• 제목/요약/키워드: Southern blot 분석

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Euphorbia lathyris에서 분비되는 Latex 65kD 단백질의 특성규명 (Characterization of 65 kD Protein in Latex Excreted from Euphorbia lathyris)

  • 박희성
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제31권4호
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    • pp.319-323
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    • 2004
  • Euphorbia lathyris의 유관세포로부터 분비되는 수용성 latex단백질을 10% SDS-polyacrylamide 전기영동으로 분리하여 특징적으로 잘 나타나고 있는 ELp65, ELp55, ELp43, ELp32 그리고 ELp23 등의 주요단백질을 확인하였다. 이들 latex 주요단백질들 중에서 ELp65는 ammonium sulfate 침전, gel permeation chromatography 그리고 ion exchange chromatography 등의 방법으로 순수 분리하였는데 ELp65의 N-terminal amino acid 서열분석에 의하면 이는 토마토의 p69a subtilisin-like pretense의 mature peptide의 앞부분과 강한 유사성을 지니고 있었으며 식물방어와 관련된 기능이 제시되었다. PCR증폭에 의하여 클로닝된 토마토의 p69a DNA를 probe로 이용하여 Southern blot hybridization을 수행한 결과 E. lathyris genome은 토마토의 subtilisin-like proteases와 유사한 정보를 지닐 수도 있는 3-5 유전자들로 구성된 gene family가 분석되었다.

외래 유전자가 이식된 동형접합성 미꾸라지 생산 II. pFV4CAT이 이식된 $F_0$ 생산 (Production of Homozygous Transgenic Mud Loach (Misgurnus mizolepis) II. pFV4CAT Transfer by Microinjection)

  • 남윤권;김철근;김동수
    • 한국양식학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.33-37
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    • 1997
  • 미꾸라지를 대상으로 어류 유전자 이식을 위한 유용 model system으로 개발하기 위한 연구의 일환으로 잉어의$\beta$-actin 유전자의 promoter와 CAT 유전자가 융합되어 있는 외래 유전자 (pFV4CAT)를 미꾸라지에 이식, transgenic founder 미꾸라지를 생산하였다. PCR 분석결과, 이식된 외래 유전자는 부화 후 9개월된 성어에서 7.4-37.0%의 빈도로 존재하였으며 Southern blot 분석에 의해서 염색체 상의 삽입 가능성을 나타내었다. In situ immunohistochemical analysis 결과 이식된 외래 유전자는 미꾸라지 세포내에서 비교적 높은 빈도로 발현하였으며 그 발현 양상은 개체마다 다양하게 나타났다.

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Aspergillus oryzae에서의 이종 Promoter들의 발현 (Expression of Heterologous Promoters in Aspersillus oryzae)

  • 함영태;김희정
    • KSBB Journal
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    • 제10권1호
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    • pp.38-45
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    • 1995
  • Aspergillus oryzae에서 A. nidulans의 glyceral d dehyde-3-phosphate dehydrogenase (gpdA)와 trpC, prmoter의 발현 능력 을 E. coli lacZ gene fusion을 이용하여 비교.분석하였다. A. oryzae 내에서 발현된 E. coli $\beta$galactosidase의 specific activIty를 조사하여 본 결과, gpdA promoter를 가지는 transformant들 에서는 2,000unit/ug of protem 정도의 activity를 보이는 반면, trpC, promater를 가지고 있는 transformant들에서는 10.5~52.3unit/ug of protein 정도의 activity를 보였다. 이 결과로부터 A. oryzae 내에서 A. nidulans의 gpdA promoter가 trpC, promoter에 비해 70 배 정도 더 강한 발현 능력을 보이고 있음을 알 수 있다. Western blot 분석에서도 gpdA promoter를 가지고 있는 transf ormant에서 더 많은 E. coli $\beta$-galactosidase가 발현된 것 을 보여 주고 있다. 또한 southern blot 분석에서는 이러한 강한 발현이 transform된 plasmid의 copy number와 상관 없음을 보여주고 있다.

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클론된 웅성 특이 DNA절편에 의한 돼지의 성결정 (Sex Determination in Somatic and Embryonic Cells of the Pig by Cloned Male-Specific DNA Fragments)

  • 전진태;이상호;홍기창;박성수
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.91-100
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    • 1995
  • 3.3kb 웅성특이 DNA(pEM39 plasmid DNA)가 성 특이 DNA 검색자로 활용되어질 수 있는가를 확인하기 위하여 구조적인 분석을 Southern blotting, DNA sequencing과 computer program 분석을 통하여 실시하였다. 전체 3.3kb에서 유래된 약 1kb 단위의 단편을 이용하여 표지된 짧은 DNA probe들은 Southern blot 분석에서 웅성특이성을 나타내었다. McGraw와 Jeon의 sequence에 대한 유사성 비교 자료로부터 여러 부분의 conserved region을 찾아내고 이것을 기초로 하여 5개의 primer set들을 선발하였다. Conserved region에 존재하면서 computer program에 의해서 선발되어진 PMS1과 2의 primer set가 최종적으로 PCR 분석을 위하여 선정되었다. 이 primer set를 사용한 PCR 분석에서, 1ng부터 10pg까지의 웅성 genomic DNA에서 PCR 산물을 얻을 수 있었으며, 자성의 경우는 어떠한 산물도 찾을 수 없었다. PCR에 이용할 수정란의 시료는 2 세포기의 수정란에서 얻었으며 순수 분리된 genomic DNA에서 확립된 조건에서 PCR을 수행하였다. 8개의 수정란을 분석한 결과 4개의 웅성과 4개의 자성 수정란을 확인하였다. 이러한 결과는 선정된 primer set가 돼지 수정란의 성을 조기 감별하는데 효율적인 DNA probe로 사용될 수 있다는 것을 암시한다.

