• 한국어병학회지
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• 제6권2호
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• pp.93-101
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• 1993

효모의 RNAI유전자는 RNA processing에 관여 하는지 혹은 RNA transport에 관여 하는지 아직까지 유전자의 기능이 정확히 알려져 있지 않은 실정이다. 효모의 RNAI 유전자의 기능을 파악하기 위한 방법으로 본 연구에서는 rna1-1 mutant gene을 cloning하여 이에 대한 DNA sequence를 조사함으로써 RNAI 유전자와 rna1-1 유전자의 차이점을 이해하고자 하였다. rna1-1 marker를 갖는 yeast strain(R49)로 부터 genomic DNA를 추출하여 이를 BglII로 절단하여 genomic southern blotting을 행한 결과 wild type의 경우와 동일하게 3.4 kb에서 hybridization되는 signal을 얻었으며, RNAl 및 rna1-1이 yeast genome내에 single site로 존재함을 보여 주는 결과를 얻었다. mutant strain으로 부터 얻은 3.4 kb의 BglI fragment를 pUC19의 BamHI site에 subcloning하여 transformant들을 얻었고, wild type RNAl 유전자를 probe로 하여 rna1-1 mutant 유전자를 cloning할 수 있었다. pUC19에 cloning된 RNA1유전자 및 rna1-1유전자로부터 다양한 Ba131유도체를 얻어 이들에 대한 염기 서열을 비교한 결과 transcription initation site에서부터 down stream쪽으로 17 아미노산위치에 TCC가 TTC로 대치되어 있었으며 그 결과 serine이 phenylalanine으로 변환되는 결과를 얻었다. Wild type RNAI gene의 5'-region에는 3군데의 TATA-like sequence가 true TATA box인지 확인하기 위하여 Bal3I deletion에 의해 -103nt까지 deletion된 유도체를 얻었으며 ${\Delta}RNAI$, rna1-1, 81-2-6 clone이 rna1-1 allele와 complementation한지 확인하였으나 ${\Delta}RNAI$은 TS-complementation을 하지 못하였다. 따라서 현재까지 TATA-box라고 알려진 부분은 promoter로 작용하지 못함을 확인하였다.

• 대한바이러스학회지
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• 제26권1호
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• pp.131-137
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• 1996

Hyphantria cunea nuclear polyhedrosis virus p10유전자와 프로모터의 염기서열을 결정하였고, p10단백질의 아미노산 서열을 유도했다. pBP10재조합클론 (Cha et. al., 1991)에 삽입이 되어있는 p10유전자의 염기서열을 결정한 결과 p10유전자의 ORF는 285 bp였고, p10단백질은 95개의 아미노산으로 구성 되었으며, 분자량은 10.26 kDa이었다. 프로모터내에는 TATA box와 전사개시부위인 TAAG 염기가 발견되었다. poly (A) signal부위인 AATAAA염기서열은 3'-말단상류의 65염기부위에 위치했다. p10단백질의 N-말단은 소수성이었으며, C-말단은 고도로 친수성이었다. p10단백질에는 cysteine, histidine, tryptophane, tyrosine, glutamine, asparagine잔기가 없었다.

• KSBB Journal
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• 제9권3호
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• pp.339-345
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• 1994

포도당 억제현상은 유전자 조작 및 induder에 의해 감소될 수 있다. UA8G와 GALl TATA box 사 이에서의 유전자 삭제는 포도당 억제현상을 줄이고 갈락토스가 존재하지 않는 조건에서 지속적인 유전자 발현을 도모했다. 상대적 inducer의 양(갈락토스/포 도당 농도의 비)은 유전자 발현 및 포도당 억제현상 에 영향을 주었다. 포도당 억제현상은 상대적 inducer의 양이 증가함에 따라 2-5배 정도 감소하였다. 또한 유전자 발현은 플라즈미드의 수에 좌우된다. 배지에 갈락토스만 았을 경우 유전자 발현은 플라즈 마드의 수가 증가함에 따라 증가하였다. 반면에 배지에 포도당과 갈락토스가 함께 있는 경우 (2% G Glu+2% Gal), 플라즈미드의 수는 유전자 발현에 별다른 영향을 주지 못했다. 그러나 높은 상대적 m­d ducer 양이 배지에 있는 경우 (0.4% Glu+0.8% Gal), 플라즈미드의 수가 증가함에 따라 유전자 발 현이 증가하였다. 즉, 포도당 억제현상을 줄임으로써 유전자 발현효율을 높이고자 할 때 갈락토스의 농도 를 증가시키는 경우보다는 포도당의 농도를 낮춤으 로써 상대적 inducer의 양음 높여 유전자 발현을 유 도하는 방법이 보다 효율적인 것으로 나타났다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제38권5호
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• pp.387-392
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• 1995

