• 제목/요약/키워드: Thymine

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Theoretical Studies on the Photochemical Reaction of Psoralen with Purine and Pyrimidine Base

  • Kim Ja Hong;Sohn Sung Ho
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제13권2호
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    • pp.173-176
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    • 1992
  • The spectroscopic studies of the 5,7-dimethoxycoumarin(5,7-DMC) and 4,5',8-trimethylpsoralen(TMP) and the conformational stability of 5,7-DMC-thymidine, 4,5',8-TMP-thymine were carried out by the CNDO/S and molecular mechanics calculation. Theoretical transition energies and direction of polarizations calculated by the CNDO/S method have been used for the interpretation of the observed results. The calculated absorption spectra of 5,7-DMC are qualitatively similar to experimental ones with their characteristic visible bands. MM2 force field calculation on the possible $C_4-cyclophotoadducts$ formed between 5,7-DMC and thymidine through a cycloaddition. of $C_3$, $C_4$ bond of 5,6-DMC to $C_5$, $C_6$ bond of thymidine showed the most stable photocycloadduct to have the anti-head to tail configuration. The major photoadduct of 4,5',8-TMP-thymine has the cis-anti configuration.

分子軌道論의 生物化學에의 應用 (第 2 報). 發癌物質과 DNA 鹽基와의 相互作用 (Application of Molecular Orbital Theory to Biological chemistry (II). Interactions of Chemical Carcinogens with DNA Bases)

  • 김호순;박윤열;박병각
    • 대한화학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.280-287
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    • 1980
  • 發癌物質과 DNA 鹽基雙間의 分子錯物形成에서 可能性있는 配置(orientation)를 決定하였다. 아데닌-티민 염기쌍에서는 티민쪽에서, 구아닌-시토신 염기쌍에서는 구아닌쪽에서 分子錯物을 形成한다.

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한국인에서 DNMT3b 유전자 다형성과 위암의 감수성 (DNMT3b Promoter Polymorphism and Risk of Gastric Cancer in the Korean Population)

  • 김성근;정헌;김신선;전경화;송교영;김진조;진형민;김욱;박조현;박승만;임근우;김승남;전해명
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제7권1호
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    • pp.9-15
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    • 2007
  • 목적: DNA 메틸화는 암 발생과정에 있어 중요한 기전 중 하나이다. DNA 메틸화는 DNMT (DNA methyltransferase)에 의해 매개되는데 이중 DNMT3b가 암세포에서 주로 암억제 유전자의 메틸화 정도롤 조절하는 것으로 알려져 있다. 저자들은 DNMT3b 유전자의 촉진자의 다형성과 한국인에서 위암발생의 연관성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 2001년 12월에서 2002년 12월까지 가톨릭대학교 성모병원에서 위암으로 진단받고 위 절제술을 받은 사람 중에서 176명과 같은 기간동안 내시경 검사를 시행했던 사람들 중 위암과 관련이 없는 경우 70명을 대상으로 하였다. DNMT3b 촉진자 다형성은 연쇄효소중합반응과 제한분절 길이 다형성 분석으로 유전형을 관찰하였다. 위암 환자에서 대립유전자 및 유전자형을 대조군과 비교하여 이런 다형성이 한국인에서 위암의 감수성을 증가시키는가에 대하여 연구하였다. 결과: DNMT3b 촉진자의 유전형은 환자군에서 14.8% (CC), 71.6% (CT), 13.6% (TT)를 보였고, 대조군에서 40% (CC), 42.9% (CT), 17.1% (TT)를 보였다. CT 이종접합체군에서 약 4.5배(OR 2.13; 95% CI, 2.324~8.803), TT 동종접합체군에서는 약 2.2배(교차비 1.42; 95% 신뢰구간, 0.899~5.165)의 위암발생률의 증가를 보였다. T 변이체 전체로는 약 3.8배의 위험률 증가를 보였다(교차비 1.88; 95%신뢰구간 2.040~7.251). 위암의 병기나 조직학적 소견, Helicobacter pylori 감염과는 유의한 관계를 보이지 않았다. 결론: DNMT3b 촉진자의 다형성은 T 변이체에서 한국인에서 위암 발생 위험도를 증가시킨다. 이러한 다형성과 위암의 병기, 조직학적 유형, Helicobacter pylori 감염과는 관련이 없었다.

