• 제목/요약/키워드: X-vector

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대장균에서 SUMO fusion tag을 이용하여 항균펩타이드인 moricin의 발현 (Expression of Antimicrobial Peptide (AMP), Moricin Using SUMO Fusion Tag in Escherichia coli)

  • 안동규;박선일;김순영
    • 생명과학회지
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    • 제32권12호
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    • pp.956-961
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    • 2022
  • 식물에서 재조합 단백질을 생산하는 것은 여러 가지 장점이 있다. 식물은 인간 병원체에 감염되지 않으며, 박테리아와 달리 내독소를 생산하지 않는다. 엽록체 형질전환은 핵 형질전환에 비해 안정적으로 많은 유전자를 발현시킬 수 있는 등 다양한 이점이 있다. 항균펩타이드(AMP)는 많은 동물들이 가지고 있는 선천면역의 일종으로, 소량이라도 항균력을 가지며, 기존 항생제와 다르게 쉽게 내성균이 생기지 않는다. 항균펩타이드인 moricin은 누에나방의 한 종류인 Bombyx mori에서 분리되었으며, C-말단은 염기성 아미노산이 모여 있고, N-말단은 α-helix 구조를 가지고 있다. Moricin을 생산할 때 SUMO와 6xHis tag를 융합하여 사용하였다. 발현된 moricin의 용해성과 안정성을 높이기 위해 SUMO를, 발현된 moricin을 정제하기 위하여 6xHis tag를 이용하였다. 본 연구에서 담배 엽록체와 대장균에서 항균펩타이드를 발현하기 위한 형질전환벡터를 제작하였다. 또한, 엽록체와 박테리아의 전사 및 번역의 유사성을 이용하여 대장균에서 단백질의 발현을 확인하였다. 발현된 moricin을 Ni 컬럼 및 SUMOase를 처리하여 정제하고 agar diffusion assay를 이용하여 항균 활성을 확인하였다.

농업용 난방기의 사용 연식에 따른 이산화탄소 배출농도 비교 (Comparison of Carbon Dioxide Emission Concentration according to the Age of Agricultural Heating Machine)

  • 김나은;김대현;김연중;김현태
    • 생물환경조절학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.190-196
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    • 2023
  • 본 연구는 등유를 사용하는 농업용 난방기에서 배출되는 가스를 포집하고, 농업용 난방기의 사용 연식에 따른 이산화탄소의 배출농도를 파악하고자 수행되었다. 선형 회귀분석의 결과로 농업용 난방기의 연식에 따른 이산화탄소의 배출량은 R2 = 0.84로 y = 26.99x+721.98의 식을 따른다고 나타났다. 농업용 난방기의 사용 연식에 따라 세 그룹으로 분류하여 분산분석을 수행하였다. 분산분석을 수행한 결과, 분석을 위해 설정한 유의확률0.05보다 작은 2.1961×10-13으로 나타났으며 이는 적어도 한 그룹에서 차이가 나타난다는 것을 의미한다. 본 연구에서는 농업용 난방기의 기본적인 배출농도의 차이를 분석하고자 기기의 제작사와 상관없이 농업용 난방기의 기기 연식만을 고려하여 배출가스 데이터를 수집하였다. 기기의 연소 방식에는 제작사에 따라 연소 방식에 차이가 미미하게 있었을 것으로 판단되며 데이터 변수의 개수가 늘어난다면, SVR(support vector regression) 기반의 선형회귀 분석 등을 실시하여 농업용 난방기의 이산화탄소 데이터가 온실가스발생량 파악에 더욱 활용도가 높아질 것으로 판단된다. 추후 연구에서는 더욱 세분화된 데이터의 수집 방식을 따라 더욱 높은 정확도를 가진 결과값을 도출할 수 있다고 판단된다. 이처럼 우리나라의 농업 분야에서 용도별 온실가스 발생량을 조사하기 위하여 고정형 농기계인 농업용 난방기의 이산화탄소 발생량을 정확히 파악하여 온실가스 배출량 조사에 활용할 수 있을 것으로 판단된다.

