• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권3호
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• pp.279-288
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• 2002

본 연구는 국내 홀스타인 젖소 보증종모우 16두와 후보종모우 93두를 이용하여 선천성 장애 유전자의 검색을 통하여 불량 유전자의 존재 유무를 판별함과 동시에 가축의 선발 및 육종, 개량시 기초자료로 제공하고자 하는데 그 목적이 있으며, 본 연구의 결과를 요약하면 아래와 같다. 공시재료(홀스타인 젖소 보증종모우 16두, 후보 종모우 93두) 109두에 대하여 DUMPS (deficiency of uridine monophophate synthase)의 검색결과 모든 개체에서 DUMPS 유전자를 보유하는 개체는 없는 것으로 판명되었다. 또한 PCR-RFLP(Ava I) 방법에 의해 조기 검색이 가능하게 되었다. 한편, BLAD(bovine leukocyte adhesion deficiency) 검색결과, 보증종모우 16두에서는 검출되지 않았으나, 후보우 93두중 5두에서 BLAD 잠재성 보유개체(carrier)로 판명되었고, 혈통확인을 통하여 BLAD 유전자의 전이 경로를 추정할 수 있었으며, PCR 증폭산물에 대한 제한효소 처리시 HaeⅢ 보다는 TaqⅠ 제한효소를 사용하였을 때 더 효율적으로 판명할 수 있는 것으로 나타났다. Citrullinemia 검색결과 보증종모우 16두 및 후보종모우 93두 모두에서 잠재성 보유개체는 없는 것으로 판명되었으나 citrullinemia에 대한 폭넓고 다양한 조사 및 분석이 이루어져야 할 것으로 사료된다. 본 연구의 결과로 미루어 볼 때 가축의 유전성 질환에 대한 다양하고 폭넓은 연구가 이루어 져야 할 것으로 사료되며, 가축의 선발과 육종, 개량에 있어서 지속적이며 혈통의 철저한 관리를 통한 개량의 방향을 설정하여야 할 것으로 판명되었다.

• 미생물학회지
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• 제48권2호
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• pp.79-86
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• 2012

ErmSF는 23S rRNA의 A2058 (E. coli numbering)에 methylation을 유발하여 macrolide-lincosamide-streptogramin B ($MLS_B$)계 항생제의 부착을 저해함으로써 항생제 활성을 억제하는 내성인자 단백질인 Erm 단백질들 중의 하나이다. Erm 단백질들 사이에서 공통적으로 나타나는 $^{222}FXPXPXVXS^{230}$ (ErmSF numbering) 서열은 Erm 단백질인 ErmC'와 DNA methyltransferase인 M. Taq I의 구조를 분석한 연구에서 타깃인 adenine과 직접적으로 상호작용하는 부위로 제안되거나 확인되었다. 따라서 이 부분 중 Erm 단백질 사이에서 잘 보존되어있지는 않지만 염기성인 잔기의 특성상 기질인 RNA와 상호작용이 예상되는 223, 227번 arginine을 alanine으로 위치 지정 치환한 변이 단백질을 이용하여 그 잔기의 효소 활성에서의 역할을 확인하였다. 두 변이 단백질은 생체 내에서 그 활성을 여전히 유지하고 있어서 항생제인 erythromycin에 대하여 내성을 나타내었으나 in vitro 상에서는 R223A 또는 R227A가 야생형 ErmSF에 비하여 약 50%, 88%의 활성을 각각 나타내어 효소 활성에서 각 잔기가 결정적이지는 않지만 중요한 역할을 수행하고 있음을 확인하였다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제42권3호
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• pp.186-195
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• 2015

