• 한국어업기술학회:학술대회논문집
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• 한국어업기술학회 2003년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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• pp.229-230
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• 2003

Shortnecked clam is a commercially important mollusks species, which is distributed all over the Yellow Sea. Consequent of the rapid increase in seed production, there is a need to understand the genetic composition of wild shortnecked clam populations in order to evaluate exactly the latent genetic effects induced by seed production operations. Many genetic and molecular researches were made because RAPD-PCR is a simple and rapid method for determining genetic diversity and similarity in various organisms with the advantage that no prior knowledge of the genome under research is needed (Fischer et at., 2000). (omitted)

• 한국수산과학회지
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• 제34권3호
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• pp.179-183
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• 2001

서해안에서 생산되는 주요 패류인 바지락의 토사 배출률을 최적화하기 위하여 토사 배출에 관여하는 환경인자의 영향과 토사 배출에 따른 해수의 pH 및 용존 산소의 변화, 그리고 바지락에 대한 세균학적 조사, 폐사율 및 토사 잔존유무를 검토하였다. 바지락의 토사 배출에 있어서 해수 온도의 영향을 보면 수온 $23^{\circ}C$에서 가장 양호하여 48시간 후에 $97.9\%$가 배출되었으며, 염분농도는 $32.9\~40\%_{\circ}$에서 가장 양호하여 48시간 후에 $94.7\~97.1\%$가 배출되었다. 또한 pH의 영향을 보면 pH 9.0에서 가장 많은 양이 배출되어 48시간 후에 $98.0\%$가 배출되었으며, 자연해수인 pH 7.9와 큰 차이는 보이지 않았다. 바지락은 해수를 유수시키지 않고 12시간마다 해수만 교환한 시험구에서는 48시간 경과후 $2\~24\%$의 폐사체가 발생하였으나, 유수 시킨 시험구에서는 48시간까지 폐사체가 발생하지는 않았다. 모든 시험구에서 36시간 이상 경과시 대부분의 토사가 배출되었다. 바지락의 토사 배출을 위한 최적 해수 공급 조건은 바지락에 대한 해수 비율이 3,000과 4,000 L/shellfish $m^3$일 때에는 해수를 150L/min./shellfish $m^3$ 이상, 6,000과 8,000 L/shellfish $m^3$일 경우에는 해수를 100L/min./shellfish $m^3$ 이상 공급하는 것이었다.

• 한국양식학회지
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• 제17권1호
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• pp.12-23
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• 2004

Genomic DNAs were extracted from the muscle of twenty-two specimens of two shortnecked clam, Ruditapes phifippinarum populations collected in Anmyeondo and Seocheon. Genetic differences within and between populations were analysed by random amplified polymorphic DNAs-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) using twenty arbitrary decamer primers. Out of 20 primers, 6 generated a total of 1,111 major and minor RAPD bands from individuals of two sites, producing approximately 4.2 average polymorphic bands per primer in individuals from Anmyeondo and ranging in size from less than 50 to larger than 1,500 base pairs (bp). The electrophoretic analysis of RAPD products amplified showed moderate levels of similarity among the different individuals in Seo-cheon population. The average bandsharing values (BS value) of the samples within population from Anmyeondo ranged from 0.155 to 0.684, whereas it was 0.143∼0.782 within population from Seocheon. The average BS value between individuals No. 13 and No. 14 from Seocheon was 0.782 which was higher than that of those from Anmyeondo. The single linkage dendrogram resulted from three primers (OPA-08, -09 and -20), indicating six genetic groupings composed of group 1 (No.4, 8 and 10), group 2 (No. 18), group 3 (No.2, 5 and 7), group 4 (No. 1, 3, 6, 9, 11, 12, 13, 14, 15 and 17), group 5 (16, 19 and 20) and group 6 (No. 21 and 22). In the Seocheon population, the individual No. 18 clustered distinctly from the others of this population. The observed genetic distance between the two populations from Anmyeondo and Seocheon was more than 0.209 (0.247 and 0.275). The shortest genetic distance (0.094) displaying significant molecular differences was between individuals No. 13 and No. 14. Especially, the genetic distance between individuals No. 22 and the remnants among individuals in two geographical populations was highest (0.275). This result illustrated that individual No.22 is distinct from other individuals within two shortnecked populations. The different geographical features of two sites may have caused the genetic diversity in two shortnecked clam populations.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
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• 한국어업기술학회 2002년도 춘계 수산관련학회 공둥학술발표회
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• pp.281-282
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• 2002

Out of 20 primers, 6 generated a total of 1,111 major and minor RAPD bands, producing approximately 4.2 average polymorphic bands per primer in shortnecked clam (Ruditapes philippinarum) population from Anmyeondo. The Bandsharing value altered from 0.15 to 0.74, with the average f 0.51, as calculated by bandsharing analysis. The RAPD profiles obtained with DNAs of two populations from Anmyeondo and Seocheon, respectively, were considerably different (0.20 and 0.51, respectively). The varying degrees of difference among populations amy also be of relevance to the restricted hybridization of wild bivalve. Besides gene mapping and breeding applications, PCR-RAPD systems could be very useful for the rapid certification and quality control of seed production and for every projects based on PCR amplification of specific bivalve DNA fragments.

