The purpose of this study was the development of promoter for the lacZ' gene. Two heterologous promoter I and II of lacZ' gene were isolated from chromosomal DNA Bam HI fragment of yeast. The size of the promoter I was estimated to be 2.5 kb and ${\beta}-galactosidase$ activity was 124.6 U/mg protein, and the size of the promoter II was 4.0 kb and its ${\beta}-galactosidase$ activity was 168.8 U/mg protein, respectively. The stability of the recombinant YEp plasmid in the transformant was from 52.7 to 67.4% at minimal medium. YIp plasmid was constructed from YEp plasmid, and expressed both in E. coli and yeast. The promoter I aid II iso-lated from yeast chromosomal DNA can be used for promoter of plasmid YEp and YIp.
$\alpha$-Amylase gene of B. amyloliquefaciens was cloned to E. coli-yeast shuttle vector YEp-13 and expressed in E. coli. Chromosomal DNA of B. amyloliquefaciens was partially digested with Sau3Al and YEp13 plasmid was cleaved with BamH1. The hybrid plasmid, pHA28, was constructed by shotgun method and transformed to E. coli C600 and HB101. The amount of $\alpha$-amylase produced by transformants of E. coli was about 20% to 30% of that produced by B. amyloli-quefaciens. About 65% of $\alpha$-amylase produced by transformant was secreted into periplasm and the others were located in cytoplasm. $\alpha$-Amylase production was maximal when transformants were cultivated for 15hr to 20hr. As the result of agarose gel electrophoresis, pHA28 plasmid was found to be various in its size. This result suggested that pHA28 plasmid was segregated.
$\alpha$-Amylase gene of Bacillus amyloliquetaciens was cloned on plasmid YEp13, S. cerevisiae-E. coli shuttle vector. Hybrid plasmid pTG17, carrying $\alpha$-amylase gene of B. amyloliquefaciens, was transformed to E. coli and the expression of it in yeast was investigated. This plasmid was unstable in E. coli and produced two minor plasmids, pTG17-1 and PTG17-2, which resulted from the segregation of it. Transformant of S. cerevisiae MC16 with pTG17-1 plasmid was not appeared on SD medium because of the Leu2 gene defection. S. cerevisiae could be transformed by the hybrid plasmid, and $\alpha$-amylase activity of the yeast transformant was detected by somogyi-Nelson method and agar diffusion method.
In order to obtain the optimum conditions for intact yeast cell transformation in the various yeast host-vector systems, 3 yeast plasmid vectors, YRp7, YEpl3 and YIp5 were introduced into 5 yeast hosts, Saccaromyces cervisiae Dl3-1A, DKD-5D, DBY-746, MC-16 and S2022D with various transformation conditions, and plasmid stabilities in all the transformants were also observed. The highest transformation frequencies in all the host-vector system were obtained in the 16 hour Cultured cell (5.4 $\times$ 10$^6$ - 2.4 $\times$ 10$^8$cells/$m{\ell}$) treated with 0.1-0.2 M lithium chloride in 0.1 M tris-HCl (pH 7.6), 35% polyethylene glycol 4000, and heat-shocked at 42$^{\circ}C$ for 5 minutes after 60 minutes of induction. The intact cell transformation got more transformation frequency in DKD-5D (YRp7) and DBY-746 (YEpl3) than protoplast transformation, but reverse tendency was observed in DKD-5D (YEp13) and Dl3-lA (YRp7). The transformants, D13-1A (YRp7) and DKD-5D (YRp7) were very unstable in selective medium, with 80 to 85% of the transformants losing the plasmid after 70 generations, but the transformants, DKD-5D (YEpl3) and DBY-746 (YEpl3) were quite stable, with 35% of the transformants losing the plasmid.
The yeast S. cerevisiae DBY747 was transformed with E. C - S. C shuttle vector YIp5, YEp13 and YRp7 by the method of spheroplast. The transformation frequency of YEp13 and YRp7 in S. cerevisiae DBY747 was $1.2{\times}10^3$ and $1.0{\times}10^2$ per $10{\mu}g$ of DNA, respectively. The transformants with YIp5 plasmid incapable of autonomous replication in S. cerevisiae were not detected in the condition of this experiment, but YIpS plasmid expressed the gene carried on it when cotransformed with a helper plasmid such as YEp13 or YRp7 : autonomously replicating plasmid. When plasmids were used in covalently closed circular form, cotransformation frequency of Ylp5-YEpl3 and Ylp5-YRp7 was 210 and 95 per $10{\mu}g$ of DNA, respectively. In cotransformation of linear plasmids, transformation frequency of the same cohesive ends was similar to that of noncomplementary cohesive ends. Transformants by the cotransformation with circular plasmids have been shown much higher frequency than with linear plasmids in S. cerevisiae DBY 747. The mitotic segregation stability test suggested that the cotransformant of YIpS-YEp13 was more stable than that of YIpS-YRp7.
