• 제목/요약/키워드: Trichormus

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Morphological and Molecular Analyses of $Anabaena$ $variabilis$ and $Trichormus$ $variabilis$ (Cyanobacteria) from Korea

  • Choi, Gang-Guk;Yoon, Sook-Kyung;Kim, Hee-Sik;Ahn, Chi-Yong;Oh, Hee-Mock
    • 환경생물
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    • 제30권1호
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    • pp.54-63
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    • 2012
  • This study characterizes three $Anabaena$ strains and 5 $Trichormus$ strains isolated from Korean waters and 3 $Anabaena$ $flos-aquae$ strains procured from the UTEX based on morphological features and molecular analyses. The $Anabaena$ and $Trichormus$ isolates were morphologically assigned to $A.$ $variabilis$ K$\ddot{u}$tzing and $T.$ $variabilis$(K$\ddot{u}$tzing ex Bornet et Flahault) Kom$\acute{a}$rek et Anagnostidis, respectively. The $Anabaena$ and $Trichormus$ strains differed significantly in the mean length of their vegetative cells. The 16S rRNA genes from the $Anabaena$ strains showed a 100% identity to that from $A.$ $variabilis$ ATCC 29413, while the 16S rRNA genes from the $Trichormus$ strains showed a 99.9% identity to that from $T.$ $variabilis$ GREIFSWALD. The overall topology was in agreement for the 16S rRNA gene and $cpcBA$-IGS trees in the both tree-constructing methods. In a neighbor-joining tree based on the 16S rRNA gene, the 3 $Anabaena$ strains were asso-ciated with $A.$ $variabilis$, the 5 $Trichormus$ strains with $T.$ $variabilis$, and the 3 $Anabaena$ (UTEX) strains were with $Nostoc$. To date, this is the first report on $A.$ $variabilis$ and $T.$ $variabilis$ strains originating from Korea.

Cyanobacterial Diversity Shifts Induced by Butachlor in Selected Indian Rice Fields in Eastern Uttar Pradesh and Western Bihar Analyzed with PCR and DGGE

  • Kumari, Nidhi;Narayan, Om Prakash;Rai, Lal Chand
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권1호
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    • pp.1-12
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    • 2012
  • The present study examines the effects of 30 mg/kg butachlor on the cyanobacterial diversity of rice fields in Eastern Uttar Pradesh and Western Bihar in India. A total of 40 samples were grouped into three classes [(i) acidic, (ii) neutral, and (iii) alkaline soils], based on physicochemical and principle component analyses. Acidic soils mainly harbored Westillopsis, Trichormus, Anabaenopsis, and unicellular cyanobacteria; whereas Nostoc, Anabaena, Calothrix, Tolypothrix, and Aulosira were found in neutral and alkaline soils. Molecular characterization using 16S rRNA PCR and DGGE revealed the presence of 13 different phylotypes of cyanobacteria in these samples. Butachlor treatment of the soil samples led to the disappearance of 5 and the emergence of 2 additional phylotypes. A total of 40 DGGE bands showed significant reproducible changes upon treatment with butachlor. Phylogenetic analyses divided the phylotypes into five major clusters exhibiting interesting links with soil pH. Aulosira, Anabaena, Trichormus, and Anabaenopsis were sensitive to butachlor treatment, whereas uncultured cyanobacteria, a chroococcalean member, Westillopsis, Nostoc, Calothrix, Tolypothrix, Rivularia, Gloeotrichia, Fischerella, Leptolyngbya, and Cylindrospermum, appeared to be tolerant against butachlor at their native soil pH. Butachlor-induced inhibition of nitrogen fixation was found to be 65% (maximum) and 33% (minimum) in the soil samples of pH 9.23 and 5.20, respectively. In conclusion, low butachlor doses may prove beneficial in paddy fields having a neutral to alkaline soil pH.

알긴산염 마이크로캡슐 내부에 동결보존된 사상체 남세균의 특성 연구 (Characterization of Filamentous Cyanobacteria Encapsulated in Alginate Microcapsules)

  • 박미례;김지훈;남승원;이상득;윤석민;권대률;이창수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.205-214
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    • 2020
  • 남세균은 수계나 토양 생태계에서 질소 고정 능력으로 인해 질소순환 과정에 중요한 역할을 하는 미생물로 다양한 산업분야에서 활용될 수 있는 유용 물질을 생산할 수 있다. 또한 일부 종은 수생태계에서 유해조류 번성을 일으켜 수자원의 이용을 제한한다. 일반적으로 생물소재은행은 관련 연구를 위해 남세균 배양주를 제공하는 역할을 한다. 하지만 국내 생물소재은행에서는 남세균의 체계적인 보존이 미비한 실정이다. 본 연구에서는 국내에서 분리한 Trichormus variabilis (syn. Anabaena variabilis)를 대상으로 알긴산 마이크로캡슐을 이용한 동결보존기술을 개발하였다. 동결보존제만 사용하는 일반 동결보존법과 세포를 마이크로캡슐에 포집한 후 동결보존제를 혼합하는 두 가지 방법으로 실험을 수행하였고 각각의 효율을 비교하였다. T. variabilis 동결보존 후 35일간 재배양하여 세포수를 비교한 결과 두 가지 동결보존법 모두 재생에 성공하였으며, 초기 농도 1.0 × 105 cells에서 마이크로캡슐 방법은 6.7 × 106 cells로, 일반 동결 보존법은 1.1 × 107 cells로 증가되었다. 또한 배양 14일 후 T. variabilis 세포의 부정형 형태를 발견하였다. 세포 소기관을 관찰하기 위해 투과전자현미경(TEM) 분석을 하였고 lacunae와 lipid body의 크기가 줄어든 것을 확인하였다. 세포 형태와 관련된 mreB 유전자가 동결보존 전에 비해 동결 보존 후 발현량이 54.7%로 감소된 것을 확인하였다. 본 연구결과를 통해 향후 사상성 남조류에 대하여 보존제와 마이크로캡슐을 이용한 동결보존이 가능할 것으로 기대된다.