• 제목/요약/키워드: allozyme variation

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버들치속(잉어과) 어류의 유전적 변이 및 종분화 (Genic Vadadon and Speciation of Fishes of the Genus Moroco(Cyprinidae))

  • 양서영;민미숙
    • 한국동물학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.75-83
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    • 1989
  • 한국 및 일본산 버들치속 어류의 유전적 변이, 종의 분류학적 위치 및 계통변화를 구명하기 위하여 전기영동법을 이용, 26개 유전자를 검출 분석하였다. 버들치속 어류의 평균 유전적 변이 정도는 타 어류군에 비하여 낮은 편이었다. 분류상 문제시 되어 오던 한국산 M. lagowskii와 M. oxycephalus 및 일본산 M. steindachneri와 M. jouyi는 각 종 특유의 genetic markers를 갖고 있어 각기 독립된 별종으로 확인되었다. M. lagowskii의 분포지역인 경포호집단은 유전적으로 뚜렷한 차이가 있고 형태적 특징으로 보아 M. percnurus로 추정된다. 각 종의 분화연대를 추정한 결과 이들은 선신세후기에서 홍종세 초기에 걸처 종분화가 되었고, 고 Amur 하 수계를 통하여 이주, 분포한 것으로 추측된다.

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Allozyme Diversity and Population Genetic Structure in Korean Endemic Plant Species : II. Hosta yingeri (Liliaceae)

  • Chung, Myong Gi
    • Journal of Plant Biology
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    • 제37권2호
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    • pp.141-149
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    • 1994
  • Levels of genetic diversity, population genetic structure, and gene flow in Hosta yingeri, a herbaceous perennial endemic to Taehuksan, Sohuksan, and Hong Islands, were investigated. Starch gel electrophoresis was conducted on leaves for 101 plants collected from three populations. Although the distribution of thespecies is restricted in the islands, it maintains high levels of genetic variatin; 64% of polymorphic loci in at least one population (Ps), the mean number of alleles per locus (Ap) of 1.92, and the mean effective number of alleles per locus (Aep) of 1.52. Overall, mean genetic diversity (Hep=0.250) was substantially higher than mean estimate for species with very similarlife history traits (0.102). Large populaton size, the persistence of multiple generations within populations, high fecundity, predominantly outcrossing breeding system, large size of pollinator visitation areas may be explanatory factors contributing the higher level of genetic diversity maintained within populations. Analysis of fixation indices showed an overall slight excess of heterozygotes (mean FIS=-0.066) relative to Hardy-Weinberg expectations, which may in part be due to the near self-incompatible breeding system in the species. Significant differences in allele frequencies among populaitns were found for 14 out of 16 polymorphic loci (P<0.05). Slightly more than 80% of the total variation in the species was common to all populations (GST=0.198). As expected, indirect estimate of the number of migrants per generation (Nm=0.45, calculated from mean GST) and nine private alleles found in the three populations indicate that gene movement among three isolated island populations was low.

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Genetic Diversity of Soybean Landraces in Korea

  • Han, Ouk-Kyu;Abe, Jun;Shimamoto, Yoshiya
    • 한국작물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.256-262
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    • 1999
  • To evaluate the genetic diversity and structure of the South Korean soybean population, 233 landraces collected in various regions of the country were surveyed for 15 allozyme loci and one protein locus. The South Korean population was fixed or nearly fixed at seven of the 16 loci tested. The number of alleles per locus was 2.06 and Nei’s gene diversity was 0.194. These values were lower than the values for the same 16 loci previously reported for the Japanese and Chinese populations. The differences among eight regional groups were not so marked, with only 7.2% of the total variation arising from regional differentiation. Three southern regional groups (Chollabuk-do, Chollanam-do and Kyong-sangnam-do) exhibited a relatively high variability because of frequent occurrence of alleles characteristic of the Japanese population. A marked difference was found in allelic frequencies at the Dial locus between large-seeded landraces and small-seeded ones, suggesting that the latter, which are used mainly for bean sprouts, had been established independently of the former, which are used mostly for soy sauce and cooking with rice. Not only the region but also the usage as food materials should therefore be taken into consideration in designing an efficient collection and preservation method for the Korean soybean landraces.

