• Title/Summary/Keyword: VTK

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Design and Implementation of Parallel Visualization System using VTK and OSG (VTK와 OSG를 이용한 병렬 가시화 시스템의 설계와 구현)

  • Lee, Joong-Youn
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2011.06b
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    • pp.286-289
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    • 2011
  • VTK와 OSG는 컴퓨터 그래픽스 분야에서 널리 사용되는 오픈 소스 라이브러리이다. VTK는 데이터 가시화에 초점을 맞추어 개발된 라이브러리로 다양한 격자 구조의 수치 데이터를 위한 고수준의 가시화 알고리즘을 제공한다. OSG는 다수의 폴리곤으로 구성된 복잡한 전경을 빠르고 효율적으로 렌더링할 수 있도록 하는 라이브러리로 전경 그래프(scene graph)와 다양한 실시간 렌더링 기술을 제공한다. VTK와 OSG는 서로 다른 목적으로 개발된 라이브러리이기 때문에 어느 한 라이브러리만을 이용해서 대용량의 수치 데이터를 가시화하는 것은 많은 노력을 필요로 한다. 따라서 VTK의 고수준 가시화 알고리즘과 OSG의 실시간 렌더링 기술을 접목하여 대용량 데이터를 빠르게 가시화하고자 하는 시도가 여러 연구 그룹에서 꾸준히 있어왔다. 본 논문에서는 테라 스케일의 거대 용량 수치 데이터를 빠르게 가시화하기 위한 방법으로 병렬 VTK 엔진과 OSG 실시간 렌더링 엔진을 접목한 병렬 가시화 시스템을 제안하고자 한다. 또, 본 논문에서 제안하는 가시화 시스템을 이용해서 실제 테라 스케일 데이터에 적용한 사례를 소개한다.

Visualization of Medical Images Using Visualization Toolkit (VTK를 이용한 의료영상의 가시화)

  • Choi, H.G.;Tack, G.R.
    • Proceedings of the KOSOMBE Conference
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    • v.1998 no.11
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    • pp.113-114
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    • 1998
  • In this paper, visualization of Visible Human data offered by NLM(National Library of Medicine) is performed using $VTK^{TM}$. Computed Tomography Data set(axial, $587\times341\times256$, and the distance between slices 1mm) is used throughout the study. Before the actual visualization routine, 8 bit-reader class of VTK is developed to transform CT data to VTK dataset. After that, the visualization procedures are done to display 3D image on PC. VTK is freeware, not a commercial software. The results of VTK show relatively good image quality and slower processing time compared with the commercial softwares like IAP, IDL, AVS. Thus if processing time is not the critical factor, VTK is worthy to be used in visualization of the medical images.

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3D Visualization of Knee MRI using VTK (VTK를 이용한 무릎 MRI의 3차원 가시화)

  • Li, Sheng-Zhe;Cui, Xue-Nan;Hong, Seong-Wook;June, Chittoo;Kim, Hak-Il
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2010.06b
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    • pp.283-288
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    • 2010
  • 본 논문은 VTK를 이용한 3차원 무릎 MRI 가시화에 대한 프로그램 기술을 제안한다. 기존의 많은 연구에서는 VTK를 사용하여 의료영상에 대한 3차원 가시화 프로그램을 제안하였으나 골관절염 진단을 목표로 한 무릎 3차원 가시화 방법은 아직 많이 제안되지 않고 있다. 본 논문에서는 볼륨렌더링(Volume redering) 기술과 다각형렌더링(Polygonal rendering)기술을 융합하여 무릎 및 연골을 효과적으로 가시화 할 수 있는 방법을 제안한다. 프로그램은 사용자 상호작용이 가능하고 VTK를 이용한 GPU기반의 프로세싱을 기반으로 하기 때문에 실시간 렌더링이 가능하다. 실험결과로부터 제안한 3차원 가시화 기술은 연골과 무릎의 관계를 직관적으로 표현할 수 있어 골관절염 조기진단에 유용하게 사용될 것으로 기대한다.