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DNA 중합효소 연쇄반응을 이용한 한국형 젖소 면역 결핍 바이러스의 검출 (Molecular Detection of Korean-type Bovine Immunodeficiency Virus by Polymerase Chain Reaction)

  • 권오식
    • 대한의생명과학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.101-107
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    • 1999
  • 젖소 면역결핍 바이러스 (BIV)는 젖소에게 여러 가지 면역결핍증후군을 야기하는 렌티 바이러스 (역전사효소 바이러스의 아군)로서 국내에서는 이에 대한 연구나 보고가 진행된 바 없다. 본 연구에서는 BIV가 다른 젖소의 역전사효소 바이러스인 젖소 백혈병바이러스 (BLV)와 동시 감염되고 (50%정도)있는 점을 착안해 우선 대구.경북지역의 소의 BLV감염실태를 조사해 BLV가 감염된 젖소를 대상으로 BIV 감염상태를 알아보았다. 먼저 10회에 걸쳐 젖소와 황소 248마리의 혈액을 채취 해 BLV와 BIV의 숙주세포가 되는 말초혈액 단핵구 (peripheral blood monocytes, PBMC)를 분리하고, 이를 이용해 DNA중합효소 연쇄반응 (PCR)과 Southern blot분석법을 통해 BLV와 BIV의 존재여부를 조사하였다. 그 결과 조사대상 젖소의 66.9% (81/121) 이상이 BLV에 감염되어 있음을 PCR 검사를 통해 알 수 있었으며, 이는 Southern blot법으로 재차 확인되었다. 이 결과는 종래에 보고된 대구경북지역에서의 BLV 감염율인 27~30%보다 2배 이상 높은 수치로서, (1) 우리가 사용한 방법들 (PCR & Southern blot법)이 분자생물학적 연구방법인 관계로 고도의 특이성 (specificity)을 지녔기 때문이며 (2) 지난 10년간 조사 대상지역인 대구 경북지역 내에서 젖소들에게 지속적으로 BLV감염이 증가하였기 때문으로 본다. 한편 이들 BLV positive PBMC의 chromosomal DNA를 사용해 BIV의 검출을 시도한 바, lot 3C샘플은 BLV에 100%감염되어 있음과 동시에 그 일부가 BIV에 감염되어 있음을 PCR 방법을 통하여 확인할 수 있었다.

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형질전환 토마토에서 Antisense Polygalacturonase 유전자의 발현 (Expression of Antisense Polygalacturonase Gene in Transgenic Tomato)

  • 김영미;김용환;이성갑;임명호;송경수
    • 식물조직배양학회지
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    • 제22권6호
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    • pp.351-355
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    • 1995
  • 국내 재배종 토마토 서광 품종으로부터 분리한 Polygalacturonase 유전자(PG2)의 3'측 1.1 kb cDNA 단편을 식물 형질전환용 운반체에 antisense 방향으로 삽입한 후 자엽을 이용하여 토마토내 도입하여 형질전환 토마토를 획득하였다. 형질전환 토마토(T$^{0}$ )를 도입시켜 그 종자를 1 mg/mL 농도의 kanamycin 함유 MS 배지에서 발아시켜 분리 집단 중에서 T$_1$9 식물체를 얻었다. T$_1$9의 Genomic Southern blot 분석 결과, antisense PG 유전자 1개가 염색체 내로 삽입되었음을 확인하였고 RNA gel blot 분석으로 endogenous PG mRNA보다 antisense PG RNA가 강하게 발현됨을 확인하였다. T$_1$9 계통 10개체의 성숙 토마토 과피조직내의 PG 효소 활성도 4~60%까지 저해되었다.

