• 약학회지
• /
• 제51권4호
• /
• pp.239-245
• /
• 2007

In order to evaluate the genotoxicity of airborne particulate matter extracted with dichloromethane (APE), the rat microsome mediated (S-9) or DNA repair enzyme treated Comet assays were performed using the single cell gel electrophoresis in A549 human lung carcinoma cells. It was found that the cells interacting with APE showed more DNA single-strand breaks relative to untreated cells. The genotoxicity of APE was increased with the treatment of S-9 mixture. Microsome mediated DNA damage was inhibited by CYP1Al inhibitor, quercetin. The APE also showed oxidative DNA damage evaluated by endonuclease III treatment. Oxidative DNA damage of APE was inhibited by antioxidants such as vita- min C and Trolox. We also found that the vegetables or fruits extract may reduce APE-induced genotoxicity by their anti- oxidant activity and CYP1A1 inhibition.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
• /
• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
• /
• pp.14-14
• /
• 2003

Potato virus X (PVX), the type member of Potexvirus genus, is a flexuous rod-shaped virus containing a single-stranded (＋) RNA. Infection by PVX produces genomic plus- and minus-strand RNAs and two major subgenomic RNAs (sgRNAs). To understand the mechanism for PVX replication, we are studying the cis- and/or trans-acting elements required for RNA replication. Previous studies have shown that the conserved sequences located upstream of two major sgRNAs, as well as elements in the 5' non-translated region (NTR) affect accumulation of genomic and sg RNAs. Complementarity between sequences at the 5' NTR and those located upstream of two major sgRNAs and the binding of host protein(s) to the 5' NTR have shown to be important for PVX RNA replication. The 5 NTR of PVX contains single-stranded AC-rich sequence and stem-loop structure. The potential role(s) of these cis-elements on virus replication, assembly, and their interaction with viral and host protein(s) during virus infection will be discussed based on the data obtained by in vitro binding, in vitro assembly, gel shift mobility assay, host gene expression profiling using various mutants at these regions.

• BMB Reports
• /
• 제35권5호
• /
• pp.465-471
• /
• 2002

From fruiting bodies of L. edodes strain L-54, single-spore isolates (SSIs) were collected. Two parental types of L-54 were regenerated via monokaryotization. By means of random-amplified polymorphic DNA (RAPD), DNA samples from L-54, its two parental types, and 32 SSIs were amplified with arbitrary primers. Dedikaryotization was demonstrated, and 91 RAPD-based molecular markers were generated. RAPD markers that were segregated at a 1:1 ratio were used to construct a linkage map of L. edodes. This RAPD-linkage map greatly enhanced the mapping of other inheritable and stable markers [such as those that are linked to a phenotype (the mating type), a known gene (priA) and a sequenced DNA fragment (MAT)] with the aid of mating tests, bulked-segregant analysis, and PCR-single-strand conformational polymorphism. These markers comprised a genetic map of L. edodes with 14 linkage groups and a total length of 622.4 cM.

• 한국환경생물학회:학술대회논문집
• /
• 한국환경생물학회 2002년도 학술대회
• /
• pp.145-153
• /
• 2002

유해 화학 물질류에 의해 오염된 해양 환경 시료의 환경독성 수준을 평가하기 위하여 다양한 화학물질에 대해 민감성이 우수한 생물학적 독성평가기법을 개발 하고자하였다. 지속성 유기오염 물질 중 다환 방향 족 탄화수소(PAHs)를 처리한 광어(Conger myriaster)와 개조개(Saxidomus pupurata)의 DNA 손상정도를 single cell gel electrophoresis assay(comet assay)를 통해 분석하였다. PAHs 중 광양만에서 높은 농도로 검출되는 benzo(a)pyrene을 농도별(0, 10, 50, 100 ppb)로 처리한 후 2일과 4일에 광어의 혈액세포와 개조개의 근육세포를 채취해 comet assay를 실시하였다. benso(a)pyrene에 대한 DNA 손상정도를 처리된 농도와 생물종에 따라 다르게 나타났는데 광어의 혈액세포는 2일에 가장 DNA 손상정도가 높았고, 4일에는 회복되는 경향을 나타냈다. 개조개의 근육세포는 시간이 지나면서 DNA 손상정도가 증가하는 경향을 보였다. 이와 같은 결과는 comet assay 기법이 유해 화학물질로 오염된 해양생물 종의 환경독성을 검색하는 유용한 수단이 될 수 있음을 보여준다.

