The level of genetic differentiation and genetic structure in a Chinese native chicken breed, Bian chicken, and two controlled chicken populations (Jinghai chicken and Youxi chicken in China) were analysed based on 29 microsatellite markers. A total of 166 distinct alleles were observed across the 3 breeds, and 32 of these alleles (19.3%) were unique to only 1 breed. Bian chicken carried the largest number of private alleles at 15 (46.9%), followed by the Jinghai chicken with 12 private alleles (37.5%). The average polymorphism information content (0.5168) and the average expected heterozygote frequency (0.5750) of the Bian chicken were the highest, and those of the Jinghai chicken were 0.4915 and 0.5505, respectively, which were the lowest. Among 29 microsatellite loci, there were 15 highly informative loci in Bian chicken, and the other 14 were reasonably informative loci. The highly informative loci in Jinghai chicken and Youxi chicken were 17 and 14 respectively. Significant deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed at several locus-breed combinations, showing a deficit of heterozygotes in many cases. As a whole, genetic differentiation among the breeds estimated by the fixation index (Fst) were at 6.7% (p<0.001). The heterozygote deficit within population (Fis) was 22.2% (p<0.001), with the highest (0.249) in Bian chicken and lowest (0.159) in Youxi chicken. These results serve as an initial step in the plan for genetic characterization and conservation of the Chinese chicken genetic resource of Bian, as well as Jinghai and Youxi chickens.
Background: Previous studies have indicated that single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the interleukin-17 (IL-17) gene are associated with an increased risk of gastric cancer. However, the findings were inconsistent. Materials and Methods: To provide a more reliable estimation of the association between SNPs in the IL-17 gene and the susceptibility to gastric cancer, we searched PubMed, CNKI, and Wan Fang databases and selected finally six studies covering 2,366 cases and 3,205 controls to perform a meta-analysis. Results: Statistical analyses showed that an rs2275913 polymorphism within the IL-17A gene was significantly associated with an increased risk of gastric cancer using a generalized odds ratio (ORG, a model-free approach). Moreover, we also found that the 'A' allele carriers of IL-17A rs2275913 had a significant link with clinicopathological features. However, no significant positive signals were observed in the association analysis of the rs3748067 and rs763780 polymorphisms with the risk of gastric cancer in IL-17A and IL-17F, respectively. Conclusions: Despite some limitations, the present meta-analysis provided a more precise estimation of the relationship between the IL-17 gene SNPs and gastric cancer risk compared with individual studies.
Objective: To explore the effect of lysine-coated oxide magnetic nanoparticles (Lys@MNPs) on viability and apoptosis of A549 lung cancer cells. Methods: Transmission electron microscopy (TEM), vibrating sample magnetometer (VSM) and Zeta potentiometric analyzer were employed to characterize Lys@MNPs. Then Lys@MNPs and lung cancer A549 cells were co-cultured to study the effect of Lys@MNPs on cell viability and apoptosis. The pathway of Lys@MNPs entering A549 cells was detected by TEM and cell imaging by 1.5 T MRI. Results: Lys@MNPs were 10.2 nm in grain diameter, characterized by small size, positive charge, and superparamagnetism. Under low-dose concentration of Lys@MNPs (< $40{\mu}g/mL$), the survival rate of A549 cells was decreased but remained higher than 95% while under high-dose concentration ($100{\mu}g/mL$), the survival ratewas still higher than 80%, which suggested Lys@MNPs had limited influence on the viability of A549 cells, with good biocompatibility and and no induction of apoptosis. Moreover, high affinity for cytomembranes, was demonstrated presenting good imaging effects. Conclusion: Lys@MNPs can be regarded as a good MRI negative contrast agents, with promising prospects in biomedicine.
