Babu, A. Giridhar;Kim, Sang Woo;Yadhav, Dil Raj;Adhikari, Mahesh;Kim, Changmu;Lee, Hyang Burm;Lee, Youn Su
Mycobiology
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제42권4호
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pp.397-400
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2014
Pseudallescheria boydii KNU13-2 was isolated from crop field soil and identified by analysis of internal transcribed spacer regions of rDNA and morphological characteristics. In the literature, P. boydii has been mentioned as a human pathogen. This is the first record of P. boydii isolated from crop field soil in Korea.
Deng, Jian Xin;Ji, Seung Hyun;Paul, Narayan Chandra;Lee, Ji Hye;Yu, Seung Hun
Mycobiology
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제41권2호
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pp.112-115
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2013
Twenty Penicillium isolates were recovered during the investigation of fungal community in the soil samples collected from Wando (Jeonnam Province, Korea). Among them, one species was identified and described as P. cainii based on phylogentic analysis of internal transcribed spacer and ${\beta}$-tubulin (BT2) genes and morphological characteristics. This is a first report of P. cainii in Korea.
Human influence on soil formation has dramatically increased as the development of human civilization and industry. Increase of anthropogenic soils induced research of those soils; classification, chemical and physical characteristics and plant growth of anthropogenic soils. However there have been no reports on soil pore properties from the anthropogenic soils so far. Therefore the objectives of this study were to test computer tomography (CT) to characterize physical properties of an anthropogenic paddy field soil and to find differences between natural and anthropogenic paddy field soils. Soil samples of a natural paddy field were taken from Ansung, Gyeonggi-do (Ansung site), and samples of an anthropogenic paddy field were from Gumi in Gyeongsangnam-do (Gasan) where paddy fields were remodeled in 2011-2012. Samples were taken at three different depths and analyzed for routine physical properties and CT scans. CT scan provided 3 dimensional images to calculate pore size, length and tortuosity of soil pores. Fractal analysis was applied to quantify pore structure within soil images. The results of measured physical properties (bulk density, porosity) did not show differences across depths and sites, but hardness and water content had differences. These differences repeated within the results of pore morphology. Top soil samples from both sites had greater pore numbers and sizes than others. Fractal analyses showed that top soils had more heterogeneous pore structures than others. The bottom layer of the Gasan site showed more degradation of pore properties than ploughpan and bottom layers from the Ansung site. These results concluded that anthropogenic soils may have more degraded pore properties as depth increases. The remodeled paddy fields may need more fundamental remediation to improve physical conditions. This study suggests that pore analyses using CT can provide important information of physical conditions from anthropogenic soils.
This study was carried out in order to survey the soil physico-chemical, morphology and content of saponins of 5 year-old Platycodon grandiflorum radix from different areas in Gyeongnam. Soil physical properties was showed 1.01-1.29 of bulk density of soil and soil hardness was increased with increasing soil depth, especially below the 30 cm, however it was maintained or small increased below the 40 cm. T-N and OM contents of top soil were highest at Geochang as 0.27% and 56.9 g/kg, respectively, compared to other areas. The root length was longer at Kimhea and Geochang as 33.8 and 33.7 cm, respectively, and fresh weight was heavy at Geochang as 208.5 g. The contents of saponin of P. grandiflorum radix was higher in fine root compare to main root. By region, content of saponins of P. grandiflorum radix were higher at Hapcheon than other area. Mg content was highly negatively correlated at p < 0.01 with platycodin D3, deapioplatycodin D, platycodin D, and deapioplatycodin D ($-0.499^{**}$, $-0.433^{**}$, $-0.421^{**}$, $-0.511^{**}$ respectively). These results suggest that no-fertilized Mg effected on the improvement of saponin contents in P. grandiflorum.
Three ciliate species, Frontonia schaefferi Bullington, 1939, Spathidium curiosum Foissner, 2016, and S. muscicola Kahl, 1930, were collected from freshwater and terrestrial habitats in Korea. Their morphology was investigated based on live observations and protargol impregnation. Frontonia schaefferi was characterized by a cell size of $89-112{\times}45-53{\mu}m$ (after protargol impregnation) and three vestibular kineties. Spathidium curiosum was characterized by a cell size of ca. $125{\times}25{\mu}m$ in vivo and the unusual shape of the extrusomes. Spathidium muscicola was characterized by a cell size of ca. $135{\times}40{\mu}m$ in vivo and four to six macronuclear nodules. These three species are new records for Korea.
