• 제목/요약/키워드: Tobacco Mosaic Virus

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토마토 종자와 식물체로부터의 TMV, ToMV 및 CMV 검출 (Detection of TMV, ToMV, and CMV from Tomato Seeds and Plants)

  • 박경훈;차병진
    • 식물병연구
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    • 제8권2호
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    • pp.101-106
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    • 2002
  • 시판중인 18품종의 토마토 종자에 대하여 TMV, ToMV, CMV의 오염률과 종자 전반률을 조사한 결과 TMV와 ToMV는 각각 9품종에서 오염이 확인되었으며, CMV는 3품종에서 바이러스 오염을 확인하였다. TMV는 3.8%로 가장 높은 오염률을 보였고, ToMV는 2.6%, CMV는 1.4%의 오염률을 보였다. 자연적인 종자 전반률을 조사한 결과, 공시한 9품종의 토마토종자에서 ToMV는 3품종에서 4.4%, CMV는 4품종에서 2.2%의 종자 전반률을 확인할 수 있었으며, TMV는 본실험에서는 종자 전반을 확인할 수 없었다. 1999년 10월부터 2000년 10월까지 충청북도 주요 토마토 재배지역에서 TMV, ToMV CMV의 지역별 바이러스 감염률과 병정별 감염률 및 생육시기에 따른 세 바이러스의 감염률을 조사한 결과, 각 지역의 토마토 포장에서는 잎말림, 괴저 및 왜화 등의 다양한 병징을 보였으며, 대부분의 포장에서 잎말림 증상이 관찰되었으며, 모자이크 증상과 누렁증상 등의 병징도 많이 관찰되었으며, 로꾸산마루 품종에서 다양한 병징이 관찰되었다. 지역별로는 옥산 지역의 로꾸산마루 포장과 가금지역의 꼬꼬 포장 및 노은지역의 로꾸산마루 포장에서 TMV와 ToMV 및 CMV의 감염률이 높았으며, ToMV의 감염률은 가금지역의 꼬꼬 포장에서 43.3%로 가장 높았으며, CMV의 감염률은 노은지역의 로꾸산마루 포장에서 40.0%로 다른 포장보다 높았다. 병징에 따른 바이러스의 감염률은 누렁증상을 보이는 병징에서 ToMV가 가장 높았고, 괴저 증상을 보이는 잎에서는 CMV가 가장 높았으며, 잎말림 과총생 및 얼룩무늬 등 대부분의 병정에서 ToMV의 감염을 확인하였고, TMV의 감염률은 낮았다. 생육단계별에 따른 바이러스 감염률을 조사한 결과 생육초기보다 생육중기와 후기가 바이러스의 오염률이 높았으며, 생육중기와 생육후기의 감염률은 차이가 없었다.

Characteristics of Potato virus Y Isolated from Paprika in Korea

  • Choi, Hong-Soo;Ko, Sug-Ju;Kim, Mi-Kyeong;Park, Jin-Woo;Lee, Su-Heon;Kim, Kook-Hyung;Were, Hassan Karakacha;Chois, Jang-Kyung;Takanami, Yoichi
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권4호
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    • pp.349-354
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    • 2005
  • A virus isolate collected from infected paprika (Capsicum annuum var. grossum) was characterized as Potato virus Y (PVY) based on biological, serological, cytopathological, and molecular properties. In host range studies, the paprika isolate produced the mosaic symptom on some tobacco, tomato and pepper (Capsicum annuum). A new paprika isolate also infected potato cultivars which is different biological characteristic compared to the other popular potyvirus infecting paprika, Pepper mottle virus (PepMoV). Previously reported PVY strains, $PVY^o$ and $PVY^N$ did not infect pepper and typical PepMoV isolates did not infect potato. Distinctive inclusion patterns of the scroll, pinwheel, long laminated inclusions, and helper components in the cytoplasm of infected cells were also different to those observed by the typical PVY isolate infections. However, the paprika isolate reacted to the monoclonal antibody of $PVY^N$ strain with high absorbance readings. RT-PCR amplification, cloning, and sequencing of the 3' untranslated region and a part of coat protein gene also added additional evidence of the paprika isolate as the $PVY^N$-related isolate. Multiple alignments as well as cluster dendrograms of PVY-paprika isolate revealed close phylogenetic relationship to the $PVY^N$ subgroup. Altogether, these results suggest that a new PVY isolate infecting paprika contained distinct characteristics compared to the other previously described PVY strains with closer relationship to the $PVY^N$ strain.

