• 제목/요약/키워드: TOF MS

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Selective Extraction and Quantification of Glutathione using Maleimide-Presenting Gold Nanoparticles

  • Oh, Hongseok;Lee, Jeongwook;Yeo, Woon-Seok
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권10호
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    • pp.3047-3051
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    • 2014
  • In this paper, we describe a new method for the selective extraction and quantification of glutathione (GSH) using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and maleimide-presenting gold nanoparticles (Mal-AuNPs). Our strategy utilizes the Michael addition to selectively extract GSH, from chosen samples, onto the maleimide of Mal-AuNPs. After the extraction step, the GSH bound to the AuNPs was analyzed by MALDI-TOF MS in the presence of an internal standard which was prepared by reacting Mal-AuNPs with isotope-labeled GSH ($GSH^*$). The $GSH^*$ has the same structure as GSH but a higher molecular weight, and therefore, enables absolute quantification of GSH by comparing the mass signal intensities of the GSH- and $GSH^*$-conjugated alkanethiols. Our strategy was verified by analyzing GSH-spiked fetal bovine serum and NIH 3T3 cells.

풀러렌$[C_{60}]$과 3- Chloroperoxy Benzoic acid 반응의 초음파적 조사 (Ultrasonic Monitoring of Reaction of Fullerene$[C_{60}]$ with 3-Chloroperoxy Benzoic acid)

  • 고원배
    • Elastomers and Composites
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    • 제41권1호
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    • pp.57-62
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    • 2006
  • 1,2-dichlorobenzene 용액에서 풀러렌$[C_{60}]$과 3-chloroperoxy benzoic acid 의 반응을 고분해능 초음파 분광기를 사용하여 조사하였다. 또한 1,2-dichlorobenzene 용액에서 풀러렌$[C_{60}]$과 3-chloroperoxy benzoic acid의 반응 생성물을 MALDI-TOF-MS를 가지고 확인하였다.

Direct Analysis in Real Time Mass Spectrometry (DART-MS) Analysis of Skin Metabolome Changes in the Ultraviolet B-Induced Mice

  • Park, Hye Min;Kim, Hye Jin;Jang, Young Pyo;Kim, Sun Yeou
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제21권6호
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    • pp.470-475
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    • 2013
  • Ultraviolet (UV) radiation is a major environmental factor that leads to acute and chronic reactions in the human skin. UV exposure induces wrinkle formation, DNA damage, and generation of reactive oxygen species (ROS). Most mechanistic studies of skin physiology and pharmacology related with UV-irradiated skin have focused on proteins and their related gene expression or single-targeted small molecules. The present study identified and analyzed the alteration of skin metabolites following UVB irradiation and topical retinyl palmitate (RP, 5%) treatment in hairless mice using direct analysis in real time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOF-MS) with multivariate analysis. Under the negative ion mode, the DART ion source successfully ionized various fatty acids including palmitoleic and linolenic acid. From DART-TOF-MS fingerprints measured in positive mode, the prominent dehydrated ion peak (m/z: 369, M+H-$H_2O$) of cholesterol was characterized in all three groups. In positive mode, the discrimination among three groups was much clearer than that in negative mode by using multivariate analysis of orthogonal partial-least squares-discriminant analysis (OPLS-DA). DART-TOF-MS can ionize various small organic molecules in living tissues and is an efficient alternative analytical tool for acquiring full chemical fingerprints from living tissues without requiring sample preparation. DART-MS measurement of skin tissue with multivariate analysis proved to be a powerful method to discriminate between experimental groups and to find biomarkers for various experiment models in skin dermatological research.

LC-MS에 의한 사철쑥에 존재하는 페놀성 화합물의 정성분석 (Qualitative Analysis of Phenolic Substances in Artemisia capillaris by LC-MS)

  • 누그로호 아궁;임상철;박희준
    • 생약학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.302-307
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    • 2012
  • The herb of Artemisia capillaris in Chinese medicine is used to treat hepatic diseases. In this research, qualitative analysis was performed using a UPLC/Q-TOF-ESI-MS/MS method for rapid identification of phenolic substances from A. capillaris: three caffeoylquinic acids (chlorogenic acid, 3,5-di-O-caffeoylquinic acid, and 4,5-di-O-caffeoylquinic acid), three flavonoids (hyperoside, isorhamnetin 3-O-robinobioside and quercetin) and three prenylated coumarins (6,8-diprenylumbelliferone, cedrelopsin and osthol) were identified. The three prenylated coumarins have not been reported from A. capillaris.

Investigation of Angiotensin Glycosylation by MALDI-TOF and ESI Tandem Mass Spectrometry

  • Park, Soo-Jin;Park, Deok-Hie;Sul, Soo-Hwan;Oh, Sung-Hwan F.;Park, In-Sook;Chung, Doo-Soo;Kim, Hie-Joon;Kim, Min-Sik;Lee, Sang-Won
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권12호
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    • pp.1791-1800
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    • 2004
  • Angiotensin I, a model decapeptide, was glycosylated and partially hydrolyzed with HCl (6 N, 80 $^{\circ}C$, 4 h), aminopeptidase, and carboxypeptidase Y. A single peptide mass map obtained from truncated peptides in the partial acid hydrolysate of angiotensin and its glycosylation product mixture by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry enabled sequencing of angiotensin by a combinatorial procedure. MALDI-TOF and electrospray ionization (ESI) tandem mass spectrometric results indicate that both the N-terminal amino group of aspartic acid and the guanidinium group of the second residue arginine are glycosylated.

