• 제목/요약/키워드: Virus inspection

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RT-PCR에 의한 카네이션괴저바이러스와 카네이션둥근반점바이러스 정밀진단 (Detection of Carnation necrotic fleck virus and Carnation ringspot virus Using RT-PCR)

  • 이시원;강은하;허노열;김상목;김유정;신용길
    • 식물병연구
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    • 제19권1호
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    • pp.36-44
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    • 2013
  • 카네이션은 세계 3대 절화용 화훼작물의 하나로, 농가 생산액 210억 원에 이르는 주요작물이다. 이들은 절화, 종자, 묘 및 삽수의 4 품목으로 수출입 되고 있다. 카네이션과 같은 영양번식성 작물의 경우, 증식하는 과정 중에 바이러스의 확산과 전파가 용이한데, 우리나라에서는 카네이션괴저바이러스(CNFV)와 카네이션둥근반점바이러스(CRSV)를 식물검역 바이러스로 지정하여 수입검사를 수행하고 있다. 본 연구에서는 CNFV와 CRSV를 신속, 정밀하고 쉽게 진단할 수 있는 특이적인 프라이머를 고안하였으며, 높은 검출 감도를 가지는 nested 프라이머 조합을 개발하였다. CNFV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 288과 447 bp를, CRSV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 503과 549 bp를 증폭하였다. CNFV의 nested는 2 세트 모두 147 bp로 동일하며, CRSV는 각각 395와 347 bp의 밴드를 증폭하였다. 또한, 실험의 신뢰도를 높이기 위하여, 증폭산물에 염기서열 6개를 삽입한 플라스미드를 제작하여 양성대조구로 활용하였다. 본 연구에서 개발한 방법은, 향후 CNFV와 CRSV에 대한 신속, 정밀한 국경검역을 지원할 수 있을 것이라고 기대된다.

Slow Bee Paralysis Virus (SBPV) 신속 검출을 위한 초고속 역전사 중합효소 연쇄반응법의 개발 (Development of Ultra-Rapid Reverse-Transcription PCR for the Rapid Detection against Slow Bee Paralysis Virus (SBPV))

  • 김소민;임수진;김정민;임윤규;윤병수
    • 한국양봉학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.171-180
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    • 2017
  • Slow Bee Paralysis Virus (SBPV)는 꿀벌 그리고 뒤영벌의 병원성 바이러스로써, 벌의 앞발을 마비시킴으로 폐사를 야기한다. 본 연구는, 뒤영벌에서 빠르게 SBPV 검출하고자 SBPV 특이 초고속 PCR법을 개발한 것을 보고하는 것이다. SBPV 특이 초고속 PCR은 제반 조건을 최적화한 후, $1.0{\times}10^8$ 분자의 SBPV 특이 유전자의 존재를 3분 35초 만에 인식할 수 있었으며, 최소 $1.0{\times}10^1$ 분자의 DNA까지 정량적으로 측정할 수 있었다. 한편, 국내외에서 생산된 뒤영벌을 시료로 SBPV 특이 초고속 역전사 PCR을 시행하였으며, 수입된 뒤영벌과 국내생산 뒤영벌 1종에서 SBPV가 존재함을 보일 수 있었다. 국내 처음으로 뒤영벌에서의 SBPV의 존재를 확인한 것이다. SBPV 특이 유전자 초고속 역전사 PCR법은 실험실 내에서 뿐만 아니라 현장에서 정량적 검출을 하기에 유용한 방법이 될 것이며 더 나아가 뒤영벌 수출입을 위한 검역 기준을 이용하여 집단적 발병 방지에 기여하기를 기대한다.

우리나라 파프리카 수출단지 및 선과장의 병해충 조사 (The pests survey of paprika export complexes and packing house in Korea)

  • 김기돈;이시원;강은하;신용길;전재용;허노열;이흥식
    • 농업과학연구
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    • 제40권2호
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    • pp.93-99
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    • 2013
  • The disease and insect were surveyed locally in greenhouse, fruit packing house and store house of 51 farms in 13 towns having purpose of paprika exportation. By analysis, various disease and insect were not only founded locally but more ones detected in farms having old facilities and no natural enemy. We found 15 pathogens such as Fusarium spp., Alternaria solani, Leveilluila taurica, PepMV (Pepino mosaic virus) and TMV (Tobacco mosaic virus) in greenhouse, Fusarium spp. in fruit packing house and Penicillium spp. in store house. We found 15 insects in greenhouse such as Bemisia tabaci, rialeurodes vaporariorum and Myzus persicae in greenhouse, Hylobitelus haroldi in fruit packing house. However, the problem quarantine disease and insect for importation and exportation were not detected in inspection time.