Background: To explore the relationship between polymorphisms of interleukin17 (IL-17) gene(A-832G 7488A/G) and the susceptibility to silicosis, a risk factor for lung cancer. Materials and Methods: A total of 113 silicosis patients and 116 workers without silicosis were enrolled in the case-control study. IL-17A A-832G and IL-17F 7488A/G polymorphisms were evaluated by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Results: The frequencies of AA,GG and AG of IL-17A A-832G locus in the case and control groups were 46.9%, 8.0%, 45.1%, and 49.2%, 7.6%, 43.2%, respectively, with no significant differences (p>0.05).The GG genotype in the IL-17F (7488A/G) locus was not found. The frequencies of AA and GA of IL-17F 7488A/G locus in the case and control groups were 84.1%, 15.9% and 66.4%, 33.6%, respectively (p<0.05). Analysis of combined effects showed that the individuals with GG+AG genotype of IL-17A and GG+GA genotype of IL-17F are protected against silicosis (OR=0.469). Conclusions: IL-17F 7488A/G is associated with susceptibility to silicosis, and G allele may have a protective effect. No relationship was found between IL-17A gene polymorphisms at A-832G and silicosis.
Aim: Recent research suggests that nucleophosmin (NPM) may be a prognostic marker in colorectal carcinomas (CRC). We here tested its use to predict the survival of CRC patients. Methods: We investigated NPM expression by immunohistochemistry in histologically normal to malignant colorectal tissues and evaluated its association with clinicopathological variables. Overall and disease-free survival after tumor removal were calculated by the Kaplan-Meier method, and differences in survival curves were analyzed by the log-rank test. The Cox proportional hazards model was used for multivariate analysis of prognostic factors. Results: NPM expression was found significantly upregulated in CRC compared to adjacent colorectal tissue, villous adenoma, tubular adenoma and normal colorectal mucosa (p<0.05 for all). NPM expression was statistically linked to cancer embolus, lymph node metastasis, differentiation grade, and recurrence of CRC. Overall and disease-free survival of NPM-negative CRC patients tended to be better than those for patients with NPM-positive lesions (log-rank statistic, p<0.05 for all). Multivariate analysis indicated NPM expression as an independent prognostic indicator for CRC patients (p<0.05 ). Conclusion: Our results suggest that NPM expression can predict the survival of CRC patients. Prognosis of CRC is determined by not only many known prognostic factors but also by NPM expression.
The production of recombinant antibodies has been generally recognized as time-consuming and labor-intensive. The aim of our study is to construct mammalian expression vectors containing the cDNA encoding the human constant regions and murine variable regions to massively and cost-effectively produce full-length chimeric antibodies. Unique restriction sites flanking the Ig variable region were designed to allow for the replacement of variable regions generated by PCR. Western blot analysis of the chimeric antibodies revealed that the expressed products were of the predicted size, structure and specificity. The usefulness of the vectors was confirmed by construction of human-mouse chimeric antibody-HCAb which secretes murine antibody against the human colorectal cancer. Selected in medium containing gradually increasing methotrexate (MTX), clones with increased expression of the product gene can be efficiently generated. The secretion of recombinant chimeric antibody-HCAb yielded $30\;pg\;cell^{-1}\;day^{-1}$ at $10^{-6}\;M$ MTX. With this high-level expression from pools, the convenient and rapid production of over 100 milligram amounts per liter of recombinant antibodies may be achieved, which indicates the significant roles of pYR-GCEVH and pYR-GCEVL in the production of chimeric antibodies.
Background: We aimed to discover potential gene biomarkers for gastric cancer (GC) diagnosis. Materials and Methods: Genechips of 10 GC tissues and 10 gastric mucosa (GM, para-carcinoma tissue, normal control) tissues were generated using an exon array of Affymetrix containing 30,000 genes. The differentially expressed genes (DEGs) between GC tissues and normal control were identified by the Limma package and analyzed by hierarchical clustering analysis. Gene ontology (GO) and pathway enrichment analyses were performed for investigating the functions of DEGs. Receiver operating characteristics (ROC) analysis was performed to measure the effects of biomarker candidates for diagnosis of GC. Results: Totals of 896 up-regulated and 60 down-regulated DEGs were identified to be differentially expressed between GC samples and normal control. Hierarchical clustering analysis showed that DEGs were highly differentially expressed and most DEGs were up-regulated. The most significantly enriched GO-BP term was revealed to be mitotic cell cycle and the most significantly enriched pathway was cell cycle. The intersection analysis showed that most significant DEGs were cyclin B1 (CCNB1) and cyclin B2 (CCNB2). The sensitivities and specificities of CCNB1 and CCNB2 were both high (p<0.0001). Areas under the ROC curve for CCNB1 and CCNB2 were both greater than 0.9 (p<0.0001). Conclusions: CCNB1 and CCNB2, which were involved in cell cycle, played significant roles in the progression and development of GC and these genes may be potential biomarkers for diagnosis and prognosis of GC.
