• 제목/요약/키워드: T/R probe

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Development of a real-time PCR method for detection and quantification of the parasitic protozoan Perkinsus olseni

  • Gajamange, Dinesh;Yoon, Jong-Man;Park, Kyung-Il
    • 한국패류학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.387-393
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    • 2011
  • The objective of this study was to develop a real-time PCR method for the rapid detection and quantification of the protozoan pathogen Perkinsus olseni using a TaqMan probe. For the standard, genomic DNA was extracted from $10^5$ in vitro-cultured P. olseni trophozoites, and then 10-fold serial dilutions to the level of a single cell were prepared. To test the reliability of the technique, triplicates of genomic DNA were extracted from $5{\times}10^4$ cells and 10-fold serial dilutions to the level of 5 cells were prepared. The standards and samples were analyzed in duplicate using an $Exicycler^{TM}$ 96 real-time quantitative thermal block. For quantification, the threshold cycle ($C_T$) values of samples were compared with those obtained from standard dilutions. There was a strong linear relationship between the $C_T$ value and the log concentration of cells in the standard ($r^2$ = 0.996). Detection of DNA at a concentration as low as the equivalent of a single cell showed that the assay was sensitive enough to detect a single cell of P. olseni. The estimated number of P. olseni cells was similar to the original cell concentrations, indicating the reliability of P. olseni quantification by real-time PCR. Accordingly, the designed primers and probe may be used for the rapid detection and quantification of P. olseni from clam tissue, environmental water, and sediment samples.

Duchenne Muscular Dystrophy에 관한 세포유전학 및 분자유전학적 연구 (Cytogenetic and Molecular Genetic Studies on Duchenne Muscular Dystrophy)

  • 홍해숙
    • Journal of Korean Biological Nursing Science
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    • 제7권1호
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    • pp.29-46
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    • 2005
  • Purpose ; 본 연구는 X-염색체와 관련된 장애 중에서 가장 흔하고 심한 Duchenne Muscular Dystrophy(DMD)의 세포유전학 및 분자유전학적 특성을 설명하기 위해서 DMD에 영향을 받고 있는 두 가계의 13명을 대상으로 가계도 분석과 염색체 분석 및 DNA 분석을 하였다. Method ; DNA분석은 DNA probe을 이용한 Southern blotting method로써 RFLPs와 DMD유전자 부위의 exon소실 유무를 조사하여 아래와 같은 결과를 얻었다. Conclusion ; A 염색체 분석 : 말초혈액과 양수를 표본으로 High-Resolution GTG염색에서 A가계와 B가계의 염색체 분석에서 12명의 염색체는 정상 X-염색체였으나 B가계의 I-2(DMD여성)에서 46, x,-x,+t(2:x)(q 21.1 : p21.2)로 나타난다. B. DNA분석3 : 1) RFLPs의 분석 J66,XJ-1.1,754-11로써 B가계의 RELPs(Restriction Fragment Length Polymorphisms)에서 J66/Pst I은 1.7hb(E), 1.6kb(e)을 보여 주었고 XJ-1.1/Taq I은 3.6kb(F), 3.0kb(f), 754-11/EoR I은 4.2kb(G), 2.0kb(g)의 대립인자를 나타내었다. 이상의 결과를 바탕으로 영향을 받고 있는 남자 (II-2)의 haplotype는 보인자인 어머니의 한쪽 인자를 받았으며 어머니와 딸은 보인자이고 임산부의 태아는 남아였고 태아의 인자들은 그의 할아버지로부터 물려받아 DMD에 영향을 받지 않은 것으로 진단되었다. 2) DMD 유전자의 exon 소실에 대한 분석 cDNA probe 8과 cDNA probe 2b-3으로써 소실에 대한 진단은 영향을 받은 남자(II-2)는 cDNA probe 8에서 12, 7.3, 6.6, 4.2kb에 소실이 있고 cDNA 2b-3은 1.7kb에 소실에 나타났다.

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접지저항 측정의 61.8%법칙 적용의 맹점과 현실적 접근 방법 (Myth of 61.8% rule and the practical application notices)