• 대한전기학회:학술대회논문집
• /
• 대한전기학회 2007년도 제38회 하계학술대회
• /
• pp.1375-1376
• /
• 2007

A synthesized 21-mer single-stranded DNA(ss DNA) was covalently immobilized onto a self-assembled aminoethanethiol monolayer modified gold electrode onto QCM. The covalently immobilized ssDNA was hybridized with complementary ssDNA. The interaction between surface immobilized ssDNA and complementary 21-mer DNA in solution was also examined. Each step was followed by monitoring changes in the QCM frequency with time. Also, PBS with pH 7.0 was selected as a supporting electrolyte in order to get maximum sensitivity and good bioactivity.

• Journal of Genetic Medicine
• /
• 제3권1호
• /
• pp.15-19
• /
• 1999

We have investigated the genetic variation in the human apo B mRNA editing protein (apobec-1) gene. Exon 3 of the apobec-1 gene was amplified by polymerase chain reaction. After detection of an additional band by single strand conformational polymorphism (SSCP) analysis, sequencing of the SSCP-shift sample revealed a single-base mutation. The mutation was a CGG transversion at codon 80 resulting in a lleRMet substitution. This substitution was confirmed by restriction fragment length polymorphism analysis since a Pvull site is abolished by the substitution. Population and family studies confirmed that the inheritance of the genotypes for apobec-1 gene polymorphism is controlled by two codominant alleles (P1 and P2). A significant difference in plasma triglyceride was detected among the different apobec-1 genotypes in the CAD patients (P<0.05). Our study could provide the basis for elucidating the interaction between genetic variation of the apobec-1 gene and disorders related to lipid metabolism.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
• /
• 한국자원식물학회 2005년도 춘계 학술발표대회
• /
• pp.52-60
• /
• 2005

본 연구의 목적은 양파추출물의 간보호 및 항산화 효과를 조사하기 위함이다. 간 손상을 유발시키는 t-BHP (1.5mM) 존재하에 간세포를 0, 0.01, 0.05, 0.1 및 0.3 mg/ml의 다양한 농도의 양파추출물로 1시간 동안 일차배양하였다. 간세포 독성과 생존율은 배양액의 GOT와 LDH 활성 및 MTT 값으로 결정하였고, 지질과산화는 TBARS 농도로 측정하였다. 항산화에 미치는 효과는 catalase, GSH-Px, GSH-Rd 활성 및 DNA strand breaking assay로 결정하였다. t-BHP는 GOT와 LDH 활성 및 TBARS 농도를 증가시켰으며 MTT값은 감소시켰다. 0.05 mg/ml 이상 농도의 양파추출물 첨가는 1.5 mM 농도의 t-BHP에 의해 증가된 GOT 및 LDH 활성을 감소시켰으며 0.01 mg/ml 이상 농도의 양파추출물은 t-BHP에 의해 감소된 MTT 값을 증가시켰다. 또한 0.01 mg/ml 이상 농도의 양파추출물 첨가는 t-BHP에 의해 증가된 TBARS 농도를 감소시켜 양파추출물이 t-BHP에 의해 유발된 간손상과 지질과산화를 억제시켰다. 1시간 동안 1.5 mM 농도의 t-BHP 처리는 간세포의 catalase, GSH-Px 및 GSH-Rd 활성을 현저히 감소시켰다. 그러나 0.01 mg/ml 이상 농도의 양파추출물 첨가는 t-BHP에 의해 감소된 catalase, GSH-Px 및 GSH-Rd 활성을 증가시켰으며 특히 catalase 활성은 t-BHP 무첨가군 수준까지 증가시켰다. 또한 hydroxyl radical을 생성하는 Fenton 시약의 존재하에 plasmid DNA를 양파추출물과 함께 배양하였을 때양파추출물은 농도 의존적으로 hydroxyl radical에 의해 유도된 single-strand 절단을 억제하였다. 이상과 같이 간세포 일차배양에서 양파추출물은 t-BHP에 의해 유발된 간독성, 간세포 생존율 감소, 지질과산화를 농도 의존적으로 억제시켰고 또한 t-BHP에 의해 억제된 GSH-Px, GSH-Rd 및 catalase의 활성을 증가시켰다. 이와 같이 양파추출물의 간보호 및 항산화 효과는 항산화 효소, 특히 catalase의 활성 증가와 hydroxyl radical에 의해 유도된 산화억제 및 이에 따른 지질과산화 억제에 기인하는 것으로 사료된다.