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Development of Dental Medical Image Processing SW using Open Source Library (오픈 소스를 이용한 치과 의료영상처리 SW 개발)

  • Jongjin, Park
    • The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication
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    • v.23 no.1
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    • pp.59-64
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    • 2023
  • With the recent development of IT technology, medical image processing technology is also widely used in the dental field, and the treatment effect is enhanced by using 3D data such as CT. In this paper, open source libraries such as ITK and VTK are introduced to develop dental medical image processing software, and how to use them to develop dental medical image processing software centering on 3D CBCT. In ITK, basic algorithms for medical image processing are implemented, so the image processing pipeline can be quickly implemented, and the desired algorithm can be easily implemented as a filter by the developer. The developed algorithm is linked with VTK to implement the visualization function. The developed SW can be used for dental diagnosis and treatment that overcomes the limitations of 2D images..

Design of 3D Visualization Software Tool Based on VTK for Manual Brain Segmentation of MRI (뇌 MR영상 수동분할을 위한 VTK기반의 3차원 가시화 소프트웨어 툴 설계)

  • Yoon, Ho-Sung;Hewage, Nuwan;Moon, Chi Wong;Kim, Young-Hoon;Choi, Heung-Kook
    • Journal of Korea Multimedia Society
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    • v.18 no.2
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    • pp.120-127
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    • 2015
  • Mild Cognitive Impairment(MCI) is a prior step to Alzheimer's Disease(AD). It is different from AD which is seriously affecting daily life. Particularly, the hippocampus could be charged a crucial function for forming memory. MCI has a high risk about progress to AD. Our investigated research for a relationship between hippocampus and AD has been studied. The measurement of hippocampus volumetric is one of the most commonly used method. The three dimensional reconstructed medical images could be passible to interpret and its examination in various aspects but the cost of brain research with the medical equipment is very high. In this study, 3D visualization was performed from a series of brain Magnetic Resonance Images(MRI) and we have designed and implemented a competitive software tool based on the open libraries of Visualization ToolKit(VTK). Consequently, our visualization software tool could be useful to various medical fields and specially prognosis and diagnosis for MCI patients.

3D Visualization of Medical Image Registration using VTK (VTK를 이용한 의료영상정합의 3차원 시각화)

  • Lee, Myung-Eun;Kim, Soo-Hyung;Lim, Jun-Sik
    • The KIPS Transactions:PartB
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    • v.15B no.6
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    • pp.553-560
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    • 2008
  • The amount of image data used in medical institution is increasing rapidly with great development of medical technology. Therefore, an automation method that use image processing description, rather than manual macrography of doctors, is required for the analysis large medical data. Specially, medical image registration, which is the process of finding the spatial transform that maps points from one image to the corresponding points in another image, and 3D analysis and visualization skills for a series of 2D images are essential technologies. However, a high establishment cost raise a budget problem, and hence small scaled hospitals hesitate importing these medical visualizing system. In this paper, we propose a visualization system which allows user to manage datasets and manipulates medical images registration using an open source graphics tool - VTK(Visualization Tool Kit). The propose of our research is to get more accurate 3D diagnosis system in less expensive price, compared to existing systems.

A Study on 3D File Format for Web-based Scientific Visualization

  • Lee, Geon-hee;Nam, Jeong-hwan;Han, Hwa-seop;Kwon, Soon-chul
    • International Journal of Advanced Culture Technology
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    • v.7 no.1
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    • pp.243-247
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    • 2019
  • The most commonly used 3D modeling file formats are OBJ (Wavefront file format specification) and STL (STereoLithography). Although they have a common point of view in 3D on the screen, detailed functions are different according to purpose of development. OBJ is the most commonly used 3D file format and STL is mainly used as 3D file format for 3D printing. However, in the field of Scientific Visualization, precise analysis is required. There is a difference in accuracy depending on the type of 3D file format. OBJ and STL are not suitable for delicate surface description because they form meshes in the form of triangular polygons. And if you increase the number of triangle polygons, it will be smoother, but the file size also increases exponentially and causes excessive CPU usage. In contrast, VTK provides a variety of polygon structures, including triangular polygons as well as rectangular polygons and cube polygons. Thus, delicate surface depiction is possible. Delicate surface rendering is possible and file size is not large. This paper describes the concept and structure of VTK. We also compared the load times and file sizes between VTK, STL, and OBJ in the Chrome browser. In addition, the difference in surface rendering ability between VTK, STL, and OBJ is intuitively viewed based on the screen in which each 3D file format is implemented under the same conditions. This study is expected to be helpful for efficient 3D file format for precise implementation of Web - based Scientific Visualization.