  • 이상무;조평동
    • 한국정보통신설비학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신설비학회 2005년도 하계학술대회
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    • pp.259-262
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    • 2005
  • 3점전위강하법을 이용한 접지저항을 측정하는데 있어서 관건이 되는 것은 전류전극에까지 이르는 직선 거리상에서 어느 지점에 접지저항의 참값이 존재하는 지를 찾는데 있다. 그러한 전위점 변화에 영향을 미치는 최대의 변수는 토양의 구성 조건이다. 61.8%법칙은 토양이 균일한 경우의 접지저항 참값을 나타내는 전위점(이하 $R_t$)을 말하는 것이다. 이종 토양구성인 경우 $R_t$는 61.8%에 있지 않으며 이에 대하여는 Dawalibi의 논문에 여러 토양 구성의 기본 모델에 대한 실험적 $R_t$를 제시하고 있다. 이러한 것은 토양의 구성 조건을 안다는 전제하에 적용할 수 있는 것이며 실제의 측정 환경에 있어서 특별히 분석을 하지 않는 한, 토양의 구성이 어떠한 특성으로 이루어져 있는 지를 알고 측정한다는 것은 현실적으로 불가능한 일이다. Dawalibi의 논문을 분석하여 보면 $R_t$에 변이를 일으키는 것은 이종 토양 구성에 의한 대지저항률의 차이에 의한 것임을 알 수 있다. 결론적으로 $R_t$는 대지저항률이 낮은 토양 쪽으로 이동하게 되는데 이것이 전위차 특성 그래프의 기울기상에 변화를 준다. 즉 $R_t$는 전위차 곡선의 기울기에 따라 변화하고 전위차 곡선의 기울기는 인근 토양 구성에 의한 영항을 받으므로 이들의 정량적 상관 관계를 분석하여 원리적 변화 규칙을 정형화하면 굳이 토양의 구성 상태를 알지 않고도 $R_t$를 산출할 수 있는 방법을 도출한 수 있으며 역으로 토양의 구성 특성을 감지할 수 있는 측정 방법을 수립할 수도 있다. 본 논문에서는 이러한 취지의 정량 관계 해석을 통한 현실적 측정 방법을 제공한다.분야 별로 아키텍쳐 정도가 다르게 나타나고 있었다(전자 부품은 분야는 오히려 모듈형에 가까웠음). 비단 항공기 개발과정 뿐만 아니라 다른 산업, 제품에도 적용될 수 있는 틀을 마련함으로써, 기존 연구개발기회에서 산업기술 분석을 통한 체계적 기획으로 전환할 수 있는 새로운 대안을 제시한다. 결과적으로 산업기술의 특성과 구조를 반영한 기술개발 방법론으로 아키텍쳐 이론을 적용할 수 있는 단초를 마련했으며, 이것은 본 논문이 기대하는 바이기도 하다.쁖잖⨀쁖잖⨀/ࠐ쁡잖⨀焆덐瀆倆Ā뫫뫫ĀĀĀĀꪛ䂇잖⨀?잖⨀⁅잖⨀耇잖⨀梷熸ጁ庆䌀―?⨀က䀜徾遖洀ᘘ⼄ⴟᠯЭ⠘

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3중 DNA probe를 이용한 FISH(fluorescence in situ hybridization) 기법으로 방사선에 의한 염색체 이상 분석 (Analysis of Chromosome aberrations by fluorescence in situ hybridization using triple chromosome-specific probes in human lymphocyte exposed to radiation)

  • 정해원;김수영;하성환
    • Journal of Radiation Protection and Research
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    • 제24권1호
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    • pp.45-53
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    • 1999
  • 각 염색체에 특이한 DNA probe를 이용하는 FISH기법은 방사선에 의해 유발된 상호전좌 및 삽입 등의 염색체의 구조적 변화를 측정하는 매우 효과적인 방법으로서 그 활용성이 증가되고 있다. 본연구는 방사선 피폭시 생물학적 선량측정법으로서 FISH기법을 활용하기 위하여 사람의 1, 2, 4번 염색체에 특이한 probe를 이용하여 고선량 단일 피폭시 유발된 각종 염색체 이상빈도를 관찰하고 이를 PAINT분류체계에 의해 분석하였다. 방사선 조사에 의한 염색체 이상빈도는 상호전좌(t)와 이동원염색체(dic)의 수가 선량 증가에 따라 같이 증가하는 것을 알 수 있으며 color junction의 수도 선량에 따라 증가하는 것을 알 수 있었다. 상호전좌의 빈도는 이동원 염색체의 빈도보다 상대적으로 높게 나타났다. 삽입(ins), 무동원염색체(ace), 및 환상염색체(r)의 수도 선량 증가에 따라 같이 증가하는 것을 알 수 있었다. 기존의 염색체재배열 분석방법과 비교해 볼 때 FISH기법은 다양한 형태의 염색체재해열을 보다 쉽게 관찰할 수 있게 하며 생물학적 선량제로서 중요한 역할을 할 것이라 기대된다.

