Intrapecific Relationship of Rehmannia glutinosa Lines Collected from Korea, Japan and China by RAPD Analysis

RAPD 방법을 이용한 국내외 수집 지황(地黃)의 유연 관계 분석

  • Published : 2000.09.30

Abstract

The optimal conditions of PCR components for the random amplification of genomic DNA were $20\;ng/20{\mu}l$ in template DNAs, 250 mM in dNTP, 10 pM in primer $1.0unit/20{\mu}l$ in Taq DNA polymerase respectively with the annealing temperature at $36^{\circ}C$, respectively. Twelve local lines were divided into 3 groups by the coefficients of 107 polymophic bands by Jaccard and Nei. The coefficients value of group I including Chongup # 1, Seochon # 1, Andong # 1, Chinan # 1, and Danyang # 1 ranged from 0.27 to 0.05 and those of group II including Suwon # 2, Chunchon # 1, Japan # 3, Danyang#2 and $F_1$ (Variety Jihwang $1{\times}$ Seohchon) ranged from 0.29 to 0.11. While, Jihwang 1 originated from China and Japan # 1 in group III showed a distant genetic relationship to Korean local lines.

지황 신품종(新品種) 육성(育成)의 기초 자료를 마련하고 자 RAPD 기법을 이용하여 국내외(國內外)에서 수집(蒐集)된 지황 12계통의 계통간(系統間) 유연관계(類緣關係)를 분석하여 다음과 같은 결과를 얻었다. PCR 증폭의 최적 조건은 총(總) 반응용액(反應溶液) $20\;{\mu}l$ 중 template DNA 20 ng, dNTP 250 mM, primer 10 pM, Taq DNA polymerase 1.0 unit, annealing 온도는 $36^{\circ}C$이었다. 20가지의 OPB random primer를 PCR한 결과(結果) 17개의 primer를 선발(選拔)하였으며 다형을 보이는 band수는 107개였다. 선정된 17개의 primer에의해 증폭된 DNA 단편(斷片)들은 $400{\sim}3,200\;bp$ 범위에 속하였으며, primer 당 나타난 band 수는 $1{\sim}10$개 까지였고 평균 6.1개 이었다. Jaccard 와 Nei 상관계수에 따라 지황의 12계통은 가운데에서 나타난 군(群)은 크게 3개군(群)으로 구분되었는 데, 우리나라 지황 수집(蒐集) 계통(系統) 중 정읍, 서천, 진안, 안동 및 단양 재래계통은 계통(系統)간 유연관계(類緣關係)가 $0.27{\sim}0.05$로 가깝게 나타났다. (제1군(群)). 수원 조직배양(組織培養) 계통(系統)과 춘천 재래(在來) 계통(系統)은 $0.29{\sim}0.11$로 유연관계가 가깝게 나타났으며, $F_1$ ( 지황 1 호${\times}$ 서천 재래계통 )과 단양 조직배양(組織培養) 계통(系統), 일본계량(日本改良) 계통도 이들과 계통간(系統間) 유연관계(類緣關係)가 가까운 군(群)에 속(屬)하였다 (제 2군(群)). 지황1호와 일본(日本) 재래(在來) 계통(系統)의 유연관계 는 각각 0.35 와 0.43 으로 우리나라 재래종(在來種)과 원연관계(遠緣關係)인 것으로 밝혀졌다.

Keywords