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Allozyme Diversity in Korean Populations of Calystegia soldanella and C. japonica (Convolvulaceae): Implications for Conservation

  • Chung, Myong Gi
    • Journal of Plant Biology
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    • 제38권2호
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    • pp.173-180
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    • 1995
  • We investigated levels and distribution of genetic variation in Korean populations of Calystegia soldanella and C. japonica, clonally reproducing herbaceous perennials. Calystegia soldanella is one ofecologically important beach plants growing only on sand and beach dunes in Europe, East Asia, the Pacific Islands, and the west coast of North America. In contrast, C. japonica usually grows on small mounds of paddy fields, roadsides, and waste places with patchy distribution. Starch gel electrophoresis was conducted on leaves collected from 13 populations of C. soldanella and eight populations of C. japonica. The levels of genetic variation of the two species are very comparable; means of expected heterozygosity (Hep) were 0.100 and 0.099 for C. soldanella and C. japonica, respectively. These values were also very similar to those for species with similar life-history and ecological traits. However, the proportion of total genetic diversity partitioned among populations (GST) of C. soldanella (0.146) was considerably lower than that of C. japonica (0.383). In addition, means of Nei's genetic identity (Ⅰ) for C. soldanella and C. japonica were 0.985 and 0.900, respectively, which supports a restricted gene flow resulting from obligate clonal reproduction of C. japonica. Significant differences in allele frequency were detected among populations at eight and nine of nine polymorphic loci for C. soldanella and C. japonica (P<0.01), respecitvely. Considering the ecological importance of C. soldanella, the isolated beach populations coupled with present destruction of natural habitats of the species may result in erosion of genetic diversity in the near future. In this respect, conservation efforts should be focused on those populations that currently maintain the most genetic diversity such as those populations in the eastern and southeastern Korean Peninsula and Hamduck Beach, Cheju Island.

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바위채송화(돌나물과)집단의 유전적 구조: 유전자 이동과 물리적 장벽에 관한 통찰 (Population genetic structure of Sedum polytrichoides (Crassulaceae): Insights into barriers to gene flow)

  • 정미윤;;정명기
    • 식물분류학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.361-370
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    • 2016
  • 한반도 남동부에 위치한 주왕산 국립공원과 그 인접산지는 식물 개체군의 유전자 이동에 대한 물리적 장벽의 영향을 시험하기 위한 훌륭한 모델 시스템이다. 우리는 식물종의 경우, 격리된 집단이 연속적인 분포를 보이는 집단보다 유전적인 분화 정도가 더 클 것으로 예측했다. 바위채송화 대부분의 집단은 4곳의 고립된 계곡에서 생육하며, 10개 집단에서 12 종류의 알로자임 유전좌위를 사용하여 유전적 다양성과 구조를 평가했다. 저자들은 이 연구와 기존 연구된 둥근잎꿩의비름(4곳 계곡에서 격리되어 생육)과 기린초(상대적으로 연속적으로 분포) 결과와 비교했다. 우리는 기린초 집단내 유전적 변이가 중간 수준임을 발견했다($H_e=0.112$). 바위채송화 집단간 분기 수준도 중간 수준($F_{ST}=0.250$)이었고 예상대로 둥근잎꿩의비름(0.261)과 유사했지만 기린초(0.165)보다 상당히 높았다. 분자분산분석(AMOVA) 결과 바위채송화와 둥근잎꿩의비름은 기린초(4%)보다 계곡간 변이(각각 19%) 비율이 높았다. STRUCTURE 프로그램 분석에 의하면 대부분의 이런 변이는 중간에 있는 두 계곡간의 유전적 조성 차이 때문이다. 저자들은 종간에 관찰된 분화 수준의 차이(즉, 기린초 대 바위채송화와 둥근잎꿩의비름)는 연구 지역 내의 그들의 분포 차이에 기인한다고 결론지었다.