Anthranilate synthase (AS)는 트립토판(Trp)과 indole-3-acetic acid, indole alkaloids의 생합성 경로에서 중요한 효소로 작용한다. 트립토판 생합성 상에서 feedback inhibition에 민감하게 반응하는 AS alpha-subunit 관련 OASA2 유전자 영역의 single (F124V) 및 double (S126F/L530D) 점돌연변이로 변형된 유전자의 재조합운반체를 작성하고 이들 유전자들을 Agrobacterium 방법으로 동진벼에 도입하여 형질전환체를 육성하였다. Single 및 double 돌연변이 OsASA2 유전자가 도입된 형질전환 벼 계통들은 nos gene probe를 이용한 TaqMan PCR 방법으로 single copy를 선발하였고, intergenic 계통을 선발하기 위해서 Bfa I 제한효소를 이용하여 RB와 LB 인접서열로부터 IPCR을 통한 FST 분석을 수행하여 4 개의 intergenic 계통을 선발하였다. 도입된 유전자의 발현으로 형질전환 벼는 Trp, IAN 및 IAA가 잎에 가장 많이 축적되었고, 종자의 트립토판 함량도 증가되었다. 후대에서 tryptophan 함량이 높은 S-TG와 D-TG의 두 호모 이벤트 계통을 육성하여 트립토판 함량을 분석한 결과 대조구에 비하여 13~30배 이상 높게 나타났으며, 유리아미노산의 함량도 증가하였다. 이벤트 계통을 이용하여 microarray 분석을 수행한 결과 세포 내 이온 수송, 영양분 공급 등에 영향을 주는 유전자군들이 up-regulation 되었고, 세포 내 기능유전자의 역할을 담당하는 조효소 등이 down-regulation 된 것을 확인 할 수 있었다. 이러한 결과는 선발된 두개의 상동성 이벤트 계통들이 고함량의 유리 트립토판 생산 벼의 육종에 효과적으로 이용될 수 있음을 보여준 결과로 생각된다.

• Journal of Korean Biological Nursing Science
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• 제7권1호
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• pp.29-46
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• 2005

Purpose ; 본 연구는 X-염색체와 관련된 장애 중에서 가장 흔하고 심한 Duchenne Muscular Dystrophy(DMD)의 세포유전학 및 분자유전학적 특성을 설명하기 위해서 DMD에 영향을 받고 있는 두 가계의 13명을 대상으로 가계도 분석과 염색체 분석 및 DNA 분석을 하였다. Method ; DNA분석은 DNA probe을 이용한 Southern blotting method로써 RFLPs와 DMD유전자 부위의 exon소실 유무를 조사하여 아래와 같은 결과를 얻었다. Conclusion ; A 염색체 분석 : 말초혈액과 양수를 표본으로 High-Resolution GTG염색에서 A가계와 B가계의 염색체 분석에서 12명의 염색체는 정상 X-염색체였으나 B가계의 I-2(DMD여성)에서 46, x,-x,+t(2:x)(q 21.1 : p21.2)로 나타난다. B. DNA분석3 : 1) RFLPs의 분석 J66,XJ-1.1,754-11로써 B가계의 RELPs(Restriction Fragment Length Polymorphisms)에서 J66/Pst I은 1.7hb(E), 1.6kb(e)을 보여 주었고 XJ-1.1/Taq I은 3.6kb(F), 3.0kb(f), 754-11/EoR I은 4.2kb(G), 2.0kb(g)의 대립인자를 나타내었다. 이상의 결과를 바탕으로 영향을 받고 있는 남자 (II-2)의 haplotype는 보인자인 어머니의 한쪽 인자를 받았으며 어머니와 딸은 보인자이고 임산부의 태아는 남아였고 태아의 인자들은 그의 할아버지로부터 물려받아 DMD에 영향을 받지 않은 것으로 진단되었다. 2) DMD 유전자의 exon 소실에 대한 분석 cDNA probe 8과 cDNA probe 2b-3으로써 소실에 대한 진단은 영향을 받은 남자(II-2)는 cDNA probe 8에서 12, 7.3, 6.6, 4.2kb에 소실이 있고 cDNA 2b-3은 1.7kb에 소실에 나타났다.