Characterization of Poly(ethylene oxide)-b-Poly(L-lactide) Block Copolymer by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry

  • Jeongmin Hong;Donghyun Cho;Taihyun Chang;Shim, Woo-Sun;Lee, Doo-Sung
    • Macromolecular Research
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    • 제11권5호
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    • pp.341-346
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    • 2003
  • A poly(ethylene oxide)-b-poly(L-lactide) diblock copolymer (PEO-b-PLLA) is characterized by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and a block length distribution map is constructed. Although the MALDI- TOF mass spectrum of PEO-b-PLLA is very complicated, most of the polymer species were identified by isolating the overlapped isotope patterns and by fitting the overlapped peaks to the Schulz-Zimm distribution function. Reconstructed MALDI-TOF MS spectrum was nearly identical to the measured spectrum and this method shows its potential to be developed as an easy and fast analysis method of low molecular weight block copolymers.

폐쇄성과 비폐쇄성 무 정자증 환자의 고환 내 세포 자연사 관련 인자들의 발현 변화와 SELDI-TOF Mass Spectrometry를 이용한 단백질 발현 분석 (Differential Expressions of Apoptosis Regulators and Protein Profiling by SELDI-TOF Mass Spectrometry in Human Testis with Obstructive and Non-obstructive Azoospermia)

  • 김슬기;김호승;이호준;박용석;서주태;윤용달
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제32권2호
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    • pp.121-132
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    • 2005
  • 연구목적: 본 연구에서는 비폐쇄성 무정자증 환자에서 나타나는 정자형성과정의 이상과 고환세포의 세포자연사와의 연관관계 여부를 확인하였다. 또한 SELDI-TOF MS 분석을 통하여 고환 내 단백질 발현 양상을 확인하고, 질환에 따른 효과적인 biomarker 개발 가능성 여부를 확인하였다. 재료 및 방법: RT-PCR 및 면역조직화학법을 사용하여 고환에서의 Fas, FasL, Bcl-2, Bax와 Caspase-3의 발현 양상을 확인하고, in situ DNA 3'-end-labelling 방법으로 고환세포의 세포자연사 양상을 확인하였다. SELDI-TOF MS 분석법에 의한 고환의 병리학적 소견에 따른 단백질 발현 변화는 소수성 칩 ($H_4$)을 사용하여 분자량 10~100 kDa 범위 내에서 분석하였다. 결 과: 정상적인 정자형성과정을 보이는 폐쇄성 무정자증 환자의 고환에 비해 지주세포 증후군 (Sertoli cell only syndrome)과 성숙정지 (maturation arrest)를 보이는 고환 내 생식세포와 지주세포에서 세포자연사가 현저하게 증가한 것을 확인할 수 있었다. 세포자연사 관련인자들의 발현 양상을 확인한 결과, 지주세포 증후군과 성숙정지 환자군에서 Fas와 FasL mRNA의 발현이 증가하였으나, bcl-2, bax와 caspase-3 mRNA 발현의 경우에는 두 질환 모두에서 유의한 차이를 확인할 수 없었다. FasL 단백질 발현의 경우, 세포자연사의 증가가 관찰되었던 지주세포 증후군과 성숙정지를 보이는 환자의 간질세포와 지주세포에서 증가하는 양상을 나타내었다. SELDI-TOF MS 분석 결과에서 폐쇄성 무정자증 환자군에 비해 전체적인 단백질 발현양이 지주세포 증후군과 성숙정지 환자의 고환에서 감소하는 양상을 보였으며, 특히, 16.730 kDa 단백질의 현저한 감소를 확인할 수 있었다. 결 론: 본 연구결과를 통해 비폐쇄성 무정자증 환자에서 나타나는 정자형성과정의 장애는 생식세포의 비정상적인 세포자연사와 연관되어 있으며, 고환 내 Fas와 FasL의 비정상적인 발현이 주된 원인인 것을 확인할 수 있었다. 또한, SELDI-TOF MS 분석법을 통한 단백질 발현 양상의 연구는 무정자증 환자에서의 다양한 병리학적 소견을 쉽게 파악할 수 있는 biomarker 발굴뿐만 아니라 질환의 원인규명을 위한 연구에도 유용하게 이용될 수 있을 것으로 사료된다.