Acquisition of Thermotolerance in Transgenic Orchardgrass Plants with DgHSP17.2 Gene

  • Kim, Ki-Yong;Jang, Yo-Soon;Cha, Joon-Yung;Son, Daeyoung;Choi, Gi Jun;Seo, Sung;Lee, Sang Jin
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권5호
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    • pp.657-662
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    • 2008
  • To develop transgenic orchardgrass (Dactylis glomerata L.) resistant to high temperature, the recombinant DgHSP17.2 gene was introduced into orchardgrass plants using the Agrobacterium-mediated transformation method and expressed constitutively under the control of the CaMV 35S promoter. The results of genomic DNA PCR and Southern analysis showed a DNA band and hybridization signal on agarose gel and X-ray film in transgenic orchardgrass plants harboring the recombinant DgHSP17.2 gene, but a DNA band and hybridization signal were not observed in the wild type and empty vector control plants. The same result was also obtained in RT-PCR and Southern blot analysis, and these transgenic orchardgrass plants did not show any morphological aberration both in the culture bottle and soil mixture. When leaf discs cut from transgenic orchardgrass plants with recombinant DgHsp17.2 gene were exposed to lethal temperature (heat treatment at $60^{\circ}C$ for 50 min), 60-80% of the leaf discs showed only damage symptoms, but non-transgenic leaf discs showed a lethal condition. These results indicate that the DgHsp17.2 gene may act as a protector from heat stress in plants.

Development of recombinant human chorionic gonadotropin (hCG) using high-density culture technique of suspension-adapted chinese hamster ovary (CHO) cells

  • Na, Kyu-Heum;Kim, Seung-Chul;Seo, Kwang-Seok;Lee, Sung-Hee;Kang, Soo-Hyung
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2005년도 생물공학의 동향(XVI)
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    • pp.37-37
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    • 2005
  • Human chorionic gonadotropin (hCG) is a heterodimeric glycoprotein hormone consisting of non-covalently linked two subunits, the ${\alpha}$ and ${\beta}$ subunit. It has been used as a infertility drug for ovulation to mimic luteinizing hormone $(LH).^{1)}$ A stable cell line was established by transfection of Rc/CMV-i-dhfr-hCG, expression vector containing hCG ${\alpha}-$ and ${\beta}-genes$, into dihydrofolate reductase-deficient CHO cells and subesquent methotrexate-mediated gene amplification. Anchorage-dependent CHO cells were adapted into a serum-free and/or animal component-free suspension medium through gradual serum weaning for the hCG production. The established cell line showed typical morphological characteristics and growth profile of CHO cells, and could produce FSH with passage-to-passage consistency. The high density perfusion culture of the CHO cells was carried out in Celligen Plus bioreactor equipped with a spin-filter as a internal cell retention device. The cell density reached up to $>1x10^{7}$ cells/ml in less than 7 days and a perfusion-control strategy based on cellular consumption rates of glucose was $established.^{2)}$ Biologically active recombinant hCG was purified by a series of chromatographic steps including anion exchange chromatography and hydrophobic interaction chromatography to homogeneity. The highly purified recombinant hCG was characterized for physicochemical, immunological and biological properties.

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CaCl2/EDTA 및 비이온성 계면활성제 활용 Inclusion Body 정제법을 이용한 BA-RGD 단백질의 생산 (Simple Purification of BA-RGD Protein Based on CaCl2/EDTA Treatment and Inclusion Body Washing)

  • 송우호;변창우;윤민호;엄지훈;최유성
    • KSBB Journal
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    • 제30권6호
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    • pp.291-295
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    • 2015
  • The limited productivity of natural shell matrix proteins has hampered the investigation of their biochemical properties and practical applications, although biominerals in nature obtained by organic-inorganic assemblies have attractive mechanical and biological properties. Here, we prepared a vector for the expression of a fusion protein of a shell matrix protein from Pinctada fucata (named as GRP_BA) with the GRGDSP residue. The fusion protein of BA-RGD was simply produced in E. coli and purified through sequential steps including the treatment with $CaCl_2$ and EDTA solution for cell membrane washing, mechanical cell disruption and the application of non-ionic surfactant of Triton X-100 for BA-RGD inclusion body washing. The production yield was approximately 60 mg/L, any other protein band was not observed in SDS-PAGE and it was estimated that above 97% endotoxin was removed compared to the endotoxin level of whole cell. This study showed this simple and easy purification approach could be applied to the purification of BA-RGD fusion protein. It is expected that the protein could be utilized for the preparation of biominerals in practical aspects.

