• 한국미생물·생명공학회지
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• 제32권3호
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• pp.256-264
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• 2004

본 연구는 벼의 세균병 중 치명적인 흰잎마름병을 유발하는 Xanthomonas oryzae pv. oryzae를 검출할 수 있는 프라이머를 개발하기 위해 실시하였다. X. o. pv. oryzae str. KACC10331의 hpaA유전자 염기서열로부터 흰잎마름병만을 특이적으로 검출할 수 있는 프라이머를 제작하여 중합효소연쇄반응에 사용하였다. 개발된 특이 프라이머는 X. o. pv. oryzae str. KACC10331과 X. campestris pv. vesicatoria, X. campestris pv. campestris, X. axonopodis pv. citri 그리고 X. axonopodis pv. glycines의 phaA유전자 염기서열의 상동성을 비교하여, 그 중 X. o. pv. oryzae만이 가지는 특이적인 부분을 바탕으로 각각 20-mer인 XOF와 XOR를 제작하였다. 제작된 프라이머를 이용하여 중합효소 연쇄반응을 실시한 결과 반응 후 생성된 단편의 크기는 534-bp였다. 반응 후 생성된 단편은 Southern hybridization을 통하여 Xanthomonas 균주들의 hpaA유전자 존재 여부 및 그 상동성을 비교분석하기 위해 사용하였다. 또한 제작된 프라이머를 이용하여 흰잎마름병에 감염된 벼 잎에서의 검출 여부를 확인하였고 X. o. pv. oryzae의 순수 균주 배양액을 중합효소연쇄반응에 이용하여 검출한계를 검정하였다. 본 연구에서 제작된 프라이머를 사용한 중합효소연쇄 반응 방법은 X. o. pv. oryzae의 검출 뿐만 아니라 흰잎마름병의 발생 예찰에 매우 유용할 것으로 판단 되었다.

• 한국식물병리학회지
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• 제14권2호
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• pp.125-129
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• 1998

Phytopathogenic bacteria causing soft-rot many vegetables; extracellular enzymes produced by them, pectate lyase(Pel) is important pathogenicity facotrs which cause tissue maceration and cell death. Ten of seventeen plant pathogenic bacteria showed weak Pel activity, four of them showed low Pel activity and Erwinia acrotovora subsp. carotovora, E. chrysanthemi, Pseudomonas marginalis and Xanthomonas campestris pv. campestris showed high Pel activity in the polygalacturonate yeast extract agar (PAY) plate. High Pel activity of the four bacteria species produced the highest Pel activity when pectin or polygalacturonic acid (PGA) was added to minimal salts (MS) medium. Pel activity of the four bacterial species was the highest at 2$0^{\circ}C$ among different temperature conditions. The rate and amount of maceration of potato tuber tissue were highest at 2$0^{\circ}C$ in E. carotovora subsp. carotovora, E. chrysanthemi and P. marginalis, while those were the highest at $25^{\circ}C$ in X. campestris pv. campetris.

• 한국식물병리학회지
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• 제12권2호
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• pp.156-161
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• 1996

세계적으로 구리약제에 대해서 저항성을 나타내는 균주들이 발견되있으며, 이들은 구리약제의 방제효과를 감소시켰다. 국내에서도, 구리 저항성 균주 Xanthomonas campestris. pv. vesicatoria HN94-2, -3, -4, -5, -6 들이 천안지역의 고추재배지에서 처음으로 분리되었으며, 이들 균주들의 nutrient agar에서 황산구리(CuSo\ulcorner)에 대한 최소억제농도(minimum inhibitory concentration, MIC)는 1.4~1.6 mM이었다. 이들은 모두 황산아연(ZnSO\ulcorner)에 대해서는 감수성을 보여, 구리저항성 균주에 대한 방제약제로서 아연 함유 약제를 사용할 수 있을 것이다. 분리된 균주중 HN94-2와 HN94-6을 이용하여 접합(conjugation)을 통해 구리저항성의 전파를 실험한 결과, 이들 두 균주 모두 구리감수성 균주에게 4.3$\times$10\ulcorner에서 1.0$\times$10\ulcorner(transconjugant/donor)의 정도로 구리 저항성이 전이되었다. 이들 HN94-2와 HN94-6 균주의 구리정항성 유전자들은 약 200 kb 정도의 커다란 플라스미드(plasmid)에 존재하며, 이들은 각각 pXVK9402와 pXVK9406이라 명명되었다.

