• 한국시뮬레이션학회논문지
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• 제22권4호
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• pp.139-147
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• 2013

본 논문에서는 질량 분석 방법에 의하여 산출된 단백체 데이터(mass spectrometric proteomic data)의 분류 분석(classification analysis)을 위한 새로운 특성 선택(feature selection) 방법을 제안한다. 이 방법은 i)높은 상관관계를 가지는 중복된 특성을 효과적으로 제거하는 전처리 단계와 ii)토너먼트(tournament) 전략을 사용하여 최적 특성 부분집합(optimal feature subset)을 탐색해 내는 단계로 구성되어 있다. 제안되는 방법을 실제 암진단에 사용되는 공개된 혈액 단백체 데이터에 적용하였으며 널리 사용되는 타 방법과 비교할 때 우수한 성능과 균형된 특이도와 민감도를 달성함을 실증하였다.

• 한국유전체학회:학술대회논문집
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• 한국유전체학회 2006년도 The 15th Korean Genome Organization Conference KOGO 2006 Annual Meeting
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• pp.41-41
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• 2006

• 대한화학회지
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• 제7권2호
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• pp.165-169
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• 1963

시금공정의 시료중의 금의 정성 및 정량을 열중성자에 의한 방사화분석으로 조사하였다. 회수률은 81.0∼93.6%이고 결과는 재현성이 좋았다. 정양적 결과는 ${\gamma}$-Spectrometric photopeak-area counting으로 얻었으며 속중성자반응으로 인한 간섭은 무시할 수 있었다.

• 지구물리와물리탐사
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• 제19권4호
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• pp.179-186
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• 2016

기준탐사를 이용하여 IAEA의 기준에 부합하는 방사능 함량도를 제작하는 일련의 절차 중에서 기존의 자료를 기준탐사 자료를 이용한 자료 맞추기(leveling)는 기존 자료들이 가지고 있는 정보들을 보존하면서도 자료들을 부드럽게 취합할 수 있도록 해야 한다. 기존의 논문에서 제시된 방법은 기존의 자료가 갖고 있던 소규모 이상대 정보가 많이 손상되는 등 원자료의 특성을 잃어버릴 염려가 있다. 이 논문에서는 기존 방사능 자료를 기준탐사 자료에 맞추는 방법에 대해 자세히 논술하고, 새로운 맞추기 방법을 제안한다. 새로운 방법은 기존의 자료를 모두 그대로 이용하는 것이 아니라 기준탐사의 측점과 일치하는 격자 자료만을 이용하여, 광역장(regional field)과 남은장(residual field)으로 나누어 광역장만으로 맞추기 계수를 결정하고 광역장과 남은장에 별도의 방법으로 적용하여 더해주는 것이다. 이 방법은 기존의 방법보다 자료를 보다 부드럽게 일치시키고, 자료 분포의 경향성을 더욱 잘 보여주며, 높은 진동수 정보를 잘 보존한다는 것을 보여준다.

• Journal of Biosystems Engineering
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• 제33권1호
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• pp.63-68
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• 2008

This study was carried out to find a useful method to predict hardness of tomato using optical spectrum data. Optical spectrum of reflectance and transmittance data were collected processed by 9 kind of preprocessing methods-normalizations of mean, maximum and range, SNV (standard normal variate), MSC (multiplicative scatter correction), the first derivative and second derivative of Savitzky-Golay and Norris-Gap. With the preprocessed and non-processed original spectrum data, prediction models of hardness of tomato were developed using analytical tools of PLS (partial least squares) and MLR (multiple linear regression) and tested for their validation. The test of validation resulted that the analytical tools of PLS and MLR output similar performances while the transmittance spectra showed much better result than the reflectance spectra.

• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
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• pp.313-318
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• 2005

Estimating the reliability of protein-protein interaction data sets obtained by high-throughput technologies such as yeast two-hybrid assays and mass spectrometry is of great importance. We develop a maximum likelihood estimation method that uses both protein localization and gene expression data to estimate the reliability of protein interaction data sets. By integrating protein localization data and gene expression data, we can obtain more accurate estimates of the reliability of various interaction data sets. We apply the method to protein physical interaction data sets and protein complex data sets. The reliability of the yeast two-hybrid interactions by Ito et al. (2001) is 27%, and that by Uetz et at.(2000) is 68%. The reliability of the protein complex data sets using tandem affinity purification-mass spec-trometry (TAP) by Gavin et at. (2002) is 45%, and that using high-throughput mass spectrometric protein complex identification (HMS-PCI) by Ho et al. (2002) is 20%. The method is general and can be applied to analyze any protein interaction data sets.

• 지구물리와물리탐사
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• 제14권1호
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• pp.116-120
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• 2011

방사성원소 비는 방사성 특성의 미묘한 변화를 지도형태의 자료로 만드는데 유용하다. 그러나 방사성원소비를 계산하는 전통적인 방법은 만약 비를 구성하는 방사성원소 중 단 하나라도 평균값에 비해 적은 분산을 갖는 농축 추정치를 갖는다면 방사성원소비 지도 작성에 중요한 영향을 주지 못하게 되어 커다란 한계를 갖게 된다. 이와는 달리 만약 비를 구하기 전에 분자와 분모를 모두 거의 같은 평균과 분산으로 정규화 시켜준다면 방사성원소들은 지도가 작성되는 영역에서 원소들 사이의 차이를 부각시키는데 동일하게 기여하게 될 것이다.

• 대한화학회지
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• 제22권3호
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• pp.138-148
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• 1978

자연 다이아몬드의 생성에 관한 여러가지 이론적인 검토를 해보았다. 특히 강조한 것은 다이아몬드의 생성이 기체에서 생긴다는 이론이다. 영구용 질양분석기의 검체안에서 분쇠 검출된 자연 다이아몬드내에 모인 기체에서 보아 다이아몬드의 생성에 대한 그 외계의 기체조성을 검토 제의한다. $200^{\circ}C$, 109 torr의 진공내에서 분쇠된 다이아몬드로부터 생성된 물질들은, 검출된 양의 순으로 나타낸다면, 물, 수소, 질소, 이산화탄소, 메탄, 일산화탄소, 아르곤 및 에틸알코올등이다. 열의학적으로 C-H-O-N 기체상의 조성의 검토는 가능한 다이아몬드의 생성조건에 관한 정보를 제공한다. 이미주어진 실험적 결과의 비교는 다이아몬드 생성에 관한 가능한 온도-압력조건이 주어진다.

• Mass Spectrometry Letters
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• 제12권3호
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• pp.81-84
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• 2021

Collagen, which accounts for one-third of human protein, is reduced due to human aging, and much attention is focused on making collagen into food to prevent such aging. Gel permeation chromatography with Reflective Index (RI) detection (GPC/RI) was chosen as the most suitable instrument to confirm molecular weight distribution, and we explored the use of this technique for analysis of collagen peptide molecular sizes and distributions. Data reliability was verified by matrix-assisted laser desorption/ionization coupled to time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometric analysis. The data were considered meaningful for comparative analysis of molecular weight distribution patterns.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권3호
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• pp.845-850
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• 2014

The rapid development of shotgun proteomics is paving the way for extensive proteome profiling, while providing extensive information on various post translational modifications (PTMs) that occur to a proteome of interest. For example, the current phosphoproteomic methods can yield more than 10,000 phosphopeptides identified from a proteome sample. Despite these developments, it remains a challenging issue to pinpoint the true phosphorylation sites, especially when multiple sites are possible for phosphorylation in the peptides. We developed the Phospho-UMC filter, which is a simple method of localizing the site of phosphorylation using unique mass classes (UMCs) information to differentiate phosphopeptides with different phosphorylation sites and increase the confidence in phosphorylation site localization. The method was applied to large scale phosphopeptide profiling data and was demonstrated to be effective in the reducing ambiguity associated with the tandem mass spectrometric data analysis of phosphopeptides.