• 한국환경농학회지
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• 제29권1호
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• pp.27-32
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• 2010

Soil Taxonomy 분류체계 변화에 대응하여 산록경사지에 분포하고 있으며, Alfisols로 분류되고 있는 안룡통을 재분류하고, 그 생성을 구명하기 위하여 안룡통 대표단명의 형태적 특성을 조사하고, Soil Taxonomy의 표준 분석방법인 Soil survey laboratory methods manual에 따라서 토양을 분석하여 Laboratory data sheets를 작성하였다. 안룡통은 0~22 cm 깊이에서 ochric 감식표층을 보유하고, 22~120 cm 깊이에서 점토피막과 같은 점토 이동의 근거를 보유하는 arfillic층을 보유하고있다. 그러나 기준 깊이에서의 염기포화도(양이온 합)가 32.3%로 35% 미만이므로 Alfisols이 아나라 Ultisols로 분류되어야 한다. 안룡통은 udic 토양수분상을 보유하고 있으므로 Udults로 분류할 수 있으며, Hapludults의 분류조건을 충족시키고 있다. 또한 Typic 아군의 분류조건을 충족시키므로 Typic Hapludults로 분류할 수 있다. 토성속 제어부위에서의 토성속이 식양질이고, 토양온도상이 mesic 온도상이기 때문에 안룡통은 Fine loamy, mesic family of Ultic Hapludalfs가 아니라 Fine loamy, mesic family of Typic Hapludults로 분류되어야 한다. 안룡통은 산록경사지에 분포하고 있으면서도 안정한 지형에 분포하고 있으므로 토양이 거의 침식되지 않고 새로운 붕적물이 별로 퇴적되지 않기 때문에 오랫동안 토양수의 하향이동에 따른 점토집적작용과 염기용탈작용을 받았다. 그 결과 점토집적층인 argillic층을 보유하는 토양으로 생성 발달되었다. 또한 Alfisols 과 Ulrisols을 구분하는 가장 기본적인 분류기준인 기준깊이에서의 염기포화도 (양이온 합)가 35% 미만으호서 Alfisols이 아니라 강산성 토양인 Ultisols로 발달하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권7호
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• pp.1203-1206
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• 2008

A Gram-positive strain designated as MSL-$14^T$ isolated from a soil sample collected from Bigeum Island, Korea, was subjected to polyphasic taxonomy. The isolate was strictly aerobic. Cells were short rods and motile. Optimum growth temperature and pH was 28$^{\circ}C$ and 7.0, respectively. It was characterized chemotaxonomically as having a cell-wall peptidoglycan type based on LL-2,6-diaminopimelic acid and MK-$8(H_4)$ as the predominant menaquinone. The major fatty acids were iso-$C_{16:0}$, $C_{17:1}$ omega8c, and $C_{18:1}$ omega9c. The G+C content was 67.6 mol%. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence revealed that strain MSL-$14^T$ is affiliated to the genus Nocardioides and formed a distinct lineage within the genus. MSL-$14^T$ showed highest sequence similarity to Nocardioides aestuarii JCM $12125^T$, having a similarity of 96.5%. Based on the 16S rRNA gene sequence divergence and phenotypic characteristics, it is proposed that strain MSL-$14^T$ should be classified as representing a novel member of the genus Nocardioides, for which we propose the name Nocardioides tritolerans sp. novo The type strain is strain MSL-$14^T$ (=KCTC $19289^T$=DSM $19320^T$).

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권4호
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• pp.303-309
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• 2012

Keratinases are of particular interest because of their action on insoluble keratins and generally on a broad range of protein substrates. Alkalophilic and neutrophilic actinomycete strains isolated from different soil samples, rich in keratinaceous substances were screened for keratinolytic activity. An alkalophilic isolate, TBG-S13A5, was found to possess good keratinolytic activity and was able to utilize feather as the sole carbon and nitrogen source. TBG-S13A5 exhibited an off-white aerial mass color with a rectus-flexibilis type of spore chain. The morphological, microscopical and biochemical characters were comparable with that of Streptomyces albidoflavus. Fatty acid methyl ester profiling (FAME) and 16S rDNA sequence analysis confirmed its identity as a strain of S. albidoflavus. Under submerged fermentation conditions, maximum protease production was recorded on the $5^{th}$ day of incubation at $30^{\circ}C$, using basal broth of pH 9.0 with 0.25% (w/v) white chicken feather. This strain could affect feather degradation when the initial pH was 8 and above and maximum protease production was recorded when the initial pH was around 10.5. The effectiveness of the crude enzyme in destaining and leather dehairing were also demonstrated.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권2호
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• pp.204-208
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• 2002

