단백질 구조에 대한 유사성과 특이성에 대한 이해는 단백질의 기능을 파악하는데 있어 중요한 역할을 하고 있기 때문에, 많은 단백질 구조를 비교하는 시스템이 개발되고 있다. 그러나 이러한 시스템들은 단백질 구조 비교를 위한 자신의 알고리즘에 맞게 PDB에서 제공하는 데이타를 가공해야 한다 더욱이 PDB 데이타베이스에 저장된 데이타가 증가함에 따라 대용량의 단백질 구조 데이타베이스를 대상으로 주어진 단백질과 유사한 부분구조를 찾는 시스템은 보다 많은 계산량이 필요하여진다. 본 논문에서는 XML 데이타베이스인 eXist를 이용하여 PSAML 문서를 제공하는 PSAML 데이타베이스에 기반을 둔 WS4E(A Web-Based Searching Substructures of Secondary Structure Elements) 단백질 구조 비교 시스템을 소개한다. PSAML(Protein Structure Abstraction Markup Language)은 XML기반의 단백질 구조 표현 기법으로서 단백질의 2차구조 구성요소와 그들 사이의 관계를 이용하여 단백질 구조를 정형화된 방법으로 기술한다. 구축된 PSAML 데이타베이스를 이용하여, WS4E는 PSAML로 표현된 단백질 구조에서 유사한 부분 구조를 찾는 웹서비스를 제공한다. 또한, PSAML 데이타베이스에서 비교 대상이 되는 단백질의 숫자를 감소시키기 위하여, 단백질 2차구조가 가지는 공간상의 정보를 이용하여 하나의 단백질 구조를 표현하는 기법인 topology string을 이용하였다.
웹 환경에서 정보 표현과 교환을 위한 표준 방식으로 널리 사용되고 있는 XML 문서의 양은 급속히 증가하고 있으며, 대용량의 XML 문서도 많이 생산된다. 이러한 XML 문서들을 RDBMS에 효율적으로 저장하고 검색하는 연구가 활발히 진행되어 왔는데 이들 연구들 중에서 Shared Inlining 저장 방법이 높은 검색 효율을 보인다. Shared Inlining 방법은 DTD의 정보를 분석하여 XML 문서를 노드의 성분별로 분할하여 관계형 데이타베이스로 저장하는 기법이다. 본 논문은 기존의 Shared Inlining 방법에서 여러 하위 노드를 가지는 엘리먼트에서 발생되는 중첩 문제를 해결하기 위한 기법을 제안한다. 이 방법에서는 DTD 정의에 맞게 XML 문서를 Shared Inlining 구조로 저장하고 검색의 정확성을 높인다.
최근 웹에서 XML(extensible markup languag) 문서들이 보편화됨에 따라, 기존의 DBMS를 이용하여 XML 문서를 효율적으로 저장하고 관리하는 방법에 대한 연구가 활발히 진행중이다. 이를 위하여 DTD(document type definition)로부터 데이타베이스 스키마를 생성하는 효율적인 방법이 필요하다. 그러나 지금까지는 대부분의 연구가 풍부한 모델링 기능을 제공하는 객체관계형 DBMS 대신에 관계령 DBMS 관점에서 진행되어왔다. 본 논문에서는 객체관계형 DRMS 인 오디세우스를 위한 XML 스키마 생성를 설계하고 구현한다 첫째. DTD로 부터 관계형 데이타베이스 스키마를 생성하는 기존의 방법을 객체관계형 DBMS의 중요한 모델링 기능인 집합 타입과 참조 타입을 이용하도록 수정한다. 둘째, 수정된 방법을 오디세우스 객체관계명 DBMS에 구현한다. 마기막으로, 구현을 용이하게 할 수 있도록 기존의 방법에서 예로서만 기술된 DTD 단순화 방법에 대만 구제적인 알고리즘을 제시한다.
