A Corynebacterium diphtheriae iron-repressible gene dirA, that was homologous to TSA of Saccharomyces cerevisiae and AhpC subunit of Salmonella typhimurium alkyl hydroperoxide reductase, was amplified with PCR and expressed in E. coli. The DirA purified from the transformed E. coli crude extracts prevented the inactivation of enzyme caused by metal-catalyzed oxidation (MCO) system containing thiols but not by ascorbate/Fe$^{3+}$/$O_2$ MCO system. The DirA concentration, which inhibited the inactivation of glutamine synthetase by 50% (IC$_{50}$) against MCO system, was 0.12 mg/ml. The multimeric forms of DirA were converted to the monomeric form in SDS-PAGE under the thioredoxin system comprised of NADPH, Saccharomyces cerevisiae thioredoxin reductase, and thioredoxin. Also, DirA showed thioredoxin dependent peroxidase activity. All of these results were consistent with the characteristics of a thiol specific antioxidant (TSA) protein having two conserved cysteine residues.
Proceedings of the Korea Crystallographic Association Conference
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2003.05a
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pp.18-18
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2003
Thioredoxin (Trx) is a small redox protein that is ubiquitously distributed from achaes to human. In diverse organisms, the protein is involved in various physiological roles by acting as electron donor and regulators of transcription and apoptosis as well as antioxidants. Sequences of Trx within various species are 27~69% identical to that of E. coli and all Trx proteins have the same overall fold, which consists of central five β strands surrounded by four α helices. The N-terminal cysteine in WCGPC motif of Trx is redox sensitive and the motif is highly conserved. Compared with general cysteine, the N-terminal cysteine has low pKa value. The result leads to increased reduction activity of protein. Recently, novel thio.edoxin-related protein (TRP14) was found from rat brain. TRP14 acts as disulfide reductase like Trx1, and its redox potential and pKa are similar to those of Trx1. However, TRP14 takes up electrons from cytosolic thioredoxin reductase (TrxR1), not from the mitochondrial thioredoxin reductase (TrxR2). Biological roles of TES14 were reported to be involved in regulating TNF-α induced signaling pathways in different manner with Trx1. In depletion experiments, depletion of TRP14 increased TNF-α induced phosphorylation and degradation of IκBα more than the depletion Trx1 did. It also facilitated activation of JNK and p38 MAP kinase induced by TNF-α. Unlike Trx1, TRP14 shows neither interaction nor interference with ASK1. Here, we determined three-dimensional crystal structure of TRP14 by MAD method at 1.8Å. The structure reveals that the conserved cis-Pro (Pro90) and active site-W-C-X-X-C motif, which may be involved in substrate recognition similar to Trx1 , are located at the beginning position of strand β4 and helix α2, respectively. The TRP14 structure also shows that surface of TRP14 in the vicinity of the active site, which is surrounded by an extended flexible loop and an additional short a helix, is different from that of Trx1. In addition, the structure exhibits that TRP14 interact with a distinct target proteins compared with Trx1 and the binding may depend mainly on hydrophobic and charge interactions. Consequently, the structure supports biological data that the TRP14 is involved in regulating TNF-α induced signaling pathways in different manner with Trx1.
Dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) belongs to the pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family including glutathione reductase and thioredoxin reductase. It catalyzes the reoxidation of dihydrolipoyl moiety of the acyltransferase components of three $\alpha$-keto acid dehydrogenase complexes and of the hydrogen-carrier protein of the glycine cleavage system. Isoleucine-51 of human E3, located near the active disulfide center Cys residues, is highly conserved in most E3s from several sources. To examine the importance of this highly conserved Ile-51 in human E3 function, it was substituted with Ala using site-directed mutagenesis. The mutant was expressed in Escherichia coli and highly purified using an affinity column. Its E3 activity was decreased about 100-fold, indicating that the conservation of the Ile-51 residue in human E3 was very important to the efficient catalytic function of the enzyme. Its altered spectroscopic properties implied that conformational changes could occur in the mutant.
