Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.38
no.5
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pp.606-611
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2009
Performance test was carried out between selective media which are generally used in Staphylococcus aureus isolation from food. Sensitivity, determined according to the appearance of characteristic colonies when 30 different S. aureus strains were tested, resulted as Baird-Parker agar (RPF)> $Petrifilm^{TM}$ Staph Express plate> Baird-Parker agar> Mannitol salt agar. Also, the four different media showed the same selectivity because all tested media did not produce the false positive colonies. Recovery efficiency from the artificially inoculated foodstuff was almost the same for the tested media. Presumptive colonies were collected from the dried fishery product using Mannitol salt agar and collected strains were tested on 4 different selective agar. Almost presumptive strains did not show the false positive colonies except for S. carnosus ssp carnosus. This strain was identified as false positive colonies on Mannitol salt agar, Baird-Parker agar and $Petrifilm^{TM}$ Staph Express plate. But Baird-Parker agar (RPF) did not show the false positive colonies with the same strains. So, it was concluded that the Baird-Parker agar (RPF) has more higher selectivity than other tested media in this experiment.
Surveys of elecirophoretic variations in isozymes and proteins encoded by 25 persumtive loci were conducted to estimate the degree of genic variation and to assess species recognition for three species of the Family Gasterosteidae (Pisces) in Korea. The average degree of genic variation of Gasterosteus aculeatus was HD = 0.086, HG = 0.084, and P =36% and it was similar to Pungitius sinensis (HD = 0.080, HG = 0.091, P = 29%). But P.kaibarae was less variable than these species (HD = 0.034; HG = 0.034, P = 13%). The average genetic similarities among the populations in each species of Gasterosteus aculeatus pungitius sinensis and P. kaibarae were S = 0.963, S = 0.953 and S = 0.800 respectively.Yongchon and Kyongiu populations of P. kaibarae were genetically remote from the rest of the conspecific populations (S = 0.690). Chae (1988) also observed morphological differences between them. The value of genetic similariiy coefficients of S = 0.606 between P. sinensis and P. kaibarae is low enough to consider as specific level of genetic difference, but moderate rate of hybridization (44%) between them at a synpatric area of Kangnung indicates that isolating mechanism is incomplete. Therefore it is concluded that P. sinensis and P. kaffarae are semispecitic status. Intergeneric genetic similarities between the genus Gasrerosteus and Pungitius were S = 0.052 and this value is the lowest estimate up to date in freshwater fishes.
Kim, Yongseok;Hur, Jina;Shim, Kyo-Moon;Kang, Kee-Kyung
Journal of the Korean earth science society
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v.40
no.6
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pp.606-612
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2019
In this study, to estimate the occurrence of frost that has a negative effect on th growth of crops, we constructed to the statistical model. We factored such various meteorological elements as the minimum temperature, temperature at 18:00, temperature at 21:00, temperature at 24:00, average wind speed, wind speed at 18:00, wind speed at 21:00, amount of cloud, amount of precipitation within 5 days, amount of precipitation within 3 days, relative humidity, dew point temperature, minimum grass temperature and ground temperature. Among the diverse variables, the several weather factors were selected for frost occurrence estimation model using statistical methods: T-test, Variable importance plot of Random Forest, Multicollinearity test, Akaike Informaiton Criteria, and Wilk's Lambda values. As a result, the selected meteorological factors were the amount of cloud, temperature at 24:00, dew point temperature, wind speed at 21:00. The accuracy of the frost occurrence estimation model using Random Forest was 70.6%. When it applied to the main production areas of vegetables, a estimation accuracy of the model was 65.2 and 78.6%.
To add genetic information to the conservation efforts on grey coral (Naemorhedus caudatus) in Korea, we investigated the pattern of mitochondrial cytochrome b gene sequence (606 bp) of six specimens from two localities in Korea. The corresponding sequences of N. caudatus in China obtained from GenBank were also used. The nucleotide Tamura-Nei distances between each of four haplotypes of N. caudatus in Korea and the haplotype of N. caudatus in China varied from 0.0650 to 0.0803: N. caudatus revealed high level of sequence diversity in Bovidae. In N. caudatus in Korea, the distances among three haplotypes at Yanggu were 0.0151 to 0.0185, and it suggests that the genetic diversity of Yanggu population was decreased in low level. Moreover, the distances between each of three haplotypes at Yanggu and one haplotype at Samcheok were 0.0343 to 0.0489. It indicates that habitat isolation caused the continuous increase of genetic distance with geographic distance in N. caudatus, and various conservation plans for mitigating the loss of genetic diversity in Korea have to be in immediate action. To clarify the taxonomic status of N. caudatus, the sequence (276 bp) of N. goral available from GenBank were also utilized, and n goral was not distinct from N. caudatus. It suggests that they may be conspecific, but further analyses with additional specimens of two species are necessary.
The Sporosarcina psychrophilia pyrB gene, which encodes aspartate transcarbamylase (ATcase), was cloned on Sau3AI restriction endonuclease fragment inserted into pUC19 plasmid vector, S. psychrophilia pyrB gene was expressed in Escherichia coli pyrB mutant for the complementation test. The sequence of 2,606 nucleotides including putative pyrB gene was determined. The region contained one full open reading frame (ORf) and two partial ORFs. The deduced amino acid sequence of the second ORF showed 59% identity with that of Bacillus caldolyticus ATCase. The first and third partial ORFs were closely related to the uracil permease (pyrP) and dihydroorotase (pyrC), respectively. Besides, potential terminator, antiterminator, and anti-antiterminator structures were found in the intergenic region between pyrP and pyrB. These results suggested that S. psychrophilia pyrimidine nucleotide biosynthesis genes are clustered as well as other Bacillus sp. Over-expressed product of pyrB encoding ATCase was purified and analyzed by the SDS-PAGE. The purified PyrB protein turned out to be molecular mass of 27 kDa and showed ATCase activity.