A design study of a 4.7 T 85 mm low temperature superconductor magnet for a nuclear magnetic resonance spectrometer

  • Bae, Ryunjun;Lee, Jung Tae;Park, Jeonghwan;Choi, Kibum;Hahn, Seungyong
    • 한국초전도ㆍ저온공학회논문지
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    • 제24권3호
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    • pp.24-29
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    • 2022
  • One of the recent proposals with nuclear magnetic resonance (NMR) is a multi-bore NMR which consists of array of magnets which could present possibilities to quickly cope with pandemic virus by multiple inspection of virus samples. Low temperature superconductor (LTS) can be a candidate for mass production of the magnet due to its low price in fabrication as well as operation by applying the helium zero boil-off technology. However, training feature of LTS magnet still hinders the low cost operation due to multiple boil-offs during premature quenches. Thus in this paper, LTS magnet with low mechanical stress is designed targeting the "training-free" LTS magnet for mass production of magnet array for multi-bore NMR. A thorough process of an LTS magnet design is conducted, including the analyses as the followings: electromagnetics, mechanical stress, cryogenics, stability, and protection. The magnet specification was set to 4.7 T in a winding bore of 85 mm, corresponding to the MR frequency of 200 MHz. The stress level is tolerable with respect to the wire yield strength and epoxy crack where mechanical disturbance is less than the minimum quench energy.

Quantitative Analysis of Two Genetically Modified Maize Lines by Real-Time PCR

  • Lee Seong-Hun;Kang Sang-Ho;Park Yong-Hwan;Min Dong-Myung;Kim Young-Mi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권2호
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    • pp.205-211
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    • 2006
  • A quantitative analytical method to detect new lines of genetically modified (GM) maize, NK603 and TC1507, has been developed by using a real-time polymerase chain reaction (PCR). To detect these GM lines, two specific primer pairs and probes were designed. A plasmid as a reference molecule was constructed from an endogenous DNA sequence of maize, a universal sequence of a cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S promoter used in most GMOs, and each DNA sequence specific to the NK603 and TC1507 lines. For the validation of this method, the test samples of 0, 0.1, 0.5, 1.0, 3.0, 5.0, and 10.0% each of the NK603 and TC1507 GM maize were quantitated. At the 3.0% level, the biases (mean vs. true value) for the NK603 and TC1507 lines were 3.3% and 15.7%, respectively, and their relative standard deviations were 7.2% and 5.5%, respectively. These results indicate that the PCR method developed in this study can be used to quantitatively detect the NK603 and TC1507 lines of GM maize.

A quantitative modeling approach to estimate the risks posed by the smuggled animal products contaminated with Foot-and-Mouth Disease (FMD) virus

  • Hong, Ki-Ok;Lee, Gil-Hong;Pak, Son-Il
    • 대한수의학회지
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    • 제45권2호
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    • pp.223-231
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    • 2005
  • A quantitative risk assessment tool was used to provide estimates of the probability that foot-and-mouth (FMD) virus-contaminated, smuggled animal products are fed to susceptible swine in Korea. Sensitivity analyses were conducted to attempt to distinguish between parameter uncertainty and variability, using different assumptions on the effect of cooking at home, the effect of the fresh meat, and the effect of heat treatment at garbage processing facility. The median risk estimate was about 20.1% with a mean value of 27.4%. In a scenario regarding all beef and pork were considered as fresh meat the estimated median risk was 3.4%. The risk was greatly dependent on the survival parameters of the FMD virus during the cooking or heat treatment at garbage processing facility. Uncertainty about the proportion of garbage that is likely contaminated with FMD had a major positive influence on the risk, whereas conversion rate representing the size of a load had a major negative effect. This model was very useful in assessing the risk explored. However, the model also requires enhancements, such as the availability of more accurate data to verify the various assumptions considered such as FMD prevalence in a specific country, proportion of garbage which is recycled as feed, proportion of food discarded as garbage. Other factors including the effect of selection of animals for slaughter, ante- and post-mortem inspection, the domestic distribution of the smuggled products, and susceptible animals other than pigs, are need to be taken into account in the future model development.

최근 2년간 부산지역에서 급성호흡기 환자로부터 분리한 인플루엔자바이러스의 유행 양상 (Epidemiological Characterization of Influenza Virus Isolated from Acute Respiratory Illness in Busan, 2004-2005)

  • 조경순;박선미;김성준;정명주;이주연;강춘
    • 미생물학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.173-178
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    • 2007
  • 2004년과 2005년 동안 부산지역에서 급성호흡기환자로부터 인플루엔자바이러스를 분리 동정하여 분식한 결과, 인플루엔자바이러스분리율은 2004년도는 1869건의 호흡기 검체 중 인플루엔자바이러스 154건 중, A/H3N2형은 77.3%에 해당하는 119건, B형의 경우 35건(22.7%)으로 나타났고 A/H1N1형은 검출되지 않았다. 분리된 인플루엔자바이러스의, 2005년의 경우 1579건의 호흡기 검체 중에서 분리된 인플루엔자바이러스 19건 중, A/H1N1형은 6건(31.6%) 검출되었으며, A/H3N2형은 52.6%에 해당하는 10건, B형의 경우는 3건(15.8%)으로 나타났다. 2005년의 경우 전체적인 인플루엔자바이러스 분리율은 2004년에 비해 떨어졌으나, A/H3N2의 경우 여전히 높은 분리율을 보였으며 2004년에는 전혀 검출되지 않았던 A/H1N1이 B형보다 많이 분리되었다. 부산지역에서 분리된 바이러스의 항원형을 분석한 결과 당해연도 백신주와 동일하거나 유사하였다. 연령별 발생 분포는 0-10세 이하에서 80-90%이상을 차지하였고, 남성에 비해 여성에서 약간 높은 분리율을 나타내었다. 월별 분리율은 2004년도는 4월, 2005년도는 2월이 가장 많이 분리되었다. 인플루엔자바이러스의 대유행 주기에 임박한 현 시점에서 지속적으로 인플루엔자유행예측조사로서 조기 분리한 인플루엔자바이러스 주를 유전자 염기서열을 분석함으로써 신종 인플루엔자바이러스가 출현되는지 적극적인 감시가 필요하다.