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소형 원형편파 UHF RFID 대역 융합형 안테나 설계 (A Design of a circularly polarized small UHF RFID antenna)

  • 채규수
    • 한국융합학회논문지
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    • 제6권1호
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    • pp.109-114
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    • 2015
  • 본 논문에서는 UHF 대역의 RFID 리더기에 적용 가능한 소형 융합형 원형편파 안테나가 제시되었다. 안테나는 플라스틱 재질의 지지구조물(${\varepsilon}_r=2.2$, 두께=5mm)에 방사용 도전체를 표면에 인쇄하는 방법으로 제작 되었다. 안테나의 급전 부는 FR-4 기판(t=1.0mm, ${\varepsilon}_r=4.7$)을 사용하여 제작하였다. 안테나와 급전부에 대한 시뮬레이션이 CST를 이용해서 이루어졌고, 이 결과에 따라 안테나와 급전부가 제작되었다. 동작 주파수 대역에서 안테나 특성은 -12dB 궤환 손실을 얻었고, 3.46dBic의 방사이득이 예측되었다. 시뮬레이션 결과를 바탕으로 2개의 안테나 샘플이 제작되었고, 이를 이용해서 안테나 특성을 측정하였다. 측정된 결과는 제안된 안테나가 소형기기에 적용하기에 적합할 것으로 예상되며, 향후 안테나 파라미터 최적화 과정을 거쳐 상용제품에 적용 가능한 융합형 안테나가 설계될 것이다.

상아질 결합제가 컴포머의 불소유리에 미치는 영향에 관한 연구 (A STUDY ON THE EFFECT OF DENTIN ADHESIVE TO FLUORIDE RELEASE OF COMPOMER)

  • 윤여상;김종수;권순원;김용기
    • 대한소아치과학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.228-237
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    • 2001
  • 본 연구의 목적은 와동 충전시 충전재와 치질 사이에 개재되는 상아질 결합제가, 수복물에서 유리되는 불소가 와동 벽으로 침투하는 과정에 어떠한 영향을 주는지를 조사함이었고, 부가적으로 레진 강화형-글라스 아이오노머 시멘트의 접착에도 상아질 결합제를 도포 하는것이 치질과의 결합력을 강화시킬 수 있는지에 대해 평가하고자 하였다. Fuji II $LC^{(R)}$와 Dyract $AP^{(R)}$를 선정하여 상아질 결합제의 도포 여부에 따른 불소 유리량 측정과 전단 결합 강도를 비교분석하였으며, 치질 내로의 불소 침투 양상은 교환 시기에 있는 제2유구치에 Fuji II $LC^{(R)}$와 Dyract $AP^{(R)}$를 충전하고 3주내에 발거하여 EPMA로 분석하였다. 상아질 결합제는 불소 유리량을 현저하게 감소시키는 것으로 나타났으며(p<0.05) Fuji II $LC^{(R)}$의 경우 상아질 결합제의 도포가 결합강도를 증가시키지 못하였다. EPMA 분석결과 상아질 결합제는 충전재로부터 유리되어 나오는 불소가 치질 내로 확산되는 것을 방해하는 것으로 확인되었다.

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Milk Fat Analysis by Fiber-optic Spectroscopy

  • Ohtani, S.;Wang, T.;Nishimura, K.;Irie, M.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권4호
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    • pp.580-583
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    • 2005
  • We have evaluated the application of spectroscopy using an insertion-type fiber-optic probe and a sensor at wavelengths from 400 to 1,100 nm to the measurement of milk fat content on dairy farms. The internal reflectance ratios of 183 milk samples were determined with a fiber-optic spectrophotometer at 5$^{\circ}C$, 20$^{\circ}C$ and 40$^{\circ}C$. Partial least squares (PLS) regression was used to develop calibration models for the milk fat. The best accuracy of determination was found for an equation that was obtained using smoothed internal reflectance data and three PLS factors at 20$^{\circ}C$. The correlation coefficients between predicted and reference milk fat at 5$^{\circ}C$, 20$^{\circ}C$ and 40$^{\circ}C$ were r=0.753, r=0.796 and r=0.783, respectively. The predictive explained variances ($Q^2$) of the final model, moreover, were more than 0.550 at all temperatures, and the regression coefficients of determination ($R^2$) were more than 0.6 (60%). Our results indicate that milk has different internal reflectance measured in the range of visible and near infrared wavelengths (400 to 1,100 nm), depending on its fat content.