한국산 흰대극(Euphorbia esula)과 섬흰대극(E. maackii)의 유전적, 형태적 분화 (Genetic and morphological divergence of Euphorbia esula and E. maackii in Korea (Euphorbiaceae))

  • 정한진;박기룡
    • 식물분류학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.267-274
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    • 2012
  • 흰대극과 섬흰대극의 형태적, 유전적 분화를 알아보기 위해 두 종의 14개 자연 집단으로부터 12개의 형태형질과 11개의 동위효소 유전좌위를 조사하였다. 흰대극복합체의 유전적 다양성 측정치(A=1.63, P=44.83, $H_e$=0.198)는 기존의 동북아산 암대극과 두메대극의 보고와 유사하며, 한국산 붉은대극과 대극보다는 약간 낮은 수치를 보여주고 있다. 비록 대부분 두 종사이의 형태형질의 측정범위가 중복되나 흰대극과 섬흰대극은 형태형질의 조합에 의해 구별되며, 이를 기초로 한 전형질도는 한국에 두 종이 분포함을 지지해주고 있다. 하지만 동위효소 자료를 이용한 분석에서는 두 종이 구별되지 않았으며, 이와 같은 두 자료의 불일치는 두 종이 최근에 분화 하였거나 종간 형질이입에 의한 교잡에 의해 이와 같은 결과가 나온 것으로 추측된다.

금강소나무 - 유전적으로 별개의 품종으로 인정될 수 있는가? - 동위효소분석 결과에 의한 고찰 - (Pinus densiflora for. erecta - Can It Be Treated Genetically as a Distinct Group? - Reconsideration Based on Allozyme Data -)

  • 김진수;이석우;황재우;권기원
    • 한국산림과학회지
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    • 제82권2호
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    • pp.166-175
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    • 1993
  • 별개의 품종으로 인정되고 있는 강원 경북지역의 금강소나무(Pinus densiflora for. erecta) 8개 집단, 소나무 17개 집단 및 곰솔 13개 집단을 대상으로 공통으로 조사된 16개 동위효소 23개 유전자좌에서의 유전변이를 상호간에 비교 분석하였다. 소나무와 금강소나무 집단에서의 대립유전자 종류와 빈도분포가 매우 유사하고 곰솔에만 출현하는 표식인자가 금강소나무 집단에서 전혀 발견되지 않은 사실로부터 금강소나무가 곰솔의 영향을 받은 이입잡종이라는 근거를 찾을 수 없었다. 계층구조에 의한 Wright의 F 분석 및 Nei의 유전적 거리, 유전자좌별 거리계수 빈도분포를 이용한 여러가지 유전분석 (유집분석, 요인분석, 수지구분석)의 결과로 부터 강원 경북지역의 소나무 집단이 다른 지역의 소나무 집단들과 구분될 수 있는 뚜렷한 유전적 차이가 없음을 확인하였다.

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한국내 맥문동의 유전적 다양성과 집단 구조 (Genetic Diversity and Population Structure of Liriope platyphylla (Liliaceae) in Korea)

  • 허홍욱;최주수;이복규;허만규
    • 생명과학회지
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    • 제17권3호통권83호
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    • pp.328-333
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    • 2007
  • 한국내 분포하는 맥문동(Liriope platyphylla) 11집단에 대한 20 알로자임 대립유전자좌위에서 유전적 다양성과 집단구조를 조사하였다. 효소내 다형성을 나타내는 빈도는 55.9%였다. 종과 집단 수준에서 유전적 다양도는 각각 0.178, 0.168로 높았으며, 집단간 분화 정도는 낮았다($G_{ST}$ = 0.064). 전체 11 집단에서 임의교배에 의한 편차는 0.311이였다. 전체 유전적 다양성는 $0{\sim}0.535$였다. 유전적 다양도 중 집단내 변이는 높았다($H_S$ = 0.305). 세대간 이주하는 개체수는 약 3.66으로 이 종의 한국내 집단간 유전자 흐름이 높음을 시사한다. 또한 라이트의 고정지수 분석 결과 많은 대립유전자좌위와 집단에서 이형접합자의 결핍이 존재하고 있었다. 집단간 유전적 동질성은 0.988이였다. 이는 맥문동의 분포지가 한국내 유사한 환경에 놓여 있고 집단이 방향적 동질성을 가지고 있음을 시사한다.