인삼 모상근 프로테옴 데이터 분석 : 인삼 EST database와의 통합 분석에 의한 단백질 동정 (Proteome Data Analysis of Hairy Root of Panax ginseng : Use of Expressed Sequence Tag Data of Ginseng for the Protein Identification)

  • 권경훈;김승일;김경욱;김은아;조건;김진영;김영환;양덕춘;허철구;유종신;박영목
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제29권3호
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    • pp.161-170
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    • 2002
  • 인삼 모상근의 프로테옴 분석에 의해 얻은 질량분석 스펙트럼 데이터는 MALDI/TOF/MS에서 얻는 질량 스펙트럼과 ESI/Q-TOF/MS에서 얻는 탄뎀 질량 스펙트럼으로 구분된다. 질량 스펙트럼은 단백질이 효소에 의해 분해된 펩타이드들의 분자량 정보를 제공하며, 탄뎀 질량 스펙트럼에서는 아미노산 단위로 분해된 절편 단백질의 분자량으로부터 아미노산 서열을 결과로 얻는다. 펩타이드의 아미노산 서열을 BLAST로 검색하면 유사한 단백질을 GenBank에서 검색할 수 있다. 이러한 단백질 동정 방법은 완전한 유전체 서열이 알려진 생물체의 경우 높은 정확도로 단백질을 동정할 수 있으나, 그렇지 않은 경우는 유사한 단백질이 데이터베이스에 존재하지 않아 분석이 용이하지 않다. 본 연구에서는 질량 스펙트럼 및 절편 단백질의 아미노산 서열을 EST (expressed sequence tag) 서열과 비교하여 프로테옴 데이터와 일치하는 EST 서열을 찾아내고 이를 BLAST검색에 의해 단백질 동정에 활용하였다. ESI/Q-TOF/MS 에서 얻은 아미노산 서열은 길이는 짧지만 데이터의 신뢰도가 높으므로 EST 서열과의 연관 관계를 밝힘으로써 단백질에 대한 정보를 보완할 수 있었다. ESI/Q-TOF/MS에서 얻은 펩타이드의 아미노산 서열을 EST 서열과 비교한 결과 90%의 아미노산 서열이 EST DB에서 발견되었다. NCBI의 nr 데이터베이스에서 아미노산 서열을 검색하여 찾은 단백질이 68%임에 비하여, 인삼 EST 서열에 의한 검색이 22% 더 많은 결과를 얻었다. MALDI/TOF/MS의 질량 스펙트럼에서 nr 데이터베이스로 검색한 결과와 인삼 EST 데이터베이스를 검색한 결과가 일치하는 경우는 47개 중 9개인 19%에 불과하여, 탄뎀 질량 분석으로 아미노산 서열을 얻지 않고, 단지 질량 스펙트럼으로부터 단백질을 동정하는 방법으로는 단백질 동정의 정확한 결과를 기대하기 어려움을 확인하였다.

A Comprehensive Identification of Synaptic Vesicle Proteins in Rat Brains by cRPLC/MS-MS and 2DE/MALDI-TOF-MS

  • Lee, Won-Kyu;Kim, Hye-Jung;Min, Hye-Ki;Kang, Un-Beom;Lee, Cheol-Ju;Lee, Sang-Won;Kim, Ick-Young;Lee, Seung-Taek;Kwon, Oh-Seung;Yu, Yeon-Gyu
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제28권9호
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    • pp.1499-1509
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    • 2007
  • Proteomic analyses of synaptic vesicle fraction from rat brain have been performed for the better understanding of vesicle regulation and signal transmission. Two different approaches were applied to identify proteins in synaptic vesicle fraction. First, the isolated synaptic vesicle proteins were treated with trypsin, and the resulting peptides were analyzed using a high-pressure capillary reversed phase liquid chromatography/tandem mass spectrometry (cRPLC/MS/MS). Alternatively, proteins were separated by two-dimensional gel electrophoresis (2DE) and identified by matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry (MALDI-TOF/MS). Total 18 and 52 proteins were identified from cRPLC/MS-MS and 2DE-MALDI-TOF-MS analysis, respectively. Among them only 2 proteins were identified by both methods. Of the proteins identified, 70% were soluble proteins and 30% were membrane proteins. They were categorized by their functions in vesicle trafficking and biogenesis, energy metabolism, signal transduction, transport and unknown functions. Among them, 27 proteins were not previously reported as synaptic proteins. The cellular functions of unknown proteins were estimated from the analysis of domain structure, expression profile and predicted interaction partners.

Free Radical Initiated Peptide Sequencing Using MALDI-TOF/TOF Mass Spectrometry

  • Song, Insu;Lee, Jae-ung;Baek, Jaehyeon;Cha, Sangwon;Han, Sang Yun;Oh, Han Bin
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제9권2호
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    • pp.56-60
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    • 2018
  • In this study, matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) was applied to the TEMPO-assisted FRIPS for the first time. We found that 3-HPA is the optimal matrix for the analysis of p-TEMPO-Bz-Sc-peptides, which gives minimal precursor fragmentations. MALDI-TOF/TOF experiments on p-TEMPO-Bz-Sc-peptides yielded mainly $[a_n+H]^+$, $[z_n+H]^+$, and $[y_n]^+-type$ products, indicating that radical-driven peptide fragmentation occurs in MALDI-TOF/TOF-MS.