A Visualization System of Brain MR image based on VTK

  • Du, Ruoyu;Lee, Hyo Jong
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2012.04a
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    • pp.336-339
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    • 2012
  • VTK is a free but professional development platform for images three-dimensional (3D) reconstruction and processing. It is powerful, open-source, and users can customize their own needs by self-development of great flexibility. To give the doctors more and detailed information by simulate dissection to the 3-D brain MRI image after reconstruction. A Visualization System (VS) is proposed to achieve 3D brain reconstruction and virtual dissection functions. Based on the free VTK visualization development platform and Visual Studio 2010 IDE development tools, through C++ language, using real people's MRI brain dataset, we realized the images 3D reconstruction and also its applications and extensions correspondingly. The display effect of the reconstructed 3D image is well and intuitive. With the related operations such as measurement, virtual dissection and so on, the good results we desired could be achieved.

Cast Study : Visualization of Large Rotor Simulation Data using VTK (사례연구 : VTK를 이용한 대용량 로터 시뮬레이션 데이터의 가시화)

  • Lee, Joong-Youn;Hur, Younju;Kim, MinAh
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2009.11a
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    • pp.393-394
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    • 2009
  • 최근 컴퓨팅 성능의 급격한 발전으로 이를 통해 생산되는 데이터의 크기 역시 매우 커지고 있다. 이는 로터 시뮬레이션 분야에서도 마찬가지인데, 과거에는 백만개 정도의 격자 데이터 정도만을 다루었던 것에 비해 최근에는 1억개 이상의 격자 데이터를 다루려는 시도가 계속되고 있다. 그러나 이렇게 생산된 대용량의 시변환(time-variant) 유동 데이터는 그 크기가 매우 크기 때문에 일반 PC에서는 실시간으로 가시화하기에 곤란한 경우가 많다. 또, 이러한 로터 시뮬레이션 데이터는 매우 복잡한 구조를 가지고 있기 때문에 초보자가 이 데이터에서 vortex와 같은 중요한 정보를 뽑아서 가시화하는 데에는 많은 어려움이 있어 왔다. 본 논문에서는 일반 PC에서 가시화하기 어려운 대용량 로터 시뮬레이션 데이터를 고성능 가시화 컴퓨터와 VTK를 이용해서 빠르게 가시화하기 위한 방법을 서술한다. 또, 복잡한 데이터 내부의 중요한 정보들을 자동으로 빠르고 간편하게 표출하기 위한 방법을 제안한다.

Development of 3D Medical Image Processing System using VTK (VKT를 이용한 3차원 의료영상처리 시스템)

  • 김민석;옥경달;이상범;탁계래
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.10d
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    • pp.442-444
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    • 2002
  • 의료영상의 시각화는 의료정보 시스템에서 질환 진단시 유용하게 사용되고 있다. 특히, 2차원 의료영상의 3차원 가시화를 통한 모의 견습은 실전에서의 부담감을 줄이는데 큰 역할을 하고 있고 이러한 결과는 관련 S/W 개발로 이어지고 있다. 본 논문에서는 의료영상을 여러 형태로 가시화하는 방법과 그 구현 결과에 대해서 기술한다. 구현은 공개 라이브러리인 VTK를 이용함으로써 기존의 유사한 S/W에 비해 가격 경쟁력 또한 갖추고 있다.

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