초분광영상의 분광라이브러리를 이용한 토지피복분류의 정확도 향상에 관한 연구 (The Study on Improving Accuracy of Land Cover Classification using Spectral Library of Hyperspectral Image)

  • 박정서;서진재;고제웅;조기성
    • 지적과 국토정보
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    • 제46권2호
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    • pp.239-251
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    • 2016
  • 밴드 수가 많고 밴드 폭이 좁은 초분광영상은 기존의 다중 분광 영상에 비해 각 픽셀이 함유하고 있는 정보가 많아 영상을 이용한 토지피복분류를 하는데 있어 최적의 영상으로 평가 받고 있다. 하지만 초분광영상의 높은 분광해상도로 부터 증가된 데이터의 용량과 노이즈로 인해 다중분광영상을 분석하는 기법을 그대로 적용하기에는 효용성이 떨어진다. 초분광영상의 분석 기법으로서 벡터의 내적을 활용하는 SAM(Spectral Angle Mapping)은 연속적인 스펙트럼을 보이는 초분광영상의 특성을 해석하는데 가장 보편적인 방법이다. 이에 본 연구에서는 분광라이브러리를 이용한 초분광영상의 토지피복분류를 수행하기 위해 SAM기법을 채택하였으나 대기영향의 노이즈로 인해 낮은 정확도를 보였다. 이를 보안하기 위한 방법으로서 Decision Tree 기법을 제안하였고 그 결과, 분류 정확도를 향상시킬 수 있었다.

Inhibitory Effects of Antisense RNA on Expression of Cholesteryl Ester Transfer Protein in Vaccinia Virus Expression System

  • Lee, Myung-Hoon;Jang, Moon-Kyoo;Park, Yong-Bok
    • BMB Reports
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    • 제28권3호
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    • pp.243-248
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    • 1995
  • Cholesteryl ester transfer protein (CETP), a hydrophobic glycoprotein promoting transfer of cholesteryl esters (CE) from high-density lipoproteins (HDL) to lower-density lipoproteins in the plasma, has been recognized a potent atherogenic factor during the development of coronary artery diseases. This study demonstrated a possible utilization of antisense RNA to inhibit expression of the CETP gene using vaccinia virus as an expression system. The CETP cDNA was inserted into a transfer vector (pSC11) in sense and antisense orientations and used to generate recombinant viruses. Recombinants containing sense or antisense orientations of the CETP cDNA were isolated by $TK^-$ selection and X-gal test. The inserted CETP cDNAs in the recombinants were identified by Southern blot analysis and allowed to transcribe in host cells (CV-1). Expressions of the exogenous CETP mRNA, extracted from the CV-1 cells coinfected with viruses containing sense and antisense DNAs, were monitored by Northern blot analysis using the CETP cDNA probe, by Western blot analysis using monoclonal antibody against the C-terminal active region of the CETP and by the CETP assay. Decreased expressions of the exogenous CETP cDNA were clearly evident in the Northern and Western blot analyses as the dose of antisense expression increased. In the CETP assay, the CETP activities decreased compared to the activity obtained from the cell extracts infected with sense construct only.

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글로벌최적화 문제인 유효해집합 위에서의 최적화 문제에 대한 선형계획적 접근방법 (A linear program approach for a global optimization problem of optimizing a linear function over an efficient set)