울릉도 말오줌나무와 근연종의 재검토 (A reappraisal of Sambucus pendula Nakai on Ulleung Island and its allies)

  • 임효인;장계선;이흥수;장진성;김휘
    • 식물분류학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.181-192
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    • 2009
  • 울릉도에 분포하는 말오줌나무는 화서가 크고 아래로 처지며 열매가 다른 분류군에 비해 작은 특징때문에 한반도 고유종으로 간주되었다. 본 연구는 근연종인, 지렁쿠나무, 덧나무, 딱총나무를 포함한 총 256개 개체에 대해 주성분분석(PCA)을 통해 각 분류군간 형태적 특징을 비교하였는데, 형태 분석 결과 말오줌나무는 지렁쿠나무와 덧나무에 비해 화서의 크기가 크고 총화경이 길어 뚜렷한 차이가 있었다. 이런 화서의 특징 이외에 말오줌나무의 암술머리 색깔은 덧나무와 지렁쿠나무의 혼합형이며, 동위효소와 염색체 수의 경우에는 덧나무에 더 가까웠다. 반면 말오줌나무는 한반도 내의 다른 개체들과 형태적으로 불연속을 보이는데, 이는 한반도 내 분류군들 간에는 지속적인 유전적 교류가 있었던 반면, 울릉도의 말오줌나무는 신생대 4기 이후 섬 지역에 고립되어 형태적으로는 비교적 고착화된 것으로 판단된다. 전 세계 딱총나무속의 연구에 의하면 종간 잡종 현상이 활발히 보고되는데, 현재 본 연구에서 분석된 지렁쿠나무와 덧나무의 형질의 혼합 혹은 중간 형태는 잡종에 의한 결과인지, 혹은 형질의 연속변이로 인한 결과인지는 불확실하다. 유라시아와 북미 대륙에 넓게 분포하는 Sambucus racemosa L.는 지역적으로 일부 분류군들이 분화하여 기존에 아종으로 처리되고, 동북아시아에서는 지렁쿠나무와 덧나무의 실체가 확인되지만 여전히 각 분류군간에 형태적으로 중첩이 된다. 따라서, 본 연구에서는 말오줌나무를 S. racemosa의 아종, 즉 S. racemosa subsp. pendula로 처리하였다.

엽록체 염기서열을 통한 너도밤나무(너도밤나무과)의 기원 추론 (Sea, wind, or bird: Origin of Fagus multinervis (Fagaceae) inferred from chloroplast DNA sequences)

  • 오상훈
    • 식물분류학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.213-220
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    • 2015
  • 울릉도의 낙엽활엽수림에 우점하고 있는 너도밤나무를 대상으로 엽록체 반수체형(haplotype)의 다양성과 공간적 분포를 파악하기 위해 울릉도 전역에서 채집한 총 144개체로부터 psbA-trnH 구간의 염기서열을 결정하였다. 너도밤나무의 근연종을 포함하여 계통분석을 수행한 결과, 너도밤나무의 엽록체 반수체형은 일본산 F. japonica와 중국산 F. engleriana 분계조와 자매관계를 이루는 것으로 나타났다. 또한, 분석한 모든 너도밤나무의 개체들은 동일한 염기서열을 갖고 있는 것으로 나타나, 엽록체 반수체형의 다양성은 매우 낮은 것으로 판명되었다. 이러한 결과는 동위효소 분석에 근거한 유전자 다양성이 매우 높다는 기존 연구 결과와 대비되는 것으로서, 너도밤나무는 핵 유전자의 다양성은 높으나 엽록체 유전자의 다양성은 낮은 것으로 판단되며, 이것은 두 가지 가설로 설명할 수 있다. 하나는 너도밤나무의 조상이 울릉도로 이주하여 정착할 초기 단계에서 엽록체 반수체형이 지역적인 구조를 갖는 조상 모집단으로부터 종자가 지속적으로 유입된 결과로 해석할 수 있다. 다른 하나는 육지의 조상 모집단으로부터 새 또는 태풍에 의해 소수의 종자가 유입되어 정착한 후, 바람에 의해 조상 모집단의 화분이 지속적으로 유입된 결과인 것으로 추론할 수 있다. 울릉도 내의 대양한 고유 자생식물의 기원을 규명하는 데 있어서 모계유전을 함으로 인해 종자의 이동을 추적할 수 있는 엽록체 DNA에 근거한 비교계통지리학적 연구가 필요한 것으로 사료된다.