• 한국양식학회:학술대회논문집
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• 한국양식학회 2002년도 춘계 한국양식학회 학술대회 발표요지
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• pp.172-174
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• 2002

Out of 20 primers, 6 generated a total of 1,11 major and minor RAPD bands, producing approximately 4.2 average polymorphic bands pe primer in shortnecked clam (Ruditapes philippinarum) population from Anmyeondo. The bandsharing value altered form 0.15 to 0.74, with the average of 0.5, as calculated by bandsharing analysis. The RAPD profiles obtained with DNAs of two populations from Anmyeondo and Seocheon, respectively, were considerably different (0.20 and 0.51, respectively). The varying degrees of difference among populations may also be of relevance to the retricted hybridization of wild bivalve. Besides gene mapping and breeding applications, PCR-RAPD system could be very useful for the rapid certification and quality control of seed production and for every projects based on PCR amplification of specific bivalve DNA fragments.

• 한국어업기술학회:학술대회논문집
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• 한국어업기술학회 1998년도 수산관련공동학술대회발표요지집
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• pp.167.1-168
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• 1998

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제2권1호
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• pp.98-104
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• 1999

The characteristics of the populations of shortnecked clam (Ruditapes philipinarum) originated from three different seed-production sites, Hadong, Kochang and Ulsan along the coast of Korea, were analysed by the morphological differences and the random amplified polymorphic DNA (RAPD) profiles. The morphology of the shell and survival rate for each population were also investigated 13-months after transplantation to a farming site in Shinsung. The morphology of the populations from Hadong and Kochang showed significant differences (P<0.05), but one year after transplantation to Shinsung, the morphology of these three populations was no longer significantly different (P>0.05). The template DNA for RAPD was efficiently extracted from the digestive diverticula of the clams. Up to 13 of amplified fragments were detected using arbitrary primers. Within the species of R. philipinarum, the genetic similarities ranged from 0.196 to 0.259. The populations from Hadong and Ulsan showed the highest similarity. The survival rates of the populations from Hadong $(69.4\%)$ and Ulsan $(63.8\%)$ were higher than that from Kochang $(41.7\%)$ 13-months after transplantation. From the RAPD analysis, it could be used as one of the primary criterion in determining which shellfish populations among various seed-production sites tend to be genetically similar and more adaptable and transplantable to a farming site.

• 한국패류학회지
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• 제26권3호
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• pp.227-234
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• 2010

A comparative analysis of size and age structures of coastal subfossil shell assemblages of the shortnecked clam Ruditapes philippinarum from open and protected bays of Cheju Island (Korea) was carried out. On the whole, taking into account the damage of small fragile shells, size and age structures of the shell assemblages corresponded to the classical curve of bivalve population distribution when its mortality diminishes with age increase up to a certain threshold. It was found that shell samples from open bays of the western, southern and eastern coasts included shells of smaller and younger individuals (L ${\leq}$ 40 mm, ${\leq}$ 4 years) than samples from the eastern protected bay (L ${\leq}$ 54.5 mm, ${\leq}$ 6 years). Evidently, strong wave activity was the reason for a short life-span of the clams from the open areas. Growth was investigated retrospectively by annual growth rings on the shells. Growth rates of the clams from the various coasts of Cheju Island differed. However, growth rates of the clams from different biotopes at the same (eastern) side of the Island were similar. Shell height/length and width/length ratios statistically significantly increased with the clam age increase. Most likely, the reason for such shell shape alteration is that more conglobated individuals more survive being more energy-optimal than oblong specimens.