Corrosion of copper alloys (copper, bronze and brass) in soil was evaluated at ambient temperature using various methods such as electrochemical impedance spectroscopy (EIS), polarization curves and Scanning Electron Microscopy (SEM) coupled with Energy Dispersive Spectroscopy microanalysis measurements. Three equivalent circuits were separately used to interpret the obtained impedance spectra. The EIS measurements indicated that the polarization resistance of all electrodes increases with increasing the immersion time. SEM showed a presence of three layers of corrosion products with various composition and morphology covering each electrode. In addition, it was found that at 20% of moisture content the $R_p$ values and the current density of all electrodes in the studied soil give the following order: copper > bronze > brass. Good consistency between the data obtained from EIS and PP measurements was observed.
In this study, fungal strains designated as KNUF-22-14A and KNUF-22-15A were isolated from soil samples in Korea. These two strains were identified based on cultural and morphological characteristics as well as phylogenetic analyses and were found to be morphologically and phylogenetically identical. Upon their morphological comparison with closely related species, such as Tolypocladium album, T. amazonense, T. endophyticum, T. pustulatum, and T. tropicale, a difference in the size of short phialides [0.6-2.4(-9.3)×0.8-1.4 ㎛] was observed. Meanwhile, these strains had larger conidia (1.2-3.0×1.2-3.0 ㎛) than T. album, T. amazonense, T. endophyticum, and T. tropicale and smaller conidia than T. pustulatum. Phylogenetic analyses using a multi-locus datasets based on ITS, LSU, and SSU showed that KNUF-22-14A and KNUF-22-15A formed a distinct cluster from previously identified Tolypocladium species. Thus, these fungal strains isolated from soil in Korea are proposed as a novel species according to their characteristics and are named Tolypocladium globosum sp. nov.
Six study sites in Gumi, Goryeong in Gyeongbuk province and Naju in Jeonnam province were selected to investigate soil properties of poorly drained horizons in paddy soils. The horizons were re-established layers which were parent material layers originated from fluvial deposits. Topsoil layers were differentiated from piled parent materials while soil structure of the topsoil layer was massive with striated microstructure. Compaction at soil re-establishment and a lack of structure and aggregate development in these soils may cause the limitation of vertical water movement and result in poorly drained horizons. Soil samples were taken from paddy fields with top soils of sandy loam, silt loam and silty clay loam and re-established soils of coarse and fine texture. The samples were taken from each horizon for the analyses of soil chemical and mineral properties. Soils with re-established soils of coarse texture had greater amounts of sands from top soil texture distributions, while soils with fine texture had greater amounts of silts. Chemical properties of top soils were analyzed from rice cultivated soils at the time of re-establishments and one year after the re-establishments. The coarse texture of the re-established horizons decreased in EC values from 0.23 to $0.11(dS\;m^{-1})$, available phosphate values from 112 to $54(mg\;kg^{-1})$, and exchangeable Ca values from 6.6 to $4.9(cmol_c\;kg^{-1})$. On the other hand, soils with fine texture showed decrease only in pH and exchangeable Ca values. Especially, organic matter and available phosphate contents showed heterogeneous distributions from each horizon. This result may be caused by mixture of plough layer and subsurface layer during and consolidation. Hydraulic conductivity values were low at the boundaries of top soil and parent material layers except SL/coarse soil. Soil microstructure was massive structure without soil clods or pores and showed striated structure. Therefore, re-established paddy fields with fluvial deposits as parent material layers showed limited vertical movements of soil water because of occurrence of compacted layers and less-development of soil clods and aggregates.
We conducted this research to observe the changes of surface morphology and composition of clay minerals influenced by various concentrations of fluoric acid. Hydrofluoric acid (HA), a solution of hydrogen fluoride (HF) in water, is a colourless solution that is highly corrosive, capable of dissolving many materials, especially oxides. To do this, we treated several concentrations of HA on the ground soil samples collected from the agricultural experimental station located at Chungnam National University to observe the influence of fluoric acid on the changes of surface structures and elemental composition of clay particles. Generally, microscopic examination showed that the HA can not only attack an edge of clay particles but also start at any point where structural defects and weaknesses predisposed sites to acid. The orderly flake arrangement of clay minerals may reflect certain crystal symmetry elements. The ESEM-EDS results of element composition of clay particles influenced by HA indicated the changes of structures of clay minerals. It is also clear from the formation of etch figures and element composition of clay particles that the product layer at least partially dissolved or disintegrated in the presence of acid. Conclusively, the clay structures can be strongly influenced by concentrations of HA, resulting in changes of physical and chemical properties that can determine the behavior of solute transport as well as mobility of ions in soils.
Based on the taxonomic survey to uncover the ciliate diversity in the eastern Kangwon-province, twenty-six species were identified from moss-covered soils and assigned to 5 classes, 9 orders, 12 families, and 15 genera. Of these, fifteen species are first records from Korea, and brief remarks with photographs were provided.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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