• 제목/요약/키워드: Sox

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SOX 유전자의 다양성 (Multiple Facets of Sox Gene)

  • 홍경원;김희수
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.716-725
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    • 2004
  • Sox 패밀리는 동물계 전체에서 찾아지는 전사인자이고, HMG라는 특이적인 DNA결합 도메인을 가진다. 이 Sox 패밀리는 HMG 도메인의 아미노산 서열을 바탕으로 현재 10개의 그룹으로 분류된다. 각 그룹의 오소로그한 Sox 단백질들은 선충에서 인간까지 상당한 보존성을 보인다. HMG 도메인은 전사 촉진 좌위에 결합하고 다른 전사인자들의 결합을 조절함으로써 동물 발생과정의 다양한 세포에서 발현되어 그들의 분화에 결정적인 영향을 미친다. 최근 많은 분자 생물학자들이 Sox 유전자와 관련된 질병, 진화, 그리고 계통 분류 등에 많은 관심을 보이고 있다. 특히, 줄기세포에서 Sox 유전자의 연구는 그들의 생물학적인 기능을 이해하기 위해 꼭 필요한 분야이다. 아마도 이 Sox 유전자들을 이해함으로써, 인간의 유전적 질병과 인간을 포함한 전체 동물계의 진화를 이해할 수 있는 열쇠가 될 것이라 생각한다.

TNF-α-Induced SOX5 Upregulation Is Involved in the Osteogenic Differentiation of Human Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Through KLF4 Signal Pathway

  • Xu, Lijun;Zheng, Lili;Wang, Zhifang;Li, Chong;Li, Shan;Xia, Xuedi;Zhang, Pengyan;Li, Li;Zhang, Lixia
    • Molecules and Cells
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    • 제41권6호
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    • pp.575-581
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    • 2018
  • Postmenopausal osteoporosis (PMOP) is a common systemic skeletal disease characterized by reduced bone mass and microarchitecture deterioration. Although differentially expressed SOX5 has been found in bone marrow from ovariectomized mice, its role in osteogenic differentiation in human mesenchymal stem cells (hMSCs) from bone marrow in PMOP remains unknown. In this study, we investigated the biological function of SOX5 and explore its molecular mechanism in hMSCs from patients with PMOP. Our findings showed that the mRNA and protein expression levels of SOX5 were upregulated in hMSCs isolated from bone marrow samples of PMOP patients. We also found that SOX5 overexpression decreased the alkaline phosphatase (ALP) activity and the gene expression of osteoblast markers including Collagen I, Runx2 and Osterix, which were increased by SOX5 knockdown using RNA interference. Furthermore, $TNF-{\alpha}$ notably upregulated the SOX5 mRNA expression level, and SOX5 knockdown reversed the effect of $TNF-{\alpha}$ on osteogenic differentiation of hMSCs. In addition, SOX5 overexpression increased Kruppel-like factor 4 (KLF4) gene expression, which was decreased by SOX5 silencing. KLF4 knockdown abrogated the suppressive effect of SOX5 overexpression on osteogenic differentiation of hMSCs. Taken together, our results indicated that $TNF-{\alpha}$-induced SOX5 upregulation inhibited osteogenic differentiation of hMSCs through KLF4 signal pathway, suggesting that SOX5 might be a novel therapeutic target for PMOP treatment.

전사활성 인자인 Sox4의 단백질 분해효소에 의한 표적 부위에 관한 연구 (A Novel Glycine-Rich Region in Sox4 is a Target for the Proteolytic Cleavage in E. coli)