대두 glycinin 유전자의 조직 특이적이고 분화 발달 특이적인 발현 조절 메카니즘을 연구하기 위하여 Gy2 유전자의 5' upstream 부위 염기서열을 조사한 결과, glycinin 유전자의 발현을 조절하는 인자로 여겨지는 여러 가지 조절 인자들을 발견하였다. 진핵세포 유전자에 공통적으로 존재하는 TATA box와 AGGA box가 존재하고, 종자 저장 단백질에서 공통적으로 발견되는 embryo factor binding sequence, RY repeat CACA sequence, ${\beta}$-conglycinin enhancer 와 유사한 sequence 등이 발견되었다. 이러한 조절 요소들이 Gy2 유전자의 발현 조절에 미치는 영향을 알아보기 위해 Gy2유전자의 5' upstream부위를 Exo III nuclease와 여러가지 제한효소를 이용하여 일련의 deletion mutants를 제조한 후 GUS 유전자와 결합시켰다. 이들 여러가지 chimeric constructs를 대두 원형질체에 전입하고 원형질체로부터 추출물을 분리하여 GUS 활성을 조사한 결과, $-28l{\sim}-223$ 혹은 $-l70{\sim}-122$ 부위를 포함하였을 경우 활성이 감소하였고, $-223{\sim}-170$ 혹은 $-l22{\sim}-16$ 부위를 포함하였을 경우 활성이 높게 나타났다. 이러한 Gy2 유전자의 이중적인 발현 양상은 glycinin 유전자의 발현조절에 음성 조절 요소와 양성 조절 요소가 관여하고있다는 사실을 제시해 주고 있다. 또한 이들 여러가지 chimeric constructs로 형질 전환된 담배의 종자와 잎에서 GUS활성을 조사한 결과, CaMV promoter를 포함하는 chimeric construct는 종자와 잎에서 모두 활성을 나타냈으나, Gy2 Promoter를 포함하는 chimeric constructs는 종자에서만 GUS 활성을 나타내고 잎에서는 활성이 나타나지 않는 조직 특이적인 발현 양상을 나타내었다.

• Molecules and Cells
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• 제42권2호
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• pp.123-134
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• 2019

Lysophosphatidic acid (LPA) is an endogenous lysophospholipid with signaling properties outside of the cell and it signals through specific G protein-coupled receptors, known as $LPA_{1-6}$. For one of its receptors, $LPA_1$ (gene name Lpar1), details on the cis-acting elements for transcriptional control have not been defined. Using 5'RACE analysis, we report the identification of an alternative transcription start site of mouse Lpar1 and characterize approximately 3,500 bp of non-coding flanking sequence 5' of mouse Lpar1 gene for promoter activity. Transient transfection of cells derived from mouse neocortical neuroblasts with constructs from the 5' regions of mouse Lpar1 gene revealed the region between -248 to +225 serving as the basal promoter for Lpar1. This region also lacks a TATA box. For the region between -761 to -248, a negative regulatory element affected the basal expression of Lpar1. This region has three E-box sequences and mutagenesis of these E-boxes, followed by transient expression, demonstrated that two of the E-boxes act as negative modulators of Lpar1. One of these E-box sequences bound the HeLa E-box binding protein (HEB), and modulation of HEB levels in the transfected cells regulated the transcription of the reporter gene. Based on our data, we propose that HEB may be required for a proper regulation of Lpar1 expression in the embryonic neocortical neuroblast cells and to affect its function in both normal brain development and disease settings.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권7호
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• pp.1055-1059
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• 2003

Keratins, the constituents of epithelial intermediate filaments, are precisely regulated in a tissue and development specific manner. There are two types of keratin in bovine. The type I is acidic keratin and the type II is neutral/basic keratin. 1.5 kb of 5' flanking sequence of Korean cattle Keratin IV gene, type II keratin (59 kDa), was cloned and sequenced. A symmetrical motif AApuCCAAA are located in a defined region upstream of the TATA box. Proximal SP1, AP1, E-box and CACC elements as the major determinants of transcription are identified. When it was compared to the bovine sequence from -600 bp to ATG upstream, the homology was 97% in nucleotide sequence. Several A and T sequences, located in the promoter region, are deleted in the Korean cattle. An expression vector consisted of Korean cattle Keratin IV gene promoter/SV40 large T antigen was transfected to HaCaT cell (Epithelial keratinocyte). The transformed HaCaT cells showed active proliferation when treated with PDGF (Platelet-derived growth factor) in 0.3% soft agar compared to control cells. These results indicate that Korean cattle Keratin IVgene promoter can be used as a promoter for transfection into epithelial cell.