• 한국식물병리학회지
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• 제13권4호
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• pp.239-243
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• 1997

1990년 8월 충북 보은의 참깨 밭에서 전형적인 엽화병(葉化病; phyllody disease)이 발생하였다. 병징은 꽃이 잎처럼 녹색으로 변하고, 이병엽은 정상엽보다 작고 잔가지가 마치 빗자루 모양으로 총생하였고 개화 및 결실이 되지 않았다. 투과 전자현미경으로 병든 잎의 사관요소에서 phytoplasma가 존재하는 것을 확인하였다. 병든 잔가지에서 추출한 DNA를 중합효소 연쇄반응으로 분석한 결과 대추나무 빗자루병에 걸린 나무에서 증폭되는 DNA와 같은 크기의 band가 관찰되었다. 따라서 위의 시료는 phytoplasma 벙으로 확인 되었으며 참깨 엽화병으로 명명하였다. 또한 참깨 엽화병을 일으키는 phytoplasma와 대추 나무 빗자루병 phytoplasma를 PCR 증폭 및 제한효소로 절단하여 분석한 결과 이들은 서로 다른 그룹이라는 것을 알 수 있었다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제17권4호
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• pp.888-891
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• 2008

Twenty-three fungal strains were isolated from meju that had originated from the Sunchang province, the famous location for making fermented soybean foods in Korea. The restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the internal transcribed spacer (ITS) region of the rDNA (ITS-RFLP) was applied to differentiate the isolated fungal strains. First, the ITS region by polymerase chain reaction (PCR) with specific primers was amplified and then cleaved the products with different restriction enzymes. Cleavage of the amplified fragments with the restriction enzymes AluI, HaeIII, HhaI, and TaqI revealed extensive polymorphisms. The ITS-RFLP results highly correlated with ITS sequence analysis. All of the 23 fungal strains were classified into 5 groups by ITS-RFLP analysis. Aspergillus oryzae was the major fungal strain isolated from Sunchang meju (12 out of 23), while Aspergillus fumigatus was the next most frequently isolated strain (7 out of 23). In contrast, it was found that Fusarium asiaticum, Aspergillus sydowii, and Arthrinium sp. were the minor fungal strains in meju.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제55권6호
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• pp.653-658
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• 2017

Hypoderma spp. larvae cause subcutaneous myiasis in several animal species. The objective of the present investigation was to identify and characterize morphologically and molecularly the larvae of Hypoderma spp. collected from cattle (Bos taurus taurus) and red deer (Cervus elaphus) in the district of Castelo Branco, Portugal. For this purpose, a total of 8 larvae were collected from cattle (n=2) and red deer (n=6). After morphological identification of Hypoderma spp. larvae, molecular characterization was based on PCR-RFLP and mitochondrial CO1 gene sequence analysis. All larvae were morphologically characterized as the third instar larvae (L3) of H. actaeon. Two restriction enzymes were used for molecular identification of the larvae. TaqI restriction enzyme was not able to cut H. actaeon. However, MboII restriction enzyme differentiated Hypoderma species showing 210 and 450 bp bands in H. actaeon. Furthermore, according to the alignment of the mt-CO1 gene sequences of Hypoderma species and to PCR-RFLP findings, all the identified Hypoderma larvae were confirmed as H. actaeon. This is the first report of identification of Hypoderma spp. (Diptera; Oestridae) from cattle and red deer in Portugal, based on morphological and molecular analyses.

• 한국약용작물학회지
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• 제8권3호
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• pp.266-273
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• 2000