The trace mineral, selenium (Se), is an essential nutrient of fundamental importance to human health. It is also very toxic and can cause Se poisoning (selenosis) in human and animals when its intake exceeds a suitable amount. Se functions within mammalian systems primarily in the form of solenoprotein. About 35 selenoproteins have been identified, though many have not yet been fully elucidated. Selenoproteins contain Se as selenocyseine (Sec) and perform variety of structural and enzymic roles; the enzymic roles are best-known as the antioxidants for hydrogen peroxides and lipid peroxides, and the catalysts for production of activity thyroid hormone. Glutathione peroxidases ($\textrm{GP}_X$) among the selenoproteins prevent the generation of free radicals and decrease the risk of oxidative damage to tissues, as does thioredoxin reductase (TR). TR also provides reducing power for several biochemical processes. Selenoproteins P and W are involved with oxidant defense in plasma and muscle, respectively, A selenoprotein is also required for sperm motility and may reduce the risk of miscarriage. Some epidemiological studies have revealed an inverse correlation between Se status and cardiovascular disease, and there is considerable evidence 1mm population com-parison data and animal studies that Se is anticarcinogenic. It is also suggested that Se should be needed for the proper functioning of the immune system, and appear to be a key nutrient in counteracting the development of virulence and inhibiting HIV progression to AIDS. As research continues, the role of selenium in the etiology of chronic diseases like appropriate medical nutrition therapy can be delivered and its effectiveness assessed. Se status in individuals is affected by diet and the availability of the Se. The Se content of plants is affected by the content and availability of the element in the soil in which they are grown, and so greatly varies from country to country, while the Se composition of meat reflects the feeding patterns of livestock. This paper provides an overview on Se as an essential trace mineral for human.
Um, Si-Hyeon;Kim, Jin-Sik;Song, Saemee;Kim, Nam Ah;Jeong, Seong Hoon;Ha, Nam-Chul
Molecules and Cells
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v.38
no.8
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pp.715-722
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2015
In Gram-negative bacteria in the periplasmic space, the dimeric thioredoxin-fold protein DsbC isomerizes and reduces incorrect disulfide bonds of unfolded proteins, while the monomeric thioredoxin-fold protein DsbA introduces disulfide bonds in folding proteins. In the Gram-negative bacteria Salmonella enterica serovar Typhimurium, the reduced form of CueP scavenges the production of hydroxyl radicals in the copper-mediated Fenton reaction, and DsbC is responsible for keeping CueP in the reduced, active form. Some DsbA proteins fulfill the functions of DsbCs, which are not present in Gram-positive bacteria. In this study, we identified a DsbA homologous protein (CdDsbA) in the Corynebacterium diphtheriae genome and determined its crystal structure in the reduced condition at $1.5{\AA}$ resolution. CdDsbA consists of a monomeric thioredoxin-like fold with an inserted helical domain and unique N-terminal extended region. We confirmed that CdDsbA has disulfide bond somerase/reductase activity, and we present evidence that the N-terminal extended region is not required for this activity and folding of the core DsbA-like domain. Furthermore, we found that CdDsbA could reduce CueP from C. diphtheriae.
Nanomaterials, which ranges in size from 1 to 100 nm, have been used to create uqnique devices at the nanoscale level possessing novel physical and chemical functional properties. However, the toxicities of nanomaterials have not been fully tested and the risk of nanomaterials is emerging issues in these days. In this study, the cytotoxicity of copper nanoparticles was tested in cultured human bronchial epithelial cells. As a results, copper nanoparticles showed cytotoxicity similar with cupric ion and the apoptotic mechanisms of DNA fragmentation and caspase-3 activation were involved. Induction of heme oxygenase-1 and thioredoxin reductase by copper nanoparticles indicated that cytotoxicity of copper nanoparticles is likely to be mediated through oxidative stress.
Manganese is a naturally occurring element which is widespread in the environment. Also, manganese is an essential trace element and plays a key role in important biological reactions catalyzed by enzymes. However, exposure to high levels of manganese can cause toxicity in neurone and inhalation system, also damage in various tissues. We investigated the toxicity induced by manganese compound ($MnCl_2$) in cultured rat cardiomyocytes. Treatment of manganese to cultured cardiomyocyte led to cell death, reactive oxygen species (ROS) increase, and cytosolic caspase-3 activation. The ROS increase was related with the decreased level of glutathione. Expressions of ROS related genes such as heme oxygenase-1, thioredoxin reductase, and NADH quinone oxidase were significantly induced in manganese treated cells. These results suggest that manganese induce oxidative stress and apoptosis in cardiomyocytes, and may be the one of risk factors to cause heart dysfunction in vivo.
