• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권11호
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• pp.1951-1964
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• 2016

1,4-Dioxane-degrading bacterial consortia were enriched from forest soil (FS) and activated sludge (AS) using a defined medium containing 1,4-dioxane as the sole carbon source. These two enrichments cultures appeared to have inducible tetrahydrofuran/dioxane and propane degradation enzymes. According to qPCR results on the 16S rRNA and soluble di-iron monooxygenase genes, the relative abundances of 1,4-dioxane-degrading bacteria to total bacteria in FS and AS were 29.4% and 57.8%, respectively. For FS, the cell growth yields (Y), maximum specific degradation rate ($V_{max}$), and half-saturation concentration ($K_m$) were 0.58 mg-protein/mg-dioxane, $0.037mg-dioxane/mg-protein{\cdot}h$, and 93.9 mg/l, respectively. For AS, Y, $V_{max}$, and $K_m$ were 0.34 mg-protein/mg-dioxane, $0.078mg-dioxane/mg-protein{\cdot}h$, and 181.3 mg/l, respectively. These kinetics data of FS and AS were similar to previously reported values. Based on bacterial community analysis on 16S rRNA gene sequences of the two enrichment cultures, the FS consortium was identified to contain 38.3% of Mycobacterium and 10.6% of Afipia, similar to previously reported literature. Meanwhile, 49.5% of the AS consortium belonged to the candidate division TM7, which has never been reported to be involved in 1,4-dioxane biodegradation. However, recent studies suggested that TM7 bacteria were associated with degradation of non-biodegradable and hazardous materials. Therefore, our results showed that previously unknown 1,4-dioxane-degrading bacteria might play an important role in enriched AS. Although the metabolic capability and ecophysiological significance of the predominant TM7 bacteria in AS enrichment culture remain unclear, our data reveal hidden characteristics of the TM7 phylum and provide a perspective for studying this previously uncultured phylotype.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제17권6호
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• pp.537-545
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• 2016

본 연구는 구강환경요인을 살펴보고, 구강환경이 구강세균 검출에 미치는 위험요인 알아보고자 시행하였다. 연구기간은 2015년 2월 15일~ 2월 28일까지 성인 근로자 60명을 대상으로 조사하였다. 연구변수로는 안정시, 자극시 타액분비율, 타액완충능, 타액 pH, 설배와 설하 구강건조도, 구취 설태량을 측정하였다. 구강세균의 검출 유무를 확인하기 위하여 안정시 타액분비율의 gDNA를 추출하여 균을 검출하였다. 그 결과, S.mutans균은 흡연자 15배, 자극시, 안정시 타액분비율 1.3~1.6배 위험도가 더 높았으며, P.intermedia는 흡연자 13배, 설하 구강건조도 4.3배, 설태량 4배 TM7은 설하 구강건조도 5.5배 더 높은 위험도를 나타냈다. 구강 내 세균을 줄이기 위해서는 타액분비율을 촉진시키는 습관을 형성하고, 금연교육을 시행함이 중요하다고 본다. 또한 구강위생이 깨끗하고 관리가 잘되는 성인에서는 구강세균이 많이 줄어들고, 구강질환을 좀 더 예방할 수 있을 것이라 기대된다.

• 미생물학회지
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• 제46권2호
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• pp.169-176
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• 2010

회전접촉장치와 점감포기 생물반응조를 이용한 실험용 규모의 폐수처리 공정을 식품산업폐수를 유입수로 사용하여 5개월 동안 운전하였으며, 16S rRNA 유전자의 말단단편길이다형성(T-RFLP) 분석과 계통분류학적 분석방법으로 폐수처리 공정의 세균군집을 조사하였다. 유기물 외에 고농도의 질소와 인이 함유된 식품산업폐수를 적용하였음에도 불구하고, 안정화 기간 동안 화학적산소요구량, 총질소, 총인의 제거효율은 각각 98%, 93%, 95% 이상이었다. 가동 초기의 세균 군집과 안정화 이후의 세균군집은 뚜렷하게 구분되었으며, 안정화 기간 동안 가장 우점한 세균군집은 Bacteroidetes였다. 운전 기간중의 주요 세균 군집은 사상균으로 분류되는 Haliscomenobacter, Sphaerotilus, Candidate division TM7이었으나, 이들 사상균에 의한 슬러지 팽화 현상은 관찰할 수 없었다. Haliscomenobacter와 유연관계가 가까운 세균군집이 안정화 시기에 증가하여 최대 우점 군집이 되었다. 본 연구결과는 회전접촉장치와 점감포기 생물반응조를 이용한 폐수처리공정의 영양물질 제거에 사상균이 중요함을 제시한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권12호
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• pp.2141-2147
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• 2016