  • 송정환
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
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    • 대한산업공학회/한국경영과학회 2000년도 춘계공동학술대회 논문집
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    • pp.53-56
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    • 2000
  • 그로벌최적화문제(Global optimization problem)의 부류인 다목적선형계획법 ( MOLP ) (Multiple objective linear programming)에서 결정된 유효해집합(a set of efficient solutions)위에서 선형함수 최적화문제 ( Ρ )는 해집합이 볼록집합이 아니므로(nonconvex set) 일반적인 선형계획법을 활용하기가 어렵다. 현재까지 ( Ρ )의 최적화를 위해서 유효해집합의 모든 꼭지점(extreme point)를 찾거나 일련의 선형계획문제들을 최적화하여 최적해를 찾는 접근방법들이 있다. 이러한 방법들에는 ( MOLP )의 해집합의 차원(dimension)이 커짐에 따라 문제해결이 실제적으로 가능하지 않는 경우가 많다. 본 연구는 주어진 선형함수와 다목적선형함수들간 관계를 고찰하여 선형목적함수를 구성하고 그 목적함수를 이용하여 주어진 문제 (Ρ) 의 최적해를 찾는 선형계획적 접근방법을 제안한다.

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E35S 프로모터 + AtNDPK2 유전자 도입에 의한 버즈풋 트레포일 (Lotus corniculatus L.) 형질전환체 생산 (Production of Transgenic Birdsfoot Trefoil (Lotus corniculatus L.) Plants by Introduction of E35S Promoter + AtNDPK2 Gene)

  • 김기용;장요순;최기준;성병렬;김원호;서성;이병현;곽상수
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.83-90
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    • 2006
  • 환경스트레스에 내성을 갖는 버즈풋 트레포일(Lotus corniculatus L.) 형질전환체를 개발하기 위하여, AtNDPK 유전자가 E35S 프로모터에 의해 조절되도록 재조합한 발현벡터 pEN-K를 Agrobacterium 형질전환 방법으로 버즈풋 트레포일에 도입하였다. Agrobacterium과 공동배양한 버즈풋 트레포일 캘러스를 $100{\mu}g/m1$의 kanamycin 및 $500{\mu}g/m1$의 cefotaxim을 첨가한 SH-3-kc 배지에서 배양하며 식물체로 재분화시켰다. 재분화된 버즈풋 트레포일의 genomic DNA를 분리, PCR 및 Southern blot 분석을 실시한 결과, AtNDPK 유전자가 도입된 형질전환체의 경우 agarose gel 전기영동 및 X-ray 필름상에서 DNA band 및 hybridization signal을 확인할 수 있었으나, 형질전환되지 않은 대조구의 버즈풋 트레포일에서는 DNA band 및 hybridization signal이 관찰되지 않았다.

한국 유통산업이 한국 경제에 미치는 상호영향력에 관한 실증적 연구 (An Empirical Study on Mutual Influence between Economic Index and Distribution Industry in Korean)

  • 임병진
    • 산경연구논집
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    • 제10권9호
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    • pp.53-60
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    • 2019
  • Purpose - The objective of this paper is to discover if there exists a relationship between the economic index and distribution industry index in Korean. Because of the distribution industry boom in the recent years, a lot of interest in the relationship between the economic index and distribution industry index in Korean and the economy has been generated. This article examine on the mutual influence between economic index and distribution industry index in Korean. Research design, data, and methodology - For this purpose, we use the vector-auto regression model, impulse response function and variance decomposition of the economic index and distribution industry index, Granger causality test using weekly data on the economic index and distribution industry price index in korea. The sample period is covering from January 2, 2010 to August 31, 2019. The VAR model can also be linked to cointegration analysis. Cointegration Analysis makes possible to find a mechanism causing x and y to move around a long-run equilibrium (Engle and Granger, 1987). This equilibrium means that external shocks may separate the series temporarily at any particular time, but there will be an overall tendency towards some type of long-run equilibrium. If variables are found to have this tendency they are said to be cointegrated and a long-run relationship between these series is established. These econometric tools have been applied widely into economics and business areas to analyze intertemporal linkages between different time series. Results - This research showed following main results. First, from the basic statistic analysis of the economic index and distribution industry index in Korean, the economic index and the distribution industry index in korea have unit roots. Second, there is at least one cointegration between the economic index and distribution industry index in Korean. Finally, the correlation between of the economic index and the distribution industry index in korea is (+) 0.528876. Conclusions - We find that the distribution industry price index Granger cause the economic index in korea. As a consequence, the distribution industry index affect the economic index in Korean. The distribution industry index to the economic index is stronger than that from the economic index to the distribution industry index.