Acinetobacter antiviralis sp. nov., from Tobacco Plant Roots

  • Lee, Jung-Sook;Lee, Keun-Chul;Kim, Kwang-Kyu;Hwang, In-Cheon;Jang, Cheol;Kim, Nam-Gyu;Yeo, Woon-Hyung;Kim, Beom-Seok;Yu, Yong-Man;Ahn, Jong-Seog
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권3호
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    • pp.250-256
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    • 2009
  • Acinetobacter strain $KNF2022^T$ was isolated from tobacco plant roots during the screening of antiviral substances having inhibitory effects on Tobacco mosaic virus (TMV) and examined by phenotypic, chemotaxonomic, and genetic characterization. It was a nonmotile, Gram-negative bacterium. This strain contained Q-9 as the main respiratory quinone. The major cellular fatty acids of the isolate were 16:0, 18:1 w9c, and 16:1 w7c/15 iso 2OH. The DNA base composition was 44 mol%. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA sequence revealed that the isolate formed an evolutionary lineage distinct from other Acinetobacter species. Based on the evaluation of morphologic, physiologic, and chemotaxonomic characteristics, DNA-DNA hybridization values, and 16S rRNA sequence comparison, we propose the new species Acinetobacter antiviralis sp. nov., the type strain of which is $KNF2022^T$ (=KCTC $0699BP^T$).

2008년 우리나라 주요 작물 바이러스병 발생 상황 (Occurrence of Virus Diseases on Major Crops in 2008)

  • 김정수;이수헌;최홍수;김미경;곽해련;조점덕;최국선;김진영
    • 식물병연구
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    • 제15권1호
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    • pp.1-7
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    • 2009
  • Viruses diagnosed on crops including rice plants from farmers or agricultural extension agencies cover the country were 11 species including Broad bean wilt virus 2 (BBWV2) in 2008. Tomato spotted wilt virus (TSWV) was the most important virus having the detection rate of 22.9%. Two viruses of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) and Tobacco leaf curl virus (TLCV) inducing leaf yellow and curl diseases on tomatoes were occurred newly with the detection rate of 12.2% and 4.0%, respectively, in 2008. Rice stripe virus (RSV) was occurred on 869.5 ha mainly at Jindo and Haenam areas in Jeollanamdo province. At Jindo area, 12 plots were damaged severely with the infected hill rate of 83.8%. At the main production area of oriental melon at Seongju, almost all fruits from whole sale market at Seongju were infected with Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) as the detection rate of 87%. The areas occurred TSWV in Korea were 25 totally from 2003 including 7 areas newly reported in 2008 including Naju in Jeoallanamdo. TSWV could be reduced as 0.1 % from 5.3% by covering insect proof net in vinyl house after chemical soil sterilization. Tomato yellow leaf curl disease was occurred on April in 2008 at Tongyoung area in Kyeongsangnamdo, and detected continuously at 13 areas, 7 in Kyeongsangnamdo, 4 in Jeollabukdo and 2 in Jejudo. Potato spindle tuber viroid (PSTVd) was occurred abruptly in a confined space of a civil breeding greenhouse and a cultivar evaluation field followed by disuse 17.4 M/T of potato tubers. No PSTVd was detected at 17 fields cultivated the related potatoes to the bred company by RT-PCR.