As one of the most complex human-associated microbial habitats, the oral cavity harbors hundreds of bacteria. Halitosis is a prevalent oral condition that is typically caused by bacteria. The aim of this study was to analyze the microbial communities and predict functional profiles in supragingival plaque from healthy individuals and those with halitosis. Ten preschool children were enrolled in this study; five with halitosis and five without. Supragingival plaque was isolated from each participant and 16S rRNA gene pyrosequencing was used to identify the microbes present. Samples were primarily composed of Actinobacteria, Bacteroidetes, Proteobacteria, Firmicutes, Fusobacteria, and Candidate phylum TM7. The ${\alpha}$ and ${\beta}$ diversity indices did not differ between healthy and halitosis subjects. Fifteen operational taxonomic units (OTUs) were identified with significantly different relative abundances between healthy and halitosis plaques, and included the phylotypes of Prevotella sp., Leptotrichia sp., Actinomyces sp., Porphyromonas sp., Selenomonas sp., Selenomonas noxia, and Capnocytophaga ochracea. We suggest that these OTUs are candidate halitosis-associated pathogens. Functional profiles were predicted using PICRUSt, and nine level-3 KEGG Orthology groups were significantly different. Hub modules of co-occurrence networks implied that microbes in halitosis dental plaque were more highly conserved than microbes of healthy individuals' plaque. Collectively, our data provide a background for the oral microbiota associated with halitosis from supragingival plaque, and help explain the etiology of halitosis.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권2호
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• pp.232-239
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• 2006

The microbial activity and bacterial community structure of activated sludge reactors, which treated free cyanide (FC), zinc-complexed cyanide (ZC), or nickel-complexed cyanide (NC), were studied. The three reactors (designated as re-FC, re-ZC, and re-NC) were operated for 50 days with a stepwise decrease of hydraulic retention time. In the re-FC and re-ZC reactors, FC or ZC was almost completely removed, whereas approximately 80-87% of NC was removed in re-NC. This result might be attributed to the high toxicity of nickel released after degradation of NC. In the batch test, the sludges taken from re-FC and re-ZC completely degraded FC, ZC, and NC, whereas the sludge from re-NC degraded only NC. Although re-FC and re-ZC showed similar properties in regard to cyanide degradation, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of the 16S rRNA gene of the bacterial communities in the three reactors showed that bacterial community was specifically acclimated to each reactor. We found several bacterial sequences in DGGE bands that showed high similarity to known cyanide-degrading bacteria such as Klebsiella spp., Acidovorax spp., and Achromobacter xylosoxidans. Flocforming microorganism might also be one of the major microorganisms, since many sequences related to Zoogloea, Microbacterium, and phylum TM7 were detected in all the reactors.

• 한국초지조사료학회지
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• 제39권4호
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• pp.227-234
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• 2019

본 연구는 고온기 여름철 사육환경에서의 홀스타인종 젖소의 반추위내 미생물 균총 변화를 분석하고, 반추위내 미생물과 고온 스트레스간의 연관성을 규명하고자 수행하였다. 국립축산과학원 낙농과에서 사육 중인 홀스타인 젖소 10두의 반추위액을 채취하였으며, 채취한 시료 샘플은 PowerSoil® DNA Isolation Kit (Cat. No. 12888, MO BIO)를 이용하여 DNA를 추출한 후 Illumina HiSeq^TM platform (Illumina, CA, USA)을 이용하여 미생물 균총 분석을 실시하였다. 반추위액 내 미생물 균총을 분석한 결과, 사육환경 온습도에 따른 미생물 군집 구성에는 큰 차이는 없었으나, 미생물의 상대적 함량에는 차이가 있었다. LEfSe 분석을 통해 적온과 고온 환경에서 특정 미생물들의 상대적 조성이 유의적으로 증가함을 확인하였다. 이들 결과를 볼 때, 반추위내 미생물 균총은 고온과 같은 외부 환경변화에 영향을 받는 것으로 판단되어 젖소의 고온스트레스 반응에 있어 반추위 미생물 변화가 중요한 역할을 담당할 것으로 사료된다. 추후 연구는 이러한 차이를 나타내는 미생물들의 대사 경로나 대사 물질에 분석을 통해 환경변화와 미생물간의 연관성 및 이러한 미생물 균총 조절을 통한 고온기 젖소의 적응성 향상을 위한 미생물학적 전략 연구가가 필요할 것으로 생각된다.