Kim, Il-Sup;Moon, Hye-Youn;Yun, Hae-Sun;Jin, Ing-Nyol
Journal of Microbiology
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v.44
no.5
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pp.492-501
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2006
In this study, we attempted to characterize the physiological response to oxidative stress by heat shock in Saccharomyces cerevisiae KNU5377 (KNU5377) that ferments at a temperature of $40^{\circ}C$. The KNU5377 strain evidenced a very similar growth rate at $40^{\circ}C$ as was recorded under normal conditions. Unlike the laboratory strains of S. cerevisiae, the cell viability of KNU5377 was affected slightly under 2 hours of heat stress conditions at $43^{\circ}C$. KNU5377 evidenced a time-dependent increase in hydroperoxide levels, carbonyl contents, and malondialdehyde (MDA), which increased in the expression of a variety of cell rescue proteins containing Hsp104p, Ssap, Hsp30p, Sod1p, catalase, glutathione reductase, G6PDH, thioredoxin, thioredoxin peroxidase (Tsa1p), Adhp, Aldp, trehalose and glycogen at high temperature. Pma1/2p, Hsp90p and $H^+$-ATPase expression levels were reduced as the result of exposure to heat shock. With regard to cellular fatty acid composition, levels of unsaturated fatty acids (USFAs) were increased significantly at high temperatures ($43^{\circ}C$), and this was particularly true of oleic acid (C18:1). The results of this study indicated that oxidative stress as the result of heat shock may induce a more profound stimulation of trehalose, antioxidant enzymes, and heat shock proteins, as well as an increase in the USFAs ratios. This might contribute to cellular protective functions for the maintenance of cellular homeostasis, and may also contribute to membrane fluidity.
Most eukaryotic peroxiredoxins (Prxs) are readily inactivated by a high concentration of hydrogen peroxide ($H_2O_2$) during catalysis owing to their "GGLG" and "YF" motifs. However, such oxidative stress sensitive motifs were not found in the previously identified filamentous fungal Prxs. Additionally, the information on filamentous fungal Prxs is limited and fragmentary. Herein, we cloned and gained insight into Aspergillus nidulans Prx (An.PrxA) in the aspects of protein properties, catalysis characteristics, and especially $H_2O_2$ tolerability. Our results indicated that An.PrxA belongs to the newly defined family of typical 2-Cys Prxs with a marked characteristic that the "resolving" cysteine ($C_R$) is invertedly located preceding the "peroxidatic" cysteine ($C_P$) in amino acid sequences. The inverted arrangement of $C_R$ and $C_P$ can only be found among some yeast, bacterial, and filamentous fungal deduced Prxs. The most surprising characteristic of An.PrxA is its extraordinary ability to resist inactivation by extremely high concentrations of $H_2O_2$, even that approaching 600 mM. By screening the $H_2O_2$-inactivation effects on the components of Prx systems, including Trx, Trx reductase (TrxR), and Prx, we ultimately determined that it is the robust filamentous fungal TrxR rather than Trx and Prx that is responsible for the extreme $H_2O_2$ tolerence of the An.PrxA system. This is the first investigation on the effect of the electron donor partner in the $H_2O_2$ tolerability of the Prx system.
A unique Schizosaccharomyces pombe $TrxR^+$ gene encoding thioredoxin reductase (TrxR) was found to be positively regulated by stress-inducing agents through the stress-responsive transcription factor Pap1. In the present study, the protective roles of S. pombe TrxR were evaluated using the TrxR-overexpressing recombinant plasmid pHSM10. In the presence of hydrogen peroxide ($H_2O_2$) and superoxide anion-generating menadione (MD), S. pombe TrxR increased cellular growth and the total glutathione (GSH) level, while it reduced levels of intracellular reactive oxygen species (ROS). The nitric oxide (NO) levels of the TrxR-overexpressing cells, in the presence of $H_2O_2$ and MD, were maintained to be similar to those of the corresponding non-treated cells. Although S. pombe TrxR was able to scavenge NO generated by sodium nitroprusside (SNP), it had no significant modulating effects on cellular growth, ROS levels, or the total GSH level of SNP-exposed yeast cells, compared with the differences in those of the two non-treated cell cultures. TrxR increased the cellular growth and total GSH level, which were diminished by nitrogen starvation. It also scavenged ROS and NO produced during nitrogen starvation. Taken together, the S. pombe TrxR protects against oxidative, nitrosative, and nutritional stresses.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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