• 한국식물학회:학술대회논문집
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• 한국식물학회 1996년도 제10회 식물생명공학심포지움 고등식물 발생생물학의 최근 진보
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• pp.26-38
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• 1996

To investigate the regulation of plant histone H2A gene expression, we isolated two H2A genes (TH254 and TH274) from wheat, which encode different types of variants. Both genes had an intron in the coding region. In the promoters, some characteristics sequences, such as Oct and Nona motifs, which are conserved among plant histone genes were also found, and they were located in a short region (about 120 bp) upstream from the putative TATA box. Analyses of promoter activity with H2A-GUS fusion genes in the transient system using tobacco protoplasts revealed novel types of positive cis-acting sequences in the TH254 promoter: a direct repeat of a 13-bp sequence (AGTTACATTATTG) and a stretch composed of an AT-rich sequence (ATATAGAAAATTAAAA) and a G-box (CACGTG). A quantitative S1 assay of the mRNA amounts from the TH254/GUS and TH274/GUG chimeric genes in stably transformed and cell cycle-synchronized tobacco cell lines showed that the promoters of both genes contained at least one cis-acting element responsible for S phase-specific expression. Histochemical analysis of transgenic tobacco plants carrying the chimeric genes showed that the promoters of the two H2A genes were both active in developing seedlings and flower organs but regulated in different manner.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제23권1호
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• pp.55-61
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• 2019

To develop a promoter capable of driving transgene expression in non-model fish, we identified and characterized the muscle-specific alpha-actin gene in olive flounder, Paralichthys olivaceus (PoACTC1). The regulatory region of PoACTC1 includes putative regulatory elements such as a TATA box, two MyoD binding sites, three CArG boxes, and a CCAAT box. Microinjection experiments demonstrated that the regulatory region of PoACTC1, covering from -2,126 bp to +751 bp, just prior to the start codon, drove the expression of red fluorescent protein in developing zebrafish embryos and hatching olive flounder. These results suggest that the regulatory region of PoACTC1 may be useful in developing a promoter for biotechnological applications such as transgene expression in olive flounder.

• 생명과학회지
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• 제17권2호통권82호
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• pp.167-173
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• 2007

생쥐 신경교세포 유래 신경영양인자 유도성 전사인자(mGIF)의 발현조절에 필요한 전사기작을 연구하기 위하여 mGIF cDNA를 탐침자로 이용하여 genomic clone을 분리하였다. 전체 유전자 13-kb 영역 중 전사개시점에서 4-kb 상류영역의 유전자 서열을 파악한 결과, 프로모터 영역에서 TATA box와 CAAT box는 발견할 수 없었으며 G+C content는 높은 것으로 나타났고 여러 개의 Sp1 전사인자 결합영역이 있었다. 또한 mGIF 유전자는 AP2 결합에 필요한 보존적 영역이 있었다. mGIF 유전자의 프로모터 영역의 단편들을 프로모터가 없는 pGL2-Basic 플라스미드의 luciferase 유전자의 상류에 연결하여 서로 다른 5종류의 결손 돌연변이체를 제조하고 NB41A3 세포주를 이용하여 전사활성을 측정하였다. Transient expression assays 결과, 모든 결손 돌연변이체에서 전사활성이 나타났으며 -213과 -129사이에 전사촉진 영역이 존재하며 -806과 -214사이에 전사억제 영역이 있는 것으로 나타났다. 신경세포주인 NB41A3과 신경교세포주인 C6 그리고 간세포주인 HepG2에서 mGIF 유전자 프로모터의 높은 활성이 관찰되었으며, 근육세포주인 C2C12에서는 낮은 활성이 관찰되었다. 따라서 mGIF 유전자는 조직특이적으로 발현하며 도파민 수용체 유전자와 구조적, 기능적 유사성이 있는 것을 알 수 있었다.

• Journal of Microbiology
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• 제44권5호
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• pp.515-522
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• 2006

A cDNA library of Ganoderma lucidum has been constructed using a Zap Express cloning vector. A glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene (gpd) was isolated from this library by hybridization of the recombinant phage clones with a gpd-specific gene probe generated by PCR. By comparison of the cDNA and the genomic DNA sequences, it was found that the complete nucleotide sequence encodes a putative polypeptide chain of 338 amino acids interrupted by 6 introns. The predicted amino acid sequence of this gene shows a high degree of sequence similarity to the GPD proteins from yeast and filamentous fungi. The promoter region contains a CT-rich stretch, two CAAT boxes, and a consensus TATA box. The possibility of using the gpd promoter in the construction of new transformation vectors is discussed.