Somboro, Anou M.;Tiwari, Dileep;Shobo, Adeola;Bester, Linda A.;Kruger, Hendrik G.;Govender, Thavendran;Essack, Sabiha Y.
Mass Spectrometry Letters
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제5권4호
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pp.110-114
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2014
The method of direct mass spectrometry profiling is reliable and reproducible for the rapid identification of clinical isolates of bacteria and fungi. This is the first study evaluating the approach of MALDI-TOF mass spectrometry profiling for rapid identification of carbapenemase-resistant enterobacteriaceae (CRE). Proof of concept was achieved by the discrimination of CRE using MALDI Biotyper MS based on the protein. This profiling appears promising by the visual observation of consistent unique peaks, albeit low intensity, that could be picked up from the mean spectra (MSP) method. The Biotyper MSP creation and identification methods needed to be optimized to provide significantly improved differences in scores to allow for subspecies identification with and without carbapenemases. These spectra were subjected to visual peak picking and in all cases; there were pertinent differences in the presence or absence of potential biomarker peaks to differentiate isolates. We also evaluated this method for potential discrimination between different carbapenemases bacteria, utilizing the same strategy. Based on our data and pending further investigation in other CREs, MALDI-TOF MS has potential as a diagnostic tool for the rapid identification of even closely related carbapenemases but would require a paradigm shift in which Biotyper suppliers enable more flexible software control of mass spectral profiling methods.
소프트웨어를 대상으로 하는 다양한 공격방법이 등장하고 있는 가운데 컴퓨터 소프트웨어에 대한 불법 조작 및 변조 등의 위협이 증가하고 있다. 특히, 온라인상에서 동작하는 어플리케이션 클라이언트를 대상으로 악의적인 로더 프로그램을 이용하여 프로그램의 코드를 조작하고, 흐름을 변조하여 정상적인 동작을 방해하는 행위가 날로 늘어나고 있다. 본 논문에서는 악의적인 용도로 사용되는 로더가 가지는 패턴을 분석하여 시그너처를 생성하고, 변형된 패턴을 탐지할 수 있고 시그너처 기법을 보완한 프로파일 기반의 탐지 기법을 제시한다.
Health Level Seven(HL7)에서 V2.x, V3 보다 향상된 FHIR(Fast Healthcare Interoperabilty Resources)를 표준을 개발하고 있고, 이를 채택한 솔루션 개발이 활발하고, 각 국가 의료환경에서의 검증이 필요하다. 현재 미국에서 성공적으로 널리 사용되는 V2.x Message와 V3 Clinical Document Architecture(CDA)가 존재 하지만, 이 기술 표준들을 개발하고 사용하는데 긴 시간 투자의 문제점이 있다. 현재 V4로 불리우는 개선된 FHIR를 사용함으로 이러한 문제점을 해결할 방법인지 확인한다. 개인건강기록 관리 또한 사회적인 관심을 끌고 있고, 스마트폰 보급률이 급격히 증가하는 함을 반영하여 개인건강기록 관리 시스템을 스마트폰으로 접속 가능한 시스템으로 개발한다. 이를 구축하기 위해서는 Electronic Medical Record(EMR) 시스템과 Personal Health Profiling(PHP) 시스템간의 정보교류를 FHIR Open API로 구성한다. PHP 시스템에서는 이들 트랜잭션을 RESTful 서비스로 제공한다. 본 연구에서는 FHIR기반의 PHP 시스템을 통해 개인건강관리 시스템의 효율성을 검증하고자 한다.
Control system for cutting piston used in vehicle that is one of the 3D shape cutting using CNC lathe is presented. In order to cut the hybrid piston shape using CNC lathe, defined piston shape and change into machine code. The control software was developed for the high speed piston shape cutting. In this paper, the performance of this software was evaluated practically. As a result, the evaluated cutting precision was quantitatively compared with theoretical precision. Also the productivity and the quality by using CNC lathe with control software were evaluated those by using profiling.
Control system for cutting piston used in vehicle that is one of the 3D shape cutting using CNC lathe is presented. In order to cut the hybrid piston shape using CNC lathe, defined piston shape and change into machine code. The control software was developed for the high speed piston shape cutting. In this paper, the performance of this software was evaluated practically. As a result, the evaluated cutting precision was quantitatively compared with theoretical precision. Also the productivity and the quality by using CNC lathe with control software were evaluated those by using profiling.