A Streptomyces sp. isolated from a soil sample collected in Taejeon, Korea has previously been found to produce two new polyene antibiotics. The two new antibiotics were named "16-methyloxazolomycin (antibacterial)" and "tetrin C (antifungal)", and their chemical structures are presented elsewhere [10, 11]. In the current study, chemotaxonomy, numerical taxonomy, and ISP methods were all employed for the taxonomic study. The spore chains were spirales and the spore surface was smooth. The spore mass was a gray series and no melanin pigment was produced. On the basis of the morphological and physiological properties, the microorganism was identified to be Streptomyces erumpens, belonging to the gray series of category IV, as defined by Bergey′s Manual. Tetrin C at the concentration of 20 ${\mu}g$/ml demonstrated a potent in vivo (pot test) preventive effect against rice blast, rice sheath blight, cucumber gray mold, wheat powdery mildew, and barley leaf rust.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권9호
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• pp.1496-1499
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• 2008

A Gram-negative, aerobic, rod-shaped, nonspore-forming bacterial strain, designated Gsoil $357^T$ was isolated from soil sample of a ginseng field in Pocheon Province (South Korea). The isolate contained Q-8 as the predominant ubiquinone and iso-$C_{16:0}$, iso-$C_{17:1}$ ${\omega}9c$, and iso-$C_{15:0}$ as the major fatty acids. The G+C content of the genomic DNA was 69.3 mol%. A phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain Gsoil $357^T$ was most closely related to Lysobacter gummosus (97.6%) and Lysobacter antibioticus (97.6%). However, the DNA-DNA relatedness value between strain Gsoil $357^T$ and its phylogenetically closest neighbors was less than 17%. On the basis of its phenotypic properties and phylogenetic distinctiveness, strain Gsoil 357T should be classified as representing a novel species in the genus Lysobacter, for which the name Lysobacter ginsengisoli sp. novo is proposed. The type strain is Gsoil $357^T$ (=KCTC $12602^T$=DSM $18420^T$).

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권6호
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• pp.913-918
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• 2007

A Gram-positive, aerobic, rod-shaped, nonmotile, endospore-forming bacterium, designated Gsoil $349^T$, was isolated from soil of a ginseng field and characterized using a polyphasic approach. Comparative analysis of 16S rRNA gene sequences revealed that the strain Gsoil $349^T$ belongs to the family Paenibacillaceae, and the sequence showed closest similarity with Cohnella thermotolerans DSM $17683^T$ (94.1%) and Cohnella hongkongensis DSM $17642^T$ (93.6%). The strain showed less than 91.3% 16S rRNA gene sequence similarity with Paenibacillus species. In addition, the presence of MK-7 as the major menaquinone and $anteiso-C_{15:0},\;iso-C_{16:0},\;and\;C_{16:0}$ as major fatty acids suggested its affiliation to the genus Cohnella. The G+C content of the genomic DNA was 53.4 mol%. On the basis of its phenotypic characteristics and phylogenetic distinctiveness, strain Gsoil $349^T$ should be treated as a novel species within the genus Cohnella for which the name Cohnella panacarvi sp. nov. is proposed. The type strain is Gsoil $349^T\;(=KCTC\;13060^T=\;DSM\;18696^T)$.