지황 신품종(新品種) 육성(育成)의 기초 자료를 마련하고 자 RAPD 기법을 이용하여 국내외(國內外)에서 수집(蒐集)된 지황 12계통의 계통간(系統間) 유연관계(類緣關係)를 분석하여 다음과 같은 결과를 얻었다. PCR 증폭의 최적 조건은 총(總) 반응용액(反應溶液) $20\;{\mu}l$ 중 template DNA 20 ng, dNTP 250 mM, primer 10 pM, Taq DNA polymerase 1.0 unit, annealing 온도는 $36^{\circ}C$이었다. 20가지의 OPB random primer를 PCR한 결과(結果) 17개의 primer를 선발(選拔)하였으며 다형을 보이는 band수는 107개였다. 선정된 17개의 primer에의해 증폭된 DNA 단편(斷片)들은 $400{\sim}3,200\;bp$ 범위에 속하였으며, primer 당 나타난 band 수는 $1{\sim}10$개 까지였고 평균 6.1개 이었다. Jaccard 와 Nei 상관계수에 따라 지황의 12계통은 가운데에서 나타난 군(群)은 크게 3개군(群)으로 구분되었는 데, 우리나라 지황 수집(蒐集) 계통(系統) 중 정읍, 서천, 진안, 안동 및 단양 재래계통은 계통(系統)간 유연관계(類緣關係)가 $0.27{\sim}0.05$로 가깝게 나타났다. (제1군(群)). 수원 조직배양(組織培養) 계통(系統)과 춘천 재래(在來) 계통(系統)은 $0.29{\sim}0.11$로 유연관계가 가깝게 나타났으며, $F_1$ ( 지황 1 호${\times}$ 서천 재래계통 )과 단양 조직배양(組織培養) 계통(系統), 일본계량(日本改良) 계통도 이들과 계통간(系統間) 유연관계(類緣關係)가 가까운 군(群)에 속(屬)하였다 (제 2군(群)). 지황1호와 일본(日本) 재래(在來) 계통(系統)의 유연관계 는 각각 0.35 와 0.43 으로 우리나라 재래종(在來種)과 원연관계(遠緣關係)인 것으로 밝혀졌다.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제38권4호
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• pp.291-298
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• 2013

본 연구에서는 백서에 구속 스트레스를 통하여 정서적인 스트레스를 가한 후, 이하선 조직의 형태학적 변화 양상을 광학 현미경으로 관찰하였으며, 타액선 조직에서 세포자멸사의 평가는 TUNEL assay에 양성을 보이는 세포 수를 측정하여, 각 군별 차이를 비교하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 백서 이하선에서 구속 스트레스를 가한 후, 5일부터 타액선 선포의 위축 및 농염이 관찰되었으며, 7일부터 세포자멸사소견이 관찰되기 시작하였다. 2. In situ DNA end labelling assay를 통하여 TUNEL 염색을 시행한 결과, 타액선 장액선포에서 양성세포가 구속 스트레스에 대해 5일부터 통계학적으로 유의하게 증가하여 7일째에 가장 큰 지수를 보여 조직학적 소견과 일치하였다. 따라서 구속에 의한 스트레스 증가에 따라 생체 내 타액선조직에서 세포자멸사가 유도됨을 증명할 수 있었으며, 향후 유도 신호전달 기전에 관한 연구가 이루어져야 한다고 사료된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.179-182
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• 2013

Human cytochrome P4502E1 (CYP2E1) is a well-conserved xenobiotic-metabolizing enzyme expressed in liver, kidney, nasal mucosa, brain, lung, and other tissues. CYP2E1 is inducible by ethanol, acetone, and other low-molecular weight substrates and may mediate development of chemically-mediated cancers. CYP2E1 polymorphisms alter the transcriptional activity of the gene. This study was conducted in order to investigate the allele frequency variation in different populations of Andhra Pradesh. Two hundred and twelve subjects belonging to six populations were studied. Genotype and allele frequency were assessed through TaqMan allelic discrimination (rs6413419) and polymerase chain reaction-sequencing (-1295G>C and -1055C>T) after DNA isolation from peripheral leukocytes. The data were compared with other available world populations. The SNP rs6413419 is monomorphic in the present study, -1295G>C and -1055C>T are less polymorphic and followed Hardy-Weinberg equilibrium in all the populations studied. The -1295G>C and -1055C>T frequencies were similar and acted as surrogates in all the populations. Analysis of HapMap populations data revealed no significant LD between these markers in all the populations. Low frequency of $CYP2E1^*c2$ could be useful in the understanding of south Indian population gene composition, alcohol metabolism, and alcoholic liver disease development. However, screening of additional populations and further association studies are necessary. The heterogeneity of Indian population as evidenced by the different distribution of $CYP2E1^*c2$ may help in understanding the population genetic and evolutionary aspects of this gene.