• 한국식물병리학회지
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• 제12권2호
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• pp.162-168
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• 1996

우리 나라의 주요 고추 재배지와 미국, 대만, 호주, 아르헨티나에서 수집된 44 개 고추 더뎅이병균(Xanthomonas campestris pv. vesicatoria)균주간의 유전적변이를 genomic DNA의 restriction fragment length polymorphism(RFLP)에 의해 분석하였다. Genomic DNA RFLP profiles을 cluster 분석하여 얻은 dendrogram에서 지리적 기원이 다른 44개 균주들은 11개 RFLP 그룹으로 분류되었다. 외국 균주들은 genomic DNA의 RFLP 분석에 의해 모두 각각 다른 RFLP 그룹으로 분류되었다. 외국 균주들 중에서 미국 균주는 우리 나라 일부 균주들과 밀접한 유전적 관련성을 가지고 함께 cluster를 이루었는데, 이것은 이 균주들이 동일한 고추 더뎅이병균의 조상 균주 집단에서 유래했으리라는 것을 시사해 준다. 우리 나라 균주들은 6개의 RFLP 그룹으로 분류되었다. 대부분의 우리 나라 균주들은 가까운 cluster를 이루며 미국 균주를 제외한 외국 균주들과 뚜렷하게 구분되었다. 그러나 우리 나라 균주들 중에서 마산에서 수집된 Ms93-1은 다른 우리 나라 균주들과 뚜렷하게 구분되었다. 유전적으로 격리된 균주의 출현은 우리 나라에서 지리적 기원이 다른 고추 더뎅이병균 균주 사이에 이미 발생한 다양한 유전적 분화의 결과라고 추론된다.

• 식물병연구
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• 제12권2호
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• pp.134-138
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• 2006

2003년부터 2004년 평창 지역의 브로콜리 포장에서 새로운 병해가 발견되었다. 유묘 감염이 되었을 때 떡잎의 주위로부터 검게 변색되기 시작하여 결국 떡잎이 떨어지고 유묘는 죽었다. 성체에서는 잎 가장자리로부터 엽맥을 타고 진전되어 V 자 또는 U 자형의 노란색 병반을 형성하였다. YDC 배지에서 병원세균을 순수 분리하였을 때 Xanthomonas 속 세균의 전형적인 특정인 노란색 색소를 띤 세균이 형성되었다. 분리된 세균을 $10^8 cfu/ml$로 현탁 한후 3 주 동안 자란 브로콜리, 양배추, 배추, 케일, 무에 가위 접종하여 병원성을 확인하였다. 지방산 조성 및 함량, 다양한 탄소원 이용정도 및 16S rDNA 염기서열를 이용하여 분리세균 SL4797 과 SL4800 을 대조균주 X. campestris pv. campestris NCPPB528 과 비교하였을 때 매우 유사하였다. 이 논문은 국내에서 브로콜리의 검은썩음병 최초 보고이다.

• 미생물학회지
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• 제28권1호
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• pp.71-75
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• 1990

한국 해안으로부터 우수 원유분해능 균주를 분리동정하여 그 특성을 관찰하였다. 이들 분리균주 중 우수 균주로는 Acinetobacter twoffii G1, Klebsiella pneumoniae L25, Pseudomonas maltophilia N246이 동정되었다. 이들 균주의 생장은 0.15%의 원유 농도와 3.5% sodium chloride에서 최대의 생장을 보여주었다. 이들 균주 중 X. campestris M12와 Xanthomonas sp. M28은 특별히 hexadecane과 octane을 그리고 P. maltophilia N246은 octane 을 탄소원으로 0.2-0.3%의 농도에서 최대로 분해하였다. K. pneumoniae L25에 의한 crude oil의 경Al적인 분해과정을 gas-liquid chromatography로 분석하였으며, 그 결과 긴 사슬의 alkane 보다 C14 이하의 짧은 사슬의 alkane을 보다 쉽게 이용하였으며 $30^{\circ}C$에서 8일간 배양시에 거의 모두 이용되었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권4호
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• pp.356-363
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• 2012

The aim of this study was to utilize rice bran, the main waste product of paddy processing, in xanthan gum production by Xanthomonas campestris fermentation. Deffated rice bran was enzymatically hydrolyzed using cellulase, gluco-amylase, alpha-amylase and xylanase at various pHs and temperatures within 0-12 h. The highest sugar content reached at $35^{\circ}C$, pH 5.5 in 6 h with 41.66%. The enzymatic hydrolysate was used as the carbon source for xanthan gum production by X. campestris NRRL B-1459 and X. campestris pv. campestris. The highest productivities obtained were 21.87 and 17.10 g/L, respectively. Viscosity measurement for the obtained xanthan gums and commercial gum was carried out in gum solutions at various pHs and temperatures. The highest viscosity was reached with 1% gum solutions at $20^{\circ}C$ and pH 5.5 for all gums with viscosity values of 470, 131 and 138 mPa sec, respectively. This work has provided relevant scientific information about the use of rice bran, an abundant agroindustrial residue, to produce xanthan gum.