• Mycobiology
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• 제51권2호
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• pp.72-78
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• 2023

In this study, a fungal strain KNUF-22-025 belonging to the genus Botryotrichum was isolated from the soil in Korea. The cultural and morphological characteristics of this strain differed from those of closely related species. On malt extract agar, strain KNUF-22-025 showed slower growth than most of the related species, except B. domesticum. The conidia size (9.6-21.1×9.9-18.4 ㎛) of strain KNUF-22-025 was larger than those of B. piluliferum, B. domesticum, and B. peruvianum but smaller than those of B. atrogriseum and B. iranicum. Conidiophores in strain KNUF-22-025 (137 ㎛) were longer than those in other closely related species but shorter than those in B. atrogriseum. Multi-locus analysis of molecular markers, such as ITS, 28S ribosomal DNA, RBP2, and TUB2 revealed that strain KNUF-22-025 was distinct from other Botryotrichum species. Thus, this strain is proposed as a novel species based on morphological characteristics along with molecular phylogeny and named Botryotrichum luteum sp. nov.

• 한국토양비료학회지
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• 제43권2호
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• pp.217-223
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• 2010

용암류 대지를 이루고 있는 철원평야에 분포하고 있으며 Alfisols로 분류되고 있는 동송통을 선정하여 우리나라의 공식적인 토양 분류 체계인 Soil Taxonomy에 따라서 분류하고, 그 생성을 구명하기 위하여 동송통 대표단면의 형태적 특성을 조사하고, Soil Taxonomy의 표준 분석방법인 Soil Survey Laboratory Methods Manual에 따라서 토양을 분석하여 Laboratory data sheets를 작성하였다. 동송통은 0~22 cm 깊이에 ochric 감식표층을 보유하고, 22~120 cm 이상의 깊이까지 점토집적층인 argillic층을 보유하고 있으며, andic 토양 특성을 보유하지 않고 있다. 또한 argillic층의 상부경계에서 125 cm 아래 깊이인 147 cm 깊이에서의 염기포화도 (양이온합)가 15.7%로 35% 미만이다. 따라서 동송통은 Alfisols, 또는 Andisols이 아니라 Ultisols로 분류되어야 한다. 동송통은 토양표면에서 50 cm 이내 깊이의 1개 이상의 층위에서 aquic 조건을 보유하고, 25~40 cm 깊이의 모든 층위에서 산화환원성인을 보유하며, argillic층의 상부 12.5 cm 깊이에서 채도 2 이하의 산화환원탈리를 50% 이상 보유하고 있으므로 Aquults로 분류할 수 있다. 우리나라 토양으로는 처음으로 Aquults로 분류할 수 있다. 토양표면에서 50 cm 깊이까지만 물로 포화되고, 그 아래 깊이에서는 포화되지 않는 episaturation을 보유하고 있으므로 대군은 Epiaquults로 분류할 수 있다. Bt1층 (50~92 cm)에서의 토색이 적갈색 (5YR 5/4)으로 높은 채도를 보유하므로 Aeric Epiaquults로 분류할 수 있다. 토성속 제어부위에서의 토성속이 식질이고, 토양온도상이 mesic 온도상이기 때문에 동송통은 Fine, mesic family of Typic Epiaqualfs가 아니라 Fine, mesic family of Aeric Epiaquults로 재분류되어야 한다. 동송통은 후기 홍적세에 열극 분출에 의하여 형성된 철원 지방의 용암류대지에 분포하고 있다. 화산쇄설물이 아니라 현무암을 모재로 하고 있으며, 기후조건 또한 비교적 건조하기 때문에 Andisols이 아닌 토양으로 생성 발달되었다고 생각된다. 동송통은 안정한 지형인 현무암 용암류 대지에 분포하고 있으므로 토양이 거의 침식되지 않고 충적물이 별로 퇴적되지 않기 때문에 오랫동안 토양수의 하향이동에 따른 점토집적작용과 염기용탈작용을 받았다. 그 결과 점토집적층인 argillic층을 보유하는 토양으로 생성 발달되었다. 그러나 동송통의 경우 점토 함량이 높기 때문에 물의 하향 이동이 제한되어 상부 층위들만 물로 포화되어 있고, 하부 층위는 불포화 상태를 이루고 있는 episaturation 상태를 이루고 있다. 따라서 Ca, Mg, K, Na 등의 염기의 하향 이동이 원활하게 이루어지지 않기 때문에 기준 깊이에서 염기포화도 (양이온 합)가 35% 미만인 Ultisols로 생성 발달한 것이라고 생각된다.