  • 허은혜;최주연;장경희;김인경;임향숙
    • 미생물학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.153-161
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    • 2002
  • Sox4는 DNA 결합 도메인인 HMG-box와 전사 활성 도메인인 serine rich region (SRR)과 아직 그 기능이 알려져 있지 않은 glycine rich region (GRR)등의 세 개의 기능 도메인을 가지는 전사인자이다. 전사인자인 Sox4는 생체 내 초기 분화 시 중요한 역할을 하는 유전자로 알려져 있으나 여전히 그 정확한 생리적 기능 및 세포 내에서 이 유전자 산물이 전사 활성 에 어떻게 관여하는지 그 정확한 기전은 잘 밝혀져 있지 않다. 이에 본 연구에서는 Sox4의 생리적 기능을 이해하고 세포 내에서 Sox4의 기능 연구에 유용하게 사용할 수 있는 항체를 제조하기 위해 Sox4를 대장균에서 발현, 정제하였다. 모든 기능 도메인을 다 포함하는 Sox4는 대장균에서 발현 시 대부분 절단되는 양상을 나타내었다. Sox4의 각 도메인을 대장균에서 GST-융합 단백질로 발현, 정제하여 그 발현 양상을 비교해 본 바 N-말단을 제거한 Sox4 ($\Delta$HMG)의 경우 67 kDa 크기의 단백질이 생성되므로 이 단백질을 항원으로 이용하여 Sox4의 GRR에 특이적으로 반응하는 항체를 제조하였다. 또한, 67 kDa 크기의 단백질 외에 34 kDa 크기에서 GST-융합 단백질이 관찰되었다. 이 밴드는 Sox4 (GRR)를 발현, 정제시에도 관찰되는 동일한 크기의 밴드이며 thrombin과의 반응을 통해 7 kDa 크기로 절단되는 Sox4 밴드이다. 그러므로 이 들 결과로부터 GRR 내에 단백질 분해효소의 표적 부위가 존재함을 확인할 수 있었다. 본 연구결과는 아직 그 기능이 밝혀져 있는 않은 Sox4의 새로운 도메인인 GRR이 단백질 분해 효소의 표적 부위로 작용하여 Sox4의 안정성을 조절함으로써 Sox4의 활성에 중요한 역할을 수행할 수 있다는 가능성을 제시하고 있다.은 억제 회복 효과는 $Mg^{2+}$에 의한 리보자임의 td intron 구조적 안정성에 기인하는 것으로 추정된다.력이 뛰어난(adaptable) 인간적 요구사항을 충족시켜야 한다. 셋째, 다이내믹 시미트리는 역(逆, reciprocity)의 원리와 보상(補賞, complement)의 원리를 제 1의 구성원리로 하며 공간에서 서로에 대한 역과 공통성(common property)을 갖고 자기유사를 지닐 때 연속체(continuum)를 손상하지 않고 전체공간을 유기체적으로 분절한다.같은 pattern 이었다. 그러나 JR89주에서는 280kb 가 나타나지 않아 다른 분리균주와 구분되었다.과 밀가루국(麴) 사이에 차(差)가 별(別)로 없었다.果)에서 총지질(總脂質)을 구성(構咸)하는 지방산(脂肪酸) 조성(組成)은 $C_{18:2}$산(酸), $C_{16:0}$산(酸)의 순(順)으로 그 함량(含最)이 맞은데 비(比)하여 각획분(各劃分)의 지질(脂質)을 구성(構成)하는 지방산(脂肪酸) 조성(組成)은 $C_{16:0}$산(酸), $C_{18:2}$산(酸)의 순(順)으로 그 함량(含量)이 많은 것으로 나타났으며 동결건조후(凍結乾燥後) 저장(貯藏)하는 동안에$C_{18:2}$산(酸), $C_{18:3}$산(酸)의 함량(含量)이 계속(繼續) 감소(減少)하고 있었다. 5. 4-monomethylsterol fraction에는 cycloartenol(20.6%)이 비교적(比較的) 높은 함량(含量)으로 함유(含有)되어 있었고, 그 외(外) cyclolaudenol, cycloeucalenol 및 citrostadienol 등이 함유(含有)되어 있었다. 6. 4-desmethylsterol fraction에

Regulation of SoxR, the superoxide-sensory regulator in Escherichia coli.