• 한국양식학회지
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• 제6권3호
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• pp.133-146
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• 1993

1991년 4월부터 1992년 3월까지 남해안의 남해도 문항리산 바지락의 비만도의 월 변화와 1991년 4월부터 동년 12월까지의 문항리의 바지락 어장에서의 부유유생 및 간출 시간에 따른 치패의 출현량을 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 본 조사 기간 동안의 수온과 염분도의 월 평균치의 범위는 $23.7\~8.3^{\circ}C$$ 와 $33.7\~26.8%o$였다. 2. 비만도의 월 변화로부터 주산란기를 추정하여 볼 때 6-9월로서 이때 비만도의 값이 급격 히 감소하였다. 3. 바지락의 각정기 유생이 출현하는 시기는 5-1l월이었다. 그리고 출현량은 8월, 9월, 7월의 순으로 많았으며 $m^3$당 각각 883개체, 797개체, 520개체로 나타났다. 4. 조사 기간 동안에 $m^3$당 월별 평균 채집 개체수는 3시간, 1시간, 6시간 간출되는 장소의 순으로 많았으며 이때의 채집 개체수는 602.8개체, 360.4개체, 140.8개체였다. 월별로 볼 때 채집량의 최대와 최소 시기와 장소는 1시간 간출되는 장소에서 $m^3$당 8월과 4월에 각각 1,508개체와 28개체였다 5. 간출 시간에 따른 채집 밀도는 6시간 노출 장소에서는 큰 변동이 없었으나, 1시간과 3시간 간출 장소에서는 8월을 정점으로하여 6월 이후부터 8월까지는 치패의 발생량의 증가에 따라 밀도가 증가되는 시기를 나타내었고, 8월 이후는 발생된 치패의 양이 감소됨으로 인하여 밀도가 감소되는 현상을 나타내었다. 이와 같은 경향은 3시간 노출 장소보다 1시간 간출 장소에서 두드러지게 나타났다. 6. 조사 기간인 4월부터 12월까지 9회에 걸쳐 채집된 바지락의 월 평균 개체수를 각장에 따라 간출 시간별로 서로 비교해보면 1시간, 3시간, 6시간 노출 장소에서 $0.25m^2$당 각장 4.0mm 이하의 개체수는 각각 56.8개체, 52.0개체, 3.2개체로서 간출 시간이 길어짐에 따라 치패의 출현량이 줄어드는 경향을 나타내었고, 각장 $4.1\~20.0mm$의 범위에서는 22.1개체, 46.8 개체, 9.7개체로서 3시간 간출 장소에서 가장 많았으며, 그 다음 1시간, 6시간의 순이었다. 그리고 20.1mm 이상의 범위에서는 각각 11.5개체, 52.8개체, 22.3개체로서 3시간, 6시간, 1 시간의 순으로서 간출 시간별로 크기에 따른 채집 개체수는 다르게 나타나, 야외에서 채묘할 경우, 채묘기를 간출 시간이 짧은 곳에 설치하고 발생된 치패는 간출 시간이 긴 곳에 방양하는 것이 유리하다. 7. 바지락을 제외한 조개의 종류로서는 동죽 (Mactra ueneriformis), 우럭 (May arenaria), 떡조개 (Dosinorbis japonicus), 새고막 (Scapharca subcrenata) 등으로서 이들의 $0.25m^2$당 평균 채집량은 1시간 간출되는 장소에서 34.3개체로서 바지락을 포함한 전체 채집 개체수의 $27.6\%$를 차지하고 있으며, 3시간 간출 시간에서는 27.8개체로서 $15.4\%$, 그리고 6시간 간출 시간에서는 15.2개체로서 $29.9\%$를 차지하여 기타 조개류의 채집량은 1시간, 3시간, 6시간 간출 장소의 순으로서 간출 시간이 증가함에 따라 감소하는 경향을 나타내었고, 그 비율은 6시간, 1시간, 3시간의 순으로 높았다.

• 한국패류학회지
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• 제23권1호
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• pp.25-30
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• 2007

양식생물의 최적생산을 위해서는 적극적 관리 외에도 환경 개선과 지속적으로 최대생산을 위하여 수산자원학적 관리방안도 함께 강구되어야 한다. 따라서 양식장의 생산성 향상을 위하여 어느 시기에 어느 정도의 사이즈의 생물을 선택적으로 채취하여야 할 것인가는 양식생산 측면에서 아주 중요한 문제가 될 수 있다. 이를 위하여 통영시 한산면 진두연안의 바지락양식장의 양성중인 바지락자원의 자원학적 특성치로부터 가입당 생산량 모델을 구현하였고, 이 모델을 통해 현재의 양식생물 이용현황을 파악하고자 하였다. 현재의 어업형태에 따른 $t_c$와 F를 적용하면, 가입당 생산량은 3.46 g에 해당하였지만, $t_c$의 경우 3.48 세까지, F의 경우 0.9295/yr까지 증가시키면 약 5% (3.63 g)의 생산증대효과를 볼 수 있는 것으로 예상되었다. 그러나 채취시기를 연장함에 따른 사육소요기간의 장기화 및 자연사망계수의 변동 가능성을 고려한다면 현재의 어업행위가 가장 적합한 것으로 판단된다.