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고추의 역병 저항성 품종 개발을 위하여 Agrobacterium tumefaciens를 이용한 elicitin 유전자 도입 (Agrobacterium-Mediated Genetic Transformation of Pepper for the Development of Blight Resistant Cultivar)

  • 권태룡;이문중;한증술;신동현;오중열;김경민;김창길
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제34권1호
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    • pp.55-59
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    • 2007
  • 고추 형질전환은 Agrobacterium (LBA4404/pBI101 cyc600-syna-elicitin)을 이용한 cyc600 promoter에 구축된 elicitin 유전자의 형질전환시 shoot의 형성율은 수비초의 경우 3 mg/L zeatin과 0.05 mg/L NAA 함유 배지에서 11.1%, 4 mg/L zeatin과 0.05 mg/L NAA 함유 배지에서 12.8%였다. 전배양 3일, 공동배양 $3{\sim}4$일에서 재분화율이 높았다. 자엽으로부터 재분화된 형질전환체의 NPTII 유전자의 primer를 이용한 PCR 반응에서 형질전환된 재분화 식물체는 536 bp의 밴드를 확인하였다. Membrane에 blot하여 NPTII gene을 probe로 사용하여 Southern blot 분석에서 고추형질전환 식물체는 536 bp 부위에 강한 signal을 보였다. elicitin 유전자를 이용한 역병 저항성 형질전환체 수비초 $T_{0}$세대의 생육은 계통간에 다소 차이는 보였고, 계통 모두 생육은 저조한 반면 개화 및 수정 등의 임성은 정상적이었다. 자식을 통해 채종한 $T_{1}$ 식물체의 유전자 도입을 확인하기 위하여 PCR을 수행한 결과 $T_{0}$ 식물체 $S1{\sim}S5$ 계통에서 elicitin 밴드가 나타나 형질전환체임을 확인하였고, $T_{1}$식물체인 S1-1 등 7계통에서 elicitin 밴드가 나타났고, S1-2 등 4계통에서는 밴드가 나타나지 않아 형질전환체가 후대에서 분리가 일어남을 확인할 수 있었다. Syn ${\alpha}$ clone을 이용하여 Southern blot analysis를 한 결과 band가 나타난 300 bp 정도의 위치에서 blot이 나오는 것을 관찰할 수 있었다. 위의 결과에서 cyc600 promoter-syn ${\alpha}$의 construct가 수비초의 genomic DNA에 삽입되었는 것을 확인할 수 있었다. 고추형질전환체의 유묘에 역병균을 접종한 결과 유주포자 $10^{3}$개/mL에서 형질전환체의 저항성 계통선발이 가능하였다.

영지버섯으로부터 homocysteine methyltransferase를 암호화 하는 metE 유전자의 클로닝 및 E. coli에서의 발현 (Cloning and Expression of the metE gene coding for homocysteine methyltransferase from the basidiomycete Ganoderma lucidum in E. coli)

  • 김현정;박동철;이갑득;이별라;이갑랑
    • 한국균학회지
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    • 제21권4호
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    • pp.279-284
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    • 1993
  • 담자균류의 영지버섯으로부터 homocysteine methyltransferase를 code하는 metE 유전자를 methionine 요구성 균주인 대장균에 complementation시켜 cloning하였다. 그 결과 삽입된 DNA의 크기는 약 1.54 kb 이었고, 5개의 제한효소 부위가 존재하였다. 이 clone체의 제한지도를 작성하였고, southern blot 분석으로 metE 유전자는 영지버섯의 genome으로부터 유래하였으며, 단일 복제수로 존재함을 확인하였다.

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Schwanniomyces castellii 전분 유전자의 Cloning과 발현 (Cloning and Expression of Schwanniomyces castellii Starch Gene)

  • 박종천;배석;전순배
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.653-659
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    • 1990
  • Schwanniomyces castelli CBS 2863의 glucoamylase 유전자를 Saccharomyuces cerevisiae에 cloning하고 발현시켰다. Southern blot 분석결과, 형질전환체의 glucoamylase 유전자는 Sch. castellii genomic DNA로부터 나온 것임을 확인하였고 5.1 혹은 1.3kb의 Sch.castellii 유전자에 해당되는 DNA 절편이 S.cerevisiae 에서 관찰되지는 않았다. S.cerevisiae의 형질전환체의 glucoamylase 활성은 Sch. castellii의 그것에 비해 2,000배 정도 낮았고 E.coli에서는 발현되지 않았다. Sch.castellii의 glucoamylase와 동일한 특성과 분자량을 가지고 있음을 알 수 있었다.

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구기자나무 (Lycium chinense)의 효과적인 재분화 및 내염성 유전자가 도입된 형질전환체의 개발 (Advanced Regeneration and Genetic Transformation of Lycium chinense Harboring Salt Tolerance Genes)

  • 이진숙;권기원;배창휴;양덕춘
    • 식물조직배양학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.47-52
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    • 2001
  • 구기자나무의 효과적인 재분화조건을 바탕으로 염류내성유 전자인 Bet A와 Bet B유전자의 도입을 시도하였다. 구기자나무의 절편체를 재료로 kinetin 1 mg/L, IBA 0.05 mg/L가 첨가된 MS배지에 2일간 전배양한 후 Agrobacterium과 공조배양 및 선발배지에서의 배양으로 kanamycin에 내성을 갖는 잠정적인 형질전환체를 유도하였다. 형질전환체는 PCR 기법 및 Southern blot분석으로 Bet A와 Bet B 유전자 전이를 확인하였고, 도입된 유전자의 발현은 RT-PCR 방법을 사용하여 확인하였다.

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