  • Lee Joon-Hee;Koo Mi-Sun;Yeo Won-Sik;Roe Jung-Hye
    • 한국미생물학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물학회 2000년도 추계학술발표대회
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    • pp.24-31
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    • 2000
  • In order to find out SoxR-reducing system in E. coli, we generated Tn10-insertion mutants and screened for constitutive expression of SoxS in a soxS-lacZ fusion strain. One mutation was mapped in rseB, a gene in rseABC (Regulation of SigmaE) operon. The constitutive soxS-expressing phenotype was due to the polar effect on the downstream gene, rseC. RseC is likely to function as a component of SoxR reduction system because SoxR was kept in oxidized form to activate soxS expression in rseC mutant. RseC is an integral membrane protein with an N-terminal cysteine-rich domain in the cytoplasm. The functionally critical cysteines were determined by substitution mutagenesis. The truncated N-terminal domain of RseC reduced the soxS transcription by $50\%$ as judged by in vitro transcription assay. Currently RseC is believed to be a reducing factor for SoxR. However, the mechanism for the reduction needs further investigation.

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발전소에서의 SOx 공정 모사, 모니터링 및 패턴 분류 (SOx Process Simulation, Monitoring, and Pattern Classification in a Power Plant)

  • 최상욱;유창규;이인범
    • 제어로봇시스템학회논문지
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    • 제8권10호
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    • pp.827-832
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    • 2002
  • We propose a prediction method of the pollutant and a synchronous classification of the current state of SOx emission in the power plant. We use the auto-regressive with exogeneous (ARX) model as a predictor of SOx emission and use a radial basis function network (RBFN) as a pattem classifier. The ARX modeling scheme is implemented using recursive least squares (RLS) method to update the model parameters adaptively. The capability of SOx emission monitoring is utilized with the application of the RBFN classifier. Experimental results show that the ARX model can predict the SOx emission concentration well and ARX modeling parameters can be a good feature for the state monitoring. in addition, its validity has been verified through the power spectrum analysis. Consequently, the RBFN classifier in combination with ARX model is shown to be quite adequate for monitoring the state of SOx emission.

OCT4와 SOX2에 의한 인간 Nanog 유전자의 전사 조절 (Transcriptional Regulation of Human Nanog Gene by OCT4 and SOX2)

  • 석현정;김영은;박정아;이영희
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제14권2호
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    • pp.123-129
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    • 2010
  • 배아 줄기세포는 미분화상태에서 자가 재생을 유지할 수 있다. 자가 재생은 OCT4, SOX2와 NANOG와 같은 많은 인자들이 작용한다. 생쥐 배아 줄기세포에서 OCT4와 SOX2가 Nanog 프로모터에 결합하여 Nanog 유전자의 발현을 촉진한다는 사실은 생쥐 promoter에 관한 정밀분석으로 알려져 있다. 본 연구에서는 인간 Nanog promoter를 정밀 분석하기 위해 연속적인 결손 돌연변이를 가진 promoter-reporter construct를 제조하였다. Promoter의 최대 활성은 0.6 kb(-253/+365) promoter-reporter construct에서 발견되었으며, 이 construct에는 OCT4 및 SOX2의 결합부위가 포함된다. OCT4와 SOX2의 기여도를 확인하기 위하여 OCT4 및 SOX2의 결합부위에 자리 특이적 돌연변이를 유도하고 promoter 활성에 미치는 영향을 조사한 결과, OCT4나 SOX2 어느 한 군데라도 돌연변이가 존재하면 promoter 활성이 현저히 저해되었다. 본 연구 결과를 통해 인간 Nanog 유전자 발현에 있어 OCT4 및 SOX2가 필수적임을 직접적으로 확인할 수 있었다.

