Gliomas are the most common type of primary brain tumors. The XRCC1 Arg194Trp variant affects the proliferating cell nuclear antigen(PCNA) binding region, which suggests that this mutation may contribute to gliomagenesis and a number of articles have examine the association between XRCC1 Arg194Trp and the susceptibility to glioma. However, the results were conflicting. Test of heterogeneity, sensitivity analysis, meta-analysis, and assessment of publication bias were all performed in our present meta-analysis, covering a total of 5,407 patients and 7,715 healthy persons. In the overall analysis the XRCC1 Arg194Trp polymorphism showed a significant association with glioma susceptibility in a recessive mode l(for TrpTrp vs ArgArg+ArgTrp: OR=1.918, 95%CI=1.575-2.336, $I^2$=2.3%). In addition, analysis of subgroups presented an increased risk in Asians and populations-based on hospitals. The results suggested that the XRCC1 Arg194Trp polymorphism is a genetic risk factor for glioma, especially in Asian population. To further evaluate gene-gene and gene-environment interactions on XRCC1 polymorphisms and glioma risk, thousands of subjects and tissue-specific biochemical characterizations are required.
Background: Non-synonymous polymorphisms in XRCC1 hase been shown to reduce effectiveness of DNA repair and be associated with risk of certain cancers. In this study we aimed to clarify any association between XRCC1 Arg399Gln and colorectal cancer (CRC) risk by performing a meta-analysis of published case-control studies. Materials and Methods: PubMed and Google Scholar were searched to explore the association between XRCC1 and CRC. Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated to estimate the association strength. Publication bias was assessed by Egger's and Begg's tests. Results: Up to January 2015, 35 case control studies involving 9,114 CRC cases and 13,948 controls were included in the present meta-analysis. The results showed that the Arg399Gln polymorphism only under an allele genetic model was associated with CRC risk (A vs. G: OR 0.128, 95% CI 0.119-0.138, p<0.001). Also, this meta-analysis suggested that the XRCC1 Arg399Gln polymorphism might associated with susceptibility to CRC in Asians (A vs G: OR 0.124, 95% CI 0.112-0.138, p<0.001) and Caucasian (A vs G: OR 0.132, 95% CI 0.119-0.146, p<0.001) only under an allele genetic model. Conclusions: This meta-analysis confirms the association between XRCC1 Arg399Gln polymorphism and CRC risk and suggests that the heterogeneity is not strongly modified by ethnicity and deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium.
Objective: Gastric cancer remains a major health problem in China. We hypothesized that XRCC1 Arg194Trp and ADPRT Val762Ala may be associated with risk. Methods: We designed a multicenter 1:1 matched case-control study of 307 pairs of gastric cancers and controls between October 2010 and August 2011. XRCC1 Arg194Trp and ADPRT Val762Ala were sequenced, and demographic data as well as lifestyle factors were collected using a self-designed questionnaire. Results: Individuals carrying XRCC1 Trp/Trp or Arg/Trp variant genotype had a significantly increased risk of gastric cancer (OR, 1.718; 95% CI, 1.190-2.479), while the OR for ADPRT Val762Ala variant genotype (Ala/Ala or Val/Ala) was 1.175 (95% CI, 0.796-1.737). No gene-gene or gene-environment interactions were found. In addition, family history of cancer and drinkers proportion were higher among cases than among controls (P<0.05). Conclusions: XRCC1 194 Arg/Trp or Trp/Trp genotype, family history of cancer, and drinking are suspected risk factors of gastric cancer from our study. Our findings may offer insight into further similar large gene-environment and gene-gene studies in this region.
Background: Gliomas are the most common type of primary brain tumor in adults, and the X-ray repair complementing group 1 gene (XRCC1) is an important candidate gene influencing its risk. The objective of this study was to detect the influence of XRCC1 genetic polymorphisms on glioma risk. Materials and Methods: A total of 629 glioma patients and 641 cancer-free subjects were enrolled in this case-control study. The genotypes of the c.1471G>A genetic polymorphism were determined by created restriction site-polymerase chain reaction (CRS-PCR) and DNA sequencing methods. The influence of the XRCC1 genetic polymorphism on glioma risk was evaluated by association analysis. Results: Our data indicated that the alleles/genotype of this genetic variant was statistically associated with glioma risk. The AA genotype was statistically associated with the increased risk of glioma compared to the GG wild genotype (odds ratios (OR) = 1.89, 95% CI 1.25-2.87, P = 0.003). The allele-A may contribute to increased the susceptibility to glioma (OR = 1.23, 95% CI 1.04-1.46, P = 0.017). Conclusions: These preliminary findings indicate that the c.1471G>A genetic polymorphism of XRCC1 has the potential to influence glioma susceptibility, and might be used as molecular marker for assessing glioma risk.