XML은 웹을 비롯한 모든 문서들을 표현할 수 있는 데이타 중심 표준 언어이다. XML 기반의 여러 문서 개발 도구들의 등장과 이를 이용한 사유 XML 문서의 증가, XML 문서로의 기존 데이타 변환가속화로 인해, 우리는 대량의 서로 상이한 구조로 표현된 XML 문서들을 가지게 되었으며, 이러한 문서 집합으로부터 원하는 정보를 담은 문서를 추출해 내는 것이 중요해 졌다. 하지만, 기존의 XML 문서에 대한 연구들은 한 개의 대규모 XML 문서나 동일한 구조를 가진 문서들에 대한 저장, 검색에 초점이 맞춰져 있거나. 상이한 구조를 지원하더라도, 구조적인 정보를 이용한 빠른 검색을 지원하지 못하는 단점을 가지고 있었다. 이에, 본 논문에서는 상이한 구조를 가진 문서들에 대해서도 빠른 경로 질의를 제공할 수 있도록 지원하기 위한 새로운 기법으로, 관계형 데이타베이스 시스템을 이용한 새로운 역 인덱스를 제안하였다. 우리는 제안된 기법이 기존의 방법에 비해 높은 성능을 보임을 실험을 통해 확인하였다. 특히, 간접 포함 관계를 포함한 모든 진의에서 논은 성능을 제공함으로서, 상이한 구조를 가진 문서들에 대해 적합한 인덱스 구조임을 보여 주었다.
본 논문은 학교 내에 구축된 교내 망을 이용하여 구축된 인트라넷 환경에서 구축되어 있는 XML DB의 정보를 이용하는 학교의 구성원인 교수와 학생들이 좀더 쉽게 인트라넷에 구축되어 있는 정보를 확인하고 활용할 수 있는 메신저를 만들어 사용자 본인이 소속된 집단의 구성원의 정보를 확인할 수 있도록 하고 자신이 소속된 그룹 안에서 사용자가 선택한 범위의 인원들을 자동으로 친구로 등록 하여 사용자가 일일이 친구를 추가하는 불편함을 줄여주고 인트라넷의 기능과 기타 추가 기능들을 통해 사용자의 인트라넷의 이용의 편의성을 제공하기 위한 연구이다. 특히 본논문에서는 XML 표준데이타를 학사 데이타베이스에 해당하는 오라클에 JDBC를 이용하여 학생의 데이타를 입력 Form을 통하여 저장한다. 그리고 SQL질의를 통해 web client에서 web server의 데이타베이스에 저장된 데이타를 검색 할 수 있다.
최근 들어 멀티미디어 정보의 사용량이 증가하면서 멀티미디어 데이타베이스로부터 오디오나 비디오, 이미지 둥 다양한 형태의 멀티미디어 컨텐츠를 효과적으로 찾아내는 멀티미디어 검색 시스템의 필요성이 증가하였다. 본 논문에서는 기존의 주석 및 내용 기반 검색 기법을 상호 보완하고 효과적인 멀티미디어 데이타 검색을 지원하는 XML 기반의 새로운 검색 기법과 이를 위한 데이타 모델을 제시한다. 이미지 및 비디오에 대한 데이타 모델은 MPEG-7 표준에 정의되어 있는 멀티미디어 기술 구조(MDS)와 기술 정의 언어인 XML Schema를 사용하여 멀티미디어 데이타의 특성 및 계층구조를 표현하였고 오디오 데이타의 경우 음향 특징들로부터 추출된 음높이를 분석하여 UDR 스트링으로 변환하고 자주 검색된 멜로디의 관리를 통해 검색 성능을 향상하였다. 본 논문에서는 제안된 모델을 기반으로 검색 시스템을 구현하였으며 다양한 실험을 통하여 성능 평가를 하였다.
본 논문에서는 3차원 이미지의 내용기반 검색을 지원하는 XML 기반의 3차원 그래픽 데이터 베이스 시스템에 대해 기술한다. 현재 대부분의 그래픽 응용들은 2차원 이미지를 대상으로 하고 있으며 3차원 그래픽스 분야에서는 3차원 이미지의 표현에 대해서만 중점적으로 연구가 되고 있을 뿐 이미지가 포함하고 있는 의미 단위로서의 객체 모델링이나 이들 간의 공간 관계에 대한 처리는 아직 미흡한 실정이다. 본 논문의 모델에서 3차원 이미지는 공간관계를 가지고 있는 3차원 그래픽 객체의 조합으로 표현된다. 복잡한 3차원 객체는 기존의 그래픽 시스템에서 사용하는 선과 면 대신에 기본적인 객체들을 이용하여 모델링된다. 이렇게 구성된 3차원 그래픽 이미지들은 객체 모양이나 객체간의 공간관계를 이용한 내용기반 검색의 대상이 된다. 3차원 그래픽 이미지들은 XML 문서 형태로 표현되며, 이를 위한 3DGML DTD를 정의하였다. 끝으로 웹 기반으로 구현된 프로토타입 시스템에서의 질의 예를 보인다.
