• 제목/요약/키워드: Subgenus Rhizirideum

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Phylogenetic Analyses of Nuclear rDNA ITS Sequences of Korean Allium L. Subgenus Rhizirideum(Alliaceae)

  • Lee, Nam-Sook
    • Animal cells and systems
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    • 제5권4호
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    • pp.283-290
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    • 2001
  • Phylogenetic relationships among the Korean taxa of the genus Allium subgenus Rhizirideum and some related taxa were assessed on the basis of in sequences of nuclear ribosomal DNA. Twenty-eight accessions of the genus Allium L. consisting of subgenera Rhizirideum (19 taxa), Allium (5 taxa) and Amerallium (one taxon) were analyzed. The variation in the ITS region was informative at the levels of section except for sect. Reticulato- bulbosa which is known to be of multiple origin. The ITS 2 region was longer than the ITS 1 region, and all of the investigated Allium taxa were the same in length in the 5.8S region except for A. monanthum. Allium cyaneum var. cyaneum was the shortest (635 bp) and A. victorialis the longest (646 bp) among the investigated Korean taxa. The three morphologically similar taxa, A. thunbergii, A. sacculiferum that has been included in A. thunbergii, and A. deltoid- fistulosum, had the same ITS lengths of 641 bp, but were clearly distinguished in the phylogenetic analysis of their ITS sequences.

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Phylogenic Relationship of Allium Species in Subgenus Rhizirideum by PCR DNA Fingerprint

  • Kim, Haeng-Hoon;Kang, Hee-Wan;Park, Yong-Jin;Baek, Hyung-Jin;Gwag, Jae-Kyun
    • 한국작물학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.328-333
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    • 2001
  • Allium is one of the largest genera, which has more than 700 species. PCR by URP (universal rice primer) primers was carried out to get phylogenetic information on 26 species, 62 accessions of subgenus Rhizirideum. The accessions were divided into seven groups at 0.76 similarity level. A. tuberosum (Chinese chives) and A. ramosum represented high similarity of 0.91. A. montanum, A. nutans, A. senescens, A. libani, A. odorum, A. austrosibiricum, and A. narcissiflorium grouped at 0.80 similarity. Some of the wild species, such as A. prostratum, A. polyrhizum, A. odorum, and A. mongolicum, showed different band patterns according to polyploidy, occurrence of B-chromosome, collection site, and origin.

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Phylogenetic Relationships among Allium subg. Rhizirideum Species Based on the Molecular Variation of 5S rRNA Genes

  • Do, Geum-Sook;Seo, Bong-Bo
    • Animal cells and systems
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    • 제4권1호
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    • pp.77-85
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    • 2000
  • This study has demonstrated the molecular variation of 5S rRNA genes in 15 Allium subgenus Rhizirideum and 1 Allium subg. Allium. For cloning of the 5S rRNA genes, PCR products were obtained from amplification with oligonucleotide primers which were derived from the conserved coding region of 5S rRNA genes. These amplified PCR products were cloned and identified by FISH and sequence analysis. The 5S rRNA loci were primarily located on chromosomes 5 and/or 7 in diploid species and various chromosomes in alloploid species. The size of the coding region of 5S rRNA genes was 120 bp in all the species and the sequences were highly conserved within Allium species. The sizes of nontranscribed spacer (NTS) region were varied from 194 bp (A. dektiude-fustykisum, 2n=16) to 483 bp (A. sativum). Two kinds of NTS regions were observed in A. victorialis var. platyphyllum a diploid, A. wakegi an amphihaploid, A. sacculiferum, A. grayi, A. deltoide-fistulosum and A. wenescens all allotetraploids, while most diploid species showed only one NTS region. The species containing two components of NTS region were grouped with different diploid species in a phylogenetic tree analysis using the sequences of 5S rRNA genes and adjacent non-coding regions.

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부추속(Allium L.) 잎 표피의 구조와 이의 분류학적 중요성 (Leaf epidermal structure of the Allium L. and its taxonomic significance)

  • 최혁재;장창기;고성철;오병운
    • 식물분류학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.97-118
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    • 2004
  • 부추속 분류군들에 대한 광학현미경 및 주사전자현미경에 의한 잎 표피의 해부학적 및 미세구조적 연구를 수행하였다. 그 결과를 토대로 종 수준 또는 절이나 아속의 수준에서 각 분류군의 주요형질 및 형질의 변이 한계를 파악하였다. 잎 표피세포의 모양은 장방형에서부터 아주 긴 선형으로 관찰되었고, 크기는 분류군에 따라 다양하였다. 엽신이 넓은 달래절, 산마늘절, 두메부추절 등에 속하는 분류군의 표피세포는 장방형으로 선형을 가지는 다른 절로부터 이들을 구분되었다. 산마늘절의 잎은 이면기공엽으로 관찰되어 양면기공엽을 가지는 나머지 분류군들과는 구분되었다. 기공복합체에서 공변세포 크기는 각 분류군 간에 거의 변이가 나타나지 않았다. 단위면적 당 기공의 수는 표피세포의 크기가 커지면 적어지고, 세포의 크기가 작아지면 많아지는 것으로 관찰되었다. 엽신이 넓고, 표피세포의 모양이 장방형인 산마늘절에서는 다른 선형의 세포를 가진 종에서 보다 아주 적게 나타났다. 관찰된 모든 분류군에서는 불규칙형 기공이 나타났다. SEM에 의한 잎 표피세포의 미세구조 관찰 결과, 표피 외벽의 융기 형태와 wax의 침적 양상이 종간에 다소 다양한 형태로 관찰되었다. 세포 표면이 융기된 돌기물의 형태는 달래절과 산마늘절에서는 나타나지 않았으나 달래절에서는 세포벽의 표면에 주축과 수직인 방향으로 미세무늬가 나타났고 산마늘절에서는 평행인 미세무늬가 나타났다. 세포벽 외부의 돌기물의 구조는 돌추절과 두메부추절에서는 뚜렷한 선모양으로, 노랑부추절에서는 미약한 선모양으로 관찰되었으나, 다른 분류절에서는 관찰되지 않았다. 달래절과 산마늘절의 분류군을 제외한 다른 분류군에서는 왁스가 침적되어 있는 것으로 관찰되었다.