최근 임베디드 시스템은 운영체제를 포함하는 복잡한 소프트웨어 계층 구조를 가지는 형태로 발전하고 있다. 이러한 소프트웨어의 성능을 분석하기 위해서는, 한 소프트웨어 계층에서의 성능 뿐 아니라 전체 소프트웨어 계층 구조를 모두 고려해야 한다. 본 논문에서는 리눅스 기반 임베디드 시스템의 모든 소프트웨어 계층 구조를 고려할 수 있는 성능 분석 도구를 설계하고 구현한 결과를 보인다. 제안하는 기법은 응용 프로그램이나 라이브러리에 대한 재컴파일 없이 모든 소프트웨어 계층의 성능 분석에 필요한 측정 정보를 수집한다. 이 기법을 통해 리눅스 기반 임베디드 시스템에서 응용 프로그램의 실행에 따라 발생하는 사용자 정의 함수, 미들웨어 라이브러리 함수, 커널의 시스템 호출, 커널 이벤트에 대한 다양한 성능 분석을 수행할 수 있다. 실험을 통해 본 연구를 통해 구현된 분석도구를 사용하여 실제 실행 경로 분석, 각 소프트웨어 계층의 함수나 이벤트의 소요시간 분석, 그리고 소프트웨어 계층간 실행 흐름 분석 결과를 확인할 수 있으며, 이를 통해 전체 소프트웨어 계층상의 성능 병목을 찾을 수 있음을 보인다.
H.264 영상압축표준은 우수한 부호화 성능 때문에 현재 DMB와 IPTV 등에 다양한 응용에 활용되고 있으나, 높은 계산량으로 인하여 임베디드 환경에서의 실시간 부호화기로의 활용은 매우 제한적이다. 본 논문은 DSP 시스템이 제공하는 컴파일러 옵션 최적화, 인트린식과 어셈블코드 적용, 데이터 메모리 배치 최적화 과정을 H.264 부호화기 최적화의 입장에서, 비판적, 종합적으로 분석하고 반영한 결과를 소개한다. 특히, 대표적인 DSP인 TMS320DM64x를 사용하여 적용된 최적화 방식에 따른 연산이득을 구체적으로 제시하였으며, 그 결과 CIF급의 영상은 현재시장에 유통되는 DSP기반으로 실시간 구현이 가능함을 확인하였다.
최근 에너지 문제가 사회적인 이슈가 되면서, 그린컴퓨팅이 주목을 받고 있다. 그린 컴퓨팅을 위한 다각적인 접근 방법 중 하나로, 컴퓨터의 전력 소비 프로파일링에 관한 연구가 활발히 진행되고 있는데, 대표적으로 PowerAPI, PowerTop, JouleMeter, pTop, 그리고 EnergyChecker 등의 도구가 있다. 이러한 연구들은 순수 소프트웨어에 기반하여 각 컴퓨터 디바이스들의 소비 전력을 측정할 수 있을 뿐 아니라, 이를 바탕으로 프로세스 레벨에서 전력 소비 프로파일링을 수행함으로써 각 프로그램의 전력 소비량도 분석할 수 있다. 따라서 전력을 많이 소비하는 프로세스를 파악하고 제어함으로서 전체 전력 소비를 줄이거나, 프로그램 설계 시 프로파일링 전력 데이터를 바탕으로 저전력 프로그램설계를 가능케 하여, 궁극적으로 그린 컴퓨팅을 지향할 수 있게 한다. 본 논문에서는 전술한 대표적인 연구들을 비교 분석하여 이상적인 프로세스 레벨 전력 소비 프로파일러의 특징들을 도출하고자 한다.
Metabolites of urine samples from 6 colorectal cancer patients were analyzed by two-dimensional NMR spectroscopy, where the samples were collected before and after the surgical treatments per patient. NMR data were analyzed with the help of the metabolome database and the statistics software. Urine samples before and after the treatments showed significantly different metabolic profiles from each other. We were able to compare 10 different metabolites. Most of the assigned metabolites of every patient showed a tendency of increase after the surgery except for a few cases. The amount of changes in individual metabolites varied significantly from patient to patient, but the combination of such changes could be used to distinguish the condition before the surgery from after, which could be done by PCA analysis. The analysis via $^{1}H-^{13}C$ HSQC spectra proved to be applicable in assessing and classifying global metabolic profiles of the urines from colorectal cancer patients.
Benzene and ethylbenzene (BE), the volatile organic compounds (VOCs) are common constituents of cleaning and degreasing agents, paints, pesticides, personal care products, gasoline and solvents. VOCs are evaporated at room temperature and most of them exhibit acute and chronic toxicity to human. Chronic exposure of benzene is responsible for myeloid leukemia and also ethylbenzene is also recognized as a possible carcinogen. To evaluate the BE effect on human, whole human genome 35 K oligonucleotide microarray were screened for the identification of the differential expression profiling. We identified 280 up-regulated and 201 down-regulated genes changed by more than 1.5 fold by BE exposure. Functional analysis was carried out by using DAVID bioinformatics software. Clustering of these differentially expressed genes were associated with immune response, cytokine-cytokine receptor interaction, toll-like signaling pathway, small cell lung cancer, immune response, apoptosis, p53 signaling pathway and MAPKKK cascade possibly constituting alternative or subordinate pathways of hematotoxicity and immune toxicity. Gene ontology analysis methods including biological process, cellular components, molecular function and KEGG pathway thus provide a fundamental basis of the molecular pathways through BEs exposure in human lymphoma cells. This may provides a valuable information to do further analysis to explore the mechanism of BE induced hematotoxicity.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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