• 제목/요약/키워드: allosterism

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트립토판 합성효소의 β반응속도에 미치는 일가양이온의 영향 (Effects of Monovalent Cations on the βReaction Kinetics of Tryptophan Synthase)

  • 김일;신혜자;임운기;김한도
    • 생명과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.17-20
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    • 2004
  • 대장균 트립토판 합성효소의 $\beta$반응의 빠른 속도 반응에 일가 양이온의 영향을 D56N과 D56G 잔기치환체를 대상으로 조사하였다. 일가 양이온을 처리하였을 때 생성되는 중간반응 생성물의 생성과 분해 속도가 영향을 받았다. 56번 자리 잔기치환체도 야생형에 비해 반응의 중간산물의 생성과 분해에 있어 모두 느린 속도를 보여주고 있다. 이들 잔기 치환체에 미치는 일가 양이온의 영향 또한 달라졌다. 이 결과는 대장균의 효소에서도 56번잔기가 이소조절에 관여하고 있고, 이 과정에서 일가 양이온들이 이소조절 리간드역할을 수행하는 것을 보여준다.

Target Recognition Triggered Split DNAzyme based Colorimetric Assay for Direct and Sensitive Methicillin-Resistance Analysis of Staphylococcus aureus

  • Jin Xu;Dandan Jin;Zhengwei Wang
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제34권6호
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    • pp.1322-1327
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    • 2024
  • The accurate and rapid detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) holds significant clinical importance. This work presents a new method for detecting methicillin-resistant Staphylococcus aureus (S. aureus) in clinical samples. The method uses an aptamer-based colorimetric assay that combines a recognizing probe to identify the target and split DNAzyme to amplify the signal, resulting in a highly sensitive and direct analysis of methicillin-resistance. The identification of the PBP2a protein on the membrane of S. aureus in clinical samples leads to the allosterism of the recognizing probe, and thus provides a template for the proximity ligation of split DNAzyme. The proximity ligation of split DNAzyme forms an intact DNAzyme to identify the loop section in the L probe and generates a nicking site to release the loop sequence ("3" and "4" fragments). The "3" and "4" fragments forms an intact sequence to induce the catalytic hairpin assembly, exposing the G-rich section. The released the G-rich sequence of LR probe induces the formation of G-quadruplex-hemin DNAzyme as a colorimetric signal readout. The absorption intensity demonstrated a strong linear association with the logarithm of the S. aureus concentration across a wide range of 5 orders of magnitude dynamic range under the optimized experimental parameters. The limit of detection was calculated to be 23 CFU/ml and the method showed high selectivity for MRSA.