Tomato Golden Mosaic Virus(TGMV) AL1 -gene의 antisense RNA 발현 형질 전환 식물체 (Transgenic Plants Expressing an Antisense RNA of ALl-Gene from Tomato Golden Mosaic Virus(TGMV))

  • 임성렬
    • 식물조직배양학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.147-152
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    • 1998
  • AL1-gene은 TGMV의 복제에 매우 중요한 역할을 하고 있다. 이 AL1 gene의 발현을 억제하기 위해서는 식물체내에서 AL1 gene의 antisense RNA의 발현에 의한 억제가 효과적 방법 중에 하나로 알려져 있다. 이런 발현을 식물체내에서 실현시키기 위해 hygromycin 저항성 유전자에 antisense AL1-gene을 연결시키고, 연결된 부위를 CaMV35s-promoter와 octopine synthase gene terminator 사이에 연결시켰다. 이 유전자 발현 단위 부분을 다시 kanamycin 저항성 유전자 발현 단위 부분을 지니고 있는 형질 전환 벡터인 pBinAR에 삽입시켜 새로운 형질 전환 벡터인 pAR35-2를 개발하였다. 이 벡터를 Agrobacterium tumefaciens LBA4404에 형질전환 시킨 다음, 토마토와 담배 잎사귀 조직에 감염시켜 식물체들을 kanamycin과 hygromycin이 함유된 배지위에서 배양하여 형질전환된 식물체들을 선발하였다. 형질 전환된 식물체들로부터 antisense AL1-gene 및 antisense RNA를 각각 PCR 및 RT-PCR를 이용한 southern hybridization 방법을 이용하여 증명하였고, 토마토 식물체의 공변세포쌍 내에 있는 엽록체 숫자가 여덟 개라는 것이 확인되어 형질 전환된 토마토 식물체가 2 배수체로서 정상적인 식물체라는 것을 증명하였다. 이러한 형질 전환 식물체는 앞으로 항 바이러스성 형질을 지니는 식물체들을 개발하는 데 많은 도움을 주리라 여겨 진다. 그리고, 본 연구에서 제조된 벡터 pAR35-2는 두 개의 항생제에서 동시 선발 할 수 있도록 되어 있고 promoter가 두 개로 되어 있어 형질 전환 식물체선발 및 유전자 발현 연구에 효과적으로 이용되어 질 수 있으리 라 여겨진다.

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우리나라 감자에 발생하는 PVY의 병원학적 특성 및 외피단백질 유전자 분석 (Etiological Properties and Coat Protein Gen Analysis of Potato Virus Y Occuring in Potatoes of Korea)

  • 정승룡
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 1995년도 Proceedings of special lectures on Molecular Biological Approaches to Plant Disease National Agricultural Science and Technology Institute Suwon, Korea
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    • pp.77-96
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    • 1995
  • To obtain basic informations for the improvement of seed potato production in Korea, some etiological properties of potato virus Y(PVY) distributed in the major seed potato production area(Daekwanryeong) were characterized, and the nucleotide and amino acid sequences of the coat protein gene of the PVY strains isolated were analyzed. PVY strains in Daekwonryeong, an alpine area, were identified to be two strains, PVYo and PVYN by symptoms of indicator plants, and their distribution in potato fields was similar. Major symptom on potato varieties by PVY was grouped as either mosaic alone or mosaic accompanied with veinal necrosis in the lower leaves. The symptom occurrence of the two symptoms was similar with Irish Cobbler, but Superior showed a higher rate of mosaic symptom than the other. The PVY strain which was isolated from potato cv. Superior showing typical mosaic symptoms produced symptoms of PVY-O on the indicator plants of Chenopodium amaranticolor, Nicotiana tabacum cv. Xanthi nc and Physalis floridana, but no symptom o Capsicum annum cv. Ace. Moreover, results from the enzyme-linked immunosorbent assay with monoclonal and polyclonal antibodies showed that the isolated PVY reacts strongly with PYV-O antibodies but does not react specifically with PVY-T antibodies. The purified virus particles were flexious with a size of 730$\times$11nm. On the basis of the above characteristics, the strain was identified to be a PVY-O and named as of PVY-K strain. The flight of vector aphids was observed in late May, however, the first occurrence of infected plants was in mid June with the bait plants surrounded with PVY-infected potato plants and early July with the bait plants surrounded with PVY-free potato plants. PVY infection rates by counting symptoms on bait plants (White Burley) were 1.1% with the field surrounded with PVY-free potato plants and 13.7% the fields surrounded with PVY-infected potato plants, showing the effect of infection pressure. The propagated PVY-K strain on tobacco(N. sylvestris) was purified, and the RNA of the virus was extracted by the method of phenol extraction. The size of PVY-K RNA was measured to be 9, 500 nucleotides on agarose gel electrophoresis. The double-stranded cDNAs of PVY-K coat protein(CP) gene derived by the method of polymerase chain reaction were transformed into the competent cells of E. coli JM 109, and 2 clones(pYK6 and pYK17) among 11 clones were confirmed to contain the full-length cDNA. Purified plasmids from pYK17 were cut with Sph I and Xba I were deleted with exonuclease III and were used for sequencing analysis. The PVY-K CP gene was comprised of 801 nucleotides when counted from the clevage site of CAG(Gln)-GCA(Ala) to the stop codon of TGA and encoded 267 amino acids. The molecular weight of the encoded polypeptides was calculated to be 34, 630 daltons. The base composition of the CP gene was 33.3% of adenine, 25.2% of guanine, 20.1% of cytosine and 21.4% of uracil. The polypeptide encoded by PVY-K CP gene was comprised of 22 alanines, 20 threonines, 19 glutamic acids and 18 glycines in order. The homology of nucleotide sequence of PVY-K CP gene with those of PVY-O(Japan), PVY-T(Japan), PVY-TH(Japan), PVYN(the Netherlands), and PVYN(France) was represented as 97.3%, 88.9%, 89.3%, 89.6% and 98.5%, respectively. The amino acid sequence homology of the polypeptide encoded by PVY-K CP gene with those encoded by viruses was represented as 97.4%, 92.5%, 92.9%, 92.9%, and 98.5%, respectively.