• 한국토양비료학회지
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• 제44권2호
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• pp.187-193
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• 2011

농촌진흥청에서는 농경지뿐 만 아니라 우리나라 전국토에 대한 토양조사를 수행하였으며 (1964-1999) 일부 도서지역이라든가 민통선 해제지역 등의 토양조사를 계속적으로 수행하여 왔다 (2000-현재). 그 일환으로 독도에 대한 토양조사를 수행하였으며 아울러 이와 유사한 토양들을 울릉도에서도 발견할 수 있었다. 서도의 대한봉 남쪽 20 m 지점 (경도 $131^{\circ}$51'53", 위도 $37^{\circ}$14'35")에서 대표단면을 선정하였다. 조사지역은 주로 조면안산암 유래 토양으로 이외에도 조면암, 유문암, 응회암등이 혼재하고 있다. 기존 분류되어 있는 토양과 달라 고유의 토양명을 부여할 필요가 있다고 판단되어 토양은 "독도통"으로 명명하였다. 토심이 매우 얕아 대체적으로 0-20 cm 정도였으며, A층은 농암갈색 (10YR 2/2)의 바위가 있는 사양토이고 AC층은 암갈색 (7.5YR 3/2)의 자갈이 있는 미사질양토로 되어 있다. 독도의 토양은 울릉도 지역과 동일하게 mesic 토양온도상을 보유한다고 하여, Dokdo, coarse loamy, mesic family of Lithic Udorthents로 분류할 수 있었다. 독도는 총면적이 18.7 ha이며 동도는 7.3 ha, 서도는 8.9 ha 및 부속도서가 2.6 ha이다. 이 중 조사된 "독도통"의 면적은 동도 4.13 ha, 서도 6.34 ha, 울릉도 808.56 ha로 새로운 토양으로 설정하기에 충분한 면적을 가지고 있다.

• 한국토양비료학회지
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• 제42권6호
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• pp.472-477
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• 2009

Alfisols로 분류되고 있는 부곡통을 재분류하기 위하여 부곡통 대표단면의 형태적 특성을 조사하고, Soil Taxonomy의 표 준 분 석 방 법 인 Soil Survey Laboratory Methods Manual에 따라서 토양을 분석하여 laboratory data sheets를 작성하였다. Ap층 (0~22 cm)은 진갈색 (7.5YR 4/6)의 양토이고, BAt층 (22~41 cm)은 갈색 (7.5YR 4/4)의 식양토, Bt1층 (41~59 cm)은 진갈색 (7.5YR 4/6)의 미사 질식양토, Bt2층 (59~78 cm)은 진갈색 (7.5YR 4/6)의 미사질식양토, Btx1층 (78~90 cm)은 진갈색 (7.5YR 4/6)의 미사질식양토, Btx2층 (90~160 cm)은 갈색 (7.5YR 4/4)의 미사질식양토이다. 부곡통은 화강편마암, 화강암, 또는 편암지대의 충적붕적층을 모재로 하는 토양으로 약한 경사지에 분포하며, 대부분 밭으로 이용되고 있다. Ap층 (0~22 cm)은 ochric 감식표층, BAt층에서 Btx2층 (22~160 cm)까지는 점토집적층인 argillic층을 보유하고, 78~160 cm 깊이에 fragipan을 보유하고 있다. 기준깊이인 fragipan 상부 경계 아래 75 cm 깊이인 153 cm 깊이에서의 염기포화도 (양이온 합)가 35.0% 미만으로 낮다. 따라서 부곡통은 Alfisols이 아니라 Ultisols로 분류되어야 한다. Udic 토양수분상을 보유하고 있으므로 부곡통은 Udults 아목으로 분류될 수 있다. 무기질 토양표면으로부터 100 cm 이내 깊이에 fragipan을 보유하고 있으므로 Fragiudults 대군의 분류기준을 충족시키고 있다. 우리나라 토양으로는 처음으로 보고되는 Fragiudults이다. 부곡통은 Fragiudalfs의 전형적인 특성을 나타내므로 아군은 Typic Fragiudults로 분류된다. 토성속 제어부 위에서의 토성속이 fine silty이고, mesic 토양온도상을 보유한다. 따라서 부곡통은 Fine loamy, mixed, mesic family of Typic Fragiudalfs가 아니라 Fine silty, mixed, mesic family of Typic Fragiudults로 분류되어야 한다.