Oh, Jee Hye;Lee, Yong Joo;Seo, Min Seok;Yoon, Jo Hi;Kim, Chul Min;Kang, Chung
Journal of Hospice and Palliative Care
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v.20
no.4
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pp.235-241
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2017
Purpose: The Palliative Performance Scale (PPS) is a widely used prognostic tool in patients with advanced cancer. This study examines the association between changes in PPS score and survival in patients with advanced cancer. Methods: We identified a cohort of 606 inpatients who died at a Korean university hospital's hospice/palliative care center. For each patient, the PPS score was measured twice according to a standard procedure: 1) upon admission, and 2) three days after admission (D3). "Change on D3" was defined as a difference between initial PPS and PPS on D3. We used a Cox regression modeling approach to explore the association between this score change and survival. Results: The changes in scores were associated with survival. A score change of >30% yielded a hazard ratio for death of 2.66 (95% CI 2.19~3.22), compared to a score change of ${\leq}30%$. PPS of ${\leq}30$ on D3 also independently predicted survival, with a hazard ratio of 1.67 (95% CI 1.38~2.02) compared to PPS of >30. Conclusion: A change of over 30% in PPS appears to predict survival in hospitalized patients with terminal cancer, even after adjustment for confounders. Changes in PPS may be a more sensitive indicator of impending death than a single PPS measured on the day of admission in terminal cancer patients. Further prospective study is needed to examine this important finding in other populations.
Fibrin clots remained in blood vessels can be one of the serious factor caused cardiovascular disease, such as ischemia, infarction and necrosis The development of an antithrombotic and thrombolysis solvent is necessary to prevent and treat these diseases. In this study, the fibirinolytic protease was prepared from the maggots of Protaetia brevitarsis using ammonium sulfate fractionation and desalting column. The optimum pH and temperature for the enzyme activity were pH 9.0 and $50^{\circ}C$, respectively. The enzyme activity was relatively stable at pH 7.0-9.0 and temperature below $60^{\circ}C$. The activity of the enzyme was strongly inhibited by phenylmethanesulfonyl fluoride. And the activity of the enzyme was inhibited by $Ca^{2+}\;and\;Zn^{2+}$, but it was not by $Mg^{2+}\;and\;Fe^{2+}$ ions. In these experimental results, we have speculated that the enzyme derived from maggots of Protaetia hrevitarsis is a serine protease with a strong fibrinolytic activity.
Aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs) play vital roles in protein biosynthesis of living organisms and are interesting antibacterial drug targets. In order to find out new inhibitor candidate molecules as antibacterial agent, the binding modes of the candidate molecules were investigated at the active sites of aaRSs by molecular docking study. The docking simulations were performed with 48 compounds from four different scaffolds into the eight different aaRSs. The results show that scaffolds 3 and 4 compounds have consistently better binding capabilities, specifically for HisRS (E. coli) and IleRS (S. aureus). The binding modes of the best compounds with the proteins were well compatible with those of two ligands in crystal structures. Therefore, we expect that the final compounds we present may have reasonable aaRS inhibitory activity.
As contemplative education has been increasingly incorporated in schools in the US, this study aims to review literature on contemplative education for teachers and students in the US and to explore pedagogical meanings of meditation. I focus my analysis on research journals that include teacher and/or student participants incorporating mindfulness in school settings. I searched "mindfulness" and "education" through Web of Science and explored organizations or associations related to contemplative practices and education. I then analyzed the subjects on research purpose, research methods, and results. In the results, quantitative research on teachers' stress reduction dominated the research on contemplative education and quantitative research on teachers' efficacy and effectiveness with mindfulness followed. Contemplative research for students focused on their stress reduction and cognitive, social, and emotional development. Contemplative education should be involved in educational settings as pedagogical contents for improving teaching and learning. Contemplative education for students should aim to conduct whole-person education and should incorporate a variety of teaching skills and materials using different contemplative practices, including mindfulness, concentration, compassion, yoga, etc. Teachers' support for and positive relationships with their students through mindfulness and compassion meditation is the most important key to encourage students' learning in education.
Lung cancer is the leading contributor to cancer deaths in the developing world. Within countries, significant variability exists in the prevalence of lung cancer risk, yet limited information is available whether some of the observed variability is associated with differences in the consumption pattern of local tobacco products with differing potency. We recruited 606 lung cancer cases and 606 controls from the B.P. Koirala Memorial Cancer Hospital in Nepal from 2009-2012. We estimated odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CI) for lung cancer risk associated with different tobacco products, using unconditional logistic regression. Unfiltered cigarettes tended to be the most frequently used products across ethnic subgroup with about 53.7% of Brahmins, 60.1% of Chettris, and 52.3% of Rai/Limbu/Magar/others. In contrast, about 39.9% of Madishe/Tharu smokers reported using bidi compared with only 27.7% who smoked unfiltered cigarettes. Among those who only smoked one type of product, choor/kankat smokers had the highest lung cancer risk (OR 10.2; 95% CI 6.2-16.6), followed by bidi smokers (OR 5.6; 95% CI 3.6-8.7), unfiltered cigarettes (OR 4.9; 95% CI 3.4-7.2), and filtered cigarettes (OR 3.4; 95% CI 2.2-5.3). A clear dose-response relationship was observed between increased frequency of smoking and lung cancer risk across all ethnic subgroups. These results highlight the important role of traditional tobacco products on lung cancer risk in the low income countries.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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