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A Lectin with Mycelia Differentiation and Antiphytovirus Activities from the Edible Mushroom Agrocybe aegerita

  • Sun, Hui;Zhao, Chen Guang;Tong, Xin;Qi, Yi Peng
    • BMB Reports
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    • 제36권2호
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    • pp.214-222
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    • 2003
  • A lectin named AAL has been purified from the fruiting bodies of the edible mushroom Agrocybe aegerita. AAL consisted of two identical subunits of 15.8 kDa, its pI was about 3.8 determined by isoelectric focusing, and no carbohydrate was discerned. Being treated by pyrogultamate aminopeptidase, the blocked N-terminus of AAL was sequenced as QGVNIYNI. AAL agglutinated human and animal erythrocytes regardless of blood type or animal species. Its hemagglutinating activity was unaffected by acid or alkali treatment and demetalization or addition of divalent metals $Mg^{2+}$, $Ca^{2+}$ and $Zn^{2+}$. AAL was toxic to mice: its LD50 was 15.85 mg per kilogram body weight by intraperitoneal injection. In this study, two novel activities of AAL were proved. It showed inhibition activity to infection of tobacco mosaic virus on Nicotiana glutinosa. The result of IEF suggested that AAL attached to TMV particles. Mycelia differentiation promotion was the other interesting activity. AAL promoted the differentiation of fruit body primordia from the mycelia of Agrocybe aegerita and Auricularia polytricha. AAL antiserum was prepared and immunologically cross-reactived with several proteins from five other kinds of mushrooms. These results suggested that AAL probably was a representative of a large protein family, which plays important physiological roles in mushroom.

시판 고추 종자에서 분리한 Tobamovirus의 병원형 (Pathotype of Tobamovirus Isolates from Commercial Red Pepper Seeds)

  • 한정헌;이철호;나용준
    • 원예과학기술지
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    • 제19권4호
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    • pp.530-534
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    • 2001
  • Nicotiana glutinosa를 이용한 단병반 분리를 통하여 30품종의 시판 고추종자로부터 모두 23개의 Tobamovirus 분이주(分離株)를 얻었다. 병원형(病原型) 판별(判別)고추를 사용하여 조사한 이들 분이주(分離株)의 병원형(病原型)은 P0 또는 P1,2형으로 나타났으며 P1과 P1,2,3형은 관찰되지 않았다. 시판고추 중 한 종류를 제외한 모든 품종이 P0와 P1 병원형에 대해서는 저항성을 보였고 P1,2형에는 모두 감수성이었다. Tobamovirus 병원형(病原型)에 관한 연구결과는 앞으로 우리나라 고추의 Tobamovirus 저항성육종(抵抗性育種)과 Tobamovirus 무감염(無感染) 고추종자의 생산에 널리 이용될 수 있을 것으로 생각된다.

