원성이 있는 반응대가 관찰되었으며 N-hydroxysuccinimido-biotic으로 표지하여 분리된 표면항원의 녁획과 비교하였을 때 60 KDa의 항원 분획이 서로 일치하는 것으로 나타났다. 따라서 60 kfDa 의 항원 분획은 료면 항원임을 확신할 수 있었다.
Kim, Tae-Yun;Kang, Shin-Yong;Ahn, Il-Young;Cho, Seung-Yull;Hong, Sung-Jong
Parasites, Hosts and Diseases
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제39권1호
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pp.57-66
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2001
In the course of immunoscreening of Clonorchis sinensis cDNA library, a cDNA CsRP12 containing a tandem repeat was isolated. The cDNA CsRP 12 encodes two putative peptides of open reading frames (ORFs) 1 and 2 (CsRP12-1 and -2). The repetitive region is composed of 15 repeats of 10 amino acids. Of the two putative peptides, CsRP12-1 was proline-rich and found to have homologues in several organisms. Recombinant proteins of the putative peptides were bacterially produced and purified by an affinity chromatography Recombinant CsRP12-1 protein was recognized by sera of clonorchiasis patients and experimental rabbits, but recombinant CsRP 12-2 was not. One of the putative peptide, CsRP12-1, is designated CsPRA, proline-rich antigen of C. sinensis. Both the C-termini of CsRP12-1 and -2 were bacterially produced and analysed to show no antigenicity. Recombinant CsPRA protein showed high sensitivity and specificity. In experimental rabbits, IgG antibodies to CsPRA was produced between 4 and 8 weeks after the infection and decreased thereafter over one you. These results indicate that CsPRA is equivalent to a natural protein and a useful antigenic protein for serodiagnosis of human clonorchiasis.
adr 아형 B형 간염바이러스의 preS2염기서열을 베타갈락토시다세 유전자에 연결시켜 클론닝한 후, 융합단백질의 형태로 대장균에서 발현시켰다. 한국인 간염환자로부터 분리된 표면항원으로 유도한 단일 클론항체 H8는 preS2에 특이성을 지니고 있으며, 상기의 융합단백질과 특이적으로결합하였다. 이 단일 클론항체는 adw2아형 preS2 융합단백질과는 단지 낮은 수준의 결합성을 보여주었는데, 이와 같은 단일클론항체 H8의 adr 아형과 adw2아형에 대한 결합성의 차이는 preS2부위의 아미노산 차이에 기인한다고볼 수 있다.
To examine humoral immune responses in the host, we measured serum antibody levels in different strains of mice (ICR, BALB/c, and C3H) experimentally infected with Neodiplostomum seoulense. Specific IgG antibody levels were increased remarkably with little difference among 3 strains of mice infected with N. seoulense from day 7 to 35 post-infection. More target proteins of adult parasites reacted with IgG at the time when the worm recovery decreased compared with other times. More than 20 protein bands, from 14 kDa to 94 kDa in size, were separated from the crude antigen of N. seoulense adults by SDS-PAGE, and among them 26, 30, 35, 43, 54, 67, and 94 kDa proteins were the major antigenic proteins. The results suggest that significant IgG antibody responses occur against N. seoulense in mice and this may be related with expulsion of worms.
A splenectomized 5-month-old calf was inoculated with cryopreserved Theileria sergenti infected blood originated from naturally infected Korean native cattle in Chonbuk district. At peak parasitemia (40.1%), blood was collected, washed, lysed and then the T sergenti merozoite was isolated by differential centrifugation. Antigenic profile of isolated T sergenti organism was analized by SDS-PAGE and western blotting techniques. Coomassie blue stained SDS-PAGE gel revealed at least twelve protein bands of approximately 14Kd, 28Kd, 30Kd, 34Kd, 36Kd, 38Kd, 41Kd, 56Kd, 66Kd, 72Kd, 97Kd and 116Kd in the merozoite homogenate. In western blot, although T sergenti antigen recognized by specific anti-T sergenti antibodies demonstrated 28Kd, 30Kd, 38Kd, 56Kd, 58Kd, 66Kd, 97Kd and 116Kd proteins. False positive reactions were also observed in normal bovine serum with T sergenti and normal erythrocytic antigens. Therefore, predominant proteins of T sergenti merozoite antigen were found to be 28Kd, 30Kd, and 41Kd proteins of molecular weights. On going studies we will analyze the relative importance of those antigens for immunity of T sergenti in Korean native cattle.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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