• Reproductive and Developmental Biology
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• 제28권1호
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• pp.45-52
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• 2004

To search a new porcine pheromonal odorants, this research for biostimulation and role of pheromone was augmented by means of "control system technologies" to offer a potentially useful and practical way to improve reproductive efficiency in livestock species. Therefore the 13 physicochemical parameters such as similarity indice (S), hydrophobicity (logP) and van der Waals molecule volume (MV) etc. of 54 steroid analogues, which are analogous of substrate molecules, 5$\alpha$-androst-16-en-3-one (P1) and 5$\alpha$-androst-16-en-3-ol (P2) of lipocalin as receptor of pig pheromones were calculated and discussed. The physicochemical properties of these steroid analogues were mainly followed by steric dissimilar of A and D ring in steroid nucleus. And we found that from correlation with S values and MV constants of molecules, the more MV constants are small, the more S values tend to approach 1. Based on this results, the S-values of 4-androsten-3,17-dione (P1-1) and 5 $\alpha$ -androstan-3-one (P2-1) were 1.0, respectively. The two compounds of them were chosen because they showed the same value each other at a side of hydrophobicity, molar refractivity and molecular volume. It is expected that the new two compounds will be able to substitute for P1 and P2, porcine pheromonal odorants.

• Applied Biological Chemistry
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• 제51권3호
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• pp.219-222
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• 2008

제3세대 제초성 cyclic imide 유도체를 탐색하기 위하여 peroxidizing 제초제로써 40개의 1-(4-chloro-2-fluoro-5-pro-pargyloxypheny)-3-thiourea 유도체(1-40) 중, 3-R-치환체의 발아 전 벼(Oryza sativa)와 논피(Echinochlo crusglli)에 대한 평균 제초활성 값들을 제시하였다. 그리고 Urea 유도체(1-40)와 protox 효소의 기질분자인 protogen사이의 분자구조 유사성을 검토하였다. 논피에 대하여 선택성을 나타내는 화합물은 diallyl-치환체(20)와 3-nitro-치환체(33)이었으며 allyl-치환체(8)가 가장 큰 제초활성$(pI_{50}=4.71)$과 유사성 지수(S=0.81) 값을 나타내었다. 그리고 aryl-치환체(21-40)와 Protogen 사이의 중첩된 부피(C)와 S값 사이에 상관성이 좋았다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제50권3호
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• pp.187-191
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• 2007

벼잎집무늬마름병균(RS: Rhizoctonia solani) 및 고추역병균 (PC: Phytophtora capsici)에 대한 N-phenyl-O-phenylthionocarbamate 유도체 중, N-phenyl 치환체(X)들의 살균활성에 관한 비교분자 유사성 지수분석(CoMSIA) 모델을 유도하고 기질분자와 ${\beta}-tubulin$ 사이의 수소결합성을 정량적으로 검토하였다. CoMSIA 모델들의 기여도로부터 두 균주에 대한 살균활성은 공통적으로 수소결합 받게장이 가장 크게 기여하였다. 두 균주 사이의 살균활성에 있어서 선택성은 N-phenyl 고리상 para- 및 meta-치환기로서, RS에서는 수소결합 주게가 아닌 작용기를 그리고 PC에서는 수소결합 받게가 아닌 작용기들의 역할에 기인하는 것으로 예측된다. 또한, RS에서는 meta-위치에 입체적으로 작고 음하전을 선호하는 치환기(X)가 그리고 PC에서는 para-위치에 수소결합 받게가 도입된다면 두 균주에 대한 살균 활성이 증가 할 것이다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제51권2호
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• pp.119-123
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• 2008

3-치환된 5,5'-diphenylimidazolidine-2,4-dione 유도체(1-22)들의 fatty acid amide hydrolase (FAAH) 저해활성에 관한 3차원적인 정량적 구조와 활성과의 관계(3D-QSARs)를 비교 분자장 분석(CoMFA)과 비교분자 유사성 지수분석(CoMFA) 방법으로 각각 검토하였다. CoMFA A1 모델과 CoMSIA 2F 모델 모두 상관성과 예측성이 양호하였다. 두 모델의 정보에 의한 등고도에 따라 설계된 X=I, Y=$N_2{^+}$-치환체(P1: $Pred.pI_{50}$=6.55)는 FAAH에 대하여 가장 높은 저해활성을 나타내었다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제53권2호
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• pp.99-104
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• 2010

3차원적인 정량적 구조-활성상관(3D-QSAR: 비교분자 유사성지수분석(CoMSIA) 및 비교분자장분석(CoMFA)) 기법에 기초하여 4-Methyl-2H-benzopyran-2-one 유도체들(1-23)의 항산화활성에 관한 benzo 고리상 치환기($R_1-R_4$)들의 영향을 정량적으로 검토하였다. CoMSIA 모델은 CoMFA 모델보다 통계적으로 양호하였으며 최적화된 CoMSIA 2 모델의 예측성($q^2$=0.700)과 상관성($r^2$=0.979)이 가장 양호하였다. 항산화 활성에 관한 CoMSIA 2 모델의 기여비율(%)은 수소결합 주게장(HD) 43.5%, 정전기장(E) 41.8% 및 입체장(S) 14.7%로 정전기장과 H-결합 주게장이 항산화활성에 가장 큰 영향을 미치는 요소이었다. CoMSIA 등고도 분석결과, benzo 고리상에 양하전을 선호하며, 그리고 H-결합주게가 아닌 치환기($R_1-R_4$)들이 항산화활성을 증가시킬 것으로 예상되었다.