• The Plant Pathology Journal
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• 제27권2호
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• pp.187-190
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• 2011

Symptoms induced in the leaves of strawberry (Fragaria x ananassa Duch.), 'Seolhyang' and 'Eyeberry', were mosaic, distortion and black colored edge on leaves at Nonsan area, one of the important production areas in Korea. Electron microscopy by quick-dip revealed the flexuous rod-shape particles having about 550-600 nm length. Cytoplasmic inclusion bodies composed of aggregated virus particles were observed frequently in mesophyll parenchyma and epidermal cells for the leaves of strawberry. The specific primers amplifying products of 635 bp and 729 bp were developed for RT-PCR detection of Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV). Nucleotide identity of the CP gene of SMYEV was 92.8-99.2% with those of other SMYEV isolates from Gen-Bank database.

• 식물병연구
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• 제26권3호
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• pp.170-178
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• 2020

바이러스의 정확한 진단법 확립은 바이러스의 피해 및 확산을 예방하는데 매우 중요하게 작용한다. 대부분의 딸기 바이러스는 조직내에 낮은 역가로 분포하여 진단이 어렵고, 특히 딸기 조직은 다당류 및 페놀화합물의 함유가 많아 RNA 추출이 어려운 것으로 알려져 있다. 딸기 우량묘 생산에 필요한 바이러스 검정기술을 확립하기 위해 본 연구에서는 딸기 잎에서 바이러스 진단을 위해 가장 최적의 RNA 추출방법 정립을 위해 다양한 상용 키트와 시약을 이용하여 RNA 추출효율 비교하였다. 바이러스 진단을 통한 RNA 추출효율을 분석하기 위해 SMoV 감염주인 미홍 딸기 품종을 이용하여 다양한 단계에서 잎조직으로부터 RNA를 추출하고 바이러스 진단을 수행하였다. 식물 RNA 추출 방법 가운데 상업용으로 판매되는 RNeasy plant mini kit (Qiagen)를 이용하는 경우 본 연구에서 살펴본 one-step 또는 two-step RT-PCR 방법과 무관하게 SMoV의 검출이 잘 되었다. 또한, 딸기 우량묘의 바이러스 검정에 대한 신뢰있는 진단방법을 구축하기 위해 주요 딸기 바이러스인 strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), strawberry mottle virus (SMoV), strawberry latent ringspot virus (SLRSV), strawberry crinkle virus (SCV), strawberry pallidosis associated virus (SPaV), strawberry vein banding virus (SVBV) 및 strawberry necrotic shock virus (SNSV) 7종에 대한 유전자 합성을 통해 진단클론을 제작하였다. 각 클론의 합성유전자를 기반으로 7종의 딸기바이러스 프라이머 세트를 설계하고 편리한 진단법 수행을 위해 동일한 PCR 조건을 설정하였다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제18권1호
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• pp.1-5
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• 2002

The availability of nucleotide sequences of the coat protein gene of Potato leafroll virus (PLRV) permitted the construction of DNA primers that were utilized for cDNA synthesis. Polymerase chain reaction (PCR) products of a 487 bp. and approximately 500 bp DNA fragments were amplified from nucleic acid extracts of PLRV-infected tissue and strawberry mild yellow-edge (SMYE) diseased strawberry tissue, respectively. The amplified DNA fragments were further differentiated by hybridization analysis with a CDNA probe for the coat protein gene of PLRV and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. These results suggest that a luteovirus is associated with the SMYE disease.

• 식물병연구
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• 제25권4호
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• pp.226-232
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• 2019

딸기를 감염하는 30여 종의 바이러스 중 전 세계적으로 가장 많이 발생하는 4종의 바이러스는 Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry mottle virus (SMoV), Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry vein banding virus (SVBV)로 이들은 모두 진딧물이 전반되며 경제적으로 가장 중요한 바이러스들이다. 2018-2019년까지 국내 주요 딸기 생산지에서 국내 딸기 품종을 대상으로 이들 4종 진딧물 전반 바이러스의 발생조사를 실시하였다. 그 결과, 일부 국내 딸기 품종에서 SMYEV와 SMoV가 각각 0.7%와 1.3%의 낮은 감염률로 검출되었으며 SCV와 SVBV는 전혀 검출되지 않았다. 한편, 바이러스 감염 식물에서 병징은 관찰되지 않았다. 국내에서 SMoV에 대한 염기서열은 보고된 바 없어 SMoV 국내분리주에 대한 3' untranslated region의 염기서열을 결정하고 분석하였다. 기존에 보고된 SMoV 분리주들과의 분자계통학적 유연관계 분석 결과, 대부분의 국내 분리주는 캐나다 분리주와 근연관계가 높은 것으로 나타났으며 염기서열의 진화적 측면에서 분화가 거의 일어나지 않은 분리주임을 확인하였다.

• 식물병연구
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• 제15권1호
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• pp.8-12
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• 2009

Virus disease surveys of strawberries cultivated and preserved as germplasm resources in Korea was conducted during 2007-2008. Virus detection was conducted by RT-PCR using total RNAs extracted from strawberry samples. We detected the infection with Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), Strawberry mottle virus (SMoV), Strawberry vein banding virus (SVBV) and Strawberry pallidosis associated virus (SPaV) while no infection with Strawberry crinkle virus (SCV), Strawberry necrotic shock virus (SNSV), Strawberry latent ring spot virus (SLRSV) and Arabis mosaic virus (ArMV) was observed. The infection rate of virus disease on 4 cultivars including Seolhyang, Maehyang, Gumhyang, and Dahong, bred in Korea, was 0.1, 1.9, 0, and 0%, respectively. Surprisingly, however, cultivar Red Peal introduced from Japan in 1997 revealed 48.3% virus infection rate. SMYEV, SMoV and SPaV were also identified in strawberries growing in the farm fields of Korea. In the field, however, SMYEV was the most predominant virus (97.4%) among those 3 identified viruses. SVBV was detected only in strawberry kept as a germplasm.

• 식물병연구
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• 제24권4호
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• pp.285-291
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• 2018

국내육성딸기 품종인 설향과 감홍에서 딸기누른오갈바이러스의 국내 분리주 2종을 분리하고 외피단백질 전체 염기서열을 결정하고 분석하였다. 국내 분리주 SH와 KH의 외피단백질 염기와 아미노산 상동성은 각각 90.4%와 95.5% 였다. 기존에 국내에서 보고된 KNS1분리주와 GenBank에 등록된 45개의 다른나라 분리주 외피단백질 염기서열을 모두 수집하여 총 48개 SMYEV 외피단백질에 대한 계통학적 유연관계를 분석할 결과 총 5개의 subgroup (I-V)으로 분류가 되었다. 이 중 subgroup IV과 V과 새로운 변이집단으로 국내분리주도 KH와 KNS1은 subgroup I에 포함된 반면, SH는 새로운 subgroup인 IV에 포함되어 국내분리주간에도 계통이 다른 것을 추측할 수 있었다. 유전적 다양성 분석결과 SMYEV의 새로운 subgroup의 다양성이 더욱 높은 것으로 나타나 SMYEV가 유전적으로 진화를 하고 있음을 알 수 있었다. 이 논문은 국내 SMYEV 분리주에 대한 분자적 특성에 대한 첫 보고이다.