VHL Gene Mutation Analysis of a Chinese Family with Non-Syndromic Pheochromocytomas and Patients with Apparently Sporadic Pheochromocytoma

  • Zhang, Bin;Qian, Jing;Chang, De-Hui;Wang, Yang-Min;Zhou, Da-Hai;Qiao, Gou-Mei
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권5호
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    • pp.1977-1980
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    • 2015
  • Objective: The Von Hippel-Lindau syndrome (VHLD), an inherited neoplastic syndrome predisposing to central nervous system hemangioblastoma (CNS), pheochromocytoma (PCC), renal cell carcinoma(RCC), retinal hemangioma (RA) and renal cysts, is caused by mutations or deletions of the VHL tumor-suppressor gene. To assess VHL genotype-phenotype correlations with function of pVHL a gene mutation analysis of members in a Chinese family with non-syndromic PCCs and individuals with apparently sporadic pheochromocytoma (ASP) was performed. Materials and Methods: DNA samples of 20 members from the Chinese family with non-syndromic PCCs and 41 patients with ASP were analyzed by polymerase chain reaction and direct sequencing, confirmed by Taqman probe. Results: Three novel mutations (H125P, 623(^TTTGTtG) and R120T) were identified in the Chinese family and in 3 among 41 ASP patients. The mutations were all located in exon 2 of VHL gene encoding ${\beta}$-domain of pVHL. The tumor type in H125P carriers and R120T carriers was VHL type 2C. And 623(^TTTGTtG) carriers presented VHL type 2B or type 2C. Conclusions: VHL gene abnormalities were identified in the Chinese family with non-syndromic PCCs and patients with APS, resulting in dysfunction of pVHL. H125P and R120T could be associated with VHL type 2C, while 623(^TTTGTtG) might be linked with VHL type 2B or type 2C. Not only is the genetic analysis helpful for early diagnosis and treatment of patients with VHLD, it is also benefitial for research intoVHLD pathogenesis.

Relationship of Oral Bacterial Load Over One Year of Smoking Cessation

  • Kim, Sunghyun;Seo, Min-Seock;Hwang, Soo-Jeong
    • 치위생과학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.213-219
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    • 2019
  • Background: Smoking exerts an adverse effect on the periodontal tissue by reorganizing the ecosystem of oral microorganisms and is considered to be an important factor in the development of periodontal disease. Although cross-sectional studies on smokers and non-smokers have been attempted to investigate the microbial differences in periodontal oral cavity, only few studies have been conducted to investigate the changes in oral microorganisms during smoking cessation. The purpose of this study was to investigate the changes of bacteria in saliva and gingival crevicular fluid (GCF) over a period of one year among 11 smokers trying to quit smoking. Methods: Eleven smokers trying to quit smoking visited the clinic at baseline, two weeks, two months, four months, six months, and 12 months to give saliva and GCF samples. The amounts of 16S rRNA, Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Prevotella intermedia, Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum, Streptococcus mutans, and Streptococcus sobrinus in saliva and GCF were quantified using real-time polymerase chain reaction TaqMan probe assay. The results were analyzed by nonparametric statistical analysis using Friedman test and Spearman correlation coefficient. Results: After cessation of smoking, the amounts of 16S rRNA corresponding to P. gingivalis, F. nucleatum, P. intermedia, and T. denticola in saliva decreased and then again increased significantly. The amount of F. nucleatum 16S rRNA in GCF decreased significantly after smoking cessation. Positive correlations were observed between 16S rRNA and F. nucleatum and between F. nucleatum and T. denticola in saliva and GCF. Conclusion: Even if the number of subjects in this study was small, we suggest that smoking cessation may reduce the total bacterial amount and F. nucleatum in GCF. However, the results regarding changes in the microbial ecosystem due to smoking or smoking cessation were inconsistent. Therefore, further in-depth studies need to be carried out.

초소형 40 GHz Hairpin 대역통과 여파기 (Compact 40 GHz Hairpin Band-Pass Filter)

  • 이영철
    • 한국항행학회논문지
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    • 제22권1호
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    • pp.27-30
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    • 2018
  • 본 연구에서는, 밀리미터파 무선 통신 시스템 응용을 위하여 hairpin 구조를 응용한 40 GHz 대역통과 여파기 (BPF; band pass filter)를 설계 및 제작하여 그 특성을 측정하였다. 3차원 전자계분석 툴과 hairpin BPF 설계 수식을 이용하여, 비유전율 2.2와 5 mil 두께의 Duroid (RT5880) 기판에 BPF를 설계하였다. 입 출력단에서 U-shape 공진기의 tapping 위치(t)는 external Q-factor ($Q_e$)를 추출하여 결정하였고, 다른 공진기들 사이의 커플링 계수는 필터 특성을 고려하면서 물리적 치수를 조정하여 결정하였다. 제작된 hairpin BPF는 probe station에서 probing 방법으로 측정하였고, 중심 주파수와 대역폭은 각각 41.61 GHz 그리고 7.43 %으로 나타났다. 측정된 입력 및 출력 반사 손실은 통과 대역에서 -10 dB 이하 이고 측정된 삽입손실은 -3.94 dB이다. 제작된 여파기의 크기는 $9.1{\times}2.8mm^2$ 이다.