Background: Multiple primary malignancies (MPM) have become increasingly prevalent worldwide. This investigation was aimed at establishing the clinicopathological characteristics of MPM patients and evaluating the impact of the living environment on MPM in the Taiwanese population. Materials and Methods: From January 2009 to December 2013, a total of 8,268 cancer patients were identified in our institutional center. Of these, 125 were diagnosed as MPM and thus enrolled. Data for clinicopathological features and treatment approaches for these MPM patients living in urban or suburb zone were obtained. Findings for the air pollution status in Taiwan were also collected. Results: The most common cancer match of MPM was esophageal cancer with hypopharyngeal cancer (12.8%), followed by colorectal cancer with gastric cancer (6.4%) and colorectal cancer with breast cancer (5.6%). The air quality was significantly worse in the urban than in the suburban zone and there was a remarkably higher portion of MPM patients in the urban zone suffering from grade III and IV post-chemotherapeutic neutropenia (30.8% vs 15.1%, P=0.036). Conclusions: The tumor frequency and site distribution should be taken into the clinical evaluation because there is a relatively high risk of developing MPM. This study also highlighted the potential influence of environmental factors on post-chemotherapeutic neutropenia for patients with MPM.
Aims: Pleiotrophin (PTN), an angiogenic factor, is associated with various types of cancer, including lung cancer. Our aim was to investigate the possibility of using serum PTN as an early indicator regarding disease diagnosis, classification and prognosis, for patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Methods: Significant differences among PTN levels in patients with small cell lung cancer (SCLC, n=40), NSCLC (n=136), and control subjects with benign pulmonary lesions (n=21), as well as patients with different pathological subtypes of NSCLC were observed. Results: A serum level of PTN of 300.1 ng/ml, was determined as the cutoff value differentiating lung cancer patients and controls, with a sensitivity and specificity of 78.4% and 66.7%, respectively. Negative correlations between serum PTN level and pathological differentiation level, stage, and survival time were observed in our cohort of patients with NSCLC. In addition, specific elevation of PTN levels in pulmonary tissue in and around NSCLC lesions in comparison to normal pulmonary tissue obtained from the same subjects was also observed (n=2). Conclusion: This study suggests that the serum PTN level of patients with NSCLC could be an early indicator for diagnosis and prognosis. This conclusion should be further assessed in randomized clinical trials.
Chemoresistance is the most common cause of chemotherapy failure during breast cancer (BCA) treatment. It is generally known that the mechanisms of chemoresistance in tumors involve multiple genes and multiple signaling pathways,; if appropriate drugs are used to regulate the mechanisms at the gene level, it should be possible to effectively reverse chemoresistance in BCA cells. It has been confirmed that chemoresistance in BCA cells could be reversed by ginsenoside Rh2 (G-Rh2). Preliminary studies of our group identified some drugresistance specific miRNA. Accordingly, we proposed that G-Rh2 could mediate drug-resistance specific miRNA and corresponding target genes through the gene regulatory network; this could cut off the drug-resistance process in tumors and enhance treatment effects. G-Rh2 and breast cancer cells were used in our study. Through pharmaceutical interventions, we could explore how G-Rh2 could inhibit chemotherapy resistance in BCA, and analyze its impact on related miRNA and target genes. Finally, we will reveal the anti-resistance molecular mechanisms of G-Rh2 from a different angle in miRNA-mediated chemoresistance signals among cells.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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