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고추냉이에서 분리한 담배 모자이크 바이러스(TMV-W)의 전체 유전자 염기서열 분석 (Complete Nucleotide Sequence of Tobacco Mosaic Virus Isolated from Wasabi(Eutrema wasabi Maxim.))

  • 이귀재
    • 한국자원식물학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.82-88
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    • 2003
  • 고추냉이에 모자이크 병징을 나타내는 이병주로부터 고추냉이 모자이크 바이러스를 분리하였다. 고추냉이 모자이크 바이러스의 genomic RNA를 추출하여 전체 유전자 구조를 결정하였다. 유전자 전체길이는 6,298 염기를 가지고 있었으며, 4개 ORF로 구성 되어 있었다. ORF 1은 180KD 단백질, ORF 2는 130KD 단백질 , ORF 3은 30KD 단백질, ORF4는 18KD로 외피단백질로 구성되어 있었다. ORF 유전자간에는 ORF4와 ORF 3 유전자간 130개의 염기, ORF 2와 ORF 3 유전자갈 20개 염기 그리고 ORF 1 과 ORF2 유전자간에는 40개의 염기로 overlaps되어 있었다 3'NCR부분은 238개 염기, 외피단백질은 537개 염기, 30KD 이동단백질은 825개 염기, 130KD 단백질은 1,896개 염기와 180k단백질의 2,958개의 염기로 구성되어 있었다. TMV-WTF전체 염기 서열의 유전자 상동성에서는 비교 유전자에서 미보고된 일본의 TMV-WSF와 러시아의 TMV-crucifer와 각각 98.6%와 82.4%로 매우 높았다.

2010년 우리나라 주요 작물 바이러스병 발생 상황 (Occurrence of Virus Diseases on Major Crops in 2010)

  • 김정수;이수헌;최홍수;김미경;곽해련;남문;김정선;최국선;조점덕;조인숙;정봉남
    • 식물병연구
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    • 제17권3호
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    • pp.334-341
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    • 2011
  • 2010년 농업현장의 농업인 등이 임상진단 요청한 시료 중 채소류는 고추 등 8개 작물이었으며 이중 토마토가 31.8%, 수박 21.4%, 고추 19.5%로 바이러스병으로 인한 피해가 많은 작물이었다. 과수류는 사과 등 4작물이었으며, 포도가 63.6%, 사과 33.0%로서 임상진단 요청시료의 대부분을 차지하였다. 화훼류는 국화 등 6개 작물이었으며, 튜립 60.0%, 선인장이 20.0%로 바이러스 피해가 발생하고 있었다. 바이러스 감염시료를 분석한 결과 고추와 토마토는 CMV, BBWV2 등 6종의 바이러스가 감염되었으며, 수박은 MNSV, CMV 등 5종의 바이러스가 감염되었다. 포도는 GFkV 등 6종의 바이러스가 감염되었다. 바이러스 종류별 감염은 CMV가 8종의 채소류 중 6종의 채소류와 튜립에 감염되었다. 2010년 농업현장에서 임상진단한 시료에 감염된 바이러스는 32종이었으며, 바이로이드는 4종이었다. 토마토황화잎말림바이러스(TYLCV)는 2010년 전북 부안 등 6개 도 18개 시 군에 신규로 발생되어 2008년 처음 발생된 이후 총 58개 시 군으로 확산되었다. 토마토원형반점바이러스(TSWV)는 2010년 전북진안, 제주도의 제주 지역에서 신규로 발생하였으며, 2004년 안양 관양동 지역에 대 발생한 이후 25개 시 군에 확산되었으나, 경북 및 충북 지역에서는 현재까지 발생하지 않았다. 토마토덤불위축바이러스(TBSV)는 2010년 경남진주 지역에 신규로 발생하여 2004년 경남 사천지역에 처음 발생한 이후 경남 충북 지역의 5개 시 군에 발생 하였다.