• 대한관절경학회지
• /
• 제9권2호
• /
• pp.222-231
• /
• 2005

목적: 저자들은 5가닥의 자가 슬괵건을 이용하여 기존의 전내측 다발에 부가적인 후외측 다발을 통한 전방 십자인대 이중 다발 재건술을 소개하고자 한다. 수술 술기: 경골 터널은 기존의 단일 터널 방법을 사용하였고, 대퇴 터널은 전내측과 후외측 다발을 위한 이중 터널 방법을 사용하였다. 전내측 대퇴 터널은 최소한의 대퇴 과간 절흔 성형술 후 기존의 방법과 동일하게 11시 혹은 1시 방향에 대퇴과 절흔의 후방 경계(over-the-top)에서 후방 피질골이 1 mm 두께로 남아 있게 만든다. 또한 후 외측 대퇴 터널은 outside-in 방법을 사용하여 관절 내 터널 위치는 슬관절 90도 굴곡 상태에서 외측 반월상 연골 후각의 경골 부착부 내연(inner margin)에서 외측 대퇴과 내측벽의 상방 $5{\sim}7mm$ 부위에 4.5 mm reamer 이용하여 만들어 준다. 이중 다발을 위한 이식건으로 전내측 다발은 기존의 4가닥 슬괵건을 사용하고 후외측 다발은 반건양건 단일 가닥으로 만든다. 대퇴 터널 고정 방법으로 전내측 다발은 rigid fix system으로 고정하며 후외측 다발은 관절 밖에 miniplate를 이용하여 endobutton 방식으로 결찰로 고정한다. 이 후 경골 터널 고정은 슬관절을 $10{\sim}20$도 굴곡 상태에서 이중 다발을 함께 인장 강도를 주고 간섭 나사못으로 고정하고 post tie로 보강한다. 결론: 저자들은 비교적 우수한 결과를 보여주었던 기존의 전내측 다발에 회전 안정성을 위한 부가적인 후외측 다발을 통해 5가닥(경우에 따라 6가닥)의 자가 슬괵건을 이용한 이중 다발 재건술을 시행함으로써 좋은 결과가 기대된다.

• Journal of Gastric Cancer
• /
• 제8권3호
• /
• pp.113-119
• /
• 2008

목적: TFF1 유전자의 -2bp에 위치하고 있는 단일염기다형성의 유전자형 및 대립형질 빈도와 H. pylori 감염 및 위암발생 민감성과의 연관성을 조사하고자 하였다. 대상 및 방법: 2000년 1월부터 2003년 12월까지 위 샘암종으로 근치적 수술을 시행 받은 167명과 정상 건강인 299명의 DNA를 이용하였다. TFF1 유전자의 단일염기다형성의 유전자형은 중합효소연쇄반응 후 제한효소를 이용한 제한 분절길이다형성과 single strand conformation polymorphism의 방법으로 분석하였다. 또한, H. pylori 감염은 Giemsa 염색으로 조사하였다. 결과: 정상 건강인의 TFF1 단일염기다형성에 대한 유전자형 및 대립형질의 빈도를 위암 환자군과 비교한 결과 통계적으로 의의가 없었다(P=0.715 & P=0.595). 위암 환자군을 성별로 나누어 정상 건강인과 비교한 경우에도 통계적 의의를 발견할 수 없었다. 또한, 위암 조직의 조직학적 소견 및 환자 연령과 TFF1 단일염기다형성의 유전자형 및 대립형질 빈도를 조사한 결과, 위암 조직의 조직학적 소견 및 연령은 TFF1 유전자 단일염기다형성과 무관하였다(P=0.088 & P=0.551). 한편, H. pylori 감염은 모두 39예에서 관찰되었는데 TFF1 유전자형과는 통계적으로 연관성이 없었다(P=0.7200). 결론: TFF1 유전자의 -2bp에 존재하는 단일염기다형성은 TFF1 단백의 합성에 큰 영향이 없으며 H. pylori 감염과 위암의 발생과는 무관하다는 것을 의미한다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제17권5호
• /
• pp.2625-2628
• /
• 2016

ABCC11 is reported to be associated with breast cancer. However, whether ABCC11 polymorphisms relate to breast cancer risk remains unclear. This study aimed to evaluate any association of a single nucleotide polymorphism (SNP), rs17822931, in ABCC11 with breast cancer in Koreans. Genomic DNA samples of 170 women with breast cancer and 100 controls were assessed for SNP rs17822931 of ABCC11 by single-strand conformation polymorphism (SSCP) and DNA sequencing. A 27-bp deletion (${\Delta}27$) of ABCC11 was analyzed by PCR amplification. The genotype of SNP rs17822931 was confirmed to be AA in all samples from breast cancer patients and ${\Delta}27$ was found in none of the samples. Our finding indicated that the SNP rs17822931 in ABCC11 is not associated with breast cancer. However, this study does provide information on fundamental genetic aspects of ABCC11 with regard to breast cancer risk in Koreans.