Plasmids, YEp13 and pMA56, were encapsulated Into liposomes by two different procedures during which the plasmid DNAs were exposed ether to 6$0^{\circ}C$ for 1.5 hr or to sonication for 2-5 min at 4$^{\circ}C$. The encapsulated plasmids were then reextracted and their physical conformations and transformation abilities were examined. It was confirmed from the results that both plasmid DNAs were remained stable throughout the procedures of encapsulation into 1iposomes.
A new computer algorithm is described to order the restriction fragments of plasmid DNA which has been cleaved with several restriction endonucleases in single or double digestions rapidly with realistic error rates. The permutation and high weight on small fragments methods construct all logical circular map solutions. The program is written in Apple BASIC and run on an Apple II plus microcomputer with 64K memory. Several examples are presented which indicate the high efficiency of the profram in construction possible restriction map for YEp24.
The transformation of Saccharomyces cerevisiae with YIp26, YRp7 and YEp13 was investigated. Transformation frequences of YIp5, YIp26, YRp7 and YEp13 in Escherichia coli HB101 was $5.1{\times}10^{-4}$, $1.5 {\times}10^{-3}$, $1.3{\times}10^{-3}$, $3{\times}10^{-3}$, respectively. When plasmids were used in covalently closed circular form, transformation frequency of YEp13 was $1.2{\times}10^{-4}$ in S. cerevisiae DBY747 and $3.3{\times}10^{-4}$ in S. cerevisiae MC16 and that of YRp7, YIp26 was $3{\times}10^{-6}$, below $6{\times}10^{-8}$ respectively in S. cerevisiae DBY747 by the method of Ito. Cotransformation of YIp26 and YEp13 in linear form increased the frequency of transformation with efficiences 270-fold higher than transformation of YIp26 only in S. cerevisiae DBY747. In cotransformation of YIp5+YEp13 and YIp26+YRp7 with S. cerevisiae DBY747 by Beggs' method. Expression frequency of YIp5+YEp13 and YIp26+YRp7 was $4{\times}10^{-6}$, $1.5{\times}10^{-6}$, respectively. The recombinant plasmid of cotransformant was thought that YIp26 and YEp13, YIp5 and YEp13, and YIp26 and YRp 7 were ligated in vivo in S. cerevisiae DBY747.
The effect of stb locus of E. COLI IncFII plasmid NR1 on the stability of chimeric plasmids was investigated. First, we have isolated the stability locus (stb) from E. coli NR1 plasmid and then inserted into the three different vectors, pUC8, YRp17 and YEp24. By examining their stability in E. coli and yeast, we showed that the recombinant plasmids containing stb locus were resonably stable. Also, by comparing the amounts of the rDNA fragments per haploid genome with those of the plasmid fragments, we showed they copy number of recombinant plasmids was not increased. Consequently, the stb locus of E. coli IncFII plasmid NR1 stabilized the chimeric plasmids but did not affect the replication or copy number of plasmids.
The effects of genetic and environmental factors on productivity of a cloned protein were studied in recombinant Saccharomyces cerevisiae. Plasmid stability and copy level were very high for a $REP^+$ system(at ca. 10 generations, stability: 65-90%, plasmid copy number per cell: 40-200), whereas these were very low for a yep- system(at ca. 10 generations, stability: 30%, plasmid copy number per cell 20). In plasmids containing the $2{\mu}m$ circle genome, a $[cir^o]$ strain was a preferred host cell since the plasmid stability and the copy number in a $[cir^o]$ strain were higher than in a $[cir^+]$strain. Cloned gene expression was dependent on plasmid copy number and stability. The inducer (galactose) level played a very important role in cloned lacZ gene expression, showing that a galactose concentration of 0.8% was sufficient for induction of gene expression. Induction rate was very fast in the case of plasmids exhibiting high stability and copy number by a factor of 4 to 25. The time to reach the peak value of gene expression was longer when galactose was added at the start of fermentation (ca. 26 hours) than at the mid-exponential phase (ca. 6 hours). Glucose repression was reduced by a factor of 2 to 5 as the relative inducer level increased.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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