Background: Published studies have reported relationships between X-ray repair cross-complementing group 1 (XRCC1) Arg399Gln polymorphism and lung cancer risk in Chinese population. However, the epidemiological results remained controversial. The objective of this study was to clarify the association of XRCC1 Arg399Gln polymorphism with lung cancer risk in the Chinese population. Materials and Methods: Systematic searches were performed through the database of Medline/Pubmed, Web of Science, Embase, CNKI and WanFang Medical Online. Odds ratios (ORs) with 95% confidence interval (95%CI) were calculated to estimate the strength of the association. Results: Overall, we observed an increased lung cancer risk among subjects carrying XRCC1 codon 399 Gln/Gln genotype (OR=1.36, 95%CI: 1.09-1.71) in the Chinese population on the basis of 19 studies with 5,416 cases and 5,782 controls. We did not observe any association between XRCC1 codon 399 Arg/Gln and Arg/Gln+Gln/Gln polymorphisms and lung cancer risk (OR=1.00, 95%CI: 0.92-1.08 and OR=1.05, 95%CI: 0.97-1.13, respectively). Limiting the analysis to studies with controls in agreement with Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), we observed an increased lung cancer risk among subjects carrying XRCC1 codon 399 Gln/Gln genotype (OR=1.18, 95%CI: 1.01-1.38). When stratified by source of control, we observed an increased lung cancer risk among subjects carrying XRCC1 codon 399 Arg/Gln+Gln/Gln genotype on the basis of hospitalized patient-based controls (OR=1.21, 95%CI: 1.04-1.42) and among subjects carrying XRCC1 codon 399 Gln/Gln genotype on the basis of healthy subject-based controls (OR=1.22, 95%CI: 1.04-1.43). Conclusions: Our findings indicated that certain XRCC1 Arg399Gln variants might affect the susceptibility of lung cancer in Chinese population. Larger sample size studies are required to confirm our findings.
Liu, Hai-Bo;Peng, Yu-Ping;Dou, Chang-Wu;Su, Xiu-Lan;Gao, Nai-Kang;Tian, Fu-Ming;Bai, Jie
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.13
no.10
/
pp.4905-4908
/
2012
Aim: Glioma cancer is the most common type of adult brain tumor. Recent genome-wide association studies (GWAS) have identified various new susceptibility regions and here we conducted an extensive analysis of associations between 12 single nucleotide polymorphisms (SNPs) and glioma risk. Methods: A total of 197 glioma cases and 197 health controls were selected, and 9 SNPs in 8 genes were analyzed using the Sequenom MassARRAY platform and Sequenom Assay Design 3.1 software. Results: We found the MAF among selected controls were consistent with the MAF from the NCBI SNP database. Among 9 SNPs in 8 genes, we identified four significant SNP genotypes associated with the risk of glioma, C/C genotype at rs730437 and T/T genotype at rs1468727 in ERGF were protective against glioma, whereas the T/T genotype at rs1799782 in XRCC1 and C/C genotype at rs861539 in XRCC3 conferred elevated risk. Conclusion: Our comprehensive analysis of nine SNPs in eight genes suggests that the rs730437 and rs1468727 in ERGF, rs1799782 in XRCC1 gene, and rs861539 in XRCC3 gene are associated with glioma risk. These findings indicate that genetic variants of various genes play a complex role in the development of glioma.
Kang, Shan;Sun, Hai-Yan;Zhou, Rong-Miao;Wang, Na;Hu, Pei;Li, Yan
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.14
no.2
/
pp.941-946
/
2013
Objective: The nucleotide excision repair (NER) and base excision repair (BER) pathways, two DNA repair pathways, are related to platinum resistance in cancer treatment. In this paper, we studied the association between single nucleotide polymorphisms (SNPs) of involved genes and response to platinum-based chemotherapy in epithelial ovarian cancer. Method: Eight SNPs in XRCC1 (BER), XPC and XPD (NER) were assessed in 213 patients with epithelial ovarian cancer using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and primer-introduced restriction analysis-polymerase chain reaction (PIRA-PCR) techniques. Results: The median progression-free survival (PFS) of patients carrying the Lys/Lys and Lys/Gln+Gln/Gln genotype of the XPC Lys/Gln polymorphism were 25 and 12 months, respectively (P=0.039); and the mean overall survival (OS) of patients was 31.1 and 27.8 months, respectively (P=0.048). Cox's multivariate analysis suggested that patients with epithelial ovarian cancer with the Gln allele had an increased risk of death (HR=1.75; 95% CI=1.06-2.91) compared to those with the Lys/Lys genotype. There are no associations between the XPC PAT+/-, XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, Arg399Gln, and XPD Asp312Asn, Lys751Gln polymorphisms and the survival of patients with epithelial ovarian cancer when treated with platinum-based chemotherapy. Conclusion: Our results indicated that the XPC Lys939Gln polymorphism may correlate with clinical outcome of patients with epithelial ovarian cancer when treated with platinum-based chemotherapy in Northern China.