방류용 수산종묘의 질병 관리에 대한 고찰 (Aquatic animal health management in stock enhancement)

  • 서장우;조미영;김진우;박경현;지보영;최동림;박명애;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.85-98
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    • 2010
  • 농림수산식품부와 국립수산과학원에서는 2009년도 방류 품종 (해면 품종 22종과 내수면 품종 11품종)을 대상으로 수산동물전염병의 감염 여부를 검사하였다. 총 12개 지방자치단체에 서 방류를 실시한 것으로 나타났으며, 이 중에서 경상남도, 전라남도, 제주도 및 충청남도는 해면 품종을 주로 방류하였으며, 경기도, 전라북도 및 충청북도는 내수면 품종을 많이 방류하는 것으로 나타났다. 검사품종중에서 해산품종으로는 전복이 24.5%로 가장 많았으며, 그 다음 해삼(15.2%), 넙치 (11.5%), 감성돔과 조피볼락(6.8%), 꽃게 (5.6%), 돌돔 (5.1%), 볼락 (4.6%), 붉은쏨뱅이 (4.5%)로 나타났다. 내수면 품종 중에서는 붕어가 19.4%로 가장 많았으며, 그 다음으로 뱀장어 (17.0%), 동자개 (12.3%), 다슬기 (12.0%), 메기 (8.4)의 순으로 검사 실적이 많았다. 총 33종의 품종을 대상으로 1,080회의 검사가 의뢰되었으며, 검사항목별로 2,066건의 검사를 실시한 결과 19건에서 red sea bream iridovirus (RSIV), koi herpesvirus (KHV) 또는 white spot syndrome virus (WSSV)와 같은 병원체가 검출되어 불합격 처리되었다.

국내 양식 무지개송어에서 분리한 IHNV glycoprotein의 유전자 분석 (Phylogenetic analysis of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) isolated from cultured rainbow trout Oncorhynchus mykiss in Korea)

  • 김형준
    • 한국어병학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.1-8
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    • 2010
  • 무지개 송어 발안란의 이동 이력과 IHNV G gene 염기서열의 계통학적 분석에 의해 IHNV의 국내 이동에 대해서 처음으로 조사되었다. IHNV RtWanju09 분리주는 IHNV RtPy91과 RtJe00의 JRt Shizuoka lineage에 속하는 것으로 나타났으며, 강원도에서 분리된 IHNV RtPy91과 RtWanju09 사이의 G gene의 유전적 차이는 1.77%였고, 약 20년간 우리나라의 JRt Shizuoka lineage에 속하는 한국 분리주들은 최대 3.03%의 유전적 차이를 나타내 계속적으로 바이러스가 진화하는 것을 알 수 있었다. 또한 전라북도 지역에서 분리된 IHNV RtWanju09 분리주는 IHNV가 오염된 강원도 지역산 발안란이 전라북도에 전파되었을 것으로 사료된다.

HPV and Cervical Cancer Epidemiology - Current Status of HPV Vaccination in India

  • Chatterjee, Sharmila;Chattopadhyay, Amit;Samanta, Luna;Panigrahi, Pinaki
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권8호
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    • pp.3663-3673
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    • 2016
  • Cervical cancer (CaCx) is the second most fatal cancer contributing to 14% of cancers in Indian females, which account for 25.4% and 26.5% of the global burden of CaCx prevalence and mortality, respectively. Persistent infection with high-risk human papilloma virus (HPV- strains 16 and 18) is the most important risk factor for precursors of invasive CaCx. Comprehensive prevention strategies for CaCx should include screening and HPV vaccination. Three screening modalities for CaCx are cytology, visual inspection with acetic acid, and HPV testing. There is no Indian national policy on CaCx prevention, and screening of asymptomatic females against CaCx is practically non-existent. HPV vaccines can make a major breakthrough in the control of CaCx in India which has high disease load and no organized screening program. Despite the Indian Government's effort to introduce HPV vaccination in the National Immunization Program and bring down vaccine cost, challenges to implementing vaccination in India are strong such as: inadequate epidemiological evidence for disease prioritization, duration of vaccine use, parental attitudes, and vaccine acceptance. This paper reviews the current epidemiology of CaCx and HPV in India, and the current status of HPV vaccination in the country. This article stresses the need for more research in the Indian context, to evaluate interventions for CaCx and assess their applicability, success, scalability and sustainability within the constraints of the Indian health care system.