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An improved synthesis of 2'-fluoro-2'-deoxyarabinofuranosyl pyrimidine nucleosides

  • Chun, Moon-Woo
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제6권1호
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    • pp.79-81
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    • 1983
  • Several potent anti-herpes virus nucleosides, 2'fluoro-2'-deoxyarabinofuranosyl pyrimidine nucleosides, were prepared in good yields by a new condensation method using sodium iodide and a new solvent system, and FMAU could be also prepared directly from thymine by this method.

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Extract of Ettlia sp. YC001 Exerts Photoprotective Effects against UVB Irradiation in Normal Human Dermal Fibroblasts

  • Lee, Jeong-Ju;An, Sungkwan;Kim, Ki Bbeum;Heo, Jina;Cho, Dae-Hyun;Oh, Hee-Mock;Kim, Hee-Sik;Bae, Seunghee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권4호
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    • pp.775-783
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    • 2016
  • The identification of novel reagents that exert a biological ultraviolet (UV)-protective effect in skin cells represents an important strategy for preventing UV-induced skin aging. To this end, we investigated the potential protective effects of Ettlia sp. YC001 extracts against UV-induced cellular damage in normal human dermal fibroblasts (NHDFs). We generated four different extracts from Ettlia sp. YC001, and found that they exhibit low cytotoxicity in NHDFs. The ethyl acetate extract of Ettlia sp. YC001 markedly decreased UVB-induced cytotoxicity. Additionally, the ethyl acetate extract significantly inhibited the production of hydrogen peroxide-induced reactive oxygen species. Moreover, it inhibited UVB-induced thymine dimers, as confirmed by luciferase assay and thymine dimer dot-blot assay. Thus, the study findings suggest Ettlia sp. YC001 extract as a novel photoprotective reagent on UVB-induced cell dysfunctions in NHDFs.

유전알고리즘과 DNA 코딩을 이용한 Numeric 패턴인식 (Numeric Pattern Recognition Using Genetic Algorithm and DNA coding)

  • 백동화;한승수
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제13권1호
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    • pp.37-44
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    • 2003
  • 본 논문은 DNA coding 방법과 Genetic Algorithm(GA)을 사용하여 numeric(0~9) 패턴인식 성능을 비교 평가하였다. 이진스트링의 개체 집단 위에서 모의진화를 일으켜 효율적으로 최적 해를 탐색하는 GA와, 생체 분자인 DNA를 계산의 도구 및 정보 저장도구로 사용하며, Adenine(A), Cytosine(C), Guanine(G), Thymine(T)등의 4가지 염기를 사용하는 DNA coding 방법을 이용하여 numeric 패턴인식을 수행하였다. DNA coding 방법과 GA의 성능을 비교 평가하기 위해서 selection, crossover, mutation 등의 GA연산자를 DNA coding에 동일하게 적용하였다. 실험결과, DNA coding 방법은 GA보다 효과적으로 패턴인식을 수행하였다. GA에 비해 DNA coding 방법의 장점은 스트링의 길이가 가변적이고 해의 중복성을 가지며, 4가지 염기를 이용하기 때문에 해 표현이 다양함을 가지고 있다.

DNA 코딩과 진화연산을 이용한 함수의 최적점 탐색방법 (Global Optimum Searching Technique Using DNA Coding and Evolutionary Computing)

  • 백동화;강환일;김갑일;한승수
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제11권6호
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    • pp.538-542
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    • 2001
  • DNA computing 은 Adleman 실험 이후에 많은 여러 가지 최적화 문제에 적용되어 왔다. DNA computing의 장점은 스트링의 길이가 가변적이고 4가지 염기를 이용하기 때문에 복잡한 문제에 전역 최적점을 찾는데 기존의 다른 방법보다는 효율적이라는것이다. 본 논문에서는 이진 스트링의 개체 지단 위에서 모의진화를 일으켜 효율적으로 최적 해를 탐색하는 GA(Genetic Algorithms)와 생체 분자와 DNA를 계산의 도구 및 정보 저장도구로 사용하여 A(Adenine). C(Cytosine), G(Guanine), T(Thymine)등의 4가지 염기를 사용하는 DNA 코딩방법을 이용하여multi-modal 함수의 전역 최적점을 탐색하는 문제에서의 각각의 성능을 조사하였다. Selection, crossover, mutation등의 GA연산자를 DNA를 코딩에 동일하게 적용하였으며 최적의 해를 탐색하는데 걸리는 시간과 찾아낸 최적해의 값을 평가한다.을 평가한다.

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