• 한국식물병리학회지
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• 제10권4호
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• pp.305-313
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• 1994

Typically susceptible lesions were developed on pepper (cv. Hanbyul) leaves inoculated with the compatible strains Ds 1 of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. The lesions appeared first water-soaked and then turned yellow with a chlorotic area. In contrast, the leaves inoculated with the incompatible strain 81-23 initially turned yellow and then developed local necrosis. Multiplication of x. c. pv. vesicatoria in pepper leaves also were distinctly different between the two strains. The strain Ds 1 multiplied more greatly than did the strain 81-23 in the infected leaves. X. c. pv. vesicatoria infection of pepper leaves induced the synthesis of soluble proteins, especially more greatly in the compatible than in the incompatible interactions. Some pathogenesis-related (PR) proteins were detected in the intercellular washing fluid (IWF) and extracts of the infected pepper leaves. In particular, the 32 kDa protein on SDS-PAGE gels appeared intensely in the incompatible interaction. In contrast, some proteins with moluecular masses of 65, 71, and 75 kDa disappeared in the infected pepper leaves. Isoelectric focusing could identify the pIs of soluble proteins in infected pepper leaves. The accumulation of the IWF from infected leaves was more conspicuous in the incompatible than the compatible interaction. These results suggest that some extremely acidic and basic proteins were induced and accumulated in the intercellular spaces of infected pepper leaves.

• The Plant Pathology Journal
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• 제36권5호
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• pp.418-427
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• 2020

Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), the pathogen of black rot which is the most destructive disease of Brassica vegetables throughout the world. Here, we reported two novel sequence-characterized amplified region (SCAR) markers (i.e., XccR6-60 and XccR6-67) for the detection of Xcc race 6 via re-alignment of the complete genome sequences of Xcc races/strains/pathovars. The specificity of SCAR primer sets was verified by mean of PCR amplification using the genomic DNA template of Xcc races/strains/pathovars and two other plant infecting bacterial strains. The PCR result revealed that the XccR6-60 and XccR6-67 primer sets amplified 692-bp and 917-bp DNA fragments, respectively, specifically from race 6, while no visible amplification was detected in other samples. In addition, the SCAR primers were highly sensitive and can detect from a very low concentration of genomic DNA of Xcc race 6. However, the complete genome sequence of Xcc race 6 is not yet publicly available. Therefore, the cloning and sequencing of XccR6-60 and XccR6-67 fragments from race 6 provide more evidence of the specificity of these markers. These results indicated that the newly developed SCAR markers can successfully, effectively and rapidly detect Xcc race 6 from other Xcc races/strains/pathovars as well as other plant pathogenic bacteria. This is the first report for race-specific molecular markers for Xcc race 6.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권5호
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• pp.785-793
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• 2019

Black rot caused by Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) is the most damaging disease in Brassica crops around the world. In this study, we developed a molecular marker specific to Xcc race 5. To do this, the available whole genome sequences of Xcc races/strains and Xc subspecies were aligned and identified a highly variable genomic region (XccR5-89.2). Subsequently, a primer set covering the 'XccR5-89.2' region was designed and tested against the genomic DNA of Xcc races/strains, Xc subspecies and other plant-infecting bacterial strains (Pseudomonas syringae pv. maculicola and Erwinia carotovora subsp. carotovora). The results showed that the 'XccR5-89.2' primer pair amplified a 2,172-bp fragment specific to Xcc race 5. Moreover, they also amplified a 1,515-bp fragment for Xcc race 1 and an over 3,000-bp fragment for Xcc race 3. However, they did not amplify any fragments from the remaining Xcc races/strains, subspecies or other bacterial strains. The 'XccR5-89.2' primer pair was further PCR amplified from race-unknown Xcc strains and ICMP8 was identified as race 5 among nine race-unknown Xcc strains. Further cloning and sequencing of the bands amplified from race 5 and ICMP8 with 'XccR5-89.2' primers revealed both carrying identical sequences. The results showed that the 'XccR5-89.2' marker can effectively and proficiently detect, and identify Xcc race 5 from Xcc races/strains, subspecies and other plant-infecting bacteria. To our knowledge, this is the first report for an Xcc race 5-specific molecular marker.