최근 XML 데이타베이스 기반 웹 응용을 위한 XML 질의 캐쉬 기법이 활발히 연구되고 있다. 이와 같은 XML 질의 캐쉬의 실용적인 중요성에도 불구하고, 캐쉬된 질의 결과를 어떻게 저장하는 것이 효율적인지에 대해서는 아직 아무런 연구가 없는 실정이다. 본 논문에서는 XML 질의 캐쉬의 저장 기법을 다룬다. XML 질의 캐쉬의 효율적인 저장 구조 설계에 있어 근본적으로 고려해야 하는 점은 캐쉬된 질의 결과에 대한 대표적인 두 종류 연산 간에 성능 트레이드오프가 존재한다는 것이다. 이 두 종류의 연산은 (1) 캐쉬된 질의 결과를 반환하기 위하여 캐쉬 전체를 검색하는 것과 (2) 소스 데이타의 변경에 대하여 캐쉬를 점진적으로 갱신하기 위하여 캐쉬의 일부분을 변경하는 것이다. 본 논문에서는 모두 여덟 개의 XML 질의 캐쉬 저장 기법을 제시한다. 이들은 크게 세 개의 그룹으로 나누어지는데, (1) 일반적인 텍스트 화일을 기반으로 한 기법 (2) 영속성 있는 DOM(PDOM) 화일에 기반을 둔 기법 (3) RDBMS를 사용하는 기법이다. 이들 모두를 구현하여 성능을 비교하였고, 기존의 XML 저장 기술에 기반을 둔 질의 캐쉬 저장 기법과도 비교 평가하였다.
XML은 인터넷 상에서 데이타의 표현 및 전송 표준으로 인식되고 있다. XPath는 XML 문서의 특정 부분을 규정하는 표준으로, XML 질의 처리와 접근 제어에 적합한 언어이다 본 논문에서는 XPath를 사용자 질의 및 접근 제어 정보를 표현하는 방법으로 사용하는 XML 접근 제어 방법을 제안한다. 제안하는 방법은 접근 제어 XPath 표현식을 통해 질의 XPath 표현식을 필터링하여 XML 문서에 대한 접근을 제어한다. 이를 위하여 XML 접근 제어 트리(XACT)를 정의하고, 이 트리를 이용하여 질의 XPath 표현식에서 접근 허용되는 부분만을 추출한다. XACT는 XML 엘리먼트들에 대한 구조적 요약으로 에지를 구성하고, 접근 제어 정보로 노드를 구성한 구조이다. 제안하는 방법의 정확성을 보이고, 기존방법과의 성능을 비교한다
현재 스트리밍 XML 데이타에 대한 관심이 점차 증가한다. 스트리밍 XML 데이타에 대한 대부분의 연구는 XML 데이타를 효율적으로 여과하는 기법에 초점을 맞추었다. 이러한 XML 여과 시스템들은 사용자들이 관심 있는 XML 문서 전체를 사용자들에게 제공한다. 이 경우, 제공된 XML 문서들로부터 관심 있는 부분만을 추출하는 부담이 사용자에게 남겨지게 된다. 따라서, 스트리밍 XML 데이타에 대하여 직접적으로 질의 처리를 수행하여 관심 있는 XML 부분만을 추출하는 스트리밍 XML 질의 처리 기법들이 제안되었다. 그러나, 기존의 스트리밍 XML 질의 처리 기법들은 제안된 XPath 질의 만을 지원하며 복수 개의 질의 문을 처리하지는 못하고 있다. 본 논문에서는 스트리밍 데이타의 한 번 읽는 특성에 따라 XML 데이타를 한 번 읽으면서 복수 개의 질의들을 동시에 처리하는 XTREAM을 제안하고자 한다. 또한, XTREAM은 기존의 기법들에 비하여 순서 기반 프리디케이트 등 다양한 종류의 XPath 질의 기능들을 지원한다. 실제 XML 데이타와 합성 XML 데이타를 통한 실험 결과들은 XTREAM의 효율성과 확장성을 보인다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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