Cyclic AMP response element binding (CREB) protein acts as a positive regulator of SOX3 gene expression in NT2/D1 cells

  • Kovacevic-Grujicic, Natasa;Mojsin, Marija;Popovic, Jelena;Petrovic, Isidora;Topalovic, Vladanka;Stevanovic, Milena
    • BMB Reports
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    • 제47권4호
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    • pp.197-202
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    • 2014
  • SOX3 is one of the earliest neural markers in vertebrates, playing the role in specifying neuronal fate. In this study we have established first functional link between CREB and human SOX3 gene which both have important roles in the nervous system throughout development and in the adulthood. Here we demonstrate both in vitro and in vivo that CREB binds to CRE half-site located -195 to -191 within the human SOX3 promoter. Overexpression studies with CREB or its dominant-negative inhibitor A-CREB indicate that this transcription factor acts as a positive regulator of basal SOX3 gene expression in NT2/D1 cells. This is further confirmed by mutational analysis where mutation of CREB binding site results in reduction of SOX3 promoter activity. Our results point at CREB as a positive regulator of SOX3 gene transcription in NT2/D1 cells, while its contribution to RA induction of SOX3 promoter is not prominent.

Sox12 Is a Cancer Stem-Like Cell Marker in Hepatocellular Carcinoma

  • Zou, Song;Wang, Chen;Liu, Jiansheng;Wang, Qun;Zhang, Dongdong;Zhu, Shengnan;Xu, Shengyuan;Kang, Mafei;He, Shaozhong
    • Molecules and Cells
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    • 제40권11호
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    • pp.847-854
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    • 2017
  • Recent studies on molecular carcinogenesis suggest that the chemo-resistance of some cancers is largely due to presence of cancer stem cells (CSCs), which affect the chemotherapy outcome for hepatocellular carcinoma (HCC). However, currently no consensus on a CSC phenotype in HCC has been obtained. Here, we examined Sox12 as a novel CSC marker in HCC. Sox12+ versus Sox12- cells were purified from HCC cell lines. The Sox12+ cells were compared with Sox12- HCC cells for tumor sphere formation, chemo-resistance, tumor formation after serial adoptive transplantations in nude mice, and the frequency of developing distal metastasis. We found that compared to Sox12- HCC cells, Sox12+ HCC cells generated significantly more tumor spheres in culture, were more chemo-resistant to cisplatin, were detected in circulation more frequently, and formed distal tumor more frequently. Moreover, Sox12 appeared to functionally contribute to the stemness of HCC cells. Thus, we conclude that Sox12 may be a novel marker for enriching CSCs in HCC.

Clinical and Prognostic Significance of SOX11 in Breast Cancer

  • Liu, Dao-Tong;Peng-Zhao, Peng-Zhao;Han, Jing-Yan;Lin, Fan-Zhong;Bu, Xian-Min;Xu, Qing-Xia
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권13호
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    • pp.5483-5486
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    • 2014
  • Recently, the transcription factor SOX11 has gained extensive attention as a diagnostic marker in a series of cancers. However, to date, the possible roles of SOX11 in breast cancer has not been investigated. In this study, immunohistochemical staining for SOX11 was performed for 116 cases of breast cancer. Nuclear SOX11 was observed in 42 (36.2%) and cytoplasmic SOX11 in 52 (44.8%) of breast cancer samples. Moreover, high expression of cytoplasmic and nuclear SOX11 was associated with clinicopathological factors, including earlier tumor grade, absence of lymph node metastasis and smaller tumor size. Kaplan-Meier survival curves demonstrated high nuclear SOX11 expression to be associated with more prolonged overall survival than those with low expression and it could be an independent predictor of survival for breast cancer patients. It is worthwhile to note that cytoplasmic SOX11 was not correlated with prognosis of breast cancer patients. These data suggest the possibility that nuclear SOX11 could be as a potential target for breast cancer therapy.

Characterization of Protein Factor Regulating the Superoxide-Sensor SoxR in Escherichia coli

  • Koo, Mi-Sun;Rah, So-Yeon;Lee, Kang-Lok;Roe, Jung-Hye
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 2001년도 학술 발표회 진행표 및 논문초록
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    • pp.64-64
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    • 2001
  • Escherichia coli has developed soxRS regulon to defend against toxicity of superoxide radical. SoxR, superoxide sensor, is oxidized by superoxide-generating agents or nitric oxide and oxidized SoxR activates the transcription of soxS gene. In order to find out the trans-acting factors regulating SoxR activity in vivo, soxS::lacZ single copy operon fusion construct was prepared and random Tn10 insertional mutatons were performed.(omitted)

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