Purpose: It is well known from clinical experience that acute complications of chemoradiation therapy vary from patients to patients. However, there are no known factors to predict these acute complications before treatment starts. The human XRCC1 gene is known as a DNA base excision repair gene. We investigated the possibilities of XRCC1 gene polymorphisms as a predictor for the acute complications of chemoradiation therapy in colorectal cancer patients. Materials and Methods: From July 1997 to June 2003, 86 colorectal cancer patients (71 rectal cancer, 13 sigmoid colon cancer and 2 colon cancer patients) were treated with chemoradiation therapy at the Department of Radiation Oncology, Inha University Hospital. Twenty-two patients were in stage B, 50 were in stage C, 8 were in stage D and 6 patients were unresectable cases. External radiation therapy was delivered with 10MV X-ray at a 1.8 Gy fraction per day for a total dose of radiation of $30.6{\sim}59.4 Gy$ (median: 54 Gy). All the patients received 5-FU based chemotherapy regimen. We analyzed the acute complications of upper and lower gastrointestinal tract based on the RTOG complication scale. The initial and lowest WBC and platelet count were recorded during both the RT period and the whole treatment period. Allelic variants of the XRCC1 gene at codons 194, 280 and 399 were analyzed in the lymphocyte DNA by performing PCR-RFLP. Statistical analyses were carried out with the SAS (version 6.12) statistical package. Results: When all the variables were assessed on the multivariate analysis, recurrent disease revealed the factors that significantly correlated with upper gastrointestinal acute complications. Arg399Gln polymorph isms of the XRCC1 gene, the radiation dose and the frequencies of chemotherapy during radiation therapy were significantly correlated with lower gastrointestinal complications. Arg399Gln polymorph isms also affected the decrease of the WBC and platelet count during radiation therapy. Conclusion: Although the present sample size was too small for fully evaluating this hypothesis, this study suggests that Arg399Gln polymorph isms of the XRCC1 genes may be used as one of the predictors for acute complications of chemoradiation therapy in colorectal cancer patients.
The relationship between the X-ray repair cross-complementing group 3 (XRCC3) Thr241Met polymorphism and gliomas remains inclusive or controversial. For better understanding of the effect of XRCC3 Thr241Met polymorphism on glioma risk, a meta-analysis was performed. All eligible studies were identified through a search of PubMed, Elsevier Science Direct, Excerpta Medica Database (Embase) and Chinese Biomedical Literature Database (CBM) before May 2013. The association between the XRCC3 Thr241Met polymorphism and gliomas risk was conducted by odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (95% CIs). A total of nine case-control studies including 3,533 cases and 4,696 controls were eventually collected. Overall, we found that XRCC3 Thr241Met polymorphism was significantly associated with the risk of gliomas (T vs. C: OR=1.10, 95%CI=1.01-1.20, P=0.034; TT vs. CC: OR=1.30, 95%CI=1.03-1.65, P=0.027; TT vs. TC/CC: OR=1.29, 95%CI=1.01-1.64, P=0.039). In the subgroup analysis based on ethnicity, the significant association was found in Asian under four models (T vs. C: OR=1.17, 95%CI=1.07-1.28, P=0.00; TT vs. CC: OR=1.79, 95%CI=1.36-2.36, P=0.00; TT vs. TC/CC: OR=1.75, 95%CI=1.32-2.32, P=0.00; TT/TC vs. CC: OR=1.11,95% CI=1.02-1.20). This meta-analysis suggested that the XRCC3 Thr241Met polymorphism is a risk factor for gliomas, especially for Asians. Considering the limited sample size and ethnicities included in the meta-analysis, further large scale and well-designed studies are needed to confirm our results.
Background: The XRCC1 (X-ray repair cross complimenting group-I) gene in BER (base excision repair) pathway is essential for DNA repair process. Polymorphisms in this gene are associated with variations in the repair efficiency which might predispose individuals to development of various cancers. Two variants of XRCC1gene (at codon 399), Gln/Gln and Arg/Gln, have been shown to be related to lowered DNA repair capacity and increased genomic instability in multiple studies. Hence our investigation focused on genotyping these variants to correlate with other multiple risk factors in lung cancer (NSCLC) patients since we hypothesized that these variants of the XRCC1 gene might influence disease susceptibility. Materials and Methods: We examined the frequency of the polymorphism in one hundred cases and an almost equal number of controls after recording their demographics with a structured questionnaire. Genomic DNA from blood samples was extracted for PCR studies, followed by RFLP to determine the variants. The significance of the data was statistically analyzed. Results: The three genotypes in cases and controls were Arg/Arg (40% and 54.45%); Gln/Gln (19% and 9.90%), and Arg/Gln (41.0% and 35.64%) respectively. Among these 3 genotypes, we found Gln/Gln and Arg/Gln to show association with lung cancer. Correlating these genotypes with several parameters, we also found that these two variants were associated with risk in males (p<0.05) and with smoking habits (p<0.05). In females Arg/Gln genotype showed association with stage of the disease (p=0.04). This is the first report in South Indian scenario where Arg399Gln genotypes were found to be associated with stage of the disease in females. Conclusions: It is concluded that XRCC1 genotypes Gln/Gln and Arg/Gln may influence cancer susceptibility in patients with smoking habits and these functional SNPs in XRCC1 gene may act as attractive candidate